Id Trinity | FTRINITY_DN54194_c0_g4_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_44478 |
Sequence | AATGGTTGATCATGCTTCTGATTCTGATGAGATACTCTCTATGTTATATTGCATGGCAATCACGAGGCTTGTGAATGGTGTCATTGAGAAGACACGTGTA AAAGAATTGGTGTCTATAGCTGTTGCTGCTGAAGCAATTGGTATTCCACGCACGCTGATCGATATTCGCCATGGATGAATGGAATGGAGCATGAACTTTG TAGTCCTTGGAGAATTTTGAATGTTTTCTCCGTATAATATGTTTACTGATGCCAATTGCAGAGGCGTCGCATCGTGAACTTCCATCACTGAAGGTTGTTC GTACTGCCTCCATTAAGGCACTTGATTGGTTAAAATTTTATTATTGGGAGCCTCAAAGCAAAGCAATTCCTTTTCAAGGTGAAAGAAATGATAAGGTCAA AAAGGAAGTCAAATCTAAAATTCGTGAATTAGCTATCTGCGTGAAAGTCAAAGGAAATCCCCAGCCTAGTACTTCATTACTCAAGGGAAAACGTGTGTAA GCTTTGTTAATTTGTACCATATTACCCCTCTAACAAATGCTTTACTCTTCCTTCTTCTATGTCTCATACGTTCGACCTATTCATTCTGTTCACCTTGTCT ATTTCATTTTCGTAATTGCTGTTTCATTCATGCTCATCGAAAGCATGTGATTCATTTAATGTGGGAAGCCCAAAGTGAAACTATGATGGTTGGAATTTGC CATGATCTTATATTGGGCATGATTTGGTTTTCACAAGGCATAATATTGCCTTTTGGCTTCAAATTTTTATTGGATAAATTAATCTTGCACTTTCCACCCT AACCTCCGAAATGCTGATATTGCTCATGCTTCTTTTTCCTTTTCATAATGTGATGTAGTTTTGATAAAAAATATTAGATTATACTTTTTGTTTGTTTATC ACTTTACCCTCACGTTTTATCGCCCCATCCCAAATAAAATCCTGTGGCTTCATATACTTATGTTAGTGGTTTCTTGCATCTTTTCGATTCACTACCCCTT GGAAGAAAAAATGCCATGCTTTTGTGCTTTGCTTTGTAGAGACGTGCTTCATGTAGTACGTATTAACACATCTGAAGGCATTTTTTATATGATATTATCC ATTAGTAAGCCACACTTCTTAGGTGAAGTATAAAATTTCATTAAAATTTATTGCAATTCAAGACAATATGGTGTTATTTGTTGATGACACAATTTTCAAT TTAGCCTTGCTTTTAAGTTAATGAAGTAGTAATTTGCTTTTAATTTATTTGCTAGTGTTCTATTAATGTCTCAGCAGTAATGAAGTATTGCTCCCACATG TGATGCAATACATTTCTAGCATCACATGCTTACATCCGAGTTAAAGTATTTGGTTTAGGTTTCTTTTAGTTGCCACTGTTTCTTATTTCTTCTGCTTTAG AGTCTTATGATGTTGAATATTGTATCTTTTAAAGGGTTGAAGCATGGTGAATTGCTCTTAGGGCGTAATAAGCTTTTGAGTCTTACGCTTGGCAAGAGCC AGTCCTCACAGTCTGGAGGTATCAGAATATTAATACATTAAATGTTTACAGTGTTTGTTCATTATACTTATATATGTGTGTGTCTTTCTCTAATCTAAGT GAGTCTAAGACCACATTAAAAAATCAAAAGGAAAACACAAGAAAATTTGCATGCAACACCATTTCGCGCAGGCATGAACAATTACATAGAAATAAATGGT TCAATTTATAAAACCGATAATATTTGTAGGTCCACTAGCTTTAGTAGATATATCATTGGCTTGCATCGCATGCAATTGTTTGAGTGTTTGTTTAATCAAA CTTAGCATGAACCAATTAAATTTCAGGAAACCCAATTCTTATTTTGGCAATTAAAATTGTATTAATCATGTACATGATCATTAAAGTGATTGTGGATTTA CATTACCATAGCATGCTGTGAAATATTCTCTACACCCTCTGGTTGTTTCTCCTTCAACTTGGAAAAGGCGAGAAATGAAAGTTTATATATTTACCAGTTT AGGGACTTGGAAGCTTGAAGTACAAAAGAAAGGAATGAAATTTAAATGATCATAGCAGTAACTTCGGCAAGGTGGTTTGTAATTCATTGTTAAGGGCAAC TTCATTGTCACCTAAGGATTAGGTTTGGCTTAATGGGTTTGAGGGAAGGACTTTGGTGAGCAGCTTTGTCAATGTTAAGAGGTTGTAGCTGTTTAAGGGG GAGGCTTGTTTTTTTGTTTCACCTCTTTTATAGGATAGACCTGTACTTTAGTTTTTTGTGTGGGTATAGCTAATAGGTTATTTTAGGATTTGCCTAGTCT GTTATGCCAACAGGTTATTTTAGAAGGATTCCTGATTCTATCCAATTTTTGTTTTTTAATTAAATAAAAAGCTCAAGTATTGCAGTTTGTCTAAAACTGG TCAAACAAATAAGTAATGTTGAATGAGATTCCTAATCTACAATGTATTAGGTTTTTATTTTTTTGTTATATTCTGAAAAGGACGTGTATTCAAGCACTAA TGCATCCTGATACTTTCAGGCTCTAAGAAACCAATTGCGAAGATTTTGAAATCTGTTCTTCGGTTGTATTCCTCCTTCTCCTCAGAGATTGTATCTGTGT TGTTGGAGTATTTGCTGAAGGCTATGAGTTCTGCAGAGTTCAAAGAGAAAGCAGATGCTGCTTCTGTCGGTCTAACCATTCAGAGTGTTTTGGCTGATTG GAAGCCTGTCATACTCAAATTGTGGGACAAGGAACCAGAATTACTTGTAAACCTTCTTAAGGAAGTTCTTGATATGATTGAGACTCGGGAAGATATGAAG TGTGATGGAGATAACCCGTGCACTGGGATTTCACACGCAAAGGCAGAGTTTTGCCGAAGTGATTATCTTTCTTCTTTGTTTGCTTGGCTTGTTGGGATTC TCAGCAAAGTTCCTTCTGCCACAGCAAATGTGCCAAAAAAAGTTTTGCTCGAGCTTCTTCATAAATGTCTTTTAATATCACAACTTTGCAACAAGCAGCT CATGGATTCAGCCCTTTATCTCGCTGAACTGGTGGGTGACAGGTTTTTGTTGGAGAGAGCTAAAAGGCTCTATCTCATTGGTTTGTCAAACTTAGACTAT GCAGATGATAAAGCTTCCTCTGTGTTGACTACAAAGAATATTTTCCAATTTGAGGAATCCATACATGAAGCAGCTAAGAAGCTAGAGTTATTTAAACAAC AGATATTGAAAAATAAAACACCAAGGGCTGTGGATTGTGAGAATAAAAAATTACAGACTTGGTCTTTGGCAAAATCATGGAACCCATGTCCTATTGGCAT GTTGCCCCGTGCAGTTGGTTCATCTGGTTTTCTCCCTGTTCTTGACCATGTTGATAACCAAAAACAGAATGTAGTATCAGAAAGGAGAGAGGATCAGAAA TTGACCCAACATGGTACCAAGCGAGATGCCACTGAAGACCTTCAACTACTCGATAATTCATCTGTTAAGAAGATGAGGGATACCAAAGAATCTTGTGATT TAAATGATGTATTGCCGAGAGATGGAGTGAAGGGATGCCTCATGGTAGCCGGAGTTTGGAAGAGAGTCGGGGAAGAAGAGCTACAAGCCATTCAGTCTTC TTTGAGGATTTTAGTTTAATTTGATAATTATTGCTTAGCTTGTCAAGATTCAATATGAGGTATGCTAGTCATTTATACGCATCTTATTTGATCTGATTTA TAGAGCATTCACTGAAATTTTGTTTTAGAAGGGGTGTAGTTTGTATCTCCCCCACCCATATCTGATTTATAAAAGAAAAAGAGGAAATTAAATGAAAAAC AATCCTATAGTTTAATTACCTGAATTAAATTCATGTAATCAGAATAGTCTTTTATCTTTGTCAGTACCATTTTCATTGTGCTGAGTGCTTGTTCAATCAG TTATGCTAGGATGCCAATGCTGTATTGTGGTAAAGGAAAGTCCAGCAGGGGCGACCTGAGAACACGTGAGCTGGGAGGTATTCTGAAACCTCTCGGCAAT CTTCATGTGTTCTCAGTACGACCCTGTAGAACCCCTCTACCTCTACATTTTCTGGAAAGTATTTTTTGCCTAAATTGGAACATTGACCTTTCTGTCATGT TTTAGCAAAGTAATGAGTTTCTCATTTTGATTCAATGGATATATAGCCTGAAACTATGTACTACTACTTCTAGAGGCTAATTTGTACTGCAACAACTACT TTTAGCAGTTTAATGAGTTTTCCTAATTTGTTTCAATATCTGAAACTTAGTATTTCTAGTCGAAAGATGTAGTACACTCAAGTACTTCCTCAAATAAATG ACGCATTATGCATGTTTGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_40545; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_44478
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | gma-MIR398c (MI0017847) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460434.1) |
Pfam | - |
Rfam | MIR398 (RF00695) |
GO | - |