Id Trinity | FTRINITY_DN54118_c0_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_44645 |
Sequence | CGAAAATGGGGCGTGGCCAAGCGGTAAGGCAACGGGTTTTGGTCCCGCTATTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGTCCCAGAGCATATTCAGTCATGATGGCT ATCCTATTTGAATCAAAATTGTTGAATACAAATTGTATATCAGAATAAAGATTAGACCTTTTTATTTTATTGTTTTTATTGTAATCACGGTGGATAATTG TATAATATAAAAAAATTTATTTTCTTTATTTTATAATATATTAATAAAAATCGATTTCTTATTATTATATATTTTTCTCTTTTTAAAGAAATAAATTTTG ACTATTTGACAAACTATCCAAATAGGATAGAAAATCTATTCATACAATAACAATATCGAATTTATTTGAAATTTTGTCGACTTCGTGTTATGTTATTACT TTAGAAATTGCCCATTCATATCGAAGGAAAACTTAGAAGTAAAAAGGATAGATTATTATGTATCGATTAAATCAATGACTATTCACGATTTCATAATTGA TAATTGAATGAATCACTTAGATACCCTATAAAGAATGTTATGGTAAAACTTCGTTTAAAACGATGTGGTAAAAAAAAAAAAGCAACGTGCGGCTTGAAAG ACATGATTAGATTAGCTGTGGATTCTTACATCTGCTATTTTTTTATAGGATATAGAAATTGGGGTGCTCTTGGCTCGACATTATTTGTTCTGTTCCACTG GAACTCGTTGTTTGGGGAACGGGAGAGGGATTGATGATGTAAATAGTACATGATGGAGCTCGAGTTGATTCATTTATCAGGGGCAAGTATCTAAGGTTAG TGAAGATTAATAAGTTAGAACAACTTCGTAAGTATATTTTTGAGAGAGAAATCGAAAGGATCCAATTCGAGCGAGGTTAAAAAAAAGTCAAATTTGTTGT AATTGGTAAAACTATACCAAATGGTTCAAGGAAAAGCTAAAGGATCCTGGAACAAGTAAATACCATTTTAAAATTGTCTCAACAATTCGAATTTTATTAG AATGACGAAAAAATAGATTATGAAGACAGACAGGAAAAGGGGGTAGAGACCGCTCAATAAATGAAATACCTAGGGGTTTTGTTTTCCTTTGAGTTATTTG AGAATTATTTAATTTGAGTTATGAGGTTGCGAATACGAAGAGTTCTTTTTTTCTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCTTATACGGTTCTAGGGGGTGTG TATTATTCATCTATATCTATCCCAATGAGCCATTTATCGAATCGTTGCAATTGATGTTCGATCCCGAAGAGAGGGAAGAGATCTTCGGAAAAAGGGGGTT TTTATGATCCACTAAAGAATAAAATCTATTTAAATATTCCTGTTATTCTTTATTTCCTTGAACAAGGCGCTCAACCTACAGGAGCTGTTCAGGATATTTC AAAAAAGGCAGGTGTTTTTATGGAACTTTCCCCTAATCAACAAACCAAATTCAATTAATGAAATAAAAAAAAAAAGAGGGTGTGGATGACTTGTATATAG ATTTATAGAATTCTTTTCTCTTTTATACCCCCCCGTTCTCTTGTTATATTGATACCTACTTTTTTTATTTCTTATTATTTTGTTGACATAGAATGCTATT TTCTATAGCCACAAAAATGGATTTTTATGGATCTTCAAAATGAACATAAAATAATCAAATAAGGATAAAAATAGAAGATATAGGAAAAAAAACAAATGAA TAATGACTAAATGAAATAATAAAATTTTGTCTATAAATACATTACCCCCGAATGGGGTGACTTTTTTGTAGTAAATAAACGAAACGAGATAAAATATTTA TATGATTTTTCATCGAATGACTATTCATCTATTGTATTTTCATGGAAATAGAGGAAAAAAACTTTATGGAAAAGGGGTGGTTCAATTCTATGTTGTTAAA TATGGACGAGTGGGGGCTAAGTAAATCAACGAATCGTTTTGGTCCTATTGAAAATACCGGTGTAAGTGAAGACCAAATTTTAACGGATATGGATAAAAAC ATTCATAATTGGAATGATAGTGACAATTCTAGTTGTAGTAATGTTGATTATTTAATCGGTGTCAGGAACATCCGGAATTTCCTATCTGATAAAACTTTTT TAGTTAAGGATAGTAAAAGGAACAGTTTTTCCATATATTTTGATATTGAGAATCCAATTTTAGAGATTGACAATGAGAATTCTTTTCTAAGTGAACCAGA AAGTTTTTTTTATAGTTATCAAAATTCTAGCTATCTGAATAATGTCTCTAAGATTGATTCCATGTGTGATAATAAATCTAGTTGGAATAATATTATTAAT AGTTGCATTGAGAGTTATCTTCGTTCTCGAATCTGTATTGATAGTTACTTTTTAAGTGATAGTGACAAAAACAATGACAGTTACCTTTCTAGTTACATTT GTGGTAAGGGTATAAGTTGGAGTGAAAGCGAGAGTGCTAGTATAATAACTAGCACGAATGATACAAATGATAGTGATTTAACTATAAGAGAAAGTTCTAA TGATCTCGATGAAACTCAAAAATACAAGCATTTGTGGGTTGAATGCGAAAATTGTTATGGATTAAATTATAAAAAATTTTTTAAATCAAAAATGAATATT TGTGAACACTGCGGATATCATTTGAAAATGAGAAGTTCGGATAGAATCGAACTTTTGATTGATTCAGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCT CTCTGGACCCCATTGAATTTCATTCGGAAGAGGACCCTTATAAAGATCGTATTGACTCTTATCAAAGAAAGATAGGATTAACTGAGGCTGTTCAAACAGG CACAGGTCAACTAAACGGTATTCCCGTAGCAATTGGGATTATGGATTTTCAGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGTGAGAAAATCACCCGT TTGGTTGAATATGCTACCAATCAACTTTTACCTCTTATTTTAGTATGTGCATCCGGAGGGGCACGTATGCAAGAAGGAAGTCTGAGCTTGATGCAAATGG CTAAAATATCTTCTGCTTTATATAATTATCAAACAAGTATAAAGTTATTCTATGTATCGATCCTTACATCTCCTACTACTGGTGGGGTGACAGCGAGTTT TGGCATGTTGGGGGATATCATTATTGCTGAACCCAATGCTTATATTGCATTTGCAGGTAAACGAGTAATTGAACAAACGTTGAATAAGACAGTACCCGAA GGTTCACAAGCGGCTGAATATTTATTCCATAAGGGCTTATTTGATTCAATCATACCGCGTAATCTTTTAAAGCAGGTTCTGAGTGAGTTATTTCATCTCC ACGGTTTCTTTCCTTTGACTCAAAATGAAAAATCAACAAGCAGGGCCTTAAATTATTTTTAAATTCTTTTGTTTATTATATTCTAGACTCATTATATATA TACTAATATATATATATTAGTATATATAAGTATATATAAATATATATATAAGTATATATATAAGTATATTCACTTACTTACCTATATTTAATATTTCAAA TATACTTATACTAAGTATATTTGAGTATAAGTGATTATAGACTATCTTTATAAGAATAAAAATATAAGATTAATCAAAATATGAAATTACAAAAATTTTT TCTATAACAATAAACAAAATACCAGGTACAAATATTAAATCGAGGTACCCATTCTATGATTAATTTCCCCTCCATTTTTGTGCCTTTAGTGGGTCTAGTA TTTCCAGCAATTGCAATGGCTTCTTTATTTATTTATGTTCAAAAAAACAAGATTTTTTAGATACACGGGCAGTATGGAAAATCTCATATATTTTTTTTAG CTCTGGAAGCAATTTGATGAATTACTCCTAAAGGTTTACATGAAAATAGTGTGTTAGTTGATGAAAGTTATTTCGGAAACAAAAAAAGTAAAGTCAAATT CATTTTCATTTGCTTGGGTTATTTATTCTACCAATTCCAATAAAATAGAACTTAATCTAATATGAGTTGGCGATCAGAACGTATATGGATAGAACTTATA AGGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTTTTTTTAGGTTCATTAGGGTTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGGA ATTTGTTATCTT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_39897; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_44645
Blastp | Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta, chloroplastic from Lotus with 79.56% of identity |
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Blastx | Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta, chloroplastic from Lotus with 79.56% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002248) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (YP_008963610.1) |
Pfam | Carboxyl transferase domain (PF01039.21) |
Rfam | Intron_gpII (RF00029) |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |