Ll_transcript_90316

• Id Trinity: FTRINITY_DN53964_c4_g4_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_90316
• Sequence: CTGATCCTGTTCATGGACCCGTCGTAATATTTCTTTACTTTGTCATCTATATTTATGTCCTTTGATGTAGTTTTGGTGTTTTGAGCTGTGAAGTATGAAG GACTGTCACAGATATGAACACAGGGGCACACCAAATTCTAAAAACTGTAGCATCCATACATGATATATAAGTTAAAAACAAAAAATGTTCATAATTCATA ATACCATAGCCGCAGTGGAGCCCAAAGCAGTAAAATTTTAATTGATGCTGTGGGGCATGTGCTATCAGCGTTGTTTCCAGACACATGACATGAATCAAAT TTATGTCCATGCTTTAAGGTTTTTGAGTGTTTTTCTGTATTGTTGTTATTTTCCTTTTGAACTCATATATTGCTGCTATTGTTCATGATTGCTCGATTTT GACCTGCAGGAAAGTTAATATTATTTCTTATGATGTTGAATGTTTACATCATATCCCAAACTTCTACATAGCCTATCTTCCCAAAAGATTTATGTTTTGG TGTGGGATGCTTGTTTGGGTGTTCTTTGCTAATTTTTTATTTTCAGGATTGTTGTTTACTTTGCACATGCCTTGCATTGTTTAATTGGAAGGAGTATAGA CTTGTTACTACTCTTCTTTTTATTGATAAGTAATAAATGTCAAATTTATGCATCTTACTCTGTAAAAGCTCTTTAATTTTTATTACAAATAGAATAAAAA TCTATAATGTAGTTGAAGACAATAACACTACTATGTGTCAAAGAAGTACTGAGACTTTTGAAGGCCCAAAAGCATTAAGTAATTACCTGCATTTTGTTTA GCTTATTTACAGTAAGATCGCAAACACATCAAGAGAAAGAAAACATTGTTTCTTTTTCCACATAGTAGATGTGGCGTTCAGGATATTTGTGGTAGATTTA CTCATCCATTTTGAAATTCCTTTGAAAACTGTCCCTCCTCCTTGGTGCTCTCATCTGATATGAGCAACCATAGATCTGTGTATTATGCATTCTCAAACAT GTTATGTGGTGTCTGCCATGGTGTGCATCTCTCTTCAGTTGGCTTTGCATCTCTCTTGAGTTGGCTTTGCATCTCTCTTGAGTTGGCTTTGCATCTCTCA TTCCTTAATTCTCTAATCTTCAGTATGTTTTGCATGACTTATTGAGCAGTTAAAGTCACTGAAACTACATAAACCAGATTTGATAAATAATCATTTCAAA CCACTCACAATTAATAAGAGAGGCACTTTAGTTGTGTCTGCTGTCGGGCATAGATAGATTTAATACTTACCTATGCATGTAGTAAGTACTCTTAATGAAT TCTAAAACTAACTTTGAAGTTATTAGGATGCTTCATTTATAATCTACTCAATCCTGAGTTCGAATTAACTATGTATGTTTCAAGGGTTTGTCTTTTATTA GTTTCTTCCATCAATCTAACATACTTCAGGCATCACTATGGTAATCATCTCTGAGTCCTCACCTGTGAGTTTGTTATGGATAGAATCATTTTCATGGTCT TTCTTTGGTGTTCAGCACATGGTCTATGTAAGGGTGTTTGCGTTAATGCCAAGAGACTGGACAGCTCTCATACGCTGACTAGTGTTTAGAACTTTCCTTT CTTTGTTTTTTGTTTTTTGTCTTTGTTGAGGATTTATTACCCCCTGCCTTTTGTGCTTCTATCTCTTTCTTTCTCTGATAAAGTTTCTTCTTTTATATAA AGTAAGTTCTCTTTTCACCAGTTATCGGTTTCTTATTACGCATCACTGCAATTCTCGCTTGAAATTACAACATTTGTGATTTATCTATGGGGTGTTGTGA TTATTATAATCCAAACTGATGAATGAACTGAGCATGCTTTAACACCAATAATGATTGGTGAGACCCACTTGAAACATCCCCAGACTCTTCCGGGAAGGTA AAAAGGAATATTTTATAAAACTGAAATCATAATGGGTTAACCTAACTTTTAGAAAATGACAGCAGATACAAGTTTCTAATTCCCTTTATTTTTCTCTGTT TCAAATACATTTTTTGTGAGATTTGTTTAATATAAACAGTTCACTTGCTGGAACACATACTTGATCTGGTGTGTTTTCACTTCAAATTAACTGTGATCTA TCCTTTCTCCCTTTTCAGCTGAGAACTGCTAGGGAAGCAGTGCAATTTGGCCTAGCAGGAAGTGCTTTGGGCGCATTATATACTGCAGGTTTTGCCTGGA AATATTCAAAGAGCTTACATGGTGCAGCACTGTCTTTCGCTGCTGGAGGTGTATTTGGGTGGACATTTGGACATGAAGTCGCAAATCATGCACTTCAACT TTACAGGGTAGACACTTTGGCTGCCGAGGTGAAGTTCCTGGAGTGGTGGAAAACCAAGAACTAAGGATATTAAACTGTTGGCTTGTGAGTCAAATGCTAC TCTTATAATTTCTGAAAAATTAAGACAATTTTTCATGTTGCCAGTGTTTCCTGTTCATTGAATAATTACTTTGTTGTGAGTTGTGACATAGTTTAAAATT TTTAAACTAGTTTGATACATCCCAGAAAATTTGTGCCATTTTCCCCACCTGTATTGTGCTCTTTTTCATTAGTCTGGTTTCTTATTGACTGGGGTAGTCG GAACAAGATGAGTAGATTTTTATATCGAATGATCATATCCAATGTGAGATTTCACACTTGAATAAACCAACACTTCTCGGGTTTGGAACGAATCCCTCTT GGGATGCACAAGTGTCAGCTCATAGGAATCGAATATTTAACATTTTGGTCTTTCTGGAGATCTAGTGGAACTTTATTCCACTAGACCAATGCGTTGTTTG GATATGATCACCGACATGAATGCCTCATATTTCTCTCCCATTTTGTTTCTTGGATGAACCTGTTGTAACAAACACAGTGAAAAGGGAAAAGGATGATGTT GAGACTACATTGATCTTTTTTTGTAAAACACACGCTTGAAACCAGAGGGGCATTGGTTGTGATTAATCAAATCGATGGGATATCCTTTTAGACTTTTAGT CTCATAGATACCTCATACCTTTTATCTTCATCATCATAAGCGAAATATACAATTTAAAATTACACTATGAAAGCTTAAACAAATGGCTTAAATTTATGTA GATTAATTCATGCTTCTTTTAATTACCTGCTATAATTGGTTGATCAACTAAAAAGAATTGTAAGCTAAATAGT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_38482;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_90316

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.4
• LF2: 0.3
• LF3: 0.3
• LF4: 0.2
• UF1: 0.3
• UF2: 0.3
• UF3: 0.2
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_90316

• Blastp: -
• Blastx: Succinate dehydrogenase subunit 6, mitochondrial from Arabidopsis with 72.84% of identity
• Eggnog: Rickettsia 17 kDa surface antigen family protein(ENOG410XWZS)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G08480)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445851.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;