Id Trinity | FTRINITY_DN53745_c12_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_122482 |
Sequence | AAATCTGGTTCGTTCCTTGAAGTTCACAAAAGAACCATGAATTGGTATGAGAGAACCAATTCGCGGTGTAGAATTGTGTTTCAATGATTCATAGCATTAT GTTGCAATTTGCCATGTTTTGTTTTTTGTTTTGGTTTTCTTATGTGGTTTAGATGAATAGTTTGTGATGTGTGATAGTCTTGTAGATATCTTATTTGTAT GGTATTGTTTACACAGTTGCACGTCTGGCTTTATTGTAGAGGTAGTAACTACTGTAATTTTATAATGTTTAATTTCTTAAGTGGTGGTTAAGATTACATA GTTACCTGGTACATAGTATGAGTATGTGGTTCCACCTGGATACGCAATTTGTCACTTTTTACATTAATTTTACGAGAAACATTCATTATGATGAACCAAT ACATGTTATGCGGCAGGGTGAATTCGGTAAGAGGAATGTATGATAAATGAGAGAATTAGATTCAAACATTTCTTGTTTCTTCTTTATATCCTAAAGAAGG TTCAAGATGTTTTGCAATTTAACATAAAGGGTAAGGTTTTACAAGCTATCTTATATTGTGTATGGCAATTTATTGTGATTTTGATAGTAACATGGCTTTC TTGCTTCAGCTATGATAAAGAAGAGATAAGTTGACCAGTAATGCTTGGGATTTGGGAGAACCATTGCCTGTGCATTATTGTTAGGATTGACATCTATAAT CTTATTGGGAAGTGTTTTGTACCAGAGTATCAGACTCGTTTTTGTAGTTTAGAATTCTTTTTGTGTTAATGCATAAATTTTTAGCACATATCATATGCAT GTATCACTCATATTTAGGTAATTATGATTTGCTAGCCTCTTCTGATGTTTTTATTCTCTAGAACTGTAATTTCTGTCATATGAAGAAAGCTTCTAGCCAA ATTACATTTCGTGCAATGTGCATGCTGTCTGCTTTCTTGAGTGGAACTGCTGAATGCAACGGGCTGCTTGCACAACCTGTTTAACTAAGCGAAATGTAAT ATAAATAGATTCATTGTAGTTGTCTTCTTTGATAATTAAAGTTTCATTGTCTGAAATTGTAAAGGGTGGTCAATGTTCTTTTAAGTGGGGGAAACAGGGT ACTTTTTCAAATCATTCAAAAAGCATGTTTAGACATAGTTACATGGTACACAGTATCAGCTCTGGTGTGCGGTACCCGGTACATGGTACATGAAATTCAG TGTGTCATACATAAGCTAAACAAGGGAAAACCTTTGATAAGGGGTTCTGGTAGGAACTGGATCAGAATTCAGAAGTTAAAAGAACTGAAATAATGGGTAC ATCTCCTCTCTGGACTGATATCAGTATTAGTGGGATCTGTATAGAAGTAACTGAAAGGAAAGAGAAGGAAAAGCATGTATAAATATACTAATAACCCCAA CCAATTTAAGAGGTCTTGTTCTCTACTATGCTTCCCTTAGGCACACCTTTACTACTCTCCATCCTTTCTTTTCCTTATATCAACACAGATCCTAACCGGA GTCCTGCTTCCCTCCACCATGTTCCCCTGCTGGCAGTTAGTTAGCAGTGGCCAAAAAATCAATGTTTTTCCTTGCCCATTTTCCCCCTATCTCCACAGCC AATATTACTTCTCACATATATATATTACTGATAGGCTCCACAGTTAGTACTTAGTAGCACTGATATAGTGGCATTGCGGAGCCTTACATGGCCAGGCCGT TTGTCGTGGTGCAGTTTTCAGCCTGGCCATCACAGCAAATACTTTCATGCAGCTGCTAGAATTAGGGTTTTTCTGATTCCTTCACTTCTTTGTCACAATT TTACCCGCACTATTACATCAAAGTTCTATGTTACCATCTTTAACTTAGCAAAACCCTATTTTTCTCTCGCTTTATCTTATCAAATGTCTTATTTACCCTC ACTTAAACATTGTAACCCTCAGTTTTAACCTTACTTAGATTGGCTATTCCACTGACTGGCCTTTGTCGTGCAAGCTCATAGCACAGACTCAGAGACTCTC TCACCTCCTTCCTTTGGTTCAACAAGTTAGCCAACTACACATTTAGTACTCTCTGCACTCTGTTTTGGCAAGTTCCTAACATAACCATATTTGTATCATG CAGATTCTTGCTCTATCAGCTCCTGTTTCAGGCTTCACTGGCCATGTTCACCTCTGTATTGATGTAGTTTTTGTTATGATGACTTGTTGTTTTTGGTGAC