Ll_transcript_123812

• Id Trinity: FTRINITY_DN53756_c1_g5_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_123812
• Sequence: GAGAAAATAGTTTATTATGTTTATTTGTTGGCAACAAGAAGATTCCAGCACACCAAACTAGTTGCAGTTGTATTGAAGCTTAAGGAACGAACCGACACAC TCAACCATATACATGTCGGTACCAACCTTTACTTCACACTCATTTCAGAAGACTTCATAGTTTTCACAAACAAACACTGTTGGTTCAATTTTTTGATTGA TGCTAGCAGAAGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAGTTTTTTTGAACTTACTATGTTCAAATCAATCTTAACACACAATTTTTGAATTCAA TTCAACACTTAGAACAATCCTCAAATGTTGGTCCAAGAACGTTCAACACCCAAATCTCAAAAACCCTTTTTGAGAAACACTCTTCCCATAAATCGTTTTG CAGAGACCAAAAATCTTGATTTCTCAACATGGGTATCAGAGAATTTCTACAAAATCGTTGCTATCTTGGTCCTCATCGCCACCGTCGCCGGACTTTTCTT CTTCCGCAACGCCGGCTACTCCGCCGCGCTGCTTTGTTTCGAGAAGGAAGCTCAGGAGCTTGAGAAGATCGCGTTCCCTAAGATCAATTGGAACAAGATC TACCCCATTACTGATAAGACCTCAAAGTTCATGAACTTTCGAACGGATCGATGGATCGTGGTTTCTGTTTCGAGTTACCCATCGGATTCATTGAGGAATG CAGTGAGGGTTAAGGGTTGGCAGGTTCTGGCGATCGGGAATTCGCGAACTCCGTTGGATTGGGAGTTGAAAGGTGCAATTTTCTTGTCATTAGATGAACA AGCTAAGTTGGGGTTTAGGGTTGTTGATTATCTTCCTTATGATTCATATGTTAGGAAAAGTGTTGGGTATTTGTTTGCAATTCAACATGGTGCTAAGAAG ATCTTTGATTTTGATGATCGAGGGGATGTAATTGATGGTGATTTGGGTAAGCATTTTGATGTTGAATTGATTGGGGAAGGTTCTAGGCAAGAGGTAGTGT TGCAGTATAGTCATGATAATCTCAACCGAACTGTTGTTAATCCGTATGTCCATTTCGGGCAGCGATCTGTTTGGCCTAGAGGTTTGCCATTGGAGAATGT AGGAGAAATTGGGCATGAAGAGTTTTACACTGAAGTGTTTGGTGGAAAGCAGTTTATACAGCAGGGGATATCAAATGGGCTTCCTGATGTTGATTCTGTG TTTTATTTTACTCGCAAATCGGGTTTAGAAGCATTTGATATTAGATTTGATGAGCATGCCCCGAAAGTCGCGTTGCCACAGGGTATGATGGTGCCTCTTA ATTCTTTTAATACAATGTACCATTCTCCTGCATTTTGGGCTTTGATGCTTCCGGTGTCTGTTAGCACAATGGCTTCTGATGTGTTGAGAGGTTACTGGGG ACAGCGGCTTCTTTGGGAAGTTGGTGGTTCTGTTGTAGTTTATCCCCCGACTGTCCATAGATATGATAGGGTTGAGGCCTATCCATTTTCAGAAGAAAAA GATCTTCATGTGAATGTCGGTCGTTTAATCAAGTATTTGGTTTCGTGGAGATCAAATAAGCATAATTTATTTGAAAAGATTTTAGAGTTAAGCTATGCAA TGGCAGAGGAAGGATTTTGGACCAAGAAGGATGTGGAACTTACTGCTGCTTGGCTACAGGACTTGCTGGCTGTAGGTTATCAACAGCCGAGGTTGATGTC ATTGGAACTCGGACGTCCAAGAGCAAATATTGGCCATGGTGATCGAAGGGAGTTTATACCACAGAAGTTGCCATCTGTTCATCTTGGGGTTGAAGAAACG GGAACAGTGAATTATGAGATTGCTAATTTAATTCGATGGAGGAAAACTTTTGGGAACGTCGTGCTTATCTTGCATTGCAGTGGGCCTGTGGAGCGTACAG CCCTTGAATGGAGGTTGCTTTATGGAAGAATATTCAGAACTGTAGTTATTTTGTCGGAAAAGAAGGATATGGATCTTGTTGTACAGGAGGGCCATTTGGA CCAAGCATACAAGTAAGTATGCTTATATTTTACATTTTTCGTTATCGTTGTTATTTTATGAATAAGCTGTTTATAAATGTTGCTGTAATCTTGTCTTAGT TATTCCAAAACTGAATCCTGTTTTTTTTTTCACAATTACATGTGAATGAGTTGATGATTTTATTTAACATTGAAAATAAGGAGAAATGTGGTTACAATCA GGTCAACTTTTTAACTAGAAATAAAAAATTGATGTTCATTGAAGAATAAAATGAAACCATCTTAAGTAATTGCATTGGGCCGTCGCCCGTTGGCCATCTC ATGAAGTAATATCCAGAAAGTTGCTTTTGTTTTAAGTTGTTGTGAAAACTGAGTCATGCTCGGAAAATGGACAGGATACAACTTACATCACTTTAAGTCT GTTATTTTTAGCATATGACATGCTATGTAGCATGAGTTACTAGCAGATTTGGAAAAGGAATATCAGAAACGTTACTTCTTTTATTGTGAAGTGTTTATGT TTACGTCCATAAACTTATTGGTTAATAATAAGAGGATTTGGAAAAGTGATTCATCGTTGAGTCTACATCAAATGTGAAATGGGTAGATTCCGATGGATAT TGATTAGGACTAGGTCCGAAAAGAGGAGCACGGAGGTGGTGAGGTAATGAAAGAATAATGATTTGTTGAGTTACCACTCCGGAGGCTCATCCCAAACAAC ACAAAAACTCAGAAAGTTTCAGTTTATCTGCTGAACGTCTGTTAACATAAATAGCCATGGAATATCTTTGTCTGGATACAGTGATAGTCATCACCCTGGT AATACATGGAAATGCTAATTTAGTGAATTCATTGAATAATACTGTCGGCACTCGGGAATGCATTTATTTGTTGAATAAAAGTGCACTGACCTCACTATTA CTCTTGAAACTACAGCTATAATTCAGATTGCTAACCTTTTTCCTACATTATATAATTTTGATTTTATCCTTCTCCTGTTTCCAGATATCTGCCAAAAATA TTTGATCAGTTTAGCAGTGCAGAAGGATTTTTGTTCCTCCGGGATAATACCATTCTTAATTACTGGAACTTACTACAGGCAGACAAAACTAAACTGTGGG CCATGAATAAGGTATTCAGTATTCCTGATAGTGTTTTCTCTCACCCAAAGCATGGGAATCGTATTCGCATAGCAAGATAGATACTTACCACTTCCTCTTT TAGTTGTTTGATTTTTAATCCTACTTTTAGTGAAGCTGTTCTACTTCTTTTTCTATTTATTCCATATAGTTGTAGAATGCTTTTTGGTTGATATCATCCA TCATTTAGTTGTTGTTGATATCTATCTGAGACACTTGAAAACAAGAACACAAAATGAGAAGAGCAAAAGTTGCTGCAAAATAATCATAAAATATCAAACA AATATCTCTTTCCTTTTTCCAAAAGAAAGTTAAAAAAGATAAAATTTCACTATCATTCAATCATATGGTAAACTAATGACCTTTGTTTATGCTTTTTTCC ATCATATGTAAACAATTTTAACAGGGACAATGTATCAAAATGAAATCCTTATTTTATGACCTTTGTTTATGCATTTTTCCATCATATGTAAACAATTTTA ACAGGGACAATGTATCAAAATGAAATCCTTATTTTATGACCTTTGTTTATGCTTTTTTTCCTTTTCAATTTCACACCTTGCTGAAAAGCATAGCTTTAAC TCAATTAATCATTAGAGGTCTCTATCTTTCTCTGACATTCACTGGGATCCAGGTATCGGGGTCTTGGAGTTCAGTATCAACCAGTGACAAATCCGATCGG TGGATATCACACCAAGCAAGCATGGTACAGAAGGTTGTTAGCATGATGCCAGCTCAATATCAAGTCAGTTACAAAGAAACAATTGGTAATGACAAGAACC TCTTAATATGCAGCTCTGAGGTGTTCTTCGTTCCTCGGCGCTTTATCAGTGATTTTGTTGATCTTGTTAACCTGGTCGGCGATCTAGAGATCCATCAGAC GGTTGCGATTCCTATGCTCTTTGTCTCTATGGATTCTCAACAGAATTTTGATTCTGTTCTTGATACAACAATCTACAAGCAAAATCACCATACTAATGCT TCCACTCTTTATTCGGCTAAAGTCCCTGCTGTTCATCCATTGAATGTGTCAAGTGAGCAAGATTTTATAAAGCTTATCAGAATAATGGCAGAAGGGGATC CACTCTTAATGGAGTTAGTTTGAAAATAGAACCGTTTTCTTCATACTAAGACAGGGGAAGAGACAAAAAACATGTAACACAGTCTTTTAGTTTGTCTTTT TCTTCTAAATATTTTTGGGATGATTTACTCTTACATTGTAGATTTGTTCCACAGGGAAAATGTATTCATCTTTGCCTCTTGTTTTTGTGAAAATATAAAA TTAAAATTTATGTGCATTCATTATTGCAATTCATGCTCTCCACTGAGATACTTTATTTGCTTATGAATTTTTAGCAAGGCTAGATAGAGAGATTTGTCCT TTTCAAGTTATGTTAGCACATCTTGCATATGCCCTTGATTTGTTTGTGAGTTAGGTTTTGAATGGGAAAGAACGGAAATGTAAAGTTTCAGAATTATTTC ATAAGTGTAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_36558;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_123812

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0.6
• LF1: 0.5
• LF2: 0.4
• LF3: 0.2
• LF4: 0.2
• UF1: 0.4
• UF2: 0.9
• UF3: 0.3
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_123812

• Blastp: Probable glycosyltransferase STELLO1 from Arabidopsis with 72.33% of identity
• Blastx: Probable glycosyltransferase STELLO1 from Arabidopsis with 72.33% of identity
• Eggnog: Protein of unknown function, DUF288(ENOG410Z6Q8)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G41770)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442960.1)
• Pfam: STELLO glycosyltransferases (PF03385.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;