| Id Trinity | FTRINITY_DN53887_c7_g1_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_23655 |
| Sequence | ATAATAGGGCAGCATTATATCGTCATAAATCATAATAACGCTGTGACCCAATCTCGCCGTAGCCGAAGGTGAGGTCTATAAATAACACCGCATAATCTCA CATAACGCAATCTCTTCATCACTCTCTTCTTTTCTTCGACTTCTCTATTTTTCATTCTTCTCTTATGGCTAAGCCACGTAAGCCTAAGAACGAAGACCCT AAAACCGAAAATTCCGGTGCCCTAGTTCATCATCAGAAGCTATGTCTCTCAATCGACATGGATAAACGCCTTCTCTACGGGTATACTGAATTGGAAATTG CGGTACCTGAGATTGGGATAGTTGGATTGCATGCGGAGAATTTAGGGATTGAGAGTGTTTGGGTTGATGGTGAACCTACTGAGTTCGAGTATTACCCGAA TCATCAGCAACAATCTGAGGATGAGAATAGATGGAGTTCTGTTGATTCTCCTAGCTCTGCTGCTGATGCTGCTGGTTCACTTTACTTATCTGCTCTTGAG AAAGAGCTGGTTCCCAATTTACTCATTAATTGTTGTAAGCCTTTTAAGATTGACACTGAGCAGCAGGATCAACCTATTTCTGAAAATGGGTTTCCTTCAT CTGCCAGCAAGGCTAATCAGGTTATAGTAGCCGCCTTTGATTTTATTCTCCGCCTAAAGTTTTTATGGCTTTGTAGCAACATATCTGAATACTAATGTGT ACGTTCCCCCCTACAATTTTGAATTAGCTAGAAGTCAGTGGACAGATTGAATTTTATTTACAAACTTGAATTATGTAAAAAGTAAACGGACAGAAGGAAT TTTATGACGTTAAATGCGGGAAGGAATTTGTATTTTGAATTACCACAAGTCGTAGACATGCTGCCACATGTTAGTTTTCACCATGAAACCTGGTCCACAG TAACATAAGAACCACAGATATGTGGCATGGATAATACATGATATATTTAATATATACGGGGAAACCATAAAATAATTGGAAGATATACAAATGAAAAGTA TATGAAAGGTATTTAAGTATGGGATACAGTATATTAAATACTGGTATGACAACCATTTTGAAGATCTTGTGTATTGTGTCACCATCACTGATGTTTTATT AAATTTTCTCCCTATTACTATTTTTAAAATATGTATAAACAAACTTTTCACACATTAATTGCAAAGAAATGAGCTGTTGTCTTTATGTCGTTGGGTAGGG TGGCTTCCTTTCCTAAATATATGGTGAAATGTGGGAGGCTGAGTTGTTGTGGTGAGGTTTACTATTTGTGTTTTCTCATGTAGGTTGATGTTGGGTGCAG AATGTGAGATTGGTTCGTATTGACTATTGGATAGAGAAGGCAGAGACAGGAATCCACTTCAAAGATAATTTCCTTCACACTGATAACCAAATAAGAAGAG CTAGGTGTTGGTTCCCGTGTGTAGATGACCATTCACAGCGATGCTGCTATGACCTGGAGTTCACTGTAGCACACAATCTTGTGGCTGTCAGTACTGGAAG GTTGCTATATCAGGTCTTAAGCAAGGACAATCCTCCTCGGAAAACATATGTGTATAAATTGGATGTTCCCGTTGCTGCAAGATGGATATCTTTGGCTGTT GCCCCATTTTCAATTCTTCCTGATCACCAATTTAGTTTCATATCACATATGTGTTCACTGCCCAATCTGTCAAAGATGCGGTATACAGTGGAATTTTTCC ATAGTGCCTTCAGCTGCTATAAGGATTATCTTTCTGTAGACTTCCCGTTCGACTCATATAAGCAAGTTTTCATTGAGCCTGAGATGGCAGTTTCATCATT GAGTTTAGGAGCATCTATGAGTATATTTAGTTCTCAAGTTTTGTTTGATGAGAAGCTTATTGATCAGACTATTGATGCAAGGATAAAACTTGCATATGCC CTTGCAAGACAGTGGTTTGGTGTATATATCACCGCTGAGGCACCAAATGATGAGTGGCTCTTGGACGGGCTTGCTGGTTTCTTAACAGATTTTTTTATTA AGAAGCATTTGGGAAATAATGAGGCACGGTACCGGAGATACAAGGCAAATTGTGCTGTTTGCAAAGTCGATAATAGTGGAGCGACATCTTTGAGCTGTTC AGCTTCTTGTAAGGATCTATATGGAACGCAATGCATTGGTTTGTATGGAAAGATAAGATCATGGAAGTCTGTGGCAGTTCTTCAGATGCTGGAAAAGCAG ATGGGTCCTGAATCTTTCCGGAGAATTTTGCAAACTATAGTTTCTCGGGCTCAAGATAAATCACGTTCCATGAAAACTATTAGTACTAAGGAGTTTCGAC ATTTTGCAAATAAGGTTGGAAATCTTGAACGTCCATTTCTGAAAGATTTCTTCCCCCGGTGGGTCGGTTCATGTGGATGTCCTGTTTTAAGGTGTAATAA GAACTTACCTCTTACTCTTTATTTCATTTTTATGGAGCTTTCTGATATACTGACGTGTTGCCTCTTGTTGCTACTAAGGATGGGGTTTTCCTATAACAAG AGGAAGAATATGGTTGAATTGGCTGTGTTGCGGGGGTGCACAGCATTGCAGACTTCAAGTACATCTGTCCTTGATATTAATCCAGATACTGAAAGTCGAG ATGGAGATACGGGATGGCCTGGGATGATGAGTATCAGGGTATATGAACTTGATGGTATGTACGACCATCCAATTCTTCCAATGGCTGGAGATTCATGGCA ACTACTGGAAATACAATGCCATTCCAAGCTTGCAGCTAGGCGCTTTCAAAAGCCTAAGAAAGGATTCAGAATTGATGGCTCTGATGATAATGGTGATGTG CCTTCCATGGACATGCGGTCCAGTGCCGAGTCTCCTTTACTATGGGTCAGAGCAGATCCTGATATGGAGTACCTTGCCGATATTCATTTTAATCAACCTA TTCAGATGTGGATTAATCAATTGGAGAAGGACAAAGATGTTATTGCTCAGGTGCAAGCAATTGCAACTCTAGAGGCATCCCCCCAGCTATCATTTTCAGT TGTAAATGCCCTAAACAATTTTCTCACTGACTCTAAGGCTTTTTGGAGAGTACGAATCGAAGCAGCATTTGCTCTGGCAAGTTCAGCATCTAAGGAAACT GATTTTGGTGGTCTTCTCCATTTGGTGAAATTTTACAAGAGCCGAAGGTTTGATCCAGACATTGGACTCCCAAAGCCAAATGATTTTTATGATTTTGCTG AGTATTTTGTTCTTGAGGTAATGCAAGGAGGTAGGATGTGTATGACTGATGTGATTTGTTTGAAATATGTTTGTGATTACATGTACTCTTGATGCAACTG TTTATTTGTGTGATGCAACTGTTTTTATTTGTGTGATGTCTATATCTCTGCCTTAGTGGACTACTGCTATAAGTTTGTCATGTTTATTTGTGTGAGTATA GTGTATCTTAGGTTCAGTGCTTTTTTTTCTTTAACTTCGTTGTATCGCGTCACATGTCCTTTGCAAATTTGACAAATAAGCACTAACCATATAGTTAAGT TTCATTATAGGATATATATTTAACACAAGAAAAATGAAAGCGTTACTAAATAGCACTTAATATATAACTCATAGATCTTTACATTTAAGCCTATCTGTGG GTGTGGGCATGTTCATGTGCATACTGTCCTATTTACCCAAATGGCCAGGCTTCCATAAATGCCAAATCTTTGCATTTGTTGGTGTGTGTGCGGTTTGCAA GGATGGATTAATTTAAAATATATGTAACTTTTTTTGTTAAAATTTTGGAATTATATCATGATCTATCCATTTTTGTTGTTTTTGAGTCTCAAGTCTTGAC AGCAAGGAAACAGGAACACTTCAAAATATTCTGTTCCAGTGTCAGACATGCATCCCTTGGGACCAATACATGCCAAGGGACTGAGTTGTCTTTGTATTTG CTGTTTTCTTTCCTTCCTCTGTAGTATCTTTGCAGGCTAAGGAGAACTCTCAATGCTTCTATTTTGTACTGTTCTTGTTGAATCCTTGTATTATAAAATA AGTCACTGTAGTGGTCAGGCTTACAATGGCAATCTAATTTTTGGTACATGGGAAAAATCACTATTGTAGCATACTAGCCTCCTGGCACCTTTAAAAAAAT GCATATAAGACACTGAGTGTATAGTGGACCAGACCAAACTTAACATGTATGAAGTTTGAATGATGCTGGAGTTATTTGTAGTGGACCCATATGTGAAGAG TGCCAGACATTTATGGATAATGTAGAAGCAGAGCTTATGTTTTTTAGGATGGAATACAATAATCCCAAAATATAGATAACTACTTGTCATTATTGGAATA TTGGGTTGCTAATCTTCATTTCATCTGTTCATAGCCTACAACTCTGTAGATTTTGTAAAATTCCGAGGCCTTCAAGTTGAATGTTCGAGTTGAGAATAAT CATTCTCTTGGTTTTACATTTTGTTGCTATAATGCTTAATGTTTTTCTCACTGTTTTGTTTCTTTTAGAATTGTTGGAAGTTGGAACATAAACGAGAGAA CTTTTTGAATTTTTTAGGGCAATATTTGTTGTGGTTCACAGTTGAATATTGAATGTGCCTTCACTTAAGTTCTGCGTACATTATCAGTAACGTTTGTGCA TTTTAAGATAATTATGAAAGTGGCATTTATATTCTGCCTATCTGCTAGATCATGAACCATTGTTTCCATGTTATCTTTTATAACTTCATGCTCGTTTTCT TATTGCTTACTAATGGGCTGTTGTAGGCCATTCCACATGCTGTAGCTATGGTAAGGTCTTCAGACAAGAAAAGCCCAAGAGAGGCTATTGAGTTTGTCTT GCAGCTTTTGAAGGTTGTTGCTTATTTTATGCTGCTGGCACTAATTTCTTCATCAGAATTTTTTTTCACAATAACATCAACAATTAAACCTAATTCTCTA TGTTATTTCTTTATGCGGTTGTTCTAACGCTCACCATTTTTGGGATTCTTCTAGTGCCATATATCACTGTCCTTTGGATTAACGATGTGTTACTTTGGCG AAGATAATTTTATTTTTAAGGAGTTTACTTCTTGATTTGGGCTATATAAATGTTATGTTAACAGTTTTGTGACTCACAAAATTTTCCTTCTTTTTTTGCA GTACAATGACAATAATGGGAACCCTTACTCAGATGTCTTCTGGCTTGCTGCATTGGTTCAGTCAGTTGGCGAGCTTGAATTCGGGCAACAGGTTCATGGA CTATTACAGTATTAACTCTTGCTGATTTTCACAATTACTTGCATGGATCAATATGCTGATTTGAGTTTGTTGTGTGTCCTTTTGTTTTTCTTCTACTAAT CAAAATCTTCTTAAATACCTAAAAAGGGTGGTCCTGCATGAGGCTGCCACCCGTTGGGATCTAGGGAGGGTAAGTAAATATATGCAGCCAAAACATATAC CTTTATATTGAAAGTATTATGTTGATAATTTTGTTGGTAACAAGCATGACTTTTTCTTGTATAATACCTGTTAAGTTTTCATCTTAAAACCAATTGGCAA TGAAAGGAGTAATCCAAGAAGTATCTAAACCATGCCTAAGAGAATGAGGCAGACAATGTGGGACTCATTTCCCAACATGCTCCCTTTCACATAAGTCCGT CAGACAAGGCGAAGGGTTACCTTTGACTCATGACTAAAAGGGCATCTTTTTGGTCCATGACAATCAGAAAGAAGTTGAGCCCTAACTCTGATACCATGTT AAGGTTATATCTCAATACCAATTTACGATGAGAGGAGTGACCCAACATGTATTTAAATCATGCCTAAGAGAATGAGGCATTCAATGTGGGACATACTTCC TAACCATGTCCATCCCCTTTACAAAAAACCAAAGAGGTTTTTTGGACTTGGACTATATTTTTTGCATCAGCTGTTAGTTTATATTTATCATTGATTTGGT TCTTACTTTATCACAATTTTTGGAAACTTGAGCCTGCTTAGTATTGACAATTAGGTTTCTTTCTGTCTCTAAAATTGATAACAGAGTATTCTCCTATTGT CGTCGCTTCTCAAGCATATTGACCGGCTGTTACAATTTGATAGTCTCATGCCAAGCTACAACGGGATCTTGACTATCAGTTGTATCCGGACATTGGCTCA GATTGCTCTAAAGCTATCGGGATTTGTTCCTCTTGATCGGGTATATGAGCTGGTAAAGCCTTTTCGGGATGTAAAAGCAATGTGGCAAGTTCGAATAGAA GCATGCAGAGCACTTCTTGATCTCGAATTCCACTGCAAGGGCATTGATGCAGCGTTACTCTTATTTGTCAAATATGTAGAGGAGGAGCCTTCTTTAAGAG GTCAGTTAAAACTGGCCACTCATGTTATGAGGCTATGTCAGATGAGAGATGGATTGGATTCAAATGATGGAATTACAAGCCAAGCTCTTGTCTCTTTGCT TTGTTTACTGGAAGGACGTATGGCTTTTAAAAATGTCTTTCTCCGTCACTACTTATTCTGCATATTGCAAATACTTGCAAGAAGGCCCCCAACTCTACAC GGGGTTCCTCGAGAAAATAGAACATTGCATTTGAGTCTTCCAGAAGCTTGCAACTATCAAAGGAACATATTTGTTCTTGATCCAGAAAGTAAACCTTTGG AACTGCCAAGCTCTACCCAAACCTTTGCACAAGATTTGGCCTTGACTGATGGTTTGAGGGGTGCAATTGATGAAGCTCCTAATGGTGCACCTTGTGAAGT TCCCAAACAAGCACATGTTGAAGCTCTAAGGGAAGCACCCCTGGAAGTACCCCCTGAGGCTCCCGATGTGGTATTAACAGAAGTTCCTCAGGAAGCACCA ATGGAAGCACCCAATGAATTTTCTAAGGAAGCTGATACAGTATCCAATAGTCATGAACGAAAAAGGACAATTAAAATCAAGGTTAAACAATCTTCTGCCA CCAGTCGGGCTGATACTGATAATCAAATGGTTGAACGCTCTATAGGTCGACGTACTGAAATGGACCATGGAGCTAGCAGTTCAGTTTCTGTAGATGCACC CCAAAGGAATTTTGCTGAGACTCTGAGCGCTGGTAATCAAAATATTGAGGAAGTTAATTCTTGGCATGATCGGGGTTCTCGCATGACTGCTAGTATTGGC AGTGCAAAATTTTTGAGTGATGGTGATGAATTGGTCAAAGAACTCCAATGCACTGCTGATTCAAGTTTAGTTTATTCACAACCTCAGCCAGAAGACCCAT CATCATCTAGCATTATTCAGGATTACAATATAGATGCTGATGCACGACGATATGCCAGCCTTCAAACTCTTTCAGCTGCAAGACTTGATGGAGATTCATT GGGTAAAGAAATTTCTGTTCGTGGGAAAGAAAAGCAGAGAGGCAAGGACAAGAAACGAAAGCGCGACAATCATAAAGGGCGCCAAGATGATCCAGAATAT TTGGAGCGAAAGCGATTGAAGAAAGAGAAAAAGCGCAAGGAAAAAGAAATGGCAAAACGGCTGAGTGATGTCCAAAAGAAACCTTCCGTAGACTTATCGA ATAAGAAAGAGGAACCTGGAGTTAATGTAGCAAGACAACGGAACGCTGTTGAATCCAGTGGATATAATTCTAAATTGGAAATCAAAAAGACTGATACCAA ACCTGAGGCACCAGAAGGTACACCTGGTGCACCAAAAATTAGAATTAGAATTAAAAACCATATCCTCAATAAGTCGTAGAGGATAGGATAAAATTAGTCC TTTTACTTGTAGATGTTAGTATTAAATCAGTCATTATCTGGGTTGTATTTTTCTTTTCAATATCCGGCTTAGCTACCATTTAGGTAATCACAATTGTTGA TTCCATGAGCTTTATTTGTTGGTGGATCTTTAATCTAGTTTTAGTGATATTGAATTCACAATCATATAACTTGGGTATTGTTATGGAGGGAGGGATAGCC TCTGTTATTCAAAAGCTGTTGTAAATTTGTAATTTTTGCATCGGATGTAAATGTGTAATTTTATTGCATTGTTTTGCAAAGTATTGCTTGTAATGTTTTC AGACATGGTTTCCGCGTGTCAAGTATTCTATTGTGTTACCTTTTTAGTTCGCATATTATTGTAATATGGATGTGGCTATGTCTTGGTTAACCAAATTTGC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_37688; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_23655
| Blastp | Transcription initiation factor TFIID subunit 2 from Arabidopsis with 45.68% of identity |
|---|---|
| Blastx | Transcription initiation factor TFIID subunit 2 from Arabidopsis with 65.01% of identity |
| Eggnog | TAF2 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor(ENOG410XS52) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G73960) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000322) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019451981.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |