Id Trinity | FTRINITY_DN53632_c0_g1_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_263030 |
Sequence | ACTCTTTTGAGCCACCTGCCCCTTTCTTATTCTTCATCCCCATCAAAGGTATAACCCACTATCTTTACTTTCCAAATTTCAATTCTTTTACAATTAGGTC TCAATTGCCCCAACTTAATTCAAACTTTTATTTCACCCCCGCTTTCATTTTTTAATCTTTGCGCCTCTATTTGGTTTTGATTCTCAAGCTGCTGTTGTGT ATATATATATATAATGTTTACAGAGGGGCTATCTAGTTTGTTTTTTTCTTCAGTTTTTCCTTTTTAATCTTAGTATTTTACGAATTAAACTGTTTCTTTC TGTGGTTAAGAATTCAGGGCTAACTAAGATTTTTGTGTATAGGTTGTTTTGAACTTTTGATGCTAAGTTAGATGGCACTGCAAGGGAAACAATAAAAATG GAATTTTGAGTATTGAATAGGTTGATTCATGATGATTTTGTTTCAGTTTAGCTATTAACACAACAGTAGTTGATTTGTGCCGAAAACTTCTACACACAAT CTTCCACCAGATGTTTAGACATAATCAGATATGCAGGTTTATATTATATGTGTTGTGATCAGATTTCGGTCATTCGGGAGTCTGGAGATATACAATTTTT CCACCCTTCTAGAATTAAGGCCCATAAAGAAAAACTAAAAATGTACATATTTGATATCCTAACCTTTGACGCTTTCATAATTATTATCAGTTTAACCGCA GGAAGCTAAGATTATCAAAGTCGATTTTCACCACTTCATCTGTATAGACGATATTGAATTGTGTTCAAGTCTGCAATAGTATAAAATATTGTTTCTACAC GTCCTTCGGCTGCTTGTGAGACCCCTTGGCTATCCATTTGGATACTATGATGGCTCTTCCCGGCTCTTTGCAGATGTCCCATGGACTGGGACTTTGCTAT AATATGGGCTGCAATAAACACCCGGGGGCAACAGGAAGAGGAAAGATATATTTATTGAGTGCAGGTCCTTCATATCCTGTTTCGTTCATGAAACAGGGTT GCTGGGGTTTCCAACACTTCCATCAAATAGGCAGGCCGACACGTACATTATCTTATAAATCTCGCTCTTTTAGGTGCCATTCTTTTTTAGTGCCAGGCCA ACCAAGTGAGCTACCTGTTGTCAAGGTGGCTGCTACCATGTTGGTGAGGTCCTATAATACGCTACAAAGCAGTCCTGTCGTAGTAAAGTTGATTCCTGCA GTTGGTATTATCATTTTTGCACTGTGGGGTTTAGGCCCATTTATGTGTCAGACAAGGAAACTTTTTTTTCAGAGGAGTGATAATGGTTGGAAGAAGAGTA CCACACATTATATAGTAACTTCTTACATTCGGCCATTACTGTTATGGACTGGAGCAATACTTATTTGCAGAGCATTGGAGCCAGTAGTTCTACCTACAGA AACTGGCCAGGTTGTTAAGGAAAGGCTTTTGCACTTTGTAAGATCATTGTCAACTGTACTGGCCTTCGCCTATTGTTTATCAAGTGTGATTCAACAAGCA CAGAAATTCTTAATGGATAACACTGATGCAAGTGAGACAAGAAATGTATGTATGTTTTCTTTATGTAACGGAAACTAACATTCTCTTCAAAAAAAGAAAC TACTGTTATAGTCTAGTTTGAAGTTCAAACATGAAAAATATACTATCAATTCCATTTATTACCCTTCCACTGTCATAAATTTAATTGCTAGAATGTCTCA GTTAAAGTTTGATATTCGGACCAATTAGCTGGCAATATTGGGCAAAATGGCCAAGTAGATGGTGTGTAATTTTTCAGCTTTTGGATAACAATTTCTCCTT ATCAATCTACTAGGTCAATTTTTATTTGCAGGAAATCTTTTGAACTGGTAGTACTTGAGTACACGAGGGCTATATAATTTGCATGTTTATTGGCTAAAGG CATTCATTATGGTCGTGCATGTATTTATATAATACTCATTTATGGAAGACACATAGCTTGGCAACTGCAATGTAGTGAAGAGAATACTTATGGGATTCCA ATTTGCAGGCAAAGCTGTTTACTCTGCAGTATGGATTGCTGCTTTTTCACTGTTCATGGAATTGCTGGGCTTCTCTACCCAGAAATGGGTGACTGCAGGA GGTCTTGGGACAGTTCTGTTGACTCTCGCTGGTCGTGAGATATTTACAAATTTCCTTTCGAGTGCGATGATTCATGCAACTCGACCTTTTGTGGTTAATG AATGGATTCAAACAAAGATCGAAGGATATGAGGTTTCCGGTACTGTTGAGCATGTTGGGTGGTGGTCACCAACAATTATAAGAGGTGAAGACCGTGAAGC TATCCATATTCCAAACCACAAATTTACAGTTAATGTTGTACGAAACCTCAGCCAGAAAACACATTGGCGGGTCAAAACCCACTTAGCCATTAGTCATTTG GATGTAAATAAGATTAATGTGAGTAGTAGTGTTGTTCTTTATATTTAACTGGCTTTTCACGATAGTTCTGCCTTTTAGATAATTTTCCCTGTAACAGTTG GTTTGGTGCTTCTGCAGAACATAGTTGCTGACATGCGGAAAGTATTATCCAAAAATCCTCAAGTTGAGCAGCAGAGGTTGCATAGGAGAGTATTTTTGGA AAACATAAATCCTGAAAATCAGGCTCTTTTGGTTAGTATTAAATGGCTAGAATATCGTGCAATTCAATGATTCTGTGATTGTTGACAGGGATCTTAAATG AGATTTTATTCTTTGTTCCTCTTTTCTTTAAGTAGATCCTTGTGCCGTAAACAAGATAGAGGCAAGCATATTATGTATTAGTCTATGCTTGCATATATTT ATATATAAGGTGTAATGTTTTTTCTATTATTTTCACAGATTCTGGTGTCTTGTTTTGTCAAGACCTCACATATTGAAGAATATTTGTGTGTTAAGGTAAG AATACTTCCTTATTCATCTACAAGATGCCATGTCATGTGATGCTGCCCTCACACAGTCATAATTCAAAACTGAGAAATAGAGCTTTGTAAACTAGTGCTA GAATTCTGTCAATTAAATAAAGCAAGAACTTCTTGTGCGAAGCTCTTTCAGAAGTTAAAAAATTCATCATAAATATATTTGAGTAGAAGCTCATGAATAA TTCCCCTTCCGTGTCCATTGTGTTGAGGCATGCAATCAACTTTTTTAATCTTATATTCTTGCTTGCTTAGTCTTTTGTATGCTTTAAGTCTATGTTTTAG TTTGTGATATTTCAGCAGTGGATCAATTTTGAAAATAAAATAAAAGATCCTAGGTACTTTGTATTTTGATGATGCAGCTGAATTATCCTAATTTTTGTTA GTGGATTATATTCTTTTAGAAACTTGTTTCGTGTATATGAGACTCCATTTATGTTTATGCATTTGATTGGCTGTGAGATAAATATTTCATAAGCTGATTC TTGTTCTGTAGAATGTCCTCATATTTTAGTGATATTGCTCAATAATCATTAAGCTGATTTTCCATGCATTGATTCTGAAAATTAGGAGGCTATACTATTG GATCTTCTCAGAGTTATTGGACATCATGGAGCCCGACTTGCAACACCAATTCGTACCTTGCAGAAAACATACCGTGGTGCTGCTGACTTGGAGAACATAC CATTTGCAGATTCCACATTCAGTGGTAATGGACCAGTATCTAACCGGCCATTATTAATGATTGAATCCGCTTACAAGATCAGTGCAGATGATAAGATGAA AAGTCGGTCAGCACGCCCAGCTGGTGACCAAGATAACAAAACAACTGTTCGAACCAAACCTGACAGCAAGACAGACACCAAGGTTAGTGACTCTGAGGTG GGCATGCCAGAAGAAATGTCCTTCTCTCAGAAAGACATCAATGTCAAACAATCTAAGAGTCAGACAACTAACAATGTCAATCCAAACATTGACACTAACA ACATCGTTTCCTCGTCGTTGACGAGCACTGATGACGGTGGACTTCCTACGATCATGTCAACAAAACAACAAGGGGAAAAGAAACCAGCTTCACAGTCTCA TGCTTCCAACAGGCCTGTTCTTGAAGAGAATATAGTGCTAGGTGTTGCATTGGATGGATCAAAGAGGACCCTTCCTATTGATGAAGGGATTGATAATGCT GCTACAACTCGCGAGGCAAAGGAAATGGCTGCATGTCAAGGTGGAAATGGATCTCCAAAGGGTACAGATGGGAATGACAAGATTGCAATTGCTCCAACCT CAAAGTGATGTTGTAATCACTAACGAGTGAGTTTAATTAGTTAGTAATTTGAAGGTTGTGTTCCAGAATCCACACCCATGATGTTGTATATATTATAACT TCCTTTGTCATACACCATTCATTACGCCCTTCTTACAACCATATTGTTTCATTAATTTGGTTGTGTTCATTATAACTTCCTTTGTCATACATTTTATTAA GTATTTATGTTCCCTATTCATTAAATGAGTTCATTTTCTGTCCATCTTAAAGTTGTGTTTTTTTGTCCTCCTTATTAATCTAGGTGATCATGAATCATTG GAGTAAAATTTAACATTTAGAGATTAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_35431; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_263030
Blastp | Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 38.76% of identity |
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Blastx | Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 76.96% of identity |
Eggnog | Mechanosensitive ion channel(COG0668) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G10490) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421403.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |