Id Trinity | FTRINITY_DN54184_c0_g3_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_43360 |
Sequence | TGGTTAAGGGTAGACAAGGAGAACGTGTCAGGTATCACTTCTAATTCAAATTTCAATTCGTATCTCTCATTTTCACTTTCTTTATTTTCATGCTCGTGTT AATGTTGTCGGATTAAGTAATTAACCATTTCAGCATTTTGTTGTTCAATGTTTGCTAATTAGTTGTCATTTTTTAATATATTTTTGTGTACCAGACTTTA TGTCAGAGGAACAATCCTTGGATACAAGAGGTCCAAGTCAAACCAATACCCAAACACTTCTTTGCTCCAGATTGAGGGAGTAAACACCAAAGAAGAGGTT GCATGGTATGCCGGGAAGCGCCTGGCATACATTTACAAAGCCAAGGTTAAGACCAATGGAAGCCACTATCGCTGCCTTTGGGGTAAGGTTAGCAGGTCTC ACGGAAACAGCGGCATTGTTCGTGCCAAGTTCAAGTCCAATCTGCCACCTAAATCAATGGGATCCAGGGTTAGAGTCTTTCTGTATCCAAGCAACATATA AGGTACTTAGACCATTTTATTTATACTCCTTGCCTTTCTTCATACATTATCAGATGTTGTCTTATTATGCTTCTTTGTAAACTGTATCTTCTGATATAGT TTGTGTAGATATGCAATTCTTGATTTCAATGGTAGGAATAATAGATTAAACCAGAATTGTTAATGAAAAATTGTGTGATTGACAGATTTTTGTTGATATT TTCAAATCTTTAATATAATATTTTCAAATCTTAACAGCTTTAATATAATATTTTCAAATCTTCCTTCTTTAAAACTGCCCATTTTATTGATAGATTCTAC ATATTGCTGAACTTCGTTCAAGTGTAGGCTCTTCTCATCTAGTCGTAAGTAGCAATATCAAACTGTTGGAAGTAATTTCCGTGTGCCAATGGTGTTATCA CTTCTCTAACTCCATTTCATGTTTTCTTGTTTCAATGCTTAAACTTGAGACAGGAAATCGCACATAGTTCTTTTTGGGAACCTAATTTTATCAAAAGCAA TTCCCAAGATTTTATTTGTGCGTATAGCAAGTCATAAGCCTATCTGCTTGAGCCTTCTCCTTTATTCATGAAGATGTGCTCCAATGTTATTGGCTTACAT TATAGTTCTCTTGAAATTAATTTCAAGGTGCTGATAATGTTAGGTCCTCCATTGTATCTTTGAACTTAGGTTGGTTTTGTAGATTGTTGTTTTCTCAAAT GATTTCTGGCTCCATTCAATTGGTTATAACTGTAATGCATCCTCTTAACTCCATGTTTGTTCTCTTTTTTTATTTTGAGACCTGACATTAAAAAAAAGAA TTCCCAGGATTTTTGTTTGTGTTTAGCAAGTTACGAGTCTCTTTATTTGAGCCTTTTCCTTTATCCATGATGTGTTCCAATGTTATCAGTATCTTGCATT TTTTTTCATTATATAAACAATTTATTGTAAATGAGTTTTTAGGAAATCTGTCTCCGATATTTGATGATCCTATAATCCCTCCTATTTTCTACACCTTTTA GGAAATCATGTCGGATGATTTTAGAGGGTTGTCTTGTTTTCCTCCTCTAATTATGTTGTCTGGGTCTATCTTTCATGTTTTCTAATTTCAATTACTTAAA ATGATCCATTGATTTTTGAGAAAGAAATCACACATAGTTCTTCTTGGGAACTTAATTTTACAAAAAATACAATTCCTAAGATTTTATTTGTGTGTATAGC AAGTCATAAACCTATCTGCTTGAGCCTTCTCCTTTCTCCATGAAGTTGTGCTCCAATGTAATTGGCTTACAGTTTTTTCTCCCATTTACTCAAATTTGTA TGATTCAGATTCTAGGCAACCTATCATAATCACCTGAACCTTCCATTTTTCTCTACTTGTAGATTGATATTTTTACAAATATACTTAGTTCAAAGCCCTG TTTCACATTTAACTGCCCTAATATTGTTTGCGATGCTTTGTTAATTCATGCCATCTTAGTGACATTAATATATCATATCAGTAAGTGATGGCTTTAATGT AGTAAAGAAGATTTCCTGGTTTTAATACAAGGTTTCCTTTATAATTTAATGGCAATGATACTAACTAAAATGTATTTACGATACTCTAATTTTGTTGGCT TCTGTTTCCAATTAGTGATATAGTAATTTATAATCATGATGCTTCTTTCATTTTATGCGACTTTGTTAAATTTTCTATGAAGTTTCTAATGTGTACTCTT TTTTTTGTTTTTATTTTTGCAGATTTTAAGTACTTAGGTGCCCATAGAGTTTATCCATTTGTAGAAGGATTGTTCAAGTTAAATTTTGATGTACTTGGTA ACTCTTGAGAAAATAGTTTCTTGTTTAGGATGGTGTGAATGAACTGCGTGTTTTATCATTCTCACTGCTATGTATTAACGAAGATTCTAAGTCTCATTTT TTCAGAAAATGGTTTTTCCCCTTCTTTGTTCCTTGTGACCAGTACCATCGTACTAAAGGAGATTATAAAATCAGTTTTCATCTCCAATTAGAATAAACTT AGTTAACTCAAATAATTTGTTTTCACCATGTCAATTAATTAAACTGTAATTTTACAGTCAGATTTCCAAGCTTATTACTAATATCAATGTCTAATTATCT ATATTTTGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_40461; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_43360
Blastp | - |
---|---|
Blastx | 60S ribosomal protein L35a-3 from Arabidopsis with 86.27% of identity |
Eggnog | Ribosomal protein(COG2451) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G74270) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462603.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |