Ll_transcript_43194

Id TrinityFTRINITY_DN54180_c5_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_43194
SequenceCAAGATTATGTGTAGAATAATAATAACATTTGTCCCATTAATGTCCTTAAGTTTCCCTTCATTCATATCCAGATCTTATCCAGTTCTATATATATAGCAT AGCACCAACCAAGCTCAAAGAGCATGGCTTCCAATATGATTCTAGTAGTCTCAAGTTTGGTTCTATCAGCTTTAGTTTCTCTCATACTTCAACTATTCTA CTTTTCACCCATTGACCCACTTCCACTTCACATACTACCTGCATCTTCATCCACAAACAACCATTTACAGGTGAAGAAGAGTTCCTACCATATCAAGGAA TTACTATATCACTCAAATATCTATGTCTTGTTCGAGCAAAGATTTACGTACACTCGTTCATGCTCAACTGTAAAGTTGTTACTTAGTCACTATGAGATTA CGAGTTCAAATCTTGGAAACAGTCTCTCTGCTTGCATGGATGAGGCTACGTACATCTACCCTCCCAGACCCTCCTAAGTGGGATCCTCGTATACTAGGCC GCCCTTTTTATACTTAAAAGTTAATGATGATTAAATATGAATGTTGATATTATAAAAGTGCATATATTTTTCTCTTAGTCTATATATAATTTTCCCTAAC AGAATGTGATAAAACTTGGAGAAGGGGATTTGAAGGATCCAGAAGATGTTTGTGTGGATAAAGAAGGCACTTTCTATACAGCAACAAGAGATGGTTGGAT TAAGAGATTGCCCAGAAATGGAAATTGGGAGAATTGGAAGCATATTCATAGTTCTACTTTGTTAGGAATCACAACAACAAAAGGAGGTATCATTGTATGT GATGCTATAAAGGTAACATAAATTAACTCATGCACTTGAAAAAGCAAAATATTTTTTTTAATATGAGTCAATCATATTCTGGTACAGAACAGCGAATAGT ATATTAAATTGCAAGAAGAACTTACTTAATTATATTTCTAGCCTCTAAGGTTATGGCCAATAACTTCCTTCATAAAAAGCCATAAAGGCATGCAACAAGG TTAAAGATCTTAAATCATAATGATTTCAGGGTTTGCTCAAGGTTACAGAAGATGGTGTCAGTATTCTTGTTTCACAAGTAAATGGTCTTCAGTTAAGTTT TGCAGATGATGTGATAGAAGCCTCTGATGGAAGTGTATATTTCAGTGTTGCTAGCACCAAATTTGATCTACACAATTGGCATCTGGATATGCTAGAAGCA AGACCTCATGGACAACTTCTTAAGTACAATCCAACATCAAATGAGATAGATATTGTCTTAGATAATCTTGCCTTTGCCAATGGTGTTGCACTCTCCAAGG ATGAAGATTATATTGTTATCTGTGAAACTTGGAAGTAAATAATTACATAGAATCTCCTATATGCTCGCTTAACCTCATTGATTTGTTTGTAACATGGCCC TAAGGTTTTAAACTGTGGTCGCAGTTACAGTTACATTGCTATTGTAAGAAAGTGGGACCATAATTACAGTTGTGGTGTAATTTGAAAGACGGCCTAAACC TTAATATTTCAGCTTCTTTTGTGATCGCTGACCCAAATTTAAAACCTTGTCGGCAAAATTCAAAATAATGCTTATTTATGTGCTAGTACATATTGTTCAC ACTGTATGTTTATCATCCTAACAATTGTTTTTCTTTTTGGTTAATCAGATTTAGGTGTCTGAGGTATTGGCTAAAAGGAATAAACAAAGACAAAACAGAC ATTTTCATTGAAAATCTCCCTGGTGGACCTGATAATATTAATCTTGCTCCTGATGGGTCTTTCTGGATTGCTCTACTTCAGGTAATATTCAGAACATTAT AGGTATTCTTCAAGAAAAAATTGATTATTATCAATATTCATGTGTACCACCATAAGTCACTATTCATGATAATAAAGGTACTATGGTGCTGTAAAACTCT TTCTATGATAATAAAGGTACTATGGTACTATAGTGAAGTTTATAATTAAACTACAAAGACATGATAATGATTTTTGAATTTGTGTTCTTCAATATTGATA TGCCACAGATTTCTACCAAAGGATTGGAGTTTGTGCACACTTCCAAGGTAGCCAAGCTCTTGCTAGCTTCATCACCAAGGCTATATAACTTAATCAATGG TGCAAAGCAGAAGGCAACAGTGGTGAAGGTGGCAACTGATGGTAAAATAATACAGAGGTTTGATGATGATAATGGAAAAGTGATTAGATTTGTCACTTCA GCTTTGGAGTTTGAGGACCATCTTTACCTTGGTAGTCTCAGTTCTAACTTTGTTGGAAAATTACCACTGCACAATACTAGTAACTAGCAAGTTCAGCTTG CTGCCACTGAATAAGAGTGTATCATCAAACAATGATCTAAAGCGGGTGGTGGTGTGAGTGAATTCTCAGCTTTAGGCGAGACACTGATCGACGTGGAAGC ATTCATTGCACCGAGTCGGTTTATCAGATTGTCAGGACTTGTAGTTGTCATCCACCTTACAGTACTAGCCACTTGTGAATAATAGAATGATTTGCCAGCC TTGCTATATTTCTTGTAGCATTCTTCTTCAAGAAGAGATGCTGATGTTTCTACTTCAATCCTGAATAAATGTTTTAAACTGTCATTGTTGGTTCTGGTTG TTTTCCGGGGTGGGAAGATGCACCCAACACAATTAAACGTGATAATGTGTGAGGACCCACAACTTGATAACATGTTTTTGCTATGATATGATTTAGCTGT GATATTTAAGTAGTTCAACTTTGGCACAGTAATTATGTGATATTGTGATCTTTAAACAAATTGCTTCGAGGTGTCAAAGAAGTTGCATACTTGTTATAGC AAGCAGATATTGAGAAATCAAGTCGGTAGTTACTTTATGTGGCAGAGAAAGAAGCTTACTTGAAGTTATGAAGCTGTTGCTGGGCCTGCTTTAGAGCATT TTGTAATCTTTGCCTGCTTGCTCCTCGCATTGTATCGGAAATAGCATTGTTCTCAACTTTTTTGCTCTGTAAATCAAAACAGGTGAATGGGGTTGCACAG ACAGGAAATAGGAGCAAAGAGTAGTAAGTTTGCTAAATTGATCGGAACAGTACAAAGCTAACAACATAATCACAGTAGTAAAAAAAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_40418; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_43194

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_43194

BlastpProtein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10 from Arabidopsis with 35.29% of identity
BlastxProtein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 6 from Arabidopsis with 38.46% of identity
EggnogSMP-30 gluconolaconase LRE domain protein(COG3386)
KeggLink to kegg annotations (AT3G57030)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019414226.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;