Id Trinity | FTRINITY_DN53721_c5_g1_i22 |
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Name Transcript | Ll_transcript_124235 |
Sequence | TGATTCTGAAGCTGCTGTTGTTGACGTTGTTGGTTCTGATGATTCTGTTGCGGAACAGAGGAAAACCAATTTTGATTGTGTTAACCTGTTATCGAACGTG TCTGCTGAAAACAAGGTACAGTTTCAACTTCCAACCAATATAGAAACCGATGATAACGCACCCGGAGAGAGAAATGTTGAATCTAACGTTCTTGAATTGT CGGTGAAGCCGGACATTGCGGTGGTTGATGTCTCGGACGTAACGGAAGAGTTTGATTCTGAAGCTGCTGTTGTTGGTTCTGCTGATTCTGATGACGATTC TGTTTCGGAACAGAGGAAAAATGATTATGATTGTGTTGAAGAAACCGGTGTCGAAAAACCGTCGTATGTGGAGGAGGAAGAAGAGAGGGATGTGGTTTTG GACGGTGATGATTGGGAAGGGGTTGAGAGGAGTGAATTAGAGAAAGTGTTTATGGCGGCTACGGAATTTGTTGTTGGTAGTGAAAGTGATCGGTTTGGTA GTGATGTAGAGAAGGAGTTGTATGGGCTTCACAAGATTGCAACAGAAGGTCCTTGTCGTCAATCTCAGCCAATGCCTCTCATGTTCTCTGCACGTGCAAA GTGGTACCTATCTATTTTATCTTGTTTCACCAGTAACTAAATCATTGTGTTAGTTCATGAAATTGTAAGCACCACATTAGTATTTGCTAGATTTAAGTGT GATCTGACCTGGTGCATGAGGCTCCAACTGGTGGGCCTGGGGTGATGCAGTCTTAACTTAATTGACATTCAACTCACAAGATAGCAGCTACTAGAGTTGG CAATAAAATGAACCAAATTAACCTTCGTTCGAAATCCGACTCAATATATAGCTCAATAAACTTAGTTCATGAGTCAAACAAATCGAACTTGAGCCAAATA CATTTTGACTATATATTGTACGTATATTAATATATATGTATGCATATATACATGTAGGAAATCTTTAATTTTTTATATATATTAAATAAATAATTACCAT TTGAGCTGACAAATTAAATCAATCGAACTAATGAGTTGAACCAAACGATTCATGAACTCTTCATAACCCAAACCAAATTGGGCTCATGAGTCGAATTGAA CAATTTGCGGACCTCAGTCAACCGAATTGAAGCTGAAAACATAACTTGTTTCGAAGTCAAGTTTCAACCCGAACAAATCTTTATCAAGTTGAACTGAGCT AAACTCTAGTTCGACTTGGTTCAAATTGTTTCTAGCTCTAGCAATATCCTTACAAGACTCGCTCTCTAAAGTTGAAGACTAATATTATGGTTGCTAACTT TTTAGTGGTGTTAGTGTTCGGAATTTATGGTTCGTCTTATGCTTTGCGTAATGGCCTGATGAGCATTGGCAGCATTGGCTTGTTCTTTAAGTTGGTGTTT TTTATGTTCTTTTTAAAATAGCTTGTGGAAATTGATTCAATCACAGCCAAAATTTGTTTAGCTCTTTGAGGGATATAAGAGTATCAGAACAAGTGAGAGT CAGTTTTTTATAAGTTGGAGTGGCACTTTGATAGGATACACAATAAAACCAAATATGTTCCTGCGAACTAACAACATAGTCTCTCGCTTTCATTTCATAA TATCTGTCCATTAAGGTTTTCACACTAAGATTAAGAAATCTATTGAATACTCAAAATTCTAGGGAAACATAAGTATATTACCAGTTCAAGTTCAACCAAT TTAAGTTGGTGCCCATAGATCAATATGAATGTGTTTAAGCTCAATGGTAGAGAATAGTTTTAAGTAGTCAACTGGCAGGTCTCATGCATTTAATTTGTAT TTGTCAAGCTCAAGTATACACAAGTTTGGACAAATGAATGAAGCATTAGATAAAATACTAAGTTGCAAGATGTCTGTCTCTTCCTAAATATAAAAGACGC TAGGAAATGTTCAAGATAAAGAAAAAAGATTAACAACAAACACGGCTGCGCTGTACTAGTTACACGGTATAGCTTGATTGCTAGTTATAATAACAGGGTT GAGAGCTGCTCTGCTTTGTATGAGTGATGGATAGTACTGATTACGTTGTGCAAGGAATGCTTGGCAAAAGCTGGGGAACATGAATCCAGAAGTTGCTATG GAGCAGTATATCAGCCTTGTTTCAGATAAAGTTCCTGGATGGATGAAAAATACTTCTGCTGGTATGAGTGAACATGAAGCCACAGGGTCAGAAATTCCGG AGAAAGTTGGTGCTGATCTGAACACATCTTTTTTTCATCAACAAATGATGTTAACTGATAGGGAACTGGAACAAGAGAAAGAGTCTAGTGCTCAATACCA TAGCCCACTCACTGAGCCAGATTTGGAGAACAATGTAAGATTGTAAAATCATTCTGACTGATTGCTTATATAACATCCATTCCAATTTGAGGTAGATGTT ACTATGTGTTATTAACAAATTGAAAAAATTAATTATGCTACTAAAGATATTACTGGTTGGGTCGCAGACTAGGCCGCTGTCTGGTACTGTAAAAAATTGT GAAAATAGACTATCAATTATGACACCCCCATGATTAGAGAGTCCAACTCAGTGTATCGGATAACCACAGTCCTGTGAAAACCGCTTTAGAATTACACCCA AAATATAGCTAACGACATATATACCTATTGTTGTGGTTAATGCCAATCAACAATATGAGTATTCATACTTGACAGTATGGCTACTGCCACCTGACAACAT AATACTGTCACTCAACAATATGGCTATTGGCACTCAATAAAATAGTTAATTCCACTTAACAAGCAAGCCAATGCCACTTACACAATATGGGGAATGTTGT TCAGACAAAAGGTTGATGTCTCTGAAAGATAAGGTTGTTACACCTAAAAGATAAAGTTGTCACCCCCTAGAAGATAAAGTTGTCGCCCCCTATAAGATAA AGTTGTCGCCCCTCAAAGGTTAGGCTCATACTCTCAAAGATACAGCGGATGCTGTCAAAGATAAGGCCAATGCTCTCAAAGATAAGGGAGATCCCCCTAA AGATAAGACCAATGCCCCTCGAAGATAAGATTGTTGCTCATCAAAAATAAGAGTGTCCACCTCAACTATAAGGTAGCTGCCACTAGGAGATAGGGCTGCT ATTGCTAAATGAAAAGAAATGGGAAGAAGTTTATGGAATTGAAAAAAAACTGAAAGCCCAACATTGAGTAGCTTATACATTTAAAGTAGTTCTCAACTCT ATAGATAGAGCCCTCCCTTTTTCACACTCGTCTATTAATAACATGCTAAATGAATATACATTTATAGGATGTACTTGCAAGTTTAGTTTTCTTATGGTTT GGGATCTAGACATAAGTTAGACAACCCCAAACTTAGTAAAAAAGACAAATTTGATTATTTATTCTTTATATCTTTTATAATTAGTTCTTTGATCAAACAT CTCCATAGAAGCATTGCCCCGTTTTCTAGGTGCATTTTTGAAGATTATTAAGCATGTGATTGAATGTTATCAAAGAACAAATAAATAATATAGGATCACT TAATCTAATGATGTAAGGCCTCGTTAGATCACCAGATAACCAAAAGGTCAATAATTCGATTTCTGTGAGTGACACTTGTTGGGAGGGGCAACCATATACT CCAAAAAAGATTAGTTCCTTACCCAAAAGGATAAGGAGATACCTTTAATATTATAAAAAAAAAATACTTAATTATAATGAAACTGGGTATAATGCACTTT GAAAAATATTTCAGGCTTAAATCCTTAGTTATTTTATCCTCTTCACATTGTTATCCTTTTTCTAGGTCACTTAGATATCATTCTTTTAAAACAATGTCAT ATTTTTTTAATATTAAGATAAATATAATTATTTTATTTTATTTTTTTGTTGCCATGTTTTTAAGTGATACACCTCAAACCAAAAATATTTGTTTCGTATC AAAAGCAGAAAAAGAACCACTAATATTTACGGTAAAAATGATATAAGAAAATATTTTAAAATTGTTGTTATCAAATTAAAAATATTCAATATCCCATCAA ACATATTACTCCCTTAGTGGTGGATTAAATCACTCTCTTTAAGATGGTTCATGATACTAAAAAAAATTGTCCAAATAAACTATCAATAACAATGTATCCA AGATAAAACAACTCATCTCACTGGATAACCACTTCACTATGAAAACTGTTCTAGATTTGCACCACAATTACTTTCATCACTCAATAACATGACTAATGCC AAACTTAATATATGACTACTTTTATGGCACCCGCCACTGACAATATGGCTACTACCAATCAACAAAATAGACGATCACACTTAACACTTAACAAATTGGC TAATGTCACTCAAACAATATGGCAAATGCTACCCAAATAAAAGGTTGATGTCTCTAAAAAAATAAGCGTGCTTCCCTCAAAGATAAGGTTGTCTCGAATA TAAGGTTGTTGTACTTGAAAGATAAGGTTGATATAGCTGTTTAATGTTTTCTATGCTATGTTCTGTTTTTTCTTCCATTGCATTATTAGAATTATTTCAG TGTTTGAATTAGTGGATTGTATACACGAGTTTTCTTAGCGTGGATACTTTCAGGTTAAGAAATGATGGCTTCTCTCTGTTTGTATTCCCCGCCATGAAAC TTCTCCATCATCTACTTCAGGGAAAATAAGATTCGCTCCAAGAAATTTGCTTTCTCCTTTGTTCTTTGAAATCAAATGCTGATTATTAAGCGTTCTTAAA TAACGAACTGTTATTATGTATTACATAAATAAATGCTTGTATATATGATCTGATATGCTTCAGAATATTGCCTACTTTCAAATTGTTAAAACTAATTTCT TTAGTATCATCTCAATCCTGTGGCTATTCCATTTAAATTTTGTTTCTTTATATTTCAACTATCATCTCAATTTGACCAATTAAGTTCTCATTTACTAGTG TATTTTTTCTAGCAATCCATGC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_36226; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_124235
Blastp | Acyl-CoA-binding domain-containing protein 3 from Arabidopsis with 49.49% of identity |
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Blastx | Acyl-CoA-binding domain-containing protein 3 from Arabidopsis with 59.7% of identity |
Eggnog | Acyl-CoA binding domain containing(COG4281) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G24230) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429834.1) |
Pfam | Acyl CoA binding protein (PF00887.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |