Id Trinity | FTRINITY_DN53949_c2_g1_i12 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_89430 |
Sequence | AGAGAAGATCCGCAACTTTCGTTATTCTTATTGTTGAATGGAGCACGTTCCTTTGTTTCTCCCTTAACCACTCTTTCTTCACATTCTCTCTCTAACTATA ACTATCTCTATTTCCTTCAAATGCTTTCATTTCACACTTTCATTCACACCCTTTATTAGGTAACTCTTTCTCTTTCTTTACCTTTTCAACTTTCAACCCA TTTTTCTTTCACTTCAAATTTTTAATCTTTTGCATTCAAATATATCGTTTATGTCTTCAGTTTTTAGATTGAAATATGGGTTTTCGTTTTCCCAATGAAC AAGATCAGTTTTTTTGAGTTAATGTTCCTTCAACCAATGTTCATGTATTAACTATCTTCTTATTGCAATTATTCCTTTGATTCTTATTTGATAATGCTTA TAATTTAGTGTTTTATTTTTATAAAAAATATGATTTGATGGAAATAATTGGCCTATTGTTTGAGATAATGAACTATAGCCAATGTCTTCTCCTTTTTGTT TGATTTGGATGTTAATTATAGGATTTGATAAGAGAAAACAATGTGTGTCTATGTTATCTTTAAGTTGAAGATTGTATAACACAACCAACGGGTGGTTGGT TCAAGTGGTACATGTTTGTTTCCCTTTGAGCAAGACCCGAGTTTGAGTCTTGTGTGTGCGGAGGAAAACTCGTTCGAGTGCTAGCCACACTATACTATAT ATGTTCTCGGCTCTCGAACAGGGTTGTCTATGATGTTGGTTGGTATGATTAGCACACTACATCTCATAAACTAAACCCATATTAGGATGGTTGATTTATT TGATTAATAGTATAGGTTTAATTGATAAAATTGTAAAATTTCCTTTGATTGAGTTAACTATAATTGCAGCCAATAATTTATAATGACACATGATAAAAAA TCATTGTTAGTTGCTACCTAACCATAGCTACCACGTATGTACAATAACAACCACGCCTTTATCTCACTAGGTGGGGTCGGCTAGCTACCATGTGTATACA AGTTTGTAAATTGTTTTGGGTTAATGGACTCCCGGAATGATATCGTAATTCAGGAAAATGCTATAATCTTGTATTTCAGCATATAATATGTAATTCGGCA TATATTATTGTCTGGATTTGAGATATTAGGGATTTGCTTAGAGTGCAGTTGTCCTTCTATGCATGGAAATATGTAGGATAACTCCAAGGGATCCAACCTC TGAATTTTTCTTTTTAATATGATATCTTTCATTGTTCTTTTAAACTTGAACTATTCACCATATATTTATGTCTTACTGCTATGCTGGATTTAACATTAGA AGGTCGGAATTATACGATAGTTCGTGCATCGATAGTTTTTCTTTATTTTTGTATTACGTTTTCTCTTTTTTTTTTTTACATTTCCAGTTGTAGCTGCTGG TGCATTTGATGAACAATTCTTGATAGAATAATTCCTTTTGTTTTTGTTATTGAATTCAGGTGAGGACAGGATCCACAATGTTTTCGTTATTGCAAGTACC TAGATGCAGAATTCACTGCTTAGCTAACTATTGGGGTGAAACATTCCACAGTTTCAATAAGACTTATGGAGACAATTCTAGTACTATCAGGTTGCTTAGT TCGAAAACTTACGGGCTTCAGGGAGGGCAAAGAAAGAAGTGGACTAGAAGACCGATAACTACAAATACCGAAGGCACTGGGAGAACCAAATCAAGAAGTA CCAAGAATGAAATTTTGAGTGAAACAATTTTAACAAGTGCTACTGTAAATGTACATAAAGCACCGATAGATCAATCACAGGCAATTCAGGACTGTGTCAT ACAACAAGAGATTGCCCAGAATAAAGATTTATCTAGCTTAGTCACCGTTATTGTTTTTGACATCGAGACCACCGGGTTTAGCAGGGAGAAGGACCGGATC ATTGAGATCGCACTTCGAGACCTTCAGGGTGGTGAGAACAGCACTTTCCAAACTCTTGTAAATCCTCAACGGGATATTCTTAATTCGGAGATTCATAGCA TTACTACACAAATGGTCGACAGACCTGATGTTCCAAGGTTACCGAAATCTCTATAGCCCTTGCGTATTTTGGATTCCTTGGATTATGCTTACCTTTTCAA AATGAAGTATTTTTCTGACTATTATGGGGTCCTATTCATCCACTAAAAAATGCTTGGTTTTGTTACTTTGACAATCAGAAAAGAAGACTCATACTTTCAA TAAAAGACCGATAAGATGATGTTATGTTTTACCTTTTCAATTTATTCAGATGTGTTGTTTGAGTTGTCTTCTTTTTGTGCTTTTCTGTAGGATGGAGGAT CTGGTTCCCATTTTAATGCGCTATGTTCAAAGTCGTCAGAAACCTAAGGGACATGTGTTATTGGTTGGTCATAATGCTCGAGTTTTTGACGTACCCTTCA TCATTCATGAGTTCCGTCGCTGTTCTACAGAGATTCCTCTGGATTGGCTGTTTCTGGACACAATGTCTTTAGCTCGTGATCTGAGGAATTCGGATGGTCT CTCTCGCTCTTTTCTCTTATATGTGCATGCGCGTGATAATTCTTGCGGTTTATGTATGAGAATGTCTTAAATTTACGGTGATTTTACAATGTTAACAGGA ACCAAACTTTCTTCGAAATCCCTTGCTGCTCTTCAGGAACTCTACAGAATTAAAGTCGACGGAGAAGCTCACAGGGCTATGGTTGATGTGAACACATTGA CGTCGATACTTCCTAGGTTGACATATGATCTGAATCTGACCCTATCCGACCTCGTTTTCAAGAAATCATTCAGAGGATCGGATATTGTCGATTCGAAGAA CAAGAAGAAGAGTTCATAATAGTTTTCTAACAGTATTTTGTAGTGTTATTGTGACCAAAGAATTATTTGTAACTCTAGGAGTTGTATAATTGAAGTGAAA AGAAACATTGTTTGTAATTGTTGACATATTATTAAGAGTAATATACATGGTTATTATGTTCCAAATATCATCATTGTCAATGAGATTTATGATTATTTAA AAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_38302; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_89430
Blastp | Exonuclease DPD1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 41.8% of identity |
---|---|
Blastx | Exonuclease DPD1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 42.33% of identity |
Eggnog | three prime repair exonuclease(ENOG4111YSP) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G26940) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419638.1) |
Pfam | Exonuclease (PF00929.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |