Ll_transcript_89728

• Id Trinity: FTRINITY_DN53942_c1_g2_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_89728
• Sequence: CTGATCTTACCTATTGAGATAAAGACTTGATTGTTGTTGTTGTTTATTTTAAGTATTTATGTGTTGTTCAATCTCAACTATTGAGATAAAGACTTGATTA TTGTTGTTTTTAATTTGTATTTTTTTAGTGTGTCAATTTGATTGATGATGTCTGTTTGGCTTTGGTGATTAGTGAGACTGTCAAAATTGTTTGTATGATG TTTATAGGTGATTAGGCATTTTCAATTGTTGTTGAGAGCCATGACATGACTTCTTTGGATTTAACTTAATAGAAATTTGTTTGGCTTCTCTACAAAATTA TATGCTTTCTTTGAAGGTAAACTTGCTACTGCAACTGCCATAACTTATAGAATTTGAATGTTGTTAGACTCACAAATCACTCAACACCCGAGTGTTTATA ACCGCTCAAGTGTTTGAACTCTAACTTTTATAAACAGTTGGGTGTTCTGTATTTGCAAATGCCTGATAGTTTCCTAGCATTCTGCTGTATCATAATAGTT GATAATTTATACATTAATCTCTATAAGTGAATTTGTTTTAGCATTCCCAAGACAGTGGTGCATGTTTTAATTGGGTTGTCTGTTGCATTGGTTTAGTTCT CAATCATGTGATTAATCATTTTGGTTTACTGAGAATAGCGTGTATAGGTATTAGGTACAAGTTATTTATTACCATGTCCATTAGATAATAATAAGCAATT TAGAAGTTGCATCTATACACTAACGCCAATAAATTCGAACTTTAGACCAAACCCATGATTGAGATTCATGGTTTTTGCTGAAGTATTTGTGCTTTTAGAT GCACACAATGAAAAGCTTTGCTTAATTGAGATTATTGTGTAGGTGTAAATTACTTGGTTGGGTTCCTGTAAAAATGTTAACATGTAAAAAATGCTTCATA TCTGGGTTTTTTAGTTGCCCTGGTATGGTAGCACATACAACTAAGCTTTTAGCTCTAGGTTTTATTCAGATTGAAGTTAAAAAAATTCTTATTCACTTGC TGGAAAGCCAGGCTCCTCCGAGCTCTCAATTAGCAGGATTCCTAGCAAGACTCTCTACTGTTGCATAGGTGAACCTCGGCGCGATGGCAAGGTTTCTCGC CTTTTTATCCAGAGGTCACCAGTTCAAATCTTAGAAATATCTTCTTTGCTTGCGAGGGTAAGGTTGTGTAAATCTACCCTCTCCAGATCCCACTAGGCGG GAGCCTCATGCACCGGGCCACCCTTTTAGTATGCTTTATACATTTCCGCAACTGATGTAGAAGTAGAGCTATAGCTTTATCGAGTAATAGGAATCAACCA TGACTTAATTCATAAATTGATGCACCAGAAATCAATGATGGGTAAGTATGTGTAGCAATGAAGAGTGATGAGATCGTTAGATTTGTTTTGGTTCCTACTA AATGCATGGGTAAATATGGGCAACTGTTATCTTAAACTACGTAGTTAATAGTGTGGCAAATTGCAACTGGTTTCATAGCCCATCACAGGTGCTATTGCAG CCTATCAAGGGTGCTATTGTGGCCCATCATGGCCCTACCTTGAACAGAGTGTGAAAACCCATTATTATCCCTGCTATTTGGCTATTCCTCTCATTTATTT CAGATTTTTTGCCATTTTGCCACCCTCAACTAAATCTGAATATTAGGGTTAGAAGCTTTCGTCATCTCATCCAGCAGCCGGGCTTTCTCTCTCGCTCTAT TCCCCTTGTTCCAGCTAGTTTCCAACCTGTTTCAGTGATTTCAGGCAAGCTTCCACTACTTTTCCCTTTTTGAGTTATATTCAACAAAGCTAATGACAAT GCATTTTGATTATTAATCATGGATTTCTTTAATTGTATTTTTTAGTGTTTCTGCGTAAGGTATAAATTATTTAAATTCTTTCCCTAGTCATCGTTGTAGC AACCATCCCGCTGTCATCATTTTTGGGGTTGGCCGCTATGTGCTGCAATCCAAGATTGCCTACATGTATCTTATTTAAAAAAAATTAAGATTGAATATAC AGTTTGTCTAACCTGAAGTGTGTTATACCGCTTTTATTTTTGTCGACCTTTATAATTTATATCTAAATATGATTCAGGGCAAAGGAGTTAGCAAACTTCA TGATTAAAGTAAGACCAGCTTGGTTCTGTCTGTATAGGATGACTAACCCTTTGGGACTGATTTATTTTCAGAATTGTTTGAGTTATTTGTTTGTGTTTGA TATTTTGAATGGTTATTGACAGGTTAGTTGATTTTTGGATAAGCTGGGATGGGTTTCACCACTCATATAATCACTGTTGCAATTGGGGAAGACATTGCAG AGAAAATTATCTCATTTTCTCAGCAGAGCCCTAAAGGCACAGCAATTTGTATCTTGACAGCCAACGGTGCTGTGTCGACTGTCACGGTTCGTCAACCTTC AACAGCAGGTGGCACTGCCATATATGAGGGGAATTTCCAGATCGCGAGCCTTAAAGGGTCATACTTGCCTACTGATAGTGGTGCCTCCCAATCTGGTGGG CTAAGTATCTTGTTTTCTTGTCCTGATGGCGGTGCCATTGGTGGAGTAATCGGTGGCGTGCTCATTGCTGCCAGCGAAGTTCAGGTTATTATTGGGAGCT TCGAATATGGAGGATCAAAGGCAAAGAGAAAGAAGATTTAGAATGCACAGTTGCGGTGAACATGAGGGATATTCTGCCACATAACTTCTATTTGGCATAT AATCATGTTATTTCTTCTGCCAAATTCATACAAATACTTCTTTTCATAGAAAAAAAGATTGAAGGGAGAGGCCTATTTTTAATATCATACTATGTAATGA GTCTCAATGAGAACTTAAGATAATATTTAGAGAAAAATCTGTTGTAGCTACTTATGGAAAATGGTCATGTAAATTGCTGTAGTTAACTTTGTAAGCAAAA TGCCCTTTATTTGACTCACTTGATGTAGAGCTTATTACTTTGTGGTTCTCTGGCCAATCTGTGTAATCCATAATTTGTGAGTTTGAAGTATGTTAATTCC TTTTGACATGAGATACACAGTTTAATTCGCGAAACCTACGCGTCAAGTAGGCATACTTAACGCGAAGGTTTCACGAGCATATCGCATTTTTTGAACATGT GGGTTTGAAAGTGAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_38249;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_89728

FPKM

• FPAB: 3.6
• FPNAB: 1.2
• LF1: 1.2
• LF2: 1
• LF3: 1.4
• LF4: 0.7
• UF1: 1.2
• UF2: 1.1
• UF3: 1.8
• UF4: 1.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_89728

• Blastp: AT-hook motif nuclear-localized protein 1 from Arabidopsis with 52.24% of identity
• Blastx: AT-hook motif nuclear-localized protein 1 from Arabidopsis with 52.21% of identity
• Eggnog: AT hook motif domain containing protein, expressed(ENOG410YFD3)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G12080)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460602.1)
• Pfam: Domain of unknown function (DUF296) (PF03479.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;