Id Trinity | FTRINITY_DN54174_c1_g2_i5 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_42511 |
Sequence | GGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATGT GAGAGCACTCATTTCCCATGTTCTTGCACCACCTGGGTTCTATATTATATTTGTGGTACATGAACATGTTCCAAACAATTGAATTTGGATTAGAATCACT TCTTGATTTCCTCAACTTCTTTATCATTTCATTCCGTAAGTCTACCTCAGGACTCCCTTCTTAGTTATATGTTTATTAGTTTTAACGGTGCTTTCCTTCT AAAAAGTTCTGCAATAATATCTTTGAGCAAAGTGAAGACCATAAGAGCAACGGATACCAGAATGGAGAGGATTAAGAGAAGGAGCATTAGAATATGAGAA ATAATTAACATTGAACCTTCTTATAGATAAGATAACATAAATAATTATCGTTTTCAGGGCTTATAGTATCATTTTTCACTTAATTATTAGCTTAAATAAA GGGGTAAAAAGTGGTATGAAGGGGGAAGAAATTAATACTGTTTACTTCTTCAGTAATATGATGTCATATATGGTATAAAACGTTATAATAGTAACAAGTT GGTGGCTCAATTTGTAAGAACCAGGGCATGTAATGTAATATGCTAGATTTGGATATATTTAAGAGTATTGGTTTCAAAATACGCAATAAATTTTCCATAT AGTGGACTTATTCAAAAGATGGGCCTTCCCGTAATGGTTTCAAAACATGTTTTTTTTTTTGTTCCCAATGCATATCTTCACACGGGAGACAATGACGTCC GAGGCAGAAACATTCACAGATATGAGAATAACTCTTTCAATGAGTATTTTTTCATCCACAAAACATGTGTTGATATTATTCATACATAAATTAAATATTG TTTCAATATTATTAAGAAATGGTATAAAAATACTTCATTAATAAATTTGATGTGAAAATTGATATTAGAGCACATGCACAATATAGATACCAAGCAGTGC AACAAATGAGTAAACTGTAAAAGAATCCAATCACCTGTTCAGAGTTGAATTTGACGACAAAATGTGTTTCTTATAAATAGCACCTAGCTTATATGTGTTT ATTTTTTTAAATCTCAATGGTTTTAATAAATTTCTCTACCAAACCAACATGTCTTTTTCATTACTTGAAGGGTATTAGTTGTGAAGATTTGTGAGATAGC TATCTTGACCTTATGCAATTGCTTTTAAAAAATTAAATAATATATTTTCATCTTTTCAGGGAGATTATATATATTGTAATCATGAAAACAACGCAAGTTT AATAAAATTTTATATGAACTTGATATGGACTACTGCATAATAATCTTCAAGTACTAGGTCGTTTTCTTGACCGGAAAGTAATGGTGTGGTATTATTAAAA AAATGAGTATTGAAGATATTTGAGATATTTATTAAATTATTATAATTCTTCATGTGGGACAAGAGATACGAATTGGGGGAGAGAGATCTATGAATTAATC ATCATTTAGGATATAGATCACCTTCATATAAGGAAAAAAAGAAAAGTTCAAAATTTTTCAAAAATCTTAAAAAAATGTATTTGTTGTGTACATATAAGAT GGTATAATAGTGTAGTAAGCAAAATTACCAGAGAAACAGTAGCAGAGATATTTAAAAGTTTATGAACTTATCATGATTTTATATCAATATGGTAAGCAGT CAACAGAGTAAACAAAAATATAAATGTTTCTCTGTTTTAATGAAATTATCCTGACACTATATCAATCATTTTTATTACATGAGAACTTCAATGGGAACAA TAGATAAACCAAAAGCTAGAACATATTAACAAGAATAGTACAGAGAAAAAAGTAAAAACATATGACAAAAAAGGTGAGTAAATGAAGGATGATCCTCATT TGATTCTAATGCTCTAAAAACAAAATGCACCAATAAAGATCACCAAAACATTCAAGCCTTATCTTTTATTTCAACGTGGTCAAAGAATAATGTGAGATCT CCAAAATTTCAACCAACAAGACATTCTGAAAAATAAGAAAAATAGAAACCAAAAAACTTACATAAATCACTAAATCAGAAACCAAAAAATAAACGGGTAC CTATTTTTATAAGCAAATTAAATGAAACTGAAAACGCAAGTTTCACAAAAGAAATAGGTATGAATATTAGTGGAGAAAGATAGCTCTTGGAACCGTTAAA ACTAATAAATAAATAAGAAATGAAGGGAATGAAGTGAAAGAAGTTGAGGAAATGAAGAACTAATTATAATCCAAAGTCCCTCGCTTGGAATATGTTCATG AACCACTAATCTAATATAGAACTCAGGTGGTGTAAGAACAGGGGAAATGGGTACTCTCACACATCCAACTTATAAGTGGAATTCCCCGTAGGATTGGCTT CACTTATGCTCAGCACCATCAGCCTCTGATTCATGGAGAAAGACTGTATTAAAAGGTGGTGCCAACATTGTAACACTAACTCAATACTTCACAAGTGTCT CATTCAACTGAAAACTCATGTTGAAACTCTAACCATACTTGAGATAACTTTGAGAAGTGGGGTGTAGAATCTTCGGCCTTAGAGGTGCAAACATAGGATC CAAATAAGGAGGAGAAAATGCCTTAAACGCAGTTCAGTTGGATAAGAGAAATGGAATAAAACGATTACTCTACCATCACGCAATAAAACGATTGTGATAC ATTCTAGGAATAGTTGTAAGCTTTAGCACCTCGAACCGTGAATCATTTTCCTTTTCTGGTTTGTAGAGAAATGGATTCAGAACCAGGTGTATTGCTTGTT CCCATCCCATTGTACCTAAAGTTGCTCCATTAATGATCAAAATGTTGCCATTTGGGAGCATCACCGTATCATTCATAACCCTAGATCTTAGCATGTCCTC CATTTTCCTTGTGGCATTTGGATATGTGATTTTGATCCTACCACATGTACTCAACACTTTTCAGAAGCGACCAAATCTTGATTTTTGCCAAGACCCTCTA GGGTCCCCACCACAGATCAAAACTCCTGCCTCAATATTGACTCCAAATTTCTCATTAGAAGCAATACTGCAGAACGAGTACTAGGAAAAGACCTAGGATT CCCACCATTTGGGATGGGAGGGTATGTCCCCACTACAGTTCCACTTTTGTAGTTGAATAAAAGGTTCCTATCCATGTCCATAAAAACATAGGAGTAAAGA TTGTTCCTCCATATGGGTCAAAGGTTTCATTCAGAAATGGTAATGAATATGTTTTAGACTGCGAAGGTGTCTTAGGATAATACTCATAATTGAATTGTTT TGTGACTCCAATTATAATTTGACGTCCATCTGACAAAATGTGATTGGTGGAGTACCACCTTTTCACATTGAGTGCGTGCATTATCGATTTCATTCCAGTC ACAAGTTGAATTTGAATTTGTGCATGGAGCAAAGGTTCTAACATGGGGACAAATTAAAAATAAAGGTGAATATTTAAAATATTTTGATAGTAATTTTAGG CACCATTTAATTGGATTTATTTGATATGAGGTGCCTAAAAAATTAAATTAATTAAATTGATATAATAAATAATATATTATAATGTTCTTAGTTCTTATCC AACGCGTTCCTTCATTGTTTTCTCCCATTTGGTTGAGCATGCCATCGGCCTTGATAGAGTCAGAGGAGCACCACACGTCCGTTTCTAAGAATAATGGGCG TAAGTATTCTTTTGTGACACCATACTCAACAGAGTGAGCGATGCAATCATTTATATAAACTCTACCAATAGTGTAGTTGCGGCATGAGCCTTTAGGCAAT GGTATGTTTAAATACCCAAAATTTGTGCGATCATATATTTTCACATGATCATTGGGTAGAAGTTGCATGTGCATTGCTGCAATGCCTATGCTCTTCTATA ACATTTGCCATGTTCAATTGATGTGATTGAGATGAGATTGCCACAAGAGCGAGGAGGAAAATAAAAAATGAAAAGGGTAGCCATTGAAGGAAAAGATGGT AGTTGAAATGTCTAATGTAAAAGTTTAAGATGAAAATATATGGAGGGAATGTTAAGCCTTTAACTAGGATTGTAGTATTAATACTTTCGTCACCAAGTAT CATATGTGTTTTCACAACATGTATTCGTTCATATAAAAATAGTATCTAATTAAAAGTTCATAAAAGATCACATGTATTTACATAGGATTTATAAAATTTC ATTTGTTATTGACACAAATGGGATTGGGTGGTGGTGATATAGTTTACCAAAACACTTTAATATGAATATTGATTTTTTATTTCATATATTATCTAATTAA TAATACATAGAAATCAAGGTTTATATTTATGTTAAACCATGACTATAAAAAATGAAAAGTAAATTATTTTTTACGAAACAAATTAAATACAAGAAGTTAG ATTTTTCTTTCATTTTTTTCCCGGATAGCTTTATTGTCATAGACAAAACACACTATAAAAAGGGATTAATTACTGGCGAATTGTGATTGTTGGAGTACCA CCTTTTCACATTGTCCACTGTCAATTTTGTTCCCGTCACAAGTTGAATTTGAGCATGAAGTGAATGTTATAACAGGGAAAAATTAAAATGAAAGATGATT ATTTAAAATATTTCTTTACATAAGCACACCAAATTAAAAGGAAATATGAATATTTAAAATATTTCCATATTAATTTTAGGCACTATTTAATTGGATAAAA GCAAATTAATATTTCATATGAGGTGCATGAAAAACTACATTGGTTAAATGGATAAAAATAAATAGTCAAACTAAATATTTATCAATTGTTTTATTATAAT AGTCACCGTATCACCCTAAGAAGTTTTCTAAATATAATATATAGAAAAAAGTAATGGTGAAAACAAAGTTTGGTCCTCCATACATAATATATTGCAATTT TCTTAGTTCTTATATTCTCTTTGTGTGCTACCTCTGGTTTGGATTAGCATGCCATCAATATTGATGGAGTGTAAACATCTGTTTCTAAGAACAACATACT TTTAAGATTGTTGGTGACATAATATTAACAGACTGAAGAGTGCAATCATTTATTAATTAGACCTTACCAACAATATAGTTTTGGCATAGGTTTATAGTTA AGGATGTATTTGAATAGTCATAATTTGTCATACATTATTACATACACAATCATTGCACAGATGTTTCACATAAGTTGCACATAAGTTGCACAGAAGTTGC ACATAAGTTGCACAGAGATTGCACGTGCATAGTTGAAATATCTATGTCAGATTCCATTGATGACTAAGGTTTGGAGATGGAATTGTCACAAAATTGAAGA GGAAAATGTAAATAAAAAAGGGTAGTCAATGAAGAAAAAATACGAGGGGAAATGCCTATGCTCTTATGCAAAAGTTTAATATAAATAATGTAAGGAGAGA ATGTCCCTTTTAAGATTGTATAATTAAATAAGATTGTATAATTATATCATGTATTCATTCATACAAAAATAATATCTAACTACAATTGCATTAGGCAACA ATTGTATTTTTCGTACCTTATTTATAAAAATTGAATCGTTATTGACACAAGTGAAATTGATTGTGGTGGTAGAGTTTACCAAAACTTTTAAATATGTATA TTATTTGTTATACATATTAAGAAAATTCATCATTGGTATACATATGAGATTAATAGATAAAATGGAAATCAAAACTTGTTGTCAGCTAGCTGTGTGAATT GAATACTAGAAAAGGTCCTATAACATAATCTAATGTCTCTTTGTTAATTTCTCATTCATTTTTTTCCTCCAAAATGGTTTCATATCTTTTATGTGTATAT TCTCACACTTTATATTTCATTTCATTATTTTTCCCCTCCAAAATGGTTTCATATCCACGCTTTAGATTGATGAGTACTTGGAAATTGCAGAGTTTGATCT ATTTGACAAAGATAGATTGACTTAACGGAATAAATACCGAACGTCTCAGCACTCCACCTCCACATGTCCTTCGTATCTCTTTTACAAGGATGATTATGCA AAAAAGAGTTAAGTTTCAACCAAGACTCTTTCTCTGTTAATCTCAAGTTGATATATGGATGTCCCAAACCCATATATCAACATTCCAATATCCACAACAC CAACAACCACCAATCTATCCAGAGCAAGTGAAAATAATCTGGGAAAAACCTCCTTCAAGGGTTGATTCCTAACCCAAATATCCAACCATAATATAATTTT CCTACCATTTTCAACCTATTTCCAAATATTATTCTCAAACCAATTCCCATGAGCCGTACAATTATTTATATGAACTCTACCAATAGTGTAATTGTGGCAT GAGCCTTTAGGTAAGGATATGTTTGAATATCCAAAATATGTGCGATCATACATTATCGCATGATCATTGGGTAGAAGTTGCATGTGCATTGCTGCAATGC ATATGCTCTTCCGTAACATTTATCATGTTCCATTGATGGGATTGCCACAAGAGCGATGAGGAAAATAAAAAATGAAAACCGGGTAGCCGTTGAAGGAAAA GAGGGTATCTGAAATGTTTAATGTAAAAGTTTAAGATGGTAATATATGGAGGGTAGGTTAAGCCTTTAAATAGGATTGTAGGATTAATACTTTCGTCATC AATCACATATGTTTTCATAACATGTATTCGTTCATATAAAAATAGTATCTAACTAAAAGTTTATCAAGCATCACATGTATTTTCATACCTCATTTATAAA ATTTCATTTGTTATTAACACAAATGGAATTGAGTGGGTGGTGATATAGTTTACCAAAACACTTTAATACGGATATTGATTTTTTTTATTTCATATATTAT CTAATTAATACTAAATAGAAATCAAGGTTTATATTTATTTCTTCATTAACTATAAAAAAATTTCTAGGGGTGTTAGAAGTGCTCACAAGGTTCTTATGTC TAGGGGTGCTATCAATGAGAAGAGTTTCTATAGAGATTTGTGGGCTGCTAAGGTACCTTCGAAATTGAGCTCTTTGGTTTGGAGATTGTCTGTTGATGGT ATCCCAACTCGTGTGAATCTTGCTAAGCGCGGTGTGTTGGCCCCCCCAACTTTGTTGCGTTTTTTGTGGCCTAGAGGACGAATTTGTTGACCATCTTTTC TTCTCATGTCATTTCTCTTACGCGGTGTGGCAAAAAATTTACTATTTGGTTGATTTTAATTCTGATATCCCAATTGGCGTGGTTCGAAACTTCCGTTACC AATGGAACTTGCTAAATATGGAGGAAAAGGCCCTACAACGATGGATGGTAGTTTGGTTTGTGACTATCTGGATGGCTAGGAACAATATCATTTTTCACCA TTCATCTGCCTTGTTGCATGAGGTTATTTTCTCGATCCACATTCACTCTTGGAATATCCTTAAGGCCCGTTTTTCTGATTTTTCTTACTCTTTCCTGCAA TGGGCTTGGAGTCCTTCTAGTTGTCTGTGTAACACTGTAAGTGTTAGTGGATAGGAGCACTACCTGTTCTCCTAATTCCTTCTTTATTTTATGAAATGAA TTGATGATAAAAAAACTATAAAAAAATTTGCATTTAGGTTTTACTATCTTATGTTAAACCATGACTATACAAAATGAAAAGTAAATTATTTTTTTTACAA AACAAATTAAATACATACATTGAACAAGAAGTTAAATTTTTCTATCATTTTCTTCTCGGATAGCTTTATTGTCATAGACAAAACTCACTATAAAAAATGG ATTAATTTCTAGCTATTGATTGTAAGACAAAGCCTAATTTAATATAATAAAAAAATATGCATTACTCAATAATATAATAAAATGGGATAAGTAACGTGCA AAAGCAATTGGCCGCAAGGAGTCAAACTCCTTTAGGTACTCGAGAGGAAAGTTAAGAGAAAAATATTAAAAATCCAATAGATGATTACATTTTTATCCTT TAACGTATAATTATATTACATGTTTACCAAGAAAAGTGTACTAAAAAATAGTTTTGTGATCTCCATTGCTAAAGAGGAGGGTGACTCTGGGCGAGGCCTT TATAAATGTTTCATCTTTTTATAAAACATGGCCTTATAATATACATATTGGATTTTTTCAATGCTCCAACTTGTGTGTACCCTTTTGCTTACTTGCATAC TTCTCCCTTATAAAAACACTTACATGGGAACTAAGAAAATTGAGGACATCATAAAGCCTATCTAGTATGAGTTTGATAATTAATCATCTCACCATCCCAA CTCAACCTTCCAAATTTGAAACTGAGATTGTCATAGACATGACAACCTCAAATGTTATAAGCCAAAACATTAGTACTAATAATATTCAAGAATCTTCCTC CTTCATGATAATTGCAATTGCAAAGCGCTTGTTAATGTCACTAAGTTCTACACTAACCAAATTTCATGCAGGTTATTTTAGAATAAGCCTCTCCCTAGGT AGCCAAGCTTTATTATGGAAGACACTAATTGGACCAACACATGACACAAGCACTCTCCGAAACGTGCTTAGCACCCTTAACCCTACCATTTTCCTTGTAC TATGGTTTCTGGCTCTCTTCACACTCGTATTACTATCTATTCTTTACCTCCTACGGTGCATTTTTTTCTTTAATATGGTTAAGGCCGAGTTCTTGCACCA TGTTGGGGTTAACTATCTCTTTGCTCCATGGATCTCTTGGTTTCTCTTGCTTCAATCAGCACCATTCTTGGCTCCAAAAACCACAGTTTATTTAACGCTC TGGTGGGTTTTTGCAATACCTGTGGTGCTTCTTGATTTGAAAATATATGGTCAATGGTTCACCAAAGGGAAGAGATTTTTATCAACGGTGGCTAACCCAA CAAGCCAGTTATCGGTTATAGGGAACTTGGTTGGGGCACAAGCTGCGGCTCATATGGGTTGGAAAGAGAGTGCTGTGTGTATGTTTTCACTAGGGATGGT GCATTATTTAGTGTTGTTTGTTACACTGTATCAGAGATTATCAGGTGGAAAAGGACTTCCAGTGATGTTAAGACCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCAGCA CCAAGTGTGGCTAGCTTGGCTTGGGCATCTATAGTTGGGGTTTTTGATATTGCTTCGAAGATGCTATTCTTTCTATCACTATTTCTTTTCATGTCACTGA TTTGTAGGCCAGCTCTATTCAAGAGATCTATGAGAAGGTTCAATGTTGCATGGTGGGCATACTCATTTCCTGTTACAGTGCTTGCTATGGCTTCCACACA CTATGCACAAGAAGTTAAAGGAACTATTTCTCATATTCTAATGCTTCTTCTCTTGATTCTTTCCTTTCTGGTATCCCTTGCTCTAATGGTCTTCACTTTG CTCAACTCTAAGATGCTTCTACCGGATAATGATCCTATTGTAAACCAGCTCGCTACTTAAATATTCATTTACCAATACAACAATATGATGGGAGCCTTAG TTCATGTCAATTTAAGCCTATAATTTATAATTGAGAATGAAGTTAAAATTTGGCTATAAAATATTCTATAATTAGTTC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_40355; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_42511
Blastp | S-type anion channel SLAH1 from Arabidopsis with 58.89% of identity |
---|---|
Blastx | S-type anion channel SLAH1 from Arabidopsis with 58.89% of identity |
Eggnog | S-type anion channel SLAH1-like(ENOG410YDIV) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G62280) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438040.1) |
Pfam | Voltage-dependent anion channel (PF03595.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |