Ll_transcript_43387

Id TrinityFTRINITY_DN54184_c0_g4_i4
Name TranscriptLl_transcript_43387
SequenceATTATGGGCTTTCTGCATATATAAAAAGTATTAGGGTTCAGCCGCGTAACTCTCTCCCTTCATTCAACTCATCTCTGCAGACGAAGAACATGGTGAAGGG ACGCCAAGGCGAGCGTGTCAGGTTTTCAATTCTCATATCATTTTCCACTTTTATATTCTCATTTCTTTTCAATTCCCCAAAACCCTAATTTCTAGTTTTC ACATAGCTTTTACCCACTTGTGCCGTTTTAATCACTCTGATTATTAATTTTGCTGCTATTGTAACTGTTTTGTTATTGATTTTTTGAATTTGATATTTTA TGTGTTACAATCGGGAATGGCTTCATGTACTTTGTTAGTGAGCCTCGACGCTACGACAATGTTGCTTCTAACGTTGATTTGATGTTTTCAAATCCTGGAA ACAGTCTTTTCGTTTGCGAGGGTTACGGTTATCCTCCCCAGGCTCCACTAGGTGCGAGGCTTGTGCATTGGTCGCCTTTTTTTAGTGAAAGAGATTTGGT TTAGTAGAAATAATTTATGATTAACAATTCCTCCTTGGTTGTTTTTGTTGGATTTTTTATGCTGTAACATTACAGAATGATTTCTTTTCACCTTAGATGT AGTTGTTGATTGAATGTGTATGAATGGTTGATGATGTGTATGATTCTTATTTCATTTGTCTTTGTTCCTTCATAGATGGCTGTATTTTCTAGTTGCTCAT TTTCTTACATGATCCTTTCCGTTAAAATAAGCTAATAATGTGTTTTTATTCCATCGTTTTAGACTCTACGTGAGGGGAACAATCCTTGGGTACAAAAGAT CCAAATCAAACCAGTACCCGAACACTTCTCTTCTTCAAATTGAAGGAGTGAACACAAAGGAGGAGGTGGCATGGTATGCTGGAAAGAGACTGGCATATAT CTACAAGGCCAAGGTGAAGACAAACGGAAGCCACTACCGCTGCATTTGGGGCAGAGTTACCAGGTCTCACGGTAACAGTGGTATTGTCCGTGCAAAGTTC AAGTCAAATCTTCCCCCCAAATCAATGGTAATAACATTTCATACATCAGTTTTATTAGTTTACCTCTTTGAACAATATTATGATCCTTTGAGTTTCATGT TTTGCAGGGGTCAAGGGTAAGAGTATTCTTGTATCCAAGCAACATATGAGGTAACATTGTCCCACTATTGATGTTCTTCTCTATGCATACTCATCTTGTT TTTCAACTTTAGAACTCCTATTTTTCATTTTATATATGGTAAATATGTTTAGTTTTGCATTTTGATAATTCCTTTGTCATGTATTACTGTTTACTGTGAT ATCTGTCCAATGCTTTTTTATCTCCAAGTTCATATGATGTATGTACTTCTACATTCTATCCACCGTATTCTTACGGAATTTACATTGAGCATACGACTAT TGGAAAACTTAGTTTGTAATTATGGCTGAAATAATAGCATGTTTTTGCTTGTGGTAACTTCCCTCTTCTTTGTAAAGTTTGAAAGCACATATCTAATTTT TAATAATCTGAATTTTTTTCTGATATTTCAGTAGCTATGTAAAGTTGAGTCCGGATTGAGACCCTTTTTAATGAAAGTATAACGAATTTGTTCGCTGTGT ATCCATATGATATGATTTGTGTTTATGTGTATTAAAATTTGCCCATGCTTGTTTTTATGCACATTATCTTGCTCTAATATTACATTGAATTTTGTTTTGT TTTGTTTCAGATCCTCATGACTGTCACTGGTCAGTAGATTTCACAGATGATTTGTAGGCACAAGGATTTTGTTTCATTTTCTTTTAAGATTATTGTCGTT TTTGTTTGCTACTTCTGAGCAGTTTTTTGTTGTTGGGGTGATGATAGGAAATGGATATTCTCTATGGTGTGACTATTGTCTATGAAGATTTTTATATTTC ATTTACTGTCAAATTGTGTGGACTTGGTTATTTGCTATGCTTTAGTTCATTTTCAATTCGTGCATGATGTAGAAATTGTTGACTTACTTGGAAATGCAAA TCCTTCGGTTACTTTAATATATAAAGATAGGGCAATGCTTTTTTCACTCATTAACATTACCTAATTACCCATAAATGTTTCAGC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_40462; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_43387

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_43387

Blastp-
Blastx60S ribosomal protein L35a-3 from Arabidopsis with 85.87% of identity
EggnogRibosomal protein(COG2451)
KeggLink to kegg annotations (AT1G74270)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019455845.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;