| Id Trinity | FTRINITY_DN53942_c1_g2_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_89718 |
| Sequence | CTGATCTTACCTATTGAGATAAAGACTTGATTGTTGTTGTTGTTTATTTTAAGTATTTATGTGTTGTTCAATCTCAACTATTGAGATAAAGACTTGATTA TTGTTGTTTTTAATTTGTATTTTTTTAGTGTGTCAATTTGATTGATGATGTCTGTTTGGCTTTGGTGATTAGTGAGACTGTCAAAATTGTTTGTATGATG TTTATAGGTGATTAGGCATTTTCAATTGTTGTTGAGAGCCATGACATGACTTCTTTGGATTTAACTTAATAGAAATTTGTTTGGCTTCTCTACAAAATTA TATGCTTTCTTTGAAGGTAAACTTGCTACTGCAACTGCCATAACTTATAGAATTTGAATGTTGTTAGACTCACAAATCACTCAACACCCGAGTGTTTATA ACCGCTCAAGTGTTTGAACTCTAACTTTTATAAACAGTTGGGTGTTCTGTATTTGCAAATGCCTGATAGTTTCCTAGCATTCTGCTGTATCATAATAGTT GATAATTTATACATTAATCTCTATAAGTGAATTTGTTTTAGCATTCCCAAGACAGTGGTGCATGTTTTAATTGGGTTGTCTGTTGCATTGGTTTAGTTCT CAATCATGTGATTAATCATTTTGGTTTACTGAGAATAGCGTGTATAGGTATTAGGTACAAGTTATTTATTACCATGTCCATTAGATAATAATAAGCAATT TAGAAGTTGCATCTATACACTAACGCCAATAAATTCGAACTTTAGACCAAACCCATGATTGAGATTCATGGTTTTTGCTGAAGTATTTGTGCTTTTAGAT GCACACAATGAAAAGCTTTGCTTAATTGAGATTATTGTGTAGGTGTAAATTACTTGGTTGGGTTCCTGTAAAAATGTTAACATGTAAAAAATGCTTCATA TCTGGGTTTTTTAGTTGCCCTGGTATGGTAGCACATACAACTAAGCTTTTAGCTCTAGGTTTTATTCAGATTGAAGTTAAAAAAATTCTTATTCACTTGC TGGAAAGCCAGGCTCCTCCGAGCTCTCAATTAGCAGGATTCCTAGCAAGACTCTCTACTGTTGCATAGGTGAACCTCGGCGCGATGGCAAGGTTTCTCGC CTTTTTATCCAGAGGTCACCAGTTCAAATCTTAGAAATATCTTCTTTGCTTGCGAGGGTAAGGTTGTGTAAATCTACCCTCTCCAGATCCCACTAGGCGG GAGCCTCATGCACCGGGCCACCCTTTTAGTATGCTTTATACATTTCCGCAACTGATGTAGAAGTAGAGCTATAGCTTTATCGAGTAATAGGAATCAACCA TGACTTAATTCATAAATTGATGCACCAGAAATCAATGATGGGTAAGTATGTGTAGCAATGAAGAGTGATGAGATCGTTAGATTTGTTTTGGTTCCTACTA AATGCATGGGTAAATATGGGCAACTGTTATCTTAAACTACGTAGTTAATAGTGTGGCAAATTGCAACTGGTTTCATAGCCCATCACAGGTGCTATTGCAG CCTATCAAGGGTGCTATTGTGGCCCATCATGGCCCTACCTTGAACAGAGTGTGAAAACCCATTATTATCCCTGCTATTTGGCTATTCCTCTCATTTATTT CAGATTTTTTGCCATTTTGCCACCCTCAACTAAATCTGAATATTAGGGTTAGAAGCTTTCGTCATCTCATCCAGCAGCCGGGCTTTCTCTCTCGCTCTAT TCCCCTTGTTCCAGCTAGTTTCCAACCTGTTTCAGTGATTTCAGGCAAGCTTCCACTACTTTTCCCTTTTTGAGTTATATTCAACAAAGCTAATGACAAT GCATTTTGATTATTAATCATGGATTTCTTTAATTGTATTTTTTAGTGTTTCTGCGTAAGGTATAAATTATTTAAATTCTTTCCCTAGTCATCGTTGTAGC AACCATCCCGCTGTCATCATTTTTGGGGTTGGCCGCTATGTGCTGCAATCCAAGATTGCCTACATGTATCTTATTTAAAAAAAATTAAGATTGAATATAC AGTTTGTCTAACCTGAAGTGTGTTATACCGCTTTTATTTTTGTCGACCTTTATAATTTATATCTAAATATGATTCAGGGCAAAGGAGTTAGCAAACTTCA TGATTAAAGTTAGTTGATTTTTGGATAAGCTGGGATGGGTTTCACCACTCATATAATCACTGTTGCAATTGGGGAAGTATGTCACTGGTTTTTACGAGTT TGTTTCAAGCTTTCTCTCTTTTTTTACCGTATGTTGAAAATTTTAACCTAGAACATTTATAAGTATTCCATGTTTTCTTTGGGCTGGGAGAGAAGGCACT ATCTTGAATTTGTCTCTTGAAATAATGTTAAAACTAATAGTATTGTATTCTAAGTAAATATTCATGTCATATATACTATTTTATCTTTTAAAAGGAAACT GTTGATTTAATAAAGTTATGTTGATATTGTCTATGATAGTTAGGTTGATAATAATGTGGGAGGCATAAAATAGAAGTGTCGGCTTCATCTTTATCTGTCA TTTATTGTTGTTGAAGTGCTACTTTTTCGTGTGAACTTGATTATTTTTATGGAACCTGTAAGCATATTGTTGCCTGAAAATGATTTCATTCGAGCCATAC AACTGTGGTCCGTCAATTATTTTCCTTTAATGTTTTTAATTAATGATCCTCTTATGGATGTGCTATATGTTCTGCCATTTGTTTAAAATATATTAGAAAT ACCGTTTTAAATTTGTGTTTTACTTCTTTGTAGGACATTGCAGAGAAAATTATCTCATTTTCTCAGCAGAGCCCTAAAGGCACAGCAATTTGTATCTTGA CAGCCAACGGTGCTGTGTCGACTGTCACGGTTCGTCAACCTTCAACAGCAGGTGGCACTGCCATATATGAGGGGAATTTCCAGATCGCGAGCCTTAAAGG GTCATACTTGCCTACTGATAGTGGTGCCTCCCAATCTGGTGGGCTAAGTATCTTGTTTTCTTGTCCTGATGGCGGTGCCATTGGTGGAGTAATCGGTGGC GTGCTCATTGCTGCCAGCGAAGTTCAGGTTATTATTGGGAGCTTCGAATATGGAGGATCAAAGGCAAAGAGAAAGAAGATTTAGAATGCACAGTTGCGGT GAACATGAGGGATATTCTGCCACATAACTTCTATTTGGCATATAATCATGTTATTTCTTCTGCCAAATTCATACAAATACTTCTTTTCATAGAAAAAAAG ATTGAAGGGAGAGGCCTATTTTTAATATCATACTATGTAATGAGTCTCAATGAGAACTTAAGATAATATTTAGAGAAAAATCTGTTGTAGCTACTTATGG AAAATGGTCATGTAAATTGCTGTAGTTAACTTTGTAAGCAAAATGCCCTTTATTTGACTCACTTGATGTAGAGCTTATTACTTTGTGGTTCTCTGGCCAA TCTGTGTAATCCATAATTTGTGAGTTTGAAGTATGTTAATTCCTTTTGACATGAGATACACAGTTTAATTCGCGAAACCTACGCGTCAAGTAGGCATACT TAACGCGAAGGTTTCACGAGCATATCGCATTTTTTGAACATGTGGGTTTGAAAGTGAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_38249; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_89718
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | AT-hook motif nuclear-localized protein 1 from Arabidopsis with 50.41% of identity |
| Eggnog | AT hook motif domain containing protein, expressed(ENOG410YFD3) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT4G12080) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460602.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |