Id Trinity | FTRINITY_DN53587_c0_g2_i17 |
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Name Transcript | Ll_transcript_181184 |
Sequence | CAAACCCCTATGGTATGATCTCATCCTCATGTGTGTGCTCAATCTCAGTTTGAGTGTGACTGTGAGTGTTATAGTATTTAATTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCAGGATGAAATGGAGGACGAAAGAGCAGCAGAGCTTCTCTTCACACGCTTGCAGGATTCCCCGGATGATGCATCTCTTCATTTTGATATTG TCTCAATTTCAATTCATTTTTCATTTTCATTTCGTCTCAATTTCAATTCATTTTTCATTTTCATTTCCTCTCAATTTCAATTCATTTTTCATTTTCATTT CCTCTCAATTTCAATTCACTAGTCATTTTGATATTGTTTGAACTTGAATTCGTTACTGATTTCTCCATCCACAGATGAGTTTAGTTATAATAATCTCATT GTTTTGTTTTGTCAGGGCATATTGTTATGGGAAAAAGAAGACACTAAGGAAAAGGCTGCTCAACATTTTATCATATCTGCCAAATTGAACCCTAATAATG GACAAGTTTTCACATATCTGGGCCATTATTATAGCAGCACTAGCAATGACACTCAGCGAGCCATTAAGTGTTACCAACGAGCTGTTGCGCTCAATCCTCT TGATTCCAATGCTGGGGAAGCTCTTTGCAACTTGCTTGACCAAGGAGGAAAGGATAGTTTGGAGGTGGCAGTGTGCTACGAAGCTTCTCAAAACTCACCC AGGGCTTTCTGGGCTTTCCGTAGATTGGGTTTGCTGCAGCTTCATCAAAACAAATGGCCTGAAGCTGTTCAAAGTCTTCAACATGCCATACGAGGCTATC CCACTTCTCCTCATTTGTGGGAAGCTTTGGGCCTTGCTTATCACCGGCTCGGCAGGTTTACTGCTGCTCTAAAGTCTTATGCCCGAGCCATTGAATTGGA 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GAATGGAACCTGTTTCAGGATATTGTCTATGTATCACTTCTATTGTCTATTCAGGATGAGAAACGTCTAAGCAAGTTGTTACCAATGTTGTAATTGTAAT AGTTAACTAAGGCATGAATCAATTGAAAATAATTTTATAGTGAACAAGAAAGAAAAAGTAAATAATGTGCTTATTTCAAGGGTAAAATTTACTATTTGCT CTTTACAGAGGCACATCAAAATATTTATAATCCTTTTACCTAGAAGAGAGAATTTTGTTATTTATGTGAAATTATGTCACTTTGTATTGCATTTATATTA ATTTAAAATGTGAAATTATGGGCATGGGGTCATAGTTTGAAGCATGATGAAGACGCTAGGTAAATGTAAGAACTAAGAAGTAACATAGATGAGCATGAGA AAGGTACGTGATTCTTGTAAACAATATACATTAATAGTATATGAATTTTAGACAAAATGGTTGTTTGGAGAATCTAAAGGAGAGATATAATGATAAGGAT AATTAAGAAAAATAAAATGTGTTATATGAGAAAAGATGTATGTTTATTTTGTGTGGTTGTTGTTGTTGAGTTGTGTAAGTAGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_35026; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_181184
Blastp | Tetratricopeptide repeat protein SKI3 from Arabidopsis with 57.88% of identity |
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Blastx | Tetratricopeptide repeat protein SKI3 from Arabidopsis with 60.65% of identity |
Eggnog | Tetratricopeptide repeat domain 37(ENOG410ZG1H) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G76630) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423132.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |