Ll_transcript_23685

• Id Trinity: FTRINITY_DN53816_c2_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_23685
• Sequence: GAAATCATAAGCGGAAATAACGAAAGGTGTGGGTCAAAAGCAGAAATACTGTAACAAATATTCAAAACTGTGAAGATGGAGTTCGTTCCTGAAGAAGGAA AGCACCTGCATGAAGATTGCTCCACTTTAATTTTGCCTGCACTGTCAATTGGAAATGTTGGGCAGTTAGTGGCAGACCTTTTGGTTTCATCAATGGATGC AGAGAGAGTTGGGTATTTGGATGATCCTTATGTTCTTCCTTGTGTTGGCAATGATGCTTATGGACCCATTCCTCAAGGAGACCTTGCTCTTCCTCTTGAA GCTTATGATTCCATTTCTAATGCTCTTACTATCATCCAACAGAGATCTCCAGTGGTTAAGGGTAGGATGGTGGAGTTTGCAAAAAACTTGGCTGATTTTG TTGCTGCTAGTGGAAAGAAGCATATTATTCTTCTCTCCAGCTTAGACTTTGGAAAGTGGCAAAAAGTTGACATGTCAAGATTTACTACCTCTCCAGTGCC AACAACAATGGAACAGATGAAAACTGTGAACAGCTTGGGTGGAAGAAACTTGAGGATTATGACCCTTCTCAAAAGCATTGGAAATATCTTAGCGATTTAG CTGAAGGAAATGCAACTCGGGATGATATCATATCCATAGAAGATGAACTAGAAGAAGAAAATTATTATGCGAGCTTGCCTTTTGCTGCTCTTTTTTCTTT TCTCAAGGCTAAAGGCTTGAAGGTTACCTGCTTGTTGTGTTATTGCTCAGAAGGTGACAACATATCTGATGCTTTTCAGTTAGCTGAGGCCGTATGCAAA CTTCAAAGGCTAAGTCATCCTACTGCTGGAATTGATGGTGGCAAATGGAGGGTTCCACTTTCTTGGATGTCTGTATATGGACCACCACCAGATATGTCCA TCTTCTAATCCGAATAAATTTCAAATGGTGGTTTAAGATAGAAATTAGTGTCTCAATATCTTTTTTGTTAAACAATGATGCTCCACTTATCTTATATATG ACAAGCTTCGAGTAGTGTAAGGTATTTTTACACTATAGGACCTATCTTCTGATGGCTATTGTTGCTATATGATGCTTTTAATTTGCTTTAGAAACTGGAA ATCCAAAATCATTATGTGTCTGTTATGTACTTTTACTAAGCCATGACCTTAATTCTGACTTAGTTAGAGCATCCACCACGATTTCTCTTAAGGACAGAAT AAGAACATTCTTACTCTGTTCTCTACTGTGTCATTCTTATTTCTTAAGTTTCGTTCTTAAATAAGAACAATTATTGTTTGTTCTTAATAAAGGAAAGTGA GGAGCGGGGTAGGTGTTGTAGGACAAAGATGGATGTCGTGGGACTCGAATAAAAATAAAAATGATGTTTGCCATTGTGTGGAAAAATTATATGTTATTCT TATTTCATAGTGAGTTGTAATAAATTATAAAATAATGTGAAAACCAAATAAGAATCGAAAGTGCATTTTCTGATGCTCTTATAATCAAAACAATGGACAC CGGCAGCATATTTTTTTGGCAAGTCCTGCACCCATTTTTCTTAATGCACTAAAATTTAATTGTAAACACACTTTTAAGTATTTTATGGTTTAGTCAATTT TAGAAGAGCCACTATAAGTTCATAAATTAAATCTGAACAAAAAAAGTTTGTTGCAATCAATGTAAGTTTAAGCAAACCTTCAATTTCCTTGCTACTTTTT TAGGACCATCCTTCATTTTATGTTCCTATTCTTTATTTTTTCACGAAGTCCGAATATAAAAATAAGGGTCTATTTCACCCTCCCCATTTGTTTCAATTTA CTGAAACTACCCTCCCCTTCTGATAAGTCAACTTCTTTCACTCTCATCTGCTCCATACAATTGCATCAACAAATTGGATTCCATATGGGAAAATATTTGT TGTTAATTACTCTTAAATCATTCTTATAAAAACCAATTGTCTTGGCATGAAGTTCATACACACATGTGAATCCATATTTCATGTGTTCCTTTTCATTTTG TAGAGTTTCAAGTCCATGAGAATATAATAAACCAACTAATTCATAATTACAATGACAACTCCGTGCGTTTCCCCCCAAAAGACCAAACATGCAACACATA ACACTATCAAAAAACCCAAAGTTCAGTGTTCCATGTCTATGCATCAGTATTGGTTCTATGTTTTTTTTTTTAACAATACTTATTGGGAGGGACAGTCACG CAACCTAAAAGAGATTAATTTTTTATCTATATAATGAGGGATATCTTTGATAGTACGAAAAAACTATCGGTTACCCACGTCATGTATTAAAAAATTTGCT TGCCTATTCAATTTTTTGAACACATTGTTTGTTGTGACCGCACCTTGGCTGATGCAACAGCAGCGAGGTTTTCACTTGGTACATATCAAATAACCAAAAA AGCTTAAATGTAATTAAGTAATTTTGATCTTCGAGTTTTTATTTTAAGATTTTATTCCTTAAACTTCTTAAACTTCTAATCTTTTGAATAAAGAGCCCCT CCTCCATCCATAATGATGCCAATGAATTCGAAGAATATAATATAATATTATATCCTTATGGATACAGATACTGCTTTTCAAAAAAAGAAAAAAGACAGAA AAGATGCAGCTACTGGAGAAAGCAAATTAAATTAAAATTTCATATCCTCAAAAAGCTTGTTACTTGTAAGAGTTTTGTTACAAAATTAACCCATCTGTCA TACACACATATGTTATTGCCAGAGTGTAATAGTTAGAAATATATATATAATATATACATAAGTTTTGCTTAATATATAGTTGTACCTGCATACTTGCATT TATAACAAAACCATAGAGAATCAATAAAATCAAAGTGACTAGTAACCTTATCTTGGAGAATGTGGAAGAGGATGGATTTTGAAAAAGAAGCAGCTGAATT GATCAACTCTGATATGAGGGAACTGAGTGTAGCTGCTAATAAACTAGCCCAACATGCCATCAAACTTGGTGGCTTAGGCTCTGGAGTCTCTTTCTTTGGA TTGATTGCTGCCATTGCTGCTATGTTTGTTTTCTAATTACTCTAAAACCAAGTTTATCTATCTCTTTCTTGTTTGCACACTATAAAAGTTTATGGTTCTA CTTCCACATTTTTCTTCCATTTTACAGTTTTGTGTATTTTAAATTTTTTTCAACATGCCCATCTTCATTACTTGTGTCTCATATGTTGTTACATGTTGCT GGAACTGGAATGATTGCTTTATTGTGAGTTGTGACTGAGTCTAACTCTATACATTTAACATTTCTTATATGTTTCTATGATATTAATGCTTCTAAGTTCT TCAACTCAGATTTCAATTTTTAATAACCATTACTAATAACATACCAACACTAGTAATAATAACCATAATGTGGCAGTGGTACCTATTCAACAATGTAAAA TAATTTAACTTTCATGTAATTAAAATATCTATAACTTAAATGGGTGGATGATAGGCCAGTTTTGTGTGTGGATGAGATCCATTCCATGGATTATTAATCA TGGTTGGTCCACCATCTTATATCACTCTACTCACTTTATCCCTCATAATATTATTTGCTATAACCTTTGTTAAAGTTGGTTCCTCTCAAACAGTTGCACC TCTCTATCAGTTGCTGAAACATTGAGGATTAGTTAAAATAGTAATTTCATTTATTTTTTTGTCCCTTGCTAAGAATATTAAATCTGCTCATTCATTACTA GGAGCTATTAAACTTTGAACATGGTTATCTTCAGTATTAAAAACTTAGCTAGCCTACAAATTTCTAGTTATTTGATGAAATAGTAACTTCTTTATGGTTT TCAATGATTGGTTTTATTTGTTCTTTGTAGCTATTTGCTGATTCTGGATCGTACAAATTGGAAGACAAACATTCTTACAGCATTGCTCATTCCATACATT TTCTTCAGCTTGCCTTCATCAATTTTCGACATCTTCAGGGGAGATACCGGAAAATGGATTGCTGCTGTTGCTATTGTATTACGGCTTTTCTTTCCAAGAC ATTTCCCAGATTGGCTTGAATTGCCTGCTGCTTTGGTTCTTCTTATCGTCGTAGCTCCTAGTCTACTTGCAAGCAAATTCAGAGACGACATTGTTGGGGT GATTGTATGCCTTATCATCGCATGTTATTTGCTGCAAGAACACGTTCGGGCATCCGGTGGTTTCAGAAACTCATTCACTAAAGCCAATGGCTTATCGAAT ACCATTGGCATTGTCCTTCTGCTAGTTTATCCCATCTGGGTACTGGTGGTCATTGTTTTTTAAAGGAAGAAATATGCAGCATTTGTACTGGGTTGATCTA TGTCAATCATACCATTTGTCTTCTGTATTATTCATTTGTTGCAATTTCATTTCTAGAAATACCCTTTCTAAAGTTTGGATGTGTGAATGTGTGAAATCAA ATATGTGATTTCTAAGATGAGGATTGATATGGTATCTTACTAGAATCTTCAATCATTGTATGCTTACCTACGTGTTACAACTTATAATATAAGTTACCTT TGTTGTTCTGTATTAGACATATTTGTCTTGCAAATGCAACAAAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_37121;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_23685

FPKM

• FPAB: 0.7
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.4
• LF2: 0.3
• LF3: 0.2
• LF4: 0.5
• UF1: 0.1
• UF2: 0.4
• UF3: 0.2
• UF4: 0.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_23685

• Blastp: Proteasome assembly chaperone 2 from Nematostella with 45.05% of identity
• Blastx: Cold-regulated 413 plasma membrane protein 2 from Arabidopsis with 68.31% of identity
• Eggnog: Proteasome (Prosome, macropain) assembly chaperone 2(ENOG410XRHJ)
• Kegg: Link to kegg annotations (NEMVE_v1g117792)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000256)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_013456328.1)
• Pfam: PAC2 family (PF09754.8)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;