Ll_transcript_263046

Id TrinityFTRINITY_DN53632_c0_g1_i23
Name TranscriptLl_transcript_263046
SequenceACTCTTTTGAGCCACCTGCCCCTTTCTTATTCTTCATCCCCATCAAAGGTATAACCCACTATCTTTACTTTCCAAATTTCAATTCTTTTACAATTAGGTC TCAATTGCCCCAACTTAATTCAAACTTTTATTTCACCCCCGCTTTCATTTTTTAATCTTTGCGCCTCTATTTGGTTTTGATTCTCAAGCTGCTGTTGTGT ATATATATATATAATGTTTACAGAGGGGCTATCTAGTTTGTTTTTTTCTTCAGTTTTTCCTTTTTAATCTTAGTATTTTACGAATTAAACTGTTTCTTTC TGTGGTTAAGAATTCAGGGCTAACTAAGATTTTTGTGTATAGGTTGTTTTGAACTTTTGATGCTAAGTTAGATGGCACTGCAAGGGAAACAATAAAAATG GAATTTTGAGTATTGAATAGGTTGATTCATGATGATTTTGTTTCAGTTTAGCTATTAACACAACAGTAGTTGATTTGTGCCGAAAACTTCTACACACAAT CTTCCACCAGATGTTTAGACATAATCAGATATGCAGGAAGCTAAGATTATCAAAGTCGATTTTCACCACTTCATCTGTATAGACGATATTGAATTGTGTT CAAGTCTGCAATAGTATAAAATATTGTTTCTACACGTCCTTCGGCTGCTTGTGAGACCCCTTGGCTATCCATTTGGATACTATGATGGCTCTTCCCGGCT CTTTGCAGATGTCCCATGGACTGGGACTTTGCTATAATATGGGCTGCAATAAACACCCGGGGGCAACAGGAAGAGGAAAGATATATTTATTGAGTGCAGG TCCTTCATATCCTGTTTCGTTCATGAAACAGGGTTGCTGGGGTTTCCAACACTTCCATCAAATAGGCAGGCCGACACGTACATTATCTTATAAATCTCGC TCTTTTAGGTGCCATTCTTTTTTAGTGCCAGGCCAACCAAGTGAGCTACCTGTTGTCAAGGTGGCTGCTACCATGTTGGTGAGGTCCTATAATACGCTAC AAAGCAGTCCTGTCGTAGTAAAGTTGATTCCTGCAGTTGGTATTATCATTTTTGCACTGTGGGGTTTAGGCCCATTTATGTGTCAGACAAGGAAACTTTT TTTTCAGAGGAGTGATAATGGTTGGAAGAAGAGTACCACACATTATATAGTAACTTCTTACATTCGGCCATTACTGTTATGGACTGGAGCAATACTTATT TGCAGAGCATTGGAGCCAGTAGTTCTACCTACAGAAACTGGCCAGGTTGTTAAGGAAAGGCTTTTGCACTTTGTAAGATCATTGTCAACTGTACTGGCCT TCGCCTATTGTTTATCAAGGTAAGCCTATTTCCTTGCCTTCACATGATCTCTAGAAACTGGTCAGGGTGTTGGTCTCTTGAGTTAATGATGCACTTAATA ACCTCCATTTGAAATAATTTGTGCTTAAACTCTTGGTTTTTCTTCCTTTTTTATTAGAGAATTCAACTATCATCACAAACTGTGATTCCTTGAATATTTA GTTTCACTTTTTCTTATATTCTTTATTGGACCCTTCACCTGTATTTTTTATGAAACAACATTTTTGTAGCTAGCTTGAGTACTTCAATCTGATTTTTAAT TCCTTACAGTGATTACTAAGTTTTACTTCCATATGTGCAATACTCTTCTGCAGTGTGATTCAACAAGCACAGAAATTCTTAATGGATAACACTGATGCAA GTGAGACAAGAAATGTATGTATGTTTTCTTTATGTAACGGAAACTAACATTCTCTTCAAAAAAAGAAACTACTGTTATAGTCTAGTTTGAAGTTCAAACA TGAAAAATATACTATCAATTCCATTTATTACCCTTCCACTGTCATAAATTTAATTGCTAGAATGTCTCAGTTAAAGTTTGATATTCGGACCAATTAGCTG GCAATATTGGGCAAAATGGCCAAGTAGATGGTGTGTAATTTTTCAGCTTTTGGATAACAATTTCTCCTTATCAATCTACTAGGTCAATTTTTATTTGCAG GAAATCTTTTGAACTGGTAGTACTTGAGTACACGAGGGCTATATAATTTGCATGTTTATTGGCTAAAGGCATTCATTATGGTCGTGCATGTATTTATATA ATACTCATTTATGGAAGACACATAGCTTGGCAACTGCAATGTAGTGAAGAGAATACTTATGGGATTCCAATTTGCAGGCAAAGCTGTTTACTCTGCAGTA TGGATTGCTGCTTTTTCACTGTTCATGGAATTGCTGGGCTTCTCTACCCAGAAATGGGTGACTGCAGGAGGTCTTGGGACAGTTCTGTTGACTCTCGCTG GTCGTGAGATATTTACAAATTTCCTTTCGAGTGCGATGATTCATGCAACTCGACCTTTTGTGGTTAATGAATGGATTCAAACAAAGATCGAAGGATATGA GGTTTCCGGTACTGTTGAGCATGTTGGGTGGTGGTCACCAACAATTATAAGAGGTGAAGACCGTGAAGCTATCCATATTCCAAACCACAAATTTACAGTT AATGTTGTACGAAACCTCAGCCAGAAAACACATTGGCGGGTCAAAACCCACTTAGCCATTAGTCATTTGGATGTAAATAAGATTAATAACATAGTTGCTG ACATGCGGAAAGTATTATCCAAAAATCCTCAAGTTGAGCAGCAGAGGTTGCATAGGAGAGTATTTTTGGAAAACATAAATCCTGAAAATCAGGCTCTTTT GGTTAGTATTAAATGGCTAGAATATCGTGCAATTCAATGATTCTGTGATTGTTGACAGGGATCTTAAATGAGATTTTATTCTTTGTTCCTCTTTTCTTTA AGTAGATCCTTGTGCCGTAAACAAGATAGAGGCAAGCATATTATGTATTAGTCTATGCTTGCATATATTTATATATAAGGTGTAATGTTTTTTCTATTAT TTTCACAGATTCTGGTGTCTTGTTTTGTCAAGACCTCACATATTGAAGAATATTTGTGTGTTAAGGTAAGAATACTTCCTTATTCATCTACAAGATGCCA TGTCATGTGATGCTGCCCTCACACAGTCATAATTCAAAACTGAGAAATAGAGCTTTGTAAACTAGTGCTAGAATTCTGTCAATTAAATAAAGCAAGAACT TCTTGTGCGAAGCTCTTTCAGAAGTTAAAAAATTCATCATAAATATATTTGAGTAGAAGCTCATGAATAATTCCCCTTCCGTGTCCATTGTGTTGAGGCA TGCAATCAACTTTTTTAATCTTATATTCTTGCTTGCTTAGTCTTTTGTATGCTTTAAGTCTATGTTTTAGTTTGTGATATTTCAGCAGTGGATCAATTTT GAAAATAAAATAAAAGATCCTAGGTACTTTGTATTTTGATGATGCAGCTGAATTATCCTAATTTTTGTTAGTGGATTATATTCTTTTAGAAACTTGTTTC GTGTATATGAGACTCCATTTATGTTTATGCATTTGATTGGCTGTGAGATAAATATTTCATAAGCTGATTCTTGTTCTGTAGAATGTCCTCATATTTTAGT GATATTGCTCAATAATCATTAAGCTGATTTTCCATGCATTGATTCTGAAAATTAGGAGGCTATACTATTGGATCTTCTCAGAGTTATTGGACATCATGGA GCCCGACTTGCAACACCAATTCGTACCTTGCAGAAAACATACCGTGGTGCTGCTGACTTGGAGAACATACCATTTGCAGATTCCACATTCAGTGGTAATG GACCAGTATCTAACCGGCCATTATTAATGATTGAATCCGCTTACAAGATCAGTGCAGATGATAAGATGAAAAGTCGGTCAGCACGCCCAGCTGGTGACCA AGATAACAAAACAACTGTTCGAACCAAACCTGACAGCAAGACAGACACCAAGGTTAGTGACTCTGAGGTGGGCATGCCAGAAGAAATGTCCTTCTCTCAG AAAGACATCAATGTCAAACAATCTAAGAGTCAGACAACTAACAATGTCAATCCAAACATTGACACTAACAACATCGTTTCCTCGTCGTTGACGAGCACTG ATGACGGTGGACTTCCTACGATCATGTCAACAAAACAACAAGGGGAAAAGAAACCAGCTTCACAGTCTCATGCTTCCAACAGGCCTGTTCTTGAAGAGAA TATAGTGCTAGGTGTTGCATTGGATGGATCAAAGAGGACCCTTCCTATTGATGAAGGGATTGATAATGCTGCTACAACTCGCGAGGCAAAGGAAATGGCT GCATGTCAAGGTGGAAATGGATCTCCAAAGGGTACAGATGGGAATGACAAGATTGCAATTGCTCCAACCTCAAAGTGATGTTGTAATCACTAACGAGTGA GTTTAATTAGTTAGTAATTTGAAGGTTGTGTTCCAGAATCCACACCCATGATGTTGTATATATTATAACTTCCTTTGTCATACACCATTCATTACGCCCT TCTTACAACCATATTGTTTCATTAATTTGGTTGTGTTCATTATAACTTCCTTTGTCATACATTTTATTAAGTATTTATGTTCCCTATTCATTAAATGAGT TCATTTTCTGTCCATCTTAAAGTTGTGTTTTTTTGTCCTCCTTATTAATCTAGGTGATCATGAATCATTGGAGTAAAATTTAACATTTAGAGATTAG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_35431; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_263046

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_263046

BlastpMechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 38.76% of identity
BlastxMechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 90.76% of identity
EggnogMechanosensitive ion channel(COG0668)
KeggLink to kegg annotations (AT5G10490)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019421403.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;