| Id Trinity | FTRINITY_DN53845_c0_g1_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_25103 |
| Sequence | AAAAAATTTCGTCCGGTTGATAAACCCTAATTCCTACCATCACCATCTTCAATTCCTTCACTCTCCAATGGAAGAACACTCACAGGAACCGCCGCCGCAG ATTCCCCAAACCATCATCTACGATACACTCACTCCCAACTCTCTCTCCGCCGCCACAGTCTCTCAACTTTCCGACCAACCCCAACCCCAACCGGAACCTA ATTCCTACTCCGTTTTCCGCAACGAGATCTCCCTCGACACAATCCAATGTGCTTCTTCCGACATCCCCGCCGTTGATTTCTTCTCCCTCAATGTTTCCGA CGAACCTTCCGCCCCGGATTCTCTCCCTGAGCCAGAGGCTCCGCCTGCTGAGGTGTATGAGCCAAAGACTCCGGCTCTCGCGCCCGAGGCGAAGCTCGAG AGTGGTTGGTTTCGTGGGAATTGCAAATTCAAGAGCCCCATGCTTCAGCTACATAAAGAGATAGTGGATTTTAGTAATTTTTTGTTGCCGACCCAAGAAG AGAAAGCTGCACGGGACACAGCAATAGAATCTGTATTTGGGGTTATAAAACACATATGGCCTCATTGCCAGGTCGAAATCTTTGGGTCTTTTCGAACAGG GCTGTATCTACCAACTAGTGATATCGATGTCGTGATTCTGAAAGCAGGCTTGCCAAATACACAGATGGGTTTGAATGCACTTTCTAGAGCATTGTCACAA AGGGGCATTGCTAAGAAGATACAGGTCTGTCAGATTGCTTAAATATCATTATTTTTATGTGAAGAAAAAATAATCAACGTTGTTAGGTTTTTTAAGTACC TGATGCACTTGTGAATTTTCCTCAGGTCATTGGAAAGGCTCGTGTGCCAATTATTAAATTTGTTGAAAAGAGAAGTGGGTTTTCATTTGATATAAGGTTC AACATTGTTCTTAAAATTTTGTTGCACAAGTTTGTTTATTTCTTCATTGTTATATGCTTACACAAGTTTGTAGTGTTCATGTGCCATCATTTAGTACGTT TTAATTTAATGTTCATTTGATTGTACATGATGTTGGATGAGCTGTTTAATTTGCTCATCTTTGCATATGCTATTTTTATTGAATTTTTAATACAGTTTCC AATCTTTCCATAAAATAACTTCCAAATTATAATTAAAAGTGCTGGAGAAGATAGATGGATTCTGTAGCTAACAACTTCCAAATTATAACTAACAGTGCTG GAGAAGATATGATGGATTCTATAGCTAATAAGCTTACTGATTTTGGGAATAGATGGACATGATATTTCTCCAAATTGTTTGCTATGTATGTCGTTAATTG TTTTCGTTGACAAAATATCCAGGCTCCATATGAAAGTCATCTTCTCCCTCTGGCGTGGTAGATTCATTTGTCTCTGTTAAACATCTAAAGTCGGCTTTAA TTGCTTGTTATTTGCATTATGATGATGAAACTTTTTGTTGTTTTCCTTACAAAGAATGGTTAAGGCAACAATATTAGTTGTGTCTTACCAGTTGCTACTA ACTGTGACAAGCGACAACCATATTATTCTTAATGTGGTTGCTTTTTTAGTTTTATAGATCATGGTTGTCACCTACTCTTTTTATTTTTGATTATCATGTT GCCCAACATTGTACAGACTACAGAGTATTAATTGACTTTGGAGTTATTTCTTGCTTCAGTTTTGTAATATGTTAATTGTACATTGTACAAAACCTATCAC AGTATTAATTTTTGTAATATGTTAATTGACTTTGGAGTTATTCCTTGCTTCAGTTTTGACATAGACAATGGACCCAAAGCTGCCGAGTATATTCAGGAAG CAGTGGCTAAGTGGCCGCCACTACGACCATTGTGTTTGATTTTGAAAGTATTTTTGCAACAAAGAGAACTAAATGAGGTATATTCTGGTGGGATTGGTTC GTATGCCCTCCTTGCTATGCTGATGGCATTGCTACGGAATATCCGTGAGAGTCAAGTTTCTGCCGAGCACAACTTGGGGCTCCTTTTGGTGCATTTTTTT GATATCTATGGACGCAAATTGAACACCTCAGATGTGGGTGTATCTTGTAATGGGGCAGGCACTTTTTTCTTAAAGAGCAGTAAAGGGTTTACTTCAAACA AGGGACGACCATACCTTATTGGCATTGAGGATCCACAGGTTTTTCTTATACAACTGCATCTTGCTTTCATAAATTTTTAGTTTTCTTTTTGCCCATCAGA ATAAAGCAAGAAAGTGAGCTTTTTGAGACGGAATTGTTCATAACTTGCCTTTAACTTTTACTTGGTTAAATTGATCTTATTTCAAAATCCAGTACAACCA TTGCTTTCTTTCTTTTTCCGGGTTGGGTCGGGATAATGTTGTGGTGTTTTGCTCAGTTCATTTTAGAGGAGTCTGCATTTTTTGTACAGAGATTGTACAT CTTTGCAGTATTCTTGAGCTTCTCCCGAACTCTTTTTTGCTTTTTTATCGGTCTATTCTCTTGTAGGATATGTGATAATCTTTCTTCCCTTGTCATTCCT TTTTATTTGTCTCTCGCATAAAAAGGTTGCATTGATAGTCTTCCCCCTTGTCATGTCCTGCTTGGTCTATCTACGTTTCAATTTTGGCATTTCTAAAGCC ATATCCATAGTGTTTTGGAGCCATTGCTCAATAATTTATGATGTAATAGTCAGAATGGAAATAGATGTTTGCTTATCAAATGCTAAAAAAATATAACTTG TTAGTGGATAATTGGAGATTATCTAAGCAGGAGTTGTATCTATCTTCTCCATTTTATGAAAGTAAATGCCTTACAATTTAATCTAATATACAAATTCAAA TAATTTCATATCGTTGATCCATTTCATATCGTTGATTCACCTAGTGGGATAAAGTTTGGTTGTTGTTGTATGCAAATTCATATAATTTGAAGTGGAATGA CACATCTACTACCAAGACACATTTTTATCATGGGGGTTTGGATGATTGACAAAAACTTTCTTCTGTCTGAATTAGGCACCAGACAACGACATTGGGAAGA GCTCTTTTAATTATTTTCAGATTAGGTCAGCTTTTGCAATGGCTTTCACAACATTGACAAATTCCAAGGTCATCCTTAGCTTAGGACCCAACAGAAGCAT TCTCGGCACTATAATAAGGCCAGACCCTGTCTTGGTGGAGCGTAAAGGGGGGCTGAACGGGGATGTGACTTTTAGTAGCTTGCTCCCTGGTGCTGGTGAG CCATTACAACAGCAGCACGGAACACAAGATATCTTATGCAATTGGCACGTAGAAGACGAAGAAGAACCACTACCACGGGGAACTGATGGTAGTTCAACGC CTAGCAAAAGCTCTTCCTCAAAGAGGAGGAGGAAATCTGCATCCAAAGAGAATTCCACTAAGAAGTTAAAGGAAAATGGAAGTAGCCGGAAAACCAGGAA TGAAGAGAATGGCTCTACTAGAAAAGAGAATGGTACAAGGAAGAAAAAGAAGAGAAGTAGTGACACTGCTTATATTCAATATACAGCAGACCAATAGTGG AGTTTCTTACAGACAGAATGTTGGGGGCACTGTATCATATGATCAGTGGCTTAAAAGTGCAGGAACCAGGCACAGCATAATGGTTGAGGCTAATTTGGAG TCCAAAATCTTATCAAGTTGTGAGCTTTTATGCATACCCAGAGAGAGGTTGCATTAGTGTATTAATTAAAATAAATCTATGATTTGTTAAATTTCTTTAT ACACATTGTTGTTATTGTTGGTTATGTCAAATTTTGTTAGAAAAGAGTGTAAGCTTTATTGTCAGCTGATTTTGATAGTTTCCTGTTTCCTTTTGTCTTA TTCCGAATGAACTTATAAATTAATAAAGAGTCAATCATTCTGCACTAAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_37362; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_25103
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Non-canonical poly(A) RNA polymerase protein Trf4-1 from Sophophora with 42.99% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425299.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |