Id Trinity | FTRINITY_DN53756_c1_g5_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_123801 |
Sequence | GAGAAAATAGTTTATTATGTTTATTTGTTGGCAACAAGAAGATTCCAGCACACCAAACTAGTTGCAGTTGTATTGAAGCTTAAGGAACGAACCGACACAC TCAACCATATACATGTCGGTACCAACCTTTACTTCACACTCATTTCAGAAGACTTCATAGTTTTCACAAACAAACACTGTTGGTTCAATTTTTTGATTGA TGCTAGCAGAAGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAGTTTTTTTGAACTTACTATGTTCAAATCAATCTTAACACACAATTTTTGAATTCAA TTCAACACTTAGAACAATCCTCAAATGTTGGTCCAAGAACGTTCAACACCCAAATCTCAAAAACCCTTTTTGAGAAACACTCTTCCCATAAATCGTTTTG CAGAGACCAAAAATCTTGATTTCTCAACATGGGTATCAGAGAATTTCTACAAAATCGTTGCTATCTTGGTCCTCATCGCCACCGTCGCCGGACTTTTCTT CTTCCGCAACGCCGGCTACTCCGCCGCGCTGCTTTGTTTCGAGAAGGAAGCTCAGGAGCTTGAGAAGATCGCGTTCCCTAAGATCAATTGGAACAAGATC TACCCCATTACTGATAAGACCTCAAAGTTCATGAACTTTCGAACGGATCGATGGATCGTGGTTTCTGTTTCGAGTTACCCATCGGATTCATTGAGGAATG CAGTGAGGGTTAAGGGTTGGCAGGTTCTGGCGATCGGGAATTCGCGAACTCCGTTGGATTGGGAGTTGAAAGGTGCAATTTTCTTGTCATTAGATGAACA AGCTAAGTTGGGGTTTAGGGTTGTTGATTATCTTCCTTATGATTCATATGTTAGGAAAAGTGTTGGGTATTTGTTTGCAATTCAACATGGTGCTAAGAAG ATCTTTGATTTTGATGATCGAGGGGATGTAATTGATGGTGATTTGGGTAAGCATTTTGATGTTGAATTGATTGGGGAAGGTTCTAGGCAAGAGGTAGTGT TGCAGTATAGTCATGATAATCTCAACCGAACTGTTGTTAATCCGTATGTCCATTTCGGGCAGCGATCTGTTTGGCCTAGAGGTTTGCCATTGGAGAATGT AGGAGAAATTGGGCATGAAGAGTTTTACACTGAAGTGTTTGGTGGAAAGCAGTTTATACAGCAGGGGATATCAAATGGGCTTCCTGATGTTGATTCTGTG TTTTATTTTACTCGCAAATCGGGTTTAGAAGCATTTGATATTAGATTTGATGAGCATGCCCCGAAAGTCGCGTTGCCACAGGGTATGATGGTGCCTCTTA ATTCTTTTAATACAATGTACCATTCTCCTGCATTTTGGGCTTTGATGCTTCCGGTGTCTGTTAGCACAATGGCTTCTGATGTGTTGAGAGGTTACTGGGG ACAGCGGCTTCTTTGGGAAGTTGGTGGTTCTGTTGTAGTTTATCCCCCGACTGTCCATAGATATGATAGGGTTGAGGCCTATCCATTTTCAGAAGAAAAA GATCTTCATGTGAATGTCGGTCGTTTAATCAAGTATTTGGTTTCGTGGAGATCAAATAAGCATAATTTATTTGAAAAGATTTTAGAGTTAAGCTATGCAA TGGCAGAGGAAGGATTTTGGACCAAGAAGGATGTGGAACTTACTGCTGCTTGGCTACAGGACTTGCTGGCTGTAGGTTATCAACAGCCGAGGTTGATGTC ATTGGAACTCGGACGTCCAAGAGCAAATATTGGCCATGGTGATCGAAGGGAGTTTATACCACAGAAGTTGCCATCTGTTCATCTTGGGGTTGAAGAAACG GGAACAGTGAATTATGAGATTGCTAATTTAATTCGATGGAGGAAAACTTTTGGGAACGTCGTGCTTATCTTGCATTGCAGTGGGCCTGTGGAGCGTACAG CCCTTGAATGGAGGTTGCTTTATGGAAGAATATTCAGAACTGTAGTTATTTTGTCGGAAAAGAAGGATATGGATCTTGTTGTACAGGAGGGCCATTTGGA CCAAGCATACAAGTAAGTATGCTTATATTTTACATTTTTCGTTATCGTTGTTATTTTATGAATAAGCTGTTTATAAATGTTGCTGTAATCTTGTCTTAGT TATTCCAAAACTGAATCCTGTTTTTTTTTTCACAATTACATGTGAATGAGTTGATGATTTTATTTAACATTGAAAATAAGGAGAAATGTGGTTACAATCA GGTCAACTTTTTAACTAGAAATAAAAAATTGATGTTCATTGAAGAATAAAATGAAACCATCTTAAGTAATTGCATTGGGCCGTCGCCCGTTGGCCATCTC ATGAAGTAATATCCAGAAAGTTGCTTTTGTTTTAAGTTGTTGTGAAAACTGAGTCATGCTCGGAAAATGGACAGGATACAACTTACATCACTTTAAGTCT GTTATTTTTAGCATATGACATGCTATGTAGCATGAGTTACTAGCAGATTTGGAAAAGGAATATCAGAAACGTTACTTCTTTTATTGTGAAGTGTTTATGT TTACGTCCATAAACTTATTGGTTAATAATAAGAGGATTTGGAAAAGTGATTCATCGTTGAGTCTACATCAAATGTGAAATGGGTAGATTCCGATGGATAT TGATTAGGACTAGGTCCGAAAAGAGGAGCACGGAGGTGGTGAGGTAATGAAAGAATAATGATTTGTTGAGTTACCACTCCGGAGGCTCATCCCAAACAAC ACAAAAACTCAGAAAGTTTCAGTTTATCTGCTGAACGTCTGTTAACATAAATAGCCATGGAATATCTTTGTCTGGATACAGTGATAGTCATCACCCTGGT AATACATGGAAATGCTAATTTAGTGAATTCATTGAATAATACTGTCGGCACTCGGGAATGCATTTATTTGTTGAATAAAAGTGCACTGACCTCACTATTA CTCTTGAAACTACAGCTATAATTCAGATTGCTAACCTTTTTCCTACATTATATAATTTTGATTTTATCCTTCTCCTGTTTCCAGATATCTGCCAAAAATA TTTGATCAGTTTAGCAGTGCAGAAGGATTTTTGTTCCTCCGGGATAATACCATTCTTAATTACTGGAACTTACTACAGGCAGACAAAACTAAACTGTGGG CCATGAATAAGGTATTCAGTATTCCTGATAGTGTTTTCTCTCACCCAAAGCATGGGAATCGTATTCGCATAGCAAGATAGATACTTACCACTTCCTCTTT TAGTTGTTTGATTTTTAATCCTACTTTTAGTGAAGCTGTTCTACTTCTTTTTCTATTTATTCCATATAGTTGTAGAATGCTTTTTGGTTGATATCATCCA TCATTTAGTTGTTGTTGATATCTATCTGAGACACTTGAAAACAAGAACACAAAATGAGAAGAGCAAAAGTTGCTGCAAAATAATCATAAAATATCAAACA AATATCTCTTTCCTTTTTCCAAAAGAAAGTTAAAAAAGATAAAATTTCACTATCATTCAATCATATGGTAAACTAATGACCTTTGTTTATGCTTTTTTCC ATCATATGTAAACAATTTTAACAGGGACAATGTATCAAAATGAAATCCTTATTTTATGACCTTTGTTTATGCTTTTTTTCCATCATATGTAAACAATTTT AACAGGGACAATGTATCAAAATGAAATCCTTATTTTATGACCTTTGTTTATGCATTTTTCCATCATATGTAAACAATTTTAACAGGGACAATGTATCAAA ATGAAATCCTTATTTTATGACCTTTGTTTATGCTTTTTTTCCTTTTCAATTTCACACCTTGCTGAAAAGCATAGCTTTAACTCAATTAATCATTAGAGGT CTCTATCTTTCTCTGACATTCACTGGGATCCAGGTATCGGGGTCTTGGAGTTCAGTATCAACCAGTGACAAATCCGATCGGTGGATATCACACCAAGCAA GCATGGTACAGAAGGTTGTTAGCATGATGCCAGCTCAATATCAAGTCAGTTACAAAGAAACAATTGGTAATGACAAGAACCTCTTAATATGCAGCTCTGA GGTGTTCTTCGTTCCTCGGCGCTTTATCAGTGATTTTGTTGATCTTGTTAACCTGGTCGGCGATCTAGAGATCCATCAGACGGTTGCGATTCCTATGCTC TTTGTCTCTATGGATTCTCAACAGAATTTTGATTCTGTTCTTGATACAACAATCTACAAGCAAAATCACCATACTAATGCTTCCACTCTTTATTCGGCTA AAGTCCCTGCTGTTCATCCATTGAATGTGTCAAGTGAGCAAGATTTTATAAAGCTTATCAGAATAATGGCAGAAGGGGATCCACTCTTAATGGAGTTAGT TTGAAAATAGAACCGTTTTCTTCATACTAAGACAGGGGAAGAGACAAAAAACATGTAACACAGTCTTTTAGTTTGTCTTTTTCTTCTAAATATTTTTGGG ATGATTTACTCTTACATTGTAGATTTGTTCCACAGGGAAAATGTATTCATCTTTGCCTCTTGTTTTTGTGAAAATATAAAATTAAAATTTATGTGCATTC ATTATTGCAATTCATGCTCTCCACTGAGATACTTTATTTGCTTATGAATTTTTAGCAAGGCTAGATAGAGAGATTTGTCCTTTTCAAGTTATGTTAGCAC ATCTTGCATATGCCCTTGATTTGTTTGTGAGTTAGGTTTTGAATGGGAAAGAACGGAAATGTAAAGTTTCAGAATTATTTCATAAGTGTAT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_36558; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_123801
Blastp | Probable glycosyltransferase STELLO1 from Arabidopsis with 72.33% of identity |
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Blastx | Probable glycosyltransferase STELLO1 from Arabidopsis with 72.33% of identity |
Eggnog | Protein of unknown function, DUF288(ENOG410Z6Q8) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G41770) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442960.1) |
Pfam | STELLO glycosyltransferases (PF03385.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |