Ll_transcript_122176

• Id Trinity: FTRINITY_DN53713_c3_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_122176
• Sequence: AAAGAAGTTTCCATAGAAAGAATACTGTGAGGAGTTTTCTGCTATTGTTGAGTTGAGACATTTCTTCATTCTCAACCAACAAAACCGTCATACAATTCCA ATTTTACCCTTCACTTCTTCTTCCTCTTCTTTTCCTTCTTCATTCCCCTTTATTCATTCCTCGTTTTTTTATTAAAAAAAACAAATTTTATTTTCTCAAT CGATTATTCAAAACACCCATAATAGCTATGCAGAGCCAAGTTGTATGTAATGGGTGCAGGAACATTTTGCTTTATCCTAGAGGGGCAACCAATGTTTGCT GTGCATTGTGCAACACAATTACATCTGTTCCTCCACCTGGAATGGAAATGTCACAACTTTACTGTGGAGGCTGCAGGACGTTGCTAATGTATGCACGTGG AGGTACAAGTGTAAGATGTTCCTGCTGTCACACTGTAAACCTTGTACCAGGTACTTACATTTGTATTTTCCAAATACATATAGCTTATTAGTTCAATTAT GATAATGTTGGACTACAAATTTATTGGGTAGATAACTATCTATGTTTCTATTTAATAACTATAGTTCTGCCAGATAAACCTTGTACCAGGTTTACCGTTT TTTTCCTTTCAAATTTCATATGTCTGTATCAATGCCCTGTTGGATCCCAAAAATTAATTTTAAACTAGATGTATGTCAAGCATTTCTTGTCAATGTGCCG TACAAGAGTCATATCAGACACGGCACCAAAATGGTGTGTCTGTGTGTTATAGATTTCAACCAATACCAGTTGAGTGCCTCAAATCAGTTTAGTGCAGTGA ATTACCTTAAGCATACATAGCATGAAAATGAAAAATACTTTCAAAATGTAATCATGCAATAAATGGTTATGGCCATTGTAATAACTTTTCTGCATTATAG TTAAAAAAAGACTTAAAAGTTATTTATGTCGCACTTGAAAAAACCTTGACGGTAGTCAATGAATGTAAACACAGAACTTTAACAAATCACCCTTCCTTTT TGTAAGCTAGTAATCAATGAAAACAATATTCAGATTCATTTGGATTGTAACGTAACCAAAACCCAGATTTGTGTTAATTGTGTTCTGTATTTAATCTTTG ATGCCAATTTTATTTTATTTTATCAGCAAACAAACATATTGAATAAAATAGGATGGATGACAAGTGGTACTCCGGACTCCACTCCACCGAAAGACCCCAA ATATTCTAACCGATTTTAATACATTCCAAAAGGATTCATAACCCATTTAGCACAAGAGCAATTCGCACCTACGGACCTTGCATAACCAAGGACCAAGATT TTAAGAATGTTATCTCCTTCACTTCATCCAAGGAAAAATATATGATGCCAATTTTATTGGTGAATGCTGATCATTATAAGGCTGCAGAACCTATTATTAA TTGAATATGAATATAACAGAGCCTGTTATTAACAAAACAGAATCTACATGACTGGACATGTCTGCTCTATATATTCTCTAATGCATTCCATTGACGAGCT CCAAGTTTTATTGTTATAATTGTTGCTTATATATAATCTGTCTGTGATAAAAAAATTATTGACTTATTGTTGATGGGATTTTTGTCTGCAACAAAAAGCT TCTAATCAAGTCAGCCATATCCATTGTGGGAACTGCCAGACAACACTCATGTATCCTTACGGAGCTCCGTCGGTCAAATGTGCACTTTGTCACTATATCA CTAATGTCAGTGTAAGTATACATTTATAGAATGATATTATCACGTGCATTCTCTCTCTATCCTTATAAGGTGGCAAGCATAAACCTACTTTTTGCTATTG AGCAGCTTGTTGACATCTAATTCAACATTGGAGCTGTAAAAAGGATGATATTCATCATATGCTGAATACGTGGTGGTTCATGTGACAGTCATAGTTATTC TCTAAATTTCTCTATGCCCGTTTATTGTTATTGCCATGACATGAAATCTTGGAAATATAATATGGAAATACTTTGCCTTTCATGTAGTTGTTCTTTGAGC TGATTTTTTCTACCTCTTGTGTCATCTGTTTCTCCTCCTTGTCTTTTGTAGACAACCAATGGAAGGCTTCCGATTCCCGGCCAAAGACCTAATGGAACAA CCAACCAAGGAACCGTATCTTCTACTCCAACATCCATGCCACACTCTCAGAGCCAAACTGTTGTAGTAGAAAATCCTATGTCTGTTGATTCGAGTGGGAA ACTGGTGAGCAATGTCGTCGTCGGCGTTACAACGGAAAAGAGATGATGCTTAACACATTATGAAGTTATGTGTTAAAAGGGACACTATTTAAAGCATTAT CAGTTGCTGGCACATGAAGATATTGTCTGTGTAAATGATGTTACAGCCTGCAATGGTTAAATTGAAGTCAATTATCTTTTTGCCAATTCAAGGTTTAAAC TTCAAACTGATTTCATGTATGTATGTATGTATGTATAGTTGTATACAAGGAGGACTAGTGGTGAGTGCTGATATAACTTATGTGATTGCCAGGGTACACT TTTTTTTGCTGCCATTGTATCTATATCCATATCAGTTGGTTTTTTCAGATTATGTCTCAGAAGTGATTGTCCTAGATTTTTTTGTTGTGACTTGAAAAGC ATGGGGTAACATTGCTTTTTACATGTTAATACTTGCTGTTATACAAGATATACAACTTATTAGGTAGGGTTGGATCTATCATAAATCATGTACAAGCATA GCTTAATATGTTATAGCTTTTTAACAGTGGGTGCTACTTTTTAGTAAGGATGCAAACTCTCACTTTCATGTGAAGAAAGTGAAAGATGCAACTCAATATA GTTGTGATATGGCTTCTCTCCT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_36162;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_122176

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0.2
• LF4: 0.2
• UF1: 0.2
• UF2: 0.2
• UF3: 0.3
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_122176

• Blastp: -
• Blastx: Protein LOL1 from Arabidopsis with 75% of identity
• Eggnog: LSD1 zinc finger domain containing protein, expressed(ENOG410YHD1)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G32540)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (NP_001241344.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;