AGTTATGCTTCACATAATGGTTGTCATGTCTGTAAGTTAAAGAAATAGTATCGGTATTAATGATTACTGTATATGAAAATTATGTTTACTGTATTTGCTA TCTTGGGTATAGTGGTTCTGTCCATCCCATTATCCACTATATCACTAGCATTTTGGGGTTGGCTGCTCCACACTGCCATCTGAGGTTGTCTACTACTTGT AGGGGGTTTTGCTAAGAGATTCTTTCTTTCTCAGACTGCCTTGTTTTAAAAGCTGTTCTCTTTGACTTATTCAAGATGATGAATTTTTTGTTTCCCTTAG TTCTGTTCCAAATATTTTAAATTGGTACTTCTTTTTGTTTCCCTCAGTTCTGTTCCAAATATTTCAAATTCTGGAAAATTATGAAAAAAGAGAGGAAGAA GAAAATAGAACATGGATATGATGATATATATGTGATACAGTGTTAATACTATACATGGAAATTGGAAACCTAATATTCCTATTCATTCCAGAAGACATGT AATCTTTGTGATACTGTATTGTTGATCAAGTAATAGGTAGTACAACTAGTTCAAGCCATCCCTATGACACACCTAAGTCCCTCACTTAACAAGATTTCTA AAAAAATGAGAATCTTAATAATCTAACATGTCACATTGCAGCCTGGATCTTCATTCTTTTTCCCCATATGTAAAATATAAAATGATATATAGTTTTAATG ACTCTAATTTTGACTGATAGGTATGGTAGTTTTAGTGCAGATGTTCAGTTGAATATGATAGGATTATTGAAGGTAAAAATTGTCTGTTCTACTTGTTGCA TGGCACCTTCCAAGTCTAAGTTCTTATGTTACTAGGTTGAATGCATTTTTTTGGGTAGAAATATAGCATTTTCAGTGCTATTACATAGATCTATATTCTA TCTTTAGAAGATATAGCTTTTAATGACTGCCCCTAACCCCCAACCACACACACAACAAAAGGTTTCTGAACTTCTTGTCTATTGCAATTGACATGTGTGT TCTTCCATACATTTCTGTTATCCACAGATTATTACCCTATCATGTCGTGGCAGACTATGAAGCCGAAGAGGATGATAGGATGCTTGATTCTGACACCACT GGGCAGATGCTTTCTCGCTCCCAGCTATGGGATAATAACATCGCTGCAAAAATTGCCGAGTTCACAGCAACATTTGAAAAGCAAGCACTTGCTTTCAATA TAATAACTCGCAAGCGAGCAATGGGGGAATTTCGGTCAGAGGAGAGGTTAATGATTGAGCAGGCTCTTCTCCAAGAGGAAAAACGGGCTATGCTGGAACT AAGAGCAGCAATGGTTCAAGCAGAGCAGGCCCGAGCTGATTCACAGTCTCATGCTGAAATGATGATGGCTCGGACTCCATTAAGAGGAAGTGCACTTGGT TCCCAAGGCAGTGATGACATTGTTCATGATATGGGAGAGCAGGATCAGGGAGGCAATCACGGTGAGATGATAAATGGATGGGGAAAAAACTCACAGAAGG ATGAGAAGGAGCCATCTGACGATTTCTTGAATGATGAAGAAACTGAAAACGGAGAAACTAGCACGCAGGACGGATGGCGCGAAGCTGGTGAATTTGATCT GAATGCCAGATGATCCTAAAAAATGTTCAATGTAGATCATATAAGACCTCGATGACTAGTCTGGATTTCTTTTTCGGAATAAGATATGAGTATGATTATT TATCCTGGGCTGATATCTGTATAAGAAGTTTATGCATGTTGTAGACTCTAGTTACATAGTTGGAGCAATTTTAGTTCTATTGGTAAGAAGTCAATTTGTC AGTAAACTGTATCTAGTTAATGTTTTGTTATGCTTCAGGTTTCTAGTTCTTCTGGACATCAAAATTGGTTTTATATGGATTTGGATTCATACATAACCAT GAGATCAAAATTTCCCATTGCAAATGATTCCTACATGAAGAGGGAGGTCAAGAAATACGGATCGAATAATAATATTTTAAGAAATGTCAAGAAAAATAAT ATATGAAACGATTAAGAATGTTCAATGTTCAAGATTAATAATATTGTTTTTTTCTTGTACATTATTAATCTTGTATGATCTACATTTAAATGTACG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_36434; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_122482
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431146.1) |
Pfam | Conserved region of unknown function on GLTSCR protein (PF15249.5) |
Rfam | - |
GO | - |