Id Trinity | FTRINITY_DN53675_c2_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_263295 |
Sequence | GTTTGCTTTTTTCGTCCCCATCGAATATGAAAGTCTACCTGATTTCTGTTCTGATTGTCTCTCTATTGGGCATCAGCTTTCGGCTTGCAGGAAAGCAAAG AAGAAGGTAGCATACGAGGAGGCACCAAAGAGGGCAACAATGGAACCAAAAAGAACCACGGTTGAACCTATAGTCCCTGCAACTATGGTGAGTGATCTTT TTATCAACTTGGAAATTGAGGAAAATGTCAACACAGAGGGATTGGTGAAAGTTTATTGCTTGCCATTGAGAGGTTGCAACTCTCAAATTCCTATTAAGGT GGAACAAAATGGGGAAGATATGGCAGTTGAAAATGTTCTATTAGATGTCATTCAAGGAAGATGAATATATAACTAATCCTGTGGTAGTCAGCGATATGCG ACTAATAGGAAGGTTATGGGATGATGATGACCTTGCTGAAGAGGTGGAAGATGAGGATAGCTTCACCCCAGTTTTGAGCAAATCACAAAAGAAAAAGCTG AGGAAAAAAGCTAGTAATGACAGAACCTACTATACTCGGAGGGGTGGTCTTGTTAATCCTGATAAATGAAGATTCTCTATTGGAATTGCCGGGGATTTGG AAACCTTAGAACAAGGTTAGTGTTTAAGAATTTTTGTTTAGCCAATAAACCAGATTTGGTTATTCTCTCTAAGCCCAAAATCTACTTTAACTCAATCCAT TCTAATTTTTGGGAAGTTGTCAATTTAAAATTGTTTGCTAGCAATGACTGTGGTAATAGGGTGCAGGGTTGTGCATTAACAACTTAAATCCTTTTGTTCT TGGTTTCTCTGAGCAGTTTATTGCTTTCTCTATACCAGCTACATCATTCGTAGAGTGCTTTGGAGTGACATACAATCTCTTATGATAGCTCATCAGGGTG CTTGATCTCTAATGAGTGCAGAGGTATGAGAAGCCCTACTAATTGCCTTCAGATGAGTTTAAAGATTTCTCCGATGACACTAATCTCATTCACTTACCTA CCACTGGTGCTCTTTTCACTTGGACCAAAAAAAGAAGGGGTAATGCCCTCATTGAGAAAAGACTTGATAGAGTTCTTTGCAATGAAAACTGGATTTCTGA GTGGCAATAGGTTGCTTGTTGCACTTTGCCTAGAATCAACTCTGATCATCACCCCTTATTGTTTTGTTCCAACACTTATGATGTTTCAAGACCTAGACAG TCCAGGTTTAAAAAAATGTGGGTTTCTCATAGTGACTACAGAAGATTAATCAGGGGTATTTGGATCTCGGAGGTTATAATCTACCCAATGTATGTCCTAA CACAAAAGCTCAAGACTCTTAAGAGTTAATTGAAGAATTGGAATAAGAATATGTTTGGAGATCTGCATCAAAGAGTATCCCTGGCAAGGGCTAGTGTTGA GGCAATTCAAACTTGTATTCAGGAAACTAAGCCTAATCAGAACTTACAAGATCAAGAGGACTTAGCTCAGCCTGAGTTGATGCAGGCTTTGATGTTGGAA GGAAAAATCTAGAATTAATTGGCACTCCTTTAGAGACAGGAACACTATTTTTTTTTCACAAAGTTGCCAAGATTAAATCAGTGGCAAATTCAATTTCTTT CTTAAAGCATGGGGATAGATTTCTTGAGTCTCAAGTTGACATTGCTGGTCATGTGCTCAACCACTTCACTGAGTTGTTTGGTACTATGGATAACACAATT TCTAATGGTTTAATAAATGAAGTTGTTCCTCATCTAGTCACTAGAGAGGATAACTTGATGATGATTGTTATTCCTTCTAAGGATGATTGTTATCTTTTGT AAGGGTTCTAAAAAGAACTACAATGTTTAAAAACTTTGGTGATGAACTATGCTCAAGCCTCTGGGAAGCAAATTAGCACCAACAAATGTAAGTTCTACAC AGCTAATGGCTCGTCTAGATACAGGAAAAGAATCAGCAATTTGTTGGGTTTTGCAGTAGGTAATTTGCCTTTCTACTACTTAGGTGTGCCTCTATCTAAA GGCAGACCTAAGAATTGTCATATGCAGCCTATTGCTGATAGCATCCTGCGGAAAATGACTTCTTGGAAAGTCTCATCTCTTTCAATTATGGGAAGGGTTG AACTTATTAAATCAATTATTCAAAGTATGCTGCTTTATAGTTTCCATATCTATAAGTGGCCAAGTCAGCTTTTGAAGACTTTGGATTCTAAAATCAAAAA CTTCATTTGGTCTGGCAATACGGAAACTAGGAAATTGCTAACTATGGCTTGGAGTACAGTGTGCACAAACCAAAATGAAGGGGTCTTGACATCAGATCTA TAAGTGGCATAAACAAAGATGCTCTTTTGAAGTTAACCTGGGATATGATTACTTCCAACCAAGATTGAGTAAAGTTCTACAAGGAGAGATTTGGCTGCTC TAAAGTTGATTCCTCTAGATATTTCTTGTTTTCTTTATGGACTAGAATAAAAGATAATTAGAACTTTGTTGTTCAGAACTCTTTTTGGTTAGTGGATGAT GGTAAAAATATAAACTTTTGGCATGGCAATTGGATGGGTGAAGCTTTAGTGGACTACTTAGAAATCCCTGCTGAAATTCATGACCGAGTCTATGCAAAGG TTTCCGACTTCATTGTTGGCAACAATTGGTCCATTCCTAGGCAACTAACGATTTCTTTCCCTGAGCTTAGTAGTAAAATAGCTAGCTTCCTAGTCTACAA CTTCAAAGATAACCTAGTTTGGTAAAAAAAAAACAGATGACGATTTGCTTGATTTGAAAAGTGATTTTTCTAGCCTTCAGTTTGGGCATTCTAGTAATAG CTGGTGCAGAAAATTATGGAATGCTTTCATTCCTCCCTCAAACTTGATGAAGAGAGGTTGCAACATGCTTTCATTCCACAATAAGCTGCCCAGTGATGAA AACTTGATGAAGAGAGGTTGCAACATGGTTTCTCGCTGCAACCTTTGTGGCAACAACTTCGAAATAAGAGAACATTTGCTTTTGTCCTACACTTTTGCAA TATACCTATGGAATTGGTTAGCTAATTTGCTATCTATCAAAATCAACCTGAGTTCTTTTCAAAATATTTTCCTGGTCTGCAGAAATGATGACATATCGCA ATGGAATGATGTTACTTTGGCTGTCATAATCCACACCATCAATTTTATATGGTTCTGACGAAATCAGCGTAGGTTCAATGATAAAAAAATCTCTCTACAA CAAGCCACTTCTCAGATCAGCAGAGACATTGCTCTATCTGGTAATGGATCCAAGTCTTCTGTTAAGTCATCCATCAGGGAGTTTGTGACTTTGAAAAAGT TGCAAATTAATCCAAACCTGAACAAGGCGCCTAGGATGGTTGAGGTTATCTGGAAGGCTCCAAGTGTGGACTGGATCAAGGTGAGCACAGATGGTGCAAC GCATGGTTCTCTCGGTCATGCAGGGAGTGAGGGATTTTTAGAAATTGTCATGGCGAGTTCATTGCTTCCTTCTTTGCCTATCTTCATATCTAATCGTCCC TTTTTGCTGAGATTCATGCCGCCATTTATGTGGTTGAGATTGCTTTTCATAAAGGTTGGTTTAATCTGTGGCTCGAATGCGATTCTACAACGGTTGTGGC GATTTTCAATGGGAACCATGTGGTGTCATGGAAGCTTTAGAATAGATGGGTTATTTGCAAATGAAAATTGGCTTCAATGAACTTTAAAATTTCTCATATA TTCAGAGAGGGTAACATTTGTGCGGATAAGCTAGCTAACTATAGTGTAGCTACTAGAACAGACAAATGGTGGAATGTTTTCCGTGACTTTATTAGAGAGG AGTTACATAGAAATGCTATGGAACTTCCTAACTATAGGTTTAGGAACTTGTAATTGGTCCTTTTGTTTTCATTAATAGAGTGGTGTTGTAGCACCTTCAT TTTAAAAAAAAGATAACAAATTATATTGATGAAAATTTATAAAATAATAAATATTAGCTCATTTTCCATCCATTTATCCTTTACCTAATTACTTTAGAGT ATTCATACCCATTTATTATAATGGGCTTATATTTTAATATACTGAAATGTTTGATTTTATTGTAATTGTGTTAATTTGTGAAGGACTACGTTTATTCAAA GACATTGGCAGAGAAATATATTTTGAGTTATAGGAAGAATGAAAATGGTGAAGGATTAGAGGTAGTAACCCTACCTTGTGGGCTTGTGGGAGGGGATACC CTTCAATCTTTCACACCAGGAAGTGTTGGAGTTCTTATCTCACAGGTCACACACAATGAAAATGCATTCAAATCACTCCAATTCTTAGAGAACTTGTTAG GGAAAATTCCACTTGTACATGTTGATGATGTGTGTGAAGCTCATATCTTCTGCATAGAAAATGACTCAATCAGTGGAAGATATTTGTGTGCATCTTCTTT TATTTCATCAAAAGATATTGAAGATTATTATGCTCTACATTATGCAGAATTCAATGTCAAACAAGGGTAAGTTCCTGTTCTTTAATTAATTATTTGCTAC ATTTTATTACAGAAAATTAAATTCAGGCTTAATCTACATGCATTCTAACACTTTCAATCATTCTTCTACATACTCCATTTGCATGTTTCCAAGGGTGTGT CACATACATTAACTAAGCTCTTATCTAACAATCATTTTTTTCGAATAATCTAAAATGATCATAAATTTTATTAGTTTATATGATAAGATTATTTAAAGAA GGCATAAAGAAACTAGTTAAGATTTACAAAATTTCTTGGAACAAATCTGAATGTGATTATAGTCTTAAAATACACGAATTTGGTCTTCTTCCATTAAGCT ATTTATAATTTTTCATTGTGAAAATTAAATTTCAGCAATGTAGATGTGGTGAAGAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_35824; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_263295
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Anthocyanidin reductase ((2S)-flavan-3-ol-forming) from Vitis with 33.87% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418611.1) |
Pfam | Zinc knuckle (PF14392.5) |
Rfam | - |
GO | - |