Ll_transcript_44026

• Id Trinity: FTRINITY_DN54160_c0_g2_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_44026
• Sequence: AATCCTAATGTGAGTCGGTTCTATTATGAAATTCAGTGATGCTATCTATTATTTCTATTTCGAGCGTTTCTTAACTCTCTCTCTATAATCTCAAAACCTT CACTTTCAAAGTTTCAATCTTTCATATAACAAATAACAAAGGAATCTTATTCCTTAAGTTGAATTCTTTCTCTTAATGGAAATTGCTAGTTCATATTGTT CTTGCTGAATTTTCTGATTCTGGAAATGGAATGATTAAAAAAGAAGTTAGTTATTAAACAAATATGGATGAAGATTTGAATGATGATTCAACAAAATTGG ATGTTGTTGAAGGTGTAGAACATGATGATTATATACTAAACCCTGAATATCCCAAATTGTTAAAAACCCAAGAAATCAGTGATGTTGTTGGACAAGGTTT TAATGTAGTTGAAGCCACTACTACCACTAGTGATGTGGCTATGCGGCGACATTTTCGCCCGAGTCTATTTTCGGGTGATGGTGGTGGAGCCATTGTTGAA GAGTTGACAGTGAAAAGTTTCAATGGTTCGGTGTTGGATATTGGTACGTCGAACAGTCGAGAGCTTGTGTATAATAAGCAGAATCACTGGCTGCAGAGTG ATTCAGGAGTGGGAAATACTATAAGTGATATTGGGTATAGAAATAGTGTTCAAGCTACTTCTAATAGTGTTTGGAAGGATTTTGGGTCCACGACATTCCG AGAGACATTGGCTAGGAAATCGGTTGGTGATGATCATAGCAATGCCATGGGACACTTGAATTCTGTTGATTATAAAGAGGACATGGGTGATGCTCGTAGA GGAATACGGACGAAAATAATATCCAAATCAGGATTTGCTGAGTATTTTATTAAAAATACATTGAAGGGAAAGGGTATTGTATGTAAAGGTCCTCCATCTT CTAACGGCTCGTGTGTTGAATCTAGAGATCAAAATCCGATAAAGGCCTCTACTCAGAATGACTCTAATGTATCACTCAGTTCTGTTTCAAAGACTGCAAA TCCCCCTTATAATGCTCCAGTGCCTAGATCTGGTGGGTCTGACTGTGACGGTGTGACTTTGAGAGAATGGTTAAGAGCTGGGCATGGAAAAGGAAGCAGA GCGGAGCGTTTAAGTATATTTAGAAAGATCGTGGATTTGGTTAACGACTCTCACTCTCAGGGAGTTGCACTGCACCACCTATGCCCATCGTATATTAAAT TATTACCGTCAAACAAGGTTATATACCTTGGTTTACCTATACAGAAACAAACATCAGCTACTGTTGCAAATTCCGAAGTTCTTCAGTTAGAGAGTTCTTT TATTAGAAAAAGGCTGCCAGAGCAGGTTACGCCTCTTGATATGCAATTGAAGAAAAAGAAAGTTGACAAGAATGTGAGAATTGCTGGTGATAGCAAAGTC AGTGCAGTTGGATCACAAGATTACTGCAATGGATATAAGGAGGATATCCGATTTTTTAAACATAATATCCGGGGAGTGTCTAGCATCCCTCATAGATCTA ATGCAGGGAGGTTGCAATTGACTTTGTTAAATGAAGGATTGGAAAGTAATTGGTATACAAGTTTTGAGGGAGGTTGCACAACATCATCAAATATCTACTG TCTGGGTGTCCTCTTTTTTGAGTTAATTGGCCATTTTGACTCCGAAAGAGCGCATATTGCAGCTATGTCTGATCTTCGTCATAGGATTCTTCCTCCACTT TTCCTATCCCAAAATCCCAAGGAAGCTGGATTTTGTCTTTGGCTGCTGCATCCTGAACCATCATCACGTCCAACAACAAGAGAGATCCTACGATCGGAAG TGATTAATGCAATGAAGGAGGTGAACAGTGAGATATTATCATCAAGTATTGATGAAGATGAGGCAGAATCAGAATTGCTATCGCATTTCCTCGTCTCATT AGAAGAGCAGAAGCAACTGGGTGCTGATCAGTTGGTAGAAGAAATCAGATGGTTGGAATTAGATATAGAAGAGGTGGAAAGGAGACATAAATCAAGAGTA TCCTTGGCTTCCTCTAGCTTGCAGAACGACCCCTCTTGTCAAATAGAGAATGCATCTCTCAGCAAAGAACCTTTGAGTTTAGCAACATTACCACACATGA GAAATATAAGTCAGATTGAAAATGCTTACTTTTCCTTGAGATCCAAAATTGAGCTTCCTGAAACAGATGCTGCAATTCGCGCAGATAAAGATATACTAAG AAACCGTGAGAACTGGTATGTGGCCCAAAAAGACAGTGAACAACATCAAAGGACAGATGCTTTAGGAGACTTCTTTGATGGTTTATGCAAGTATGCAAGT TATAGCAAGTTTGAAGTGCGGGGTGTACTAAGAAATGCAGGTTTGAACAACCCTGCTAATGTAATCTGCTCTCTGAGCCTAGATAGGGATGAAGACTACT TTGCTGCTGCTGGGATATCAAAGAAAATAAAAGTATTTGAGTTTGATGCACTTCTTAATGACTCTGTTGATATTCATTATCCTGTACTTGAGATGTCAAA CAGATCAAGGCTCAGTTGTGTTTGCTGGAATAACTACATCAAGAACTATCTTGCCTCCACAGACTATGGTGGTGTAGTTAAGCTATGGGATACTAGCACA GGTCAAGAAATTTCTCATTTCAGTGAACATGAAAAGCGGGCTTGGTCTGTTGATTTCTCTCCAGTATGCCCTACAAAGTTTGCGAGTGGGAGTGATGATT GTTCTGTGAAGCTGTGGAGCATCAGTGAGAGAAACAGTTCAGGCACAATCAGGAATGCTGCTAATGTATGCTGTGTTCAATTCTCTGCTCATTCCTCTCA TTTACTGGCCTTGGGATCTGCGGATAACTCAACTTATTGCTATGATCTTCGCAATCTTAGAAGCCCCTGGTGTGTGTTGGCTGGCCACCGTAAAGCTGTA AGCTTTATCAAATTCTTAGACTCTGAAACAATTGTTTCCGCATCAACCGATAATACACTAAAGATCTGGGATCTCAATAAAACCTCTCCTGTTGGTCCAT CTACTAGTGCTTGCAGCTTAACCCTATCAGGACATACTAATAAGAAGAATTTTGTGGGTTTAACAGTTGCTGATGGATACATTGCATGTGGTTCAGAAAC AAATGAGGTTTATGCTTACTATAAATCTCTTCCCATGCCCGTCGCATCGCAGAAGTTTGGGTCCGTTGATCCCATTTCTGGTAAAGAGATTGATTATGAC AATGGCCAGTTTGTTTCAAGTGTGTGCTGGAGAGGGAAATCAAACATGGTTATTGCTGCGAATTCGAGTGGATGTATGAAAGTGTTCCAAATGGTTTGAG GTAATGTTAAGCCCTTGATCATGAATTTGTTGCAGTTTATGCAGTCCTGCAGTTTTTTCCTTTCCACTCAGCCCAATCTCATCAATTATGCCTCAGGGCT ATGTAATTTGTTTTAACATCTTCAGCTCTAGCTTATAATTTGATGTAGAATTGCATCCATAGTTGGATGGGAAAACAATTCACAATCTAAACCTGGTTGG AAAACTATAGCATGCTCCATGTTTTTGGCTTTCAAATCATTGATTCATTATTAAAAAAAATCAGTTAGATGCAGCCCAGTTGCGTTATGCCCCGATGTGG CCACATCATTGTCATTCAGTGTCACTGCAATTGCGGTGCTCCGCATTTTGAATCAGTGCTTACAACTCATGCTCAATCTTCCTCACTGCTATCTCCACAA CAATCCCATGATTATGACCACAAGTGTCTAATTTATATGGAGCTGTTTATCCTATTCCTTATATCCTTAACCTTATTTTTTCACTTGTTTATAACAATAT TATTAGCACTTGGAAGATGATTTAACAATGTTAATTGCAAAATAGAGTGATTTATGATGTTATGTGAAGTGAAGAGAATAGAGAATAGAGAATAGAGATT ATTGATTTTTACTCCATGCTTAATTAGAAAAAAACTATATATCAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_40260;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_44026

FPKM

• FPAB: 2.2
• FPNAB: 4
• LF1: 3.4
• LF2: 3.5
• LF3: 3.5
• LF4: 2.7
• UF1: 3
• UF2: 3.6
• UF3: 3.1
• UF4: 2.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_44026

• Blastp: Protein SPA1-RELATED 2 from Arabidopsis with 50.15% of identity
• Blastx: Protein SPA1-RELATED 2 from Arabidopsis with 50.15% of identity
• Eggnog: eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase(ENOG410XS0B)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G11110)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001073)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019423924.1)
• Pfam: WD domain, G-beta repeat (PF00400.31)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;