Id Trinity | FTRINITY_DN53624_c7_g1_i13 |
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Name Transcript | Ll_transcript_263610 |
Sequence | CCCACATCGCCTACCTCATTCTTTCGGCGATGGTTTAAATACCTGTTGGGCTACTCCTCTCATTGTTAATTGGTTTTGAGATAGAACCTTAACAGTAGGA ATTTCTAATTTTGTAATTTTCATGCTTTATGTCCTCAAATTCATCCATATTTATTGTACTTTTCTGTATATTTTGTTCTTCAAATGACAAATAGATTTTC CTATGTGGTTGAGGATTTGATTAAGTTGAGGATATCAAAATTAAGTTACATATACTAACTTGGATAATTTGATTAAGATCCCTTGGAAAAGCACATAGGA AACTTAATCTTGGTTAATGGGAGTTCAAATTTCTTTAGTATTGTTCTTGTTGGGAGTGTTGAGTTAGGGAGACACTCCTCTGAAATACAATTTTCATTTT CGAGTTTAATGTGTGTAAATTTAAAGAGCGTAAATTTGTTAATCCGTAAATTCATTAACCGGGTATGATGATTGTAACCATTCATCATTTTCAATAGTTT ACATTGAGCAATTTAAGCAAAATGTACTTTCCATGAGGCACCCCAATTTAATTAAAATTGATCTTTAGGATATGTTTTGGATTTGATTACTAGTGATGTT ATAGGTAAAATTCTTTTCTTTTTCAATTCTCACTTTCAAAATGTCAAACAATGCAGAATCTATCTTTTGCAGTGTATAATTAATTGTAGGTCAAAACTGA GGCCAACCTGCAGAATGAACATTTATCTATCTCCAACCACCTAGTCCTACCAACTTTATGAGATGTATTCAAATCAATATATCCAAATTAATATGGTTGA TGTGGTGGAATGTTAGGATTCAATTGCTAAGTATGGGACTCGTCACGTATATTCCATTGCTGGAGGGTCCAGTACAACAGACGATCTCGATTCAACTTAG AGAATATTTTTTCTATTTATATAATTTTTTTGGGTCTGTCATGGCTAGCTTTTGTAGGGTGGTTTTCCGAATGTTCGTATCAATTGGTATTAGAGCTTTT CGCCGTATCTATGAGGTGCAAATAAGCTGTGTAGATGCTAACATCAGAATTGCAGTATTCACCTATGAACTAGCCAAAGGGCTAGTGCACAACCAACCCA TGTTAGGATCCAATTGCAATGTATGGGACTTGAGTTTCACATCCAAAGTATGAGACTCTTGTGTGGGATTTATATGGCTTTAGGCTTTTTACCACAATGT GTGATTTATTTGTGTAAGGTTGGTTTCATTGTGATCTACAGTGATTGCAACCAGAACATTTAGCTATAACGCATTGAGATCAGCAACCGGAGATTTTCAT CCTTCAAGCAAAATTGGTGGAGGAGGTTATGGAGTTGTCTACAAGGGATCTTTAAGGGATGGTACTCAAGTTGCTATTAAGTCTCTTTCTGTGGACTCTA AACAAGGAAGCCATGAATTCATGACAGAAATTAATATGATATCAAATATACATCATCCGAATCTGGTAGAGCTAATTGGCTGTTGCGTTGAGGGTAGTCA CCGAATATTGGTCTACGAGTTTCTGGAGAACAATAGCCTTGCCAATTCCTTGCTTGGTAAGTATCCATTACTTGCAGGTGACTCTTATTTGAGTTGGATG CTTATTCACCCTTTTTCATTTTTGAAATGCTTTATCTTCATATTGTATGTTTGTTTACGATTTCGGAACACCTCAAACAATACTTGATAAGGAGAATTTT TTCCTCTCCCCAAATTGGACGGTTAGCATATAAGATCATACTAATAAACTCCAACCTGGTGGGTTCTAGGAAAGGTAGATGTATGCAGCCTTACCGCACA AGTGGAGAGGTTGTTTTCGGATGAATTGGGCAATTGCCTATGCTAATACAGAGACAAAATTTTACAGGTTCCCGGAGTAAATATATTCCTCTGGATTGGC CTAAGAGAGCTGCTATATGCCATGGCACAGCTTCCGGCCTTAGGTTTCTTCATGAAGAGGCTCAACCAAACATTGTTCACAGAGATATCAAGGCCAGTAA CATACTTCTGGACCGGAACTTTAATCCTAAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAACTTTTTCCTGACAATGTCACCCATGTTAGTACTCGCGTTGCAGGC ACGGTGTAAGCACATATGCGCAACTTATATTAATGTTTTGGAAGTTAGTTTAGTCTTCAAAAAATTTGTGAACTTATTCTACTTCCATAGTCCATCTTAA GACAGATTTTGATAGGAAGAAAAAATATCAGTAGCACATATATTCCATAGGTTCTTATGAATCCTTATGAGTTATGACTATGCACTTTTGTTCTTCTAGT TCTAACATCATGAAATCACTTTCAGACTTTAGTATTGTCTAATATAGTATAATATGCTCCAAAATTCACATCAATGTAATAGTTCACTCATCTTAACATG CACTGCTGCTATCTCTATTTTCATTATTGAAATATTTAATCATTACATTTTAATTTTGAAACATTAAGAAACAATGTCAAGTAATTTATTTGACAACAAT AATATGCTCTGAGATGCAATGTTTTCGCGAAACGCAAGAGAATAGAGAAAGAAAAGTTGACAACTAAAAACTGTTCAAAATCTCCTATATTTTTCGGGCT TATTTAGAACCTTTTGAGATGTATATAGGCCATAAACATTTGATGCTGCTCAGAAATTCATTAGCATAGATACATCCTTAGTTTTTTGTTTGAGATTTTG TCTTAACTCTTAACATACAAATGATGTTTATTTGTTCTTTGTGAAGAGGATATCTTGCACCAGAGTATGCACTTCTAGGACAGCTTACAAAGAAGGCTGA TGTATATAGTTTTGGGGTTCTTATGCTTGAAATAATCAGTGGTAAAAGTAGTAGCAAAGCAGCATTTGGAGATAATCTCTTGGTTCTTGTAGAATGGGTA CATTTTTTGGATTCTTGGGTCACAATAATATTGATTCAATACATGCTATGATCTTATATTAACTTCTTTAATTGCCTTAGACATATACAGATAAATTAAA GTCACAAATTATCAGAAGCAGAATTATATTCTTATCTTGATAATAGGAGACCAGTATCATTGTAAAGTTGAAATTTTTTAAGGCTTCTAATGAATAATAT CATGTATTTTCACTCTGATTCTTAACACTTATATTGTATTGAAAACTCATCCATGATTTTGTTTCACTCTGATTCTTAACACTTACAAGTTATACCAAAC TAACCATGAATACAAACAAGGCGTTGGTCTAGTGGTTTAAAGCCCTGCTTCGGTTCCTGGAGCGAAACTTGTTGGAATGAGCAGTCACGCACCCCGAAAG GAATTAGTTCCTTACCCATACGGCATGGAAGCTGAAAGAAGAAGAAAGGCTTCTGGACATCGTAGACCCGGAACTAACCGATTACAACGAGATCGAAGTG TATAGGTTCATCATGGTTGCTCTATTTTGCACCCAAGCAGCTTCTCAGCACAGACCAAGCATGAAGCAAGTATTGCAAATGCTTTCCAAAGAAGTTCATA TGAATGAGAAAGCATTGACTGAGCCTGGAATATATAGATGGCATTCCTCTGCAAAGATGAACACTTCTTTGAATGAATCTTCATCATCTTCTTCTTCTCA AGTAGTGAAGCACAACAAATATGAAAATCCATATGTAACTTCAAACAACTTGAGTGGTACAGATATTGTGACAGAGATGATTCCTAGATGATTGTTTGTT ACATATGATGTTTGGTTCATATTAGTAGGATGTTGGATAGGCTATATCTTAAGATACACTCCTATCTTTTCTTTATCTTGTTTCAGAGGCCGAGTCTCGG TGCAACTATAAGGTTGTTGCCTCCTTATGACATATAGGTCATGTGTACATGTGACGTAGAAGCAATATCTTCATTTACGGAAAAAAGGTTGTGTATATTT ATCCTTTATATATCCTTCTTCCACCATGCAAAAGCCTCGTATAGTTAGAGGCGGAGGTTGGAAGGGACAGGTGGGGGCAGCTGCCTCCGTGATTTTTTTT TAATTTATATATATATATATTTTTTATCCTTTGAGAACACGTCTGTTATCTTATAAAGTGTGTGTCACTTCATATGCAATATATTTTATTTGGCTATAAA AA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_35365; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_263610
Blastp | - |
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Blastx | Cold-responsive protein kinase 1 from Arabidopsis with 68.92% of identity |
Eggnog | Serine Threonine protein kinase(COG0515) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G16670) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462412.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |