Id Trinity | FTRINITY_DN53806_c2_g2_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_24596 |
Sequence | TTCTCATTTTATTTTGAGTCACATTCATCACTCGTCATTTTCTCATTTGACTCGTTCTGCTAACGAAATTCCATTGCTTAGTTTGAGGTTAATCCAATTA CATTAGGTGGTTCCGATTGGTTAATTTGGCTTTTCAGATTTTCGGGACCCACATAATTAAACTACGCATAATATTAGGGATCAAATTGAAATTTTACTAG GGGCTAGTTGATCTTAAAAAAATAGGAAATAGGAAAAGGAAAATATTTAGTAAAAAGAAGTTTTTTAATATTTTAAAACACTTTTCTTCCACATTAGCAA ATATTTAAGTTACTGTAATAATAATTAAATAAAAGGTTTTGCAATAAGTAAACTTATTAATGAATACTTAATAAACAAAAAAGAGTTAATACAATCAAAA GAATTAAAGAGTGACCAATCATGCTTGATTCCCCTTAAGCAAAGTCTTGTGTTCAATTTTTGTGAATGGAAAAATATCACCGAGAGAGTTAGCTCCACGT ACTTATGGATTTCTGGCTTGGACATGATGATCTCGGTGCGAATATACATGTGAGAAACCATAAAAAAAATTAAAGAGTGTAATATATATATATATATCAT TCATAATTTATTTGTGTTACTTATATTCAAGATTAATGATGATTAAATAAATATGAACGATAAACAACACAATGACAGTGTAAAAAAATTGTACGTACAT TATTGGGGGATACAATTGTGTTTAATAGTGTAAAAGGTTTGGGTAATTGTATACTTCTTCTAGAATGAATACTCTCTAATCTCTATGTTCCAAAACTTGA TATTTAAGGTTATGTGTATATTTTTAAAAATCAATAAATGATGTTGAATACAATTGGACTAAAGTAACATCTTTTAATACTCATTGGAAAGAGAAATGAT GGTGAAACAGATGAGTAAAACATAAAAATATAATTTGAAAGTAAAATAACATGAGAAAATTAACTTAAGTTTAGTCATTTCTGAAACATTCATGAAGTAA AATTTATTTACAAAATAAATGCATTCCAAATATTCATCATTCATTTCAAGCGAATTGCCATAATTTTTTGGTCACTAAGGTATATCCAATGGTTGATAAA TTTCCAAGACAGTGAATTTATAGTATTGGATCCTATTCTATCATGTGGTTAATGAAGTAGGATACAGAATATTTTATAGTCAGTATTCAGAGAACAGAAT AAAACTTATATAGCCATGTTGTCTATGTAAGTCTAATAGACACGTGCCTAATAGACATGTGCCTATACAGGTTTTTCTCTGGTGGCATTCATGATTCCTG TGTCTCATTGTTCCCTAATGTGCACCATTATTCCAATTTGTTGTTATGCTCTTTACATCATCACTTGCACATGCTCATTGAGGTGGCATAAACTCTTTTC TTTAACATGTTCTGTCATGTAATTCATAATCTCCAAACCTGTCCTTTGTGACTTTGTTTATCTGCTTCAGGCTCAGAGACATTATGGAAGGCAAGCCCAT GTTGTGTAGAATGTTGTAGAGGGTTCAAAAAATGTGGTGTAATGATAATAGTTAAATAATAATGAATTGTGCCATTGATTTGTGTTTTATTGTCTTGCTT TGACTCAATTAACTTGAGTGTTAAACTATTACTGATCTGAGGACCTGTGTTATTCAGGTAAGTGATTATAATTTTTCATTCATTTTCAAATGGGAAGTTG AAAGACTTTCTATGAATTTATTCGACAAGCATCTGTGTTTTAGCGCCTTTTTTACACGTCTTGCAAAACTTGTTATAATATATACTACCTCCAGTCCTTT TTACAGGACCTTTTTTAGAGATTGGTTTTGATGCTTTTTATAAGATCATTTTGAGATTTCTCTGTACATTAATTATTTTGTTATCAAAACATCCTCATTA ATTAGCTTGTAATGGAAAGAGAAAATGTAGTTTATCAAATTAAGGGCTACTACATCCTTTCTGTCACTTAAGAAACAAACTATCTTAAAGGAGCCTTTTC GGCATATCTTGTACCACCAAATGCTGTGATGGCTGGCCAGCAACTCTTAAACCTTCTTTACTTCAACCTAAGCTTTAGTTGGTTGATGGGACTTAGGCCA AAACCTTCTTATTAGGTGTATACTTTTATTGGTTTAGGGATAGATATGCCTTTTCAACTAATGCATATTAGGCATGTCTGCTTTGTTAAATGAGGCTTGC AATGTTCCTAACATTCATCATGCTTTAATGCATAAAGTAAAAGAAATTAATGTGATGAACTTTCATTTTAACAGAGATGGTAATTTTGCAGGTCTGTAAA GCCAAATATCAAGAGTTGCTAGAGCGATATTCCGGGAGCAAGTAAATAGAGACTATTCTTTTCTATAGTTTTGTTTATTTAAAATTTCCTAAATTGATAG TATGTCTTATTTTGCTTTAGATTTAATGATATGCCTCCGAAGACTGTATTGAAGTTGTATGCTATATCTCATTGTGTTATGTTAACATGGTAGGGCTTGG TTTGAGGAGCTTAAAAAGGAAGGGATGGCAGAGCTTAAGAGAGCTTTGGAGCAATCTGAAAAATCAATTGGGTCTCTTAAATCAAAGCTTGAATTCCTTA AGACCGAGAAGAATGAGACAAAAAGTGATTGTCATCTTGACAATGTCCCAGCTGGACCAGAATTACGTGTTCCTTCACAGAATTTGGAGAGAGTGGAATC ATCCAATAAAGAGACTTCGAAGGATGGGCTATCTGCTGGGAGTTTCACGCATGAAACCCGGACAAACTGGTCTCCTGAAGGTACCCAGTCTGCTGAACAA GAGAAAGTTTTGAATGTACTTAAGTTGGAAGATCCTATAGGTGAAGGACAGGTAGGGGGCTTAAAAAAGCAAAGAGGGAAAAGGAAGAGGAAGGATTCTG ACAGTAATATTAATAAAACAAGTGTTCGAGAAAGTGATGTGTTACATTCAGTAGATGTGTCCGGATATAAAGAAAGTTCAACTAGCAACAGTGACGAAAT TGCAAAATTTTGTAGCAAAGATAAGAAGAATCATAACTCGAGAAAGGATAGTATGAAAGATATCATGGAGATTCTGGACTATATTTTGCAATCTAAGGGT GCTTCTTCTTTCCATCGCAAACATGATAGCCAGAAAAGAGGCAGGTACAGGAGCATGATCCGGAAGCACATGGACCTTGACACTATAAGGTTAAGAATCA GCAACCGAACGATTAAATCGGTCATGGAACTTTTCAGAGACTTATATCTACTCATCAACAATGCTCTAGTCTTCTACTCCAAGAGCACTCGCCAGTATAA AAATGCTCAACTGCTTAGAGACATGGTCAATGAAACATTAAAAGAATGCATCAAAGATTTTAGAAGCAGTGTTACCAATGCTGATGTCTCTATCACATTA CCTGTCGATGAGCCTCCCCTGAAACTCAGAAGTGTATGCCCTGGTAACCGGAAGGTTGTCGCAAAGGAAGCCGGTGGTGGCAGCAAGTCTGCTTCTGAGG TCTCACATGGAGCTAAGGTACCCAACAAAGTGAATCCCCCACTTTCAGAGGAATCCTTGCCCATCAAGAAATCTTTTGGTCGATCGAAAAAGGTTGGACG TGAAACCACAGGAAGTCAGAGACCCGCTATGGCAATGAAGAGAAGGAGAACAGTGAGAGCCAAAGATGATAATGCTGAGGATTTGGTTCCATCTAAAGCT TATCCATTAGGTCTTTAAGGGCATCTTTGTACTAAGACTACCCATCTTTATTAATCTTTTTTTGTTTGATGAGCCTTCATGCAACCAGAAGGGAACTAGG GCATCAAAGTTCAAACATGAAATAGTTATAAATTATAGTAGCTAAACTAGATAAATTTCCAAATATAGTAGCAGGTACTTCTCCTTTTATCAGTATCTAA ATAAATTGTACATTGTAATTATTAACTTAGTGGGAAGTATGCTAAGTTAAATTGACACCAATGGGTATATTAACTTGTTTATCACAAGGGATATTATTTC ACTTAATCTTTTTGAATTGTTTGCATTTGCTTCCATGAAGTGCATTAATCTGTGAAATGCAGAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_37048; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_24596
Blastp | Bromodomain-containing protein 8 from Mus with 27.03% of identity |
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Blastx | Bromodomain-containing protein 8 from Mus with 27.03% of identity |
Eggnog | Bromodomain containing 8(ENOG410Y97J) |
Kegg | Link to kegg annotations (78656) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445628.1) |
Pfam | Bromodomain (PF00439.24) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |