Id Trinity | FTRINITY_DN53912_c1_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_91135 |
Sequence | CTTCACTTCTTCACTTCTTCACTTTCAGTTCATCACTTTCACTGTAGCAAGTGTGGCAAACAAAAGCTTCTCACTCTCCCAGAAATCACTTCATCTCCTT TGATTTCCAAGCTTCTTTATTTAGTATAAAACTTTCTTCGACACTTTCCACAAACACTCCAACCACTTTTTCTTGCTTCTGATGCTCCTCCCCAGCTCCA AATCCAAATCCAATTCAGTTCAATCAATATTCGTTTCGGTCTTAGTTTTTGTGTGTTCTTTTGGTGAATTTTAGTGTTTACACGGTTTTTTCTCTTGGAT TTGTAAGCTTTTGTTGCGATGTCTCTTATGGATTGATGATGTTATAATCTTTAGTTGCTCTTTGTTGATCTAGATCTACTTTGTAACTTCTATTTTTATG TTTGTGGATTTCTATTTTTGATTTGATTTTACTGTAAGGTGTTAGGGTTTTGACTTTTATGATTTTGCTAATTTATGCTTTTTGATTTGATAAGTTTTAT GATATTATGTTCTATGCAATTGGATAGAGTTACTACTTCCTTTTCCAAAAAATATGGTATGATATGTGAAGCTGTTTGGTTGGTTGCACAATATGCATAT TGATTTGGTCAAAGCTGTCATACATGTATTAAGAGAATTTGAGTTTTCTTTTCGATCATGAAATAATTTAATGTGGCATGTTTAGCTATTTTGAGAAAAG AGAATTAACTATTTTGATGGAGATACAATGACTCATTGTCTAATGTGGCATGCTTGTTGATTAGTGAAACAAGGACTTATTCATAAGATTGTTTATAGTG CCATGTGAGGTCACATGATCCAATTAACAAGGAGGGCCACTTGAGTCTGTAAGCTAACTATGCAACTACAAGATATCAAGTTTTTTTAATTACTATAGTA TGAGAAAGGGAATGAGATAAATGGTGGGATATCTGAGATGTTATTTCTTTTACCAAGATGAGACTATAAATGTGTAACAGTGTCCTTCAAACTGCTAGTG TCGGCCAAAGGGTGTTGTCATTGACCACAGTAAACTCATGTCGGCAGGACAGTAAGTTTTATGGATGAGGATCCTCTGTCCCATGTTCCTGTCCCAACCC CTGTCCCGTCCAGTGATATTTTGCCACGTCATTTAAAAATCCACCTCATACTTAACAGCTCTAAACACTGTCAATTTCTCTTAAAAGTCTTATTATTCTT TATTCTTTCTTGCCTTCCCCTAAGAAGAAGAGTTCATTCTCTTGTGTCAACAAATACTATGATTTCATCTCATTACATAAGAGTGCTATGCGAGAGAGAT AATAGAACGGTTGGGGTCCTCTGATTGTTGATGATACGGTTCCCATTGTTGTAGAGAAGATTAGAGGACATGTATCGGTGGTAAGTAATATCTTGTAGGA AGCTTTGTGTTTTAAGAAACAACTTTTGATTCTGGTCAAACAATTTCATGTTATCTCTTCTCATTGTTATCCATTTTTGTTATTTATTTTTCAAACTTTC CTGAACTAAATGGAGTTAATGGTTATATTGTCAAAAATTGCATATTAGATGTTCGATGAACTGTCTAAGAGACTTTAAGGGCCAGAAACATATGCATATA ACTTGACAGTGTGTAGAATTACATAATAGAGTAAATCATACAGAATTATAAAATCATAATACATGGCCAAGGTCACATTACAATTCTCTCTGTTTTTTAC CCATATACTAAAATTCATGTATATGTTATTAATCACCTATGTATTAAAAGAAAAAGTGCATTTAGTGACCTTAGCAACATTGACAGTGTGTTACTTGTGT TAGTGAGAAGATGCATAAATCATGGTTTCTATTGCTAGTCGTATTTGTGGTGGCCAAGAATGGTTACTGACAATGTAGCTAAGGATTTTTACATAAATTG ATGTTGGTGGTTCTGTTAGGTTGGTGTTGTGGAAGATGAAGTGATTTATGGCGAGGGTAGTTTGGGTTTTTCAGAATTAAGATGCGGTAAATTTTATTGG GGATGGGGTTAAAATGAACTCTATTACTTCACCTCATCCTTGTAAGTGACTTAAGTTTTCACTTATCATATAACTTGTTAGCATGTTGCTACCAAAGTTT TTAGTTTTTACACAAATAATGATCATCAATTTGTTCTAAACTTGCATGGCTGCACAAATTATAATCCTAACCTTCTTAAGTACTCTTGCCATATCAAATG CAGGTTTTATCCTCTCCATGTCATGTCATTTGTATCCATGCTACCAATGTAATTCTCAATGGAAATAGTGACACATGGAAAGTGTAGTACAACCATTGAA AGTTTCAGGAGTACTTCTTGCAACAAATGATGATAGAGAACAATGTTTAGAAGATCATGGTGGTAGTTGTGGAATGGTGGCAGATCATAAAACTGACATG CAGAATTTTAGCACCAGTGTGATGTTATCAAAACTAATATTAGCAAAGTTTAGTCAAATGAAGATGTCAGTTGAAACTCTTATTGTACTTTCATGATGCT CAAATTATTTACAAGACCAACATTTGTACACTTGAAAATTGTCTTGTAATGCAAATGTTTCTATATACTTAGAAAATTGTTATGTTGTCTCTTTTATTCC GTAGGATAAGAACAGGGTATGTATTTATGAATAGATACAATATCACTTTTAAGTTAACCTTGAATGCAAAAGTTATGAATCAATCCTTGTAATGCAATAT TTTTTAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_37973; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_91135
Blastp | - |
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Blastx | Protein NEOXANTHIN-DEFICIENT 1 from Lycopersicon with 40.79% of identity |
Eggnog | NA(ENOG4111GNU) |
Kegg | Link to kegg annotations (101248551) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014523161.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |