Id Trinity | FTRINITY_DN53587_c0_g2_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_181160 |
Sequence | CATACATTACTTTTTATATTTTATTGTTATTACCAAACTCAACCTAAAAAATAACATGTAACGAACTCGAGTTAAGTTTCGAGTCAAACTAATCTTTATC GAGCTAAATTAAACTGAACTCTTCAGGTAATATTTCCTCTTAGTAAAGTCTCAATTCGAATCTTATAGATGGAAAGATGACTAATAAAAGAAAAGCTTGA TAGGAATGTATCCATATTAAAATTATAATTTGAAATTATAAGATTAAGAAGGTATTTATTTGTAAATGAGGTGTGAATATAAGTTTTTGTGTTAAATAGA ATAACTAGAATCAGAGATATGAGAAAAGAAGAGAAGGTTGGAGAGAAGGGGAAAGGGTTTGAATGATTAGTGATTAGTGATTAGTGATTAGTGATTAGTG ATTAGTGATTAGTGATAGCTAAGTTAACGAAGCAAAGAAACAAAGAAGTAAGTGCAGTAGCCTTCGGTTGTAGCCAACATAACCAAACCCCTATGGATGA AATGGAGGACGAAAGAGCAGCAGAGCTTCTCTTCACACGCTTGCAGGATTCCCCGGATGATGCATCTCTTCATTTTGATATTGGCATATTGTTATGGGAA AAAGAAGACACTAAGGAAAAGGCTGCTCAACATTTTATCATATCTGCCAAATTGAACCCTAATAATGGACAAGTTTTCACATATCTGGGCCATTATTATA GCAGCACTAGCAATGACACTCAGCGAGCCATTAAGTGTTACCAACGAGCTGTTGCGCTCAATCCTCTTGATTCCAATGCTGGGGAAGCTCTTTGCAACTT GCTTGACCAAGGAGGAAAGGATAGTTTGGAGGTGGCAGTGTGCTACGAAGCTTCTCAAAACTCACCCAGGGCTTTCTGGGCTTTCCGTAGATTGGGTTTG CTGCAGCTTCATCAAAACAAATGGCCTGAAGCTGTTCAAAGTCTTCAACATGCCATACGAGGCTATCCCACTTCTCCTCATTTGTGGGAAGCTTTGGGCC TTGCTTATCACCGGCTCGGCAGGTTTACTGCTGCTCTAAAGTCTTATGCCCGAGCCATTGAATTGGATAATACCATGCTCTTTGCTTTCATTCAAAGTGG AAATATCTCCTTAACTCTTGCTTCATTTAGAAAGGGTGTTGAACATTTTCGACAAGCTCTGGAGATTTCACCGCAATCTGTGCCTGCACAATATGGACTT GCTTTGGCACTGCTTGGTTTGGCAAAAGATTGCATTAACCTGGGAGCATATCAGTGGGGGGCTTCATTGTTAGAGGAAGCATCTGAGGTTGCTAGGGCAT GTGCTTTTTTTGTTAGGAATGTCTCATGTATTTGGAAACTGCATGCTGATATCCAGCTTACATATGCAAGATGTTTTCCTTGGATTGAGGATGTCCAAGA ATTGGAGTCCGATAAGGAGGCTTTCAGTGCTTCCATTATTTCTTGGAGGATGACCTGCTTGTTGGCTGCAAGACGTGCAATGTTTTCGTATCAACGAGCC CTGCACTTGTCACCATGGCAAGCAAACATCTATGCTGACATTGCAGTAACTTCAGATCTTATTACTTCATTGAGTGAGAATTGTAAACAAGACTCAAGTG CATGGCTACTGCCAGAGAAGATGGCTGTGGGAGCCTTGCTACTTGAGGGTGACAATTATGAGTTCTGGATGGCTTTGGGATGTTTGTCGCACCATAATGC ACTTAATCATCATGCTTTAATCAGGGGACTGCAATTGAATGTATCTCTAGCTGTTGCTTGGGGATATCTTGGTAAGGTAATGTCATGTGTCGTCTCATCA GTAAAAAGTAATTACCTGACTTGGTAATTGTTCATTGTTATTAAGGATGTACTTGTCAAATTTATTTTTTGATAAGTTGACAGGGCAGAGAAAAAGGAAA CTTAAATCGTAAGTCATGGATGGGTTTGTTTACATGGCAATCTCTGCCTCTTTGATTCATGTTGTAATGCTGAACATCATATGAAATACTTCGGCAATTT TATGTGTGCCGTGTGCGGGTTTTTCAACTTGTATATAATTTTATACATCTTGCAGCTGTATTATAAAATGGGTGAAAAGCAACTGTCAAGGCAGGTATTC GATCGTGCTAGAAGTATTGATCCTGGCCTTGCATTGCCATGGGCAAGCATGTCAGCTGAGTCTTGTATTAGGGAGCTTGAACTAGATGAGGCATTTGAGA GCTGTTCACGAGCTGTGCAGATAATGCCTGTATATTAATTTCTACCACTTAAAATGCAATTTATAATGTGTTTATGTTTATATTGTCCTATTGTACGGGT TTGGTGGTTATTTATCATCACCATGTATTTGTTGTTTGGAATTTTTATGGGATAATATTGATTTCTGGTCCCTCTGGTCTGTTGGAGGGATTTCTTCTCA ATACCTGCTTCATAGCTTTATTGGACATATCATTTTAGCCTAATATTTTTATTTGTTGTGTTTAAATTTTATTAATTTTTTAATAATATTTTTATTAATG CACAGTTAGCTGAATTCCAAATTGGTCTCACCAAACTTGCTTTGCCAAGTGGCCGTCTGTCATCTTCACAGGTTTTTGGAGCTATTCAACAGGCTGTGCA GCATTCTCCTCACTATCCTGAATCCCATAATTTACATGGGCTGGTTTGTGAGGCTCGAAAAGAGTACAAGTCCGCTGCTGCTTCTTATAGGTTAGCACGT CATGCAATCAACATTGGCTCATGGAATATTGCAGACTCACAAGTGAAGGATATATCAATCAATTTGGCCAGATCGCTTTCTTTGGCAGGGAATGCTGTTG ATGCTTTGCAGGAATGTGAAAATTTGAAAATCCAAGGGGCACTTGACGCAGAAGGCTTACAGGTATATGCTTTCTCATTGTGGCAACTTGGTGAAAATGG TTTGGCTCTCTCTGTAGCTAGAAGTCTTGCTGCAACTCTTTCTTCTATGGAAAAGGCATCTGTTGCCACATCCATATGCTTCATCTGTAGATTGATATAC TACATGTGTGGACTGGATGCGGTCATCACTAACATTGTAAAAATGCCAAGGGAGCTATTTCAAAGTTCAAAAGTTTGTTTTGTTATGTTGGCTATCAATG CTCTTGATGGAAATAATCGTCTTGGATTTGTTGTCACAACTAGCCGATATTTTCTCAAATATCATGAAGAAATTGCCAGGATGCACTTTTTAATAGCGCT TGGTAAACTGGTCAAAAATGGGTCTGTTTGCTGTCTTGATGTTCAGAGTGGAGTTGCCTACCTCAAAAAAGCTATGCACATGTTCCCTAACTGTAATTTG ATGAGGTGGAGCGGGTACTGATGTGTATAGTAACACAACTCAAGTGTCCTGCCACCTTATCTTTTCTCATCCTCAGTGTTTATCCCTCTGTCCTCTCCAT GAATCCAACAGTTCAGCCTTTCTATGTTGTCACCTCAATCCCAACTCACCATTGCTTGTCACAATGGCAGCGCTGGTTCAAGTTTTGACTGCACCAGTTA GACTAACATTGAAGTTCACTGGGTCCAAAAATACCCCGCACTTTCTTAAAATTTCTTATTTTTTCCCCTATCCATTCAGGCTGGCCTGTTATAATTCCTT CAAATTATGTAATTAACATACAACAACCAAGCCTTAACATACCCTTCCTTAAATTGTATGGAAGAACCTTCTTGGCTATCTCTTGCTATCCAGTAAAGAG TTAAACGATTGTCATGTGGCGATAAGATGCTGTAAACTGGGGCATCTTGATCTTTCTGATGAAGAAGGTTTAAAATCAGCTTTTGATATTCATGGTGCTG GAGCAGTTGCTTGCTATGCCACTAGCAACAGCAGTCCGAAGTTTACTTTTCCAACTTGTACGATGCAGTGTTCTAGTCATTCTGGAGCTATCAGATACCT GCAGAAATCTTTTCACCAGAAACCTTGGAATCATGATGCCCGGTACTTGATTGTTCTTAATTATCTTCAGAGGGCACGTGAAGAGAGATTTCCTCATCAT CTTTGTGTTATACTAAAGCGTCTAACTCATGTTGCCCTCGCAAATGAATTGTATAGCAAGACAGAAATGTTGTATCAATATAGACACTTCCAACTTCTAC TTTGTGCCTCTGAGATCAGTTTACAATGTGGGGATCACATTACCTCTATCTCTCATGCGAAAAAGGCTTCTGAACTTGTGCTTCCTGATGATTACTTATT CTTCGCTCATCTACTACTGTGCCGTGTGTATGCCATGATAGGCGATCATCTAAATTTTAAGAATGAGTTTGCACAATGCTTGGAGCTTAGGACAGATTGC CATATTGGTTGGATTTGTCTCAAACTAATGGAATGTCGGTATGAACTGCAAATCAGCTCCAATGTCATAGATCTGAACTTTGAAGAATGTGTTCAAAAGG GTGGAAATTCATGGAATATGTGGATGGCTGTATATAACCTAGTGAGAGGTATGATTTCCTTGCAGAACAGGGATTTATTCTCCGCAGAAGAGTTTATGGG GCAGGCTTGTTCTTTGACAGGTTTTGAGAGCTGCCTCTTTCTATGTCATGGCGTTATTTGTATGGAGCTTGGCAGGCAGCTCAATGATTCTAAGTTCCTA TTACAAGCTGCTATGAGTCTTACCAAAGTTCACGAGCTTTCATTAATTCCCTTGCCTCTTGTCTCTGTATTGGTGGCTCAAGCAGAAGGAAGCCTCGGTT CTAAGGAGAAGTGGAACAGAAATCTTTCGTTTGAATGGGATACTTGGCCACCAGAAATGAGGCCTGCAGAGCTTTACTTTCAAATGCATTTGCTTGCAAG ACAGTTGAAAGTTGGGGCCAACTCTACATATAGCATAGTGTCCACTCAGACTCCTCAGAGATGGGTTCTTCGGGCAATTCATGTGAATCCTTCTTGTATG AGATATTGGAAAGTTTTACTGAAGCTTCTGGAGTAGATTTACAAGTGAATGGAACCTGTTTCAGGATATTGTCTATGTATCACTTCTATTGTCTATTCAG GATGAGAAACGTCTAAGCAAGTTGTTACCAATGTTGTAATTGTAATAGTTAACTAAGGCATGAATCAATTGAAAATAATTTTATAGTGAACAAGAAAGAA AAAGTAAATAATGTGCTTATTTCAAGGGTAAAATTTACTATTTGCTCTTTACAGAGGCACATCAAAATATTTATAATCCTTTTACCTAGAAGAGAGAATT TTGTTATTTATGTGAAATTATGTCACTTTGTATTGCATTTATATTAATTTAAAATGTGAAATTATGGGCATGGGGTCATAGTTTGAAGCATGATGAAGAC GCTAGGTAAATGTAAGAACTAAGAAGTAACATAGATGAGCATGAGAAAGGTACGTGATTCTTGTAAACAATATACATTAATAGTATATGAATTTTAGACA AAATGGTTGTTTGGAGAATCTAAAGGAGAGATATAATGATAAGGATAATTAAGAAAAATAAAATGTGTTATATGAGAAAAGATGTATGTTTATTTTGTGT GGTTGTTGTTGTTGAGTTGTGTAAGTAGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_35026; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_181160
Blastp | Tetratricopeptide repeat protein SKI3 from Arabidopsis with 60.48% of identity |
---|---|
Blastx | Tetratricopeptide repeat protein SKI3 from Arabidopsis with 60.91% of identity |
Eggnog | Tetratricopeptide repeat domain 37(ENOG410ZG1H) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G76630) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423132.1) |
Pfam | Sel1 repeat (PF08238.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |