Id Trinity | FTRINITY_DN54099_c1_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_142614 |
Sequence | AGAACACTCAAACATAACAATGAATAAAATATTTAAAAACAAAACCATTTATTCACTCTGTATACCTTTTTCTTCTTCATTTCTCAACATCTCTATCCAA ATTCGCTTTCTCCATTGCTTTTCCACTTCTCTGAATTCAACTTATTTAAATCAAAACAAAAAAAGAATAATCACAAAACATGTCAATGAAAAAGAAGGGA ACGAATTCAAGAGAAGCATTAGAAGGTGCAGTGAAATCAATAGGGTTAGGTTTTGATCTATGCAACGCTCTTAGACTCAGACACTGCAAGAATTACTCAC GTGACTCTAGGTTGATTTCTATCGACGATGATCACGTGCGTAATCTTGATCTACCAGGTTCACTTTCAATTTCAAATGTTCCCAAATCTATTAAGTGTGA TAAAGGTGACCGTACTAGATTATGCTCCGATGTTCTCTCTTTTCAGCAGGTATCATGATTTTTTTTCACTAACTAGTTCTTGGGGTTGCTTCCATTTTTG TAAACTATGGATAGGACTTGTTTTTTATGATTTTTGCTTATAAAAATCTTTTTTTTATGTAATTGTTTTTCCCTATGATGTTTATATGCTTGTTTGGTAT GGGTTTTACTATAATTGTTTGTATTGAGAAGAAAAAAATGAGCTGAAGTATGCTTTTTGGAGAAGTTAAACCTTTCAGGTTCTAAAAAAAGAAAGTGTTG CTGCCTAATTTCACAAAGGGGCAAAATTTTTTTTTTTACTTCGTTTTTGCAATTAAGTTTGTTCTCATATTTAAAAGGGCAAATTAGTAAAATTTGTGCT TGAAATCATGCTCTACTTGAACAAATCCGGACAACTTTGATTCTTATAACGCAAGGTGCATGCGCTATGCACCATAAAATAAAAATTTGGAAGGTTGTCG GGATTTGTTGTACAAATGGGGTGGTTCTTTGTACAAGTTAGTCATTGGATTTATAAAACTTGTATGAAATTAGTGATTCTTAAGGACAAAGTTGAGTAAT ATAATAAGGAGTAAGCTGATATAAGTTTTATAAATTTGAAGACTAAGTTATACAATAATTAGTTTTCGAACTAAAATGTATATGGAGAATAATTCCAGAA ATTAAGTTGGTAATTTACTCGCTACTTTAAACTTCAAAGTGTGTTCCTTTTTTAGTTTTAGATCATGTAGGTTATATTGGTTGAGAAAATATTTTTAGTT AAATATTTTTGGTTTTGTTTTTGGTGTTGTTATTGCTATGTGGACTATTGTTTGTTGAAGAATGGCTTGTTTTGATGTAGATGTCGGAGCATTTCAACCA AGACCTCTCACTTTCTGGTAAGATTCCAACAGGCCATTTCAATGATGCGTTTGAGTTTTCAGGAATTTGGCAGAAAGATGCAGCAAGTACCAAAAGTCTC GCTTTTGATGGTGTCTCCATAACACTATACGATGTAGCACTTGATAAAACCCAGGTTGTTCTTCGTGATTATGTCAAACAAGCTGTTCCCTCATCATGGG ATCCTGCTGCATTGGCGAGGTTCATTGAGAAGTATGGAACCCATGTTATAGTTGGGGTGAAAATCGGGGGAACCGATATAGTATATGCAAAGCAGCAGTA CTCTTCTCCCCTGCAACCTGCTGATGTGCAGAAAAAATTGAAGGACATGGCAGATAGATTCTTCATTGATGGAGCTGGACAAAATAACACAAATGATCGG AGATTTAATGGAAAGCTAAAGGTTTGAAGCTTTCGATTTCGGATTTATTGTTCATCTCTTTCTCTTTTTTGGATTGAAATAGTGATCATTTCCATAAAGT GAACTGTAAGTCTGTAAAAGCTATCAAAATATTGAAAACATAACAAGTCTATTTTCAGATGATATTGATGAGCCCAAGTTCGACTTGTAGATTGTAAAGT ATGTTAAATATCAAACAACAAATAACAAGATATTTTCTGATCTTTAATAAAAAGGATGAGAGTCCTTCTCTACTGGAAGTGTATATTGCTGGTAAAGCAA TTGAGTTGTTTGGTAATAAAATACTGTCATTCCATGTTATGGGATAAATTCTGGAAATCTTGGATTTCAACTTCATACATTACAGATGGTGGTATAGAAG TAATTTGAAGTCCATTTCATATTCTTTAGTAGTGTTTTTGAAAAACGGGAGCGAAAATTGCTACTAGAACATGCTTTCGGCTTTCCGTGTATAGGTAGAC CTCTTTTGTAATTTTGTGTGTAGTAAAACTATTCCACATTTCCACTCAGCAACTTTTGTATGCTTCTTCTTTTATTTACTTAAATTACTACGTACGGCCA TTTTAACTCATCATTTTCTCTTCCCCTCCTCTTTTTCCTCAGTTTATGAAGGACAATGAGCTAGGTTTCGTGGACATCCAAACTCGTTCCTACTCCGAAT TAGAGGTAAAAACATTTTCATTTTTAAATGAATTTATGGCAGATTCAGGATTCTTCTTGTTATTAGTATTTGCTTTACTGGGAGCAGCACTACCTGGTTT CTTTTTCATGCTTCTATTATATAAATTGTTGTGCAGCATGCTGACAGAGTGTCAGGTGATATGATTGTCTGTCATGGTTTATTTTTGACAAGTTTCTAGG TTTTCTAACTCACTGTAACATCATTCTTATTGTTTCTTTTCTTGCTCGATCAGCCATTAATATAACCTTGCGTTCTATCATTCTATCCATATAAGTCTAA GTTAATTAAATAGAAGAAACAAAATTAAATTCTTCCACTTATTTTTTTTTCTTTTGTTTAAAATCTTTAGGTGCAGGATATCAAGTTCATGTGCAAGAGA AAAGGTGGAAGTGGGAAAAATGACCTAACCCATAATGAATGGTGCCAAACTGTTTTGTCTCAACCTGATGTGATTTCAATTTCATTCATGCCAATTATAT CTCTACTTAATGGAATCAATGGGAGTGGATTTTTAACTCATGCCATAAATCTATATCTTCGATGTAAGCAAGACATCTTTAGTCATTTATTTGCATTTGG CCCTAAAACCAATTGACCTATTCTAATTCTATTGCAGTGAAGATTGTTTAAGATTAACTGTAAGCTATATATTTTGGTTTATTAGGAAACCATGACCTCT TGGTTTAGAAACATGTCATGTGAGTAATCAAATAAAATTTACTAAAAAGTGGAGTACAGGTGATGAACACTATTAACATTAGATAGTCTTACGGTAGTGA GGACTGAGGATGTCTCCAGTCTTTAAATGGAATTTATAACTTTGAACCCTCATTAGTGGTGCTAATTGACTGGTGATATCAAGTTAGTAACTATGAAGAC ATCAACCATAGATGTTGTCATGTTGCTTCTACTACCATTATTTTACCATGCTCATTCAGATAAAAGTATTATTTTAGTTAATACTTTTCAGGCTTCTGGA GTTTTTGCTTGTATAATCTAACATTCAGCATTGCATGATAAAGAGATTCTATTATGTTCTTAATCAGTTGTTATAATTTTTGTGTTTGTTTGTCATCCAT GTTTAAAAGATGGTGTGGGTCATATTTATGTGTACCGTTATTTAAAATAATTTTGTGTTATTTTATTCTATAATTGATATATTAAATGAAAATAAACCAA CAAGTTACTTTCTATTATTCATTCCAGTCCTTCGGAATGGGTGGGACAGTGGTGTTGGAGACATCAAACTTGTCATGGGCAAACATTATAGCTTAAGCAT TTAGGAGGGCCTTCAACATGGTATTAAAACCGATATGATAAATTTGTCAAGAGTTCCATCTCTGTAATAGGTTAATGTAACTGAAGGCGGCCACTATATG AAGTTAATTCAAAGCATATGCAATTCTCAATCCATGCATACCTGAAGTTATGAAAAAACATGTCTGTAGTAAATTATAATTACCATCCTTTTAAACAAGA AGAAAATATAACCACCATACAATATCTTCGGACTGCAGATAAACCACCAGTTGGAGAACTGCATCAATTTTTAGAGTTCCAGATACCAAGGCAGTGGGCG CCTGTATTTGGCGATCTTGCCCTTGGTCCTGACAGGAAGCTACAGAGTAAAACATCTTTGCAGTTCAGTTTTATGGGTCCTAAGCTTTATGTAAATACAA CACTGGTAAGCTTGTTTTATTTAAAGTTTTGTTTCATCCAAATGAGTTGCTGTTATATTTCGATCTTTGGCTTGTATTTTATATATTTTGTGCGCAGCAA GATTAAATACATGTCATGTATACTGTTAGTTTTCCTTTTGTTTTTCTATTAAAAGGTAGGGGCAGGCAAATCTGGTCCACCAAAGAGGCACTATGTAATT TTCTCTATTTTTGTTAGTTTAAACTTGAAACTTCTGAAATTAAAGAAATTATAACCTTAAGTTGGGGCTCATTGTCATTGGTATCCCTGTCTAGAGTTTA GTGCTAGGCAACAGATGAGAATAGTCTTTTTTCACATTTTCAGGAGTGTCCACTTAAGAGTTTAGAACTTCTTCTCTTAAGTGTTAGATATTACTCCCCA AGATTTGTGAGTTTATTGATCTCTTCCAGCAATAATAAGGGAAGGATAAGTGACAACCACAGCTGCCAACTCATGAATCAACTATTAGATTAAGCACCAT TTTCTCAGTGATTTAGTTGTTCCTTATATGTTATAGAATATCTGGTGAAACATTAGTGAAAAAACTAATGTTTCATCTAATCTCCTTTCTTGAATGAACC TTCTATTATCATATAAAACTGTGTTAACTTGTTTGTGCCATGAAACTCCGTTAGCCAATAGTTAGATGCAATTATGAAGTATCTGCTATTTTTTATTTAT TTAATTAACCATTGTTGGAAGTTATCATTCTCAAAATTAATGTGGCGATTTAGACATTATTTGAATTTATGTACAGATTGATGTGGGGAAGAGCCCTGTG ACGGGCCTCCGGTTGTATTTGGAAGGAAAGAGAAGCAACCAATTGGCAATCCATTTGCAGCACCTTTCCTCCATTCCCAAGACCTTTCAAATTCAGGATG AGCTGGATGGAAATGTGTCTGACGCCACTTCAGAACGCAGTTACTATGAGAAGGTGCAGTGGAAGAGTTTCTCTCATGTTTGCACAGCCCCGGTTGAATC TTACGATGACTACTCAGTTGTGACTGGGGCTCATTTTGAAGTTGGAGATTCTGGCATGAAGAAAGTTCTATTTCTAAGACTTCGTTTCTCTAAAGTTGTC GGTGCAATTCGTGTCAAAGCTCCCGAGTGGGATGGTTCTCCTGGCTTGACCCAGAAATCCGGAATAGTCTCAACTTTGATCAGCACCCGCTTCTCATCTG CTGCACAAAAACCACCACCACGCCCATCTGATGTAAACATCAACTCTGCGTTATACCCCGATGGACCTCCCGTATCAACACACACACCTAAACTTCTGAA GTTTGTTGACACAACAGAAATGACAAGAGGACCACAAGACTCTCCAGGCTACTGGGTTGTGTCTGGAGCACGGCTTTTGGCCGAGAAGGGTAAAATATCA CTCAAAGTAAAATATTCCCTTTTAACTGTGATTCCACCTGATGAAGAGGCACTAAGTTATTGAAAATACCACATGAGATGGGTGTATATATGATAGTGTG TCTGATTTGTACATCTGCTCTATTCATTTTAGGTTACTAGTTGATAGATATTGCCATTATTTGTGTGTCCTTTACAGTGCAGATCTCTTGGGAGAAATTC CATTATGTGGTTCTTGGAAAAGCTTGTATGATCATGCCCATTATGCCTTTTTGTGTGTATCATTGTATGTGTTTCCATTATGTTAGTGGCTTGGTTATGC AGTAACTATCAATGTTCTGCTCTCAAAAAATGAATGCATTGAGCTGGGAAGTGATCTTTCAATGGGGATTTGGGAAGTGGGAACCACATTAATGTCTTTG CCATGGTTTATTCGTGGTTATGTTCATGTAGTGTTTTTTCCCTTAGTTTTGTAGAGAACTAAAATTATAAAGAGTGTAATATTTATTTACTGTCAGTGTA AAGATTTATACGCAGCCAATACATTATACACTAGTTATTTGTATTTCTTTTTTTGAAGAGTTAATGATGATAAAATATGAACGGTGGATAATGCAATGAT GATGTATAAACATTGTTACTGTATCCATTTTTTTTAATTATGAAATGAGAAAAAATATCTTTGTATGTCCTTAAAATCTTCTAGTGTGTTGATTAGAGTT TTCAGTTGAAGAACCATTCGAGCTCGGCCATTACATCCACCAGTTTTTAGGGCTAGGTTGTGTTAGACCAAATTTATTTACTTTGGGTCTGTAATTTCAC CAGCACAGCAACTTGCAAAGGGAAAAGGGCCAAACAGGTTGGCTTATGAGCCATTAGTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAACACCAAACTATG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_39736; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_142614
Blastp | MACPF domain-containing protein At4g24290 from Arabidopsis with 64.86% of identity |
---|---|
Blastx | MACPF domain-containing protein At4g24290 from Arabidopsis with 69.51% of identity |
Eggnog | MAC/Perforin domain(ENOG410Y9MJ) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G24290) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416771.1) |
Pfam | MAC/Perforin domain (PF01823.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |