| Id Trinity | FTRINITY_DN54194_c0_g4_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_44484 |
| Sequence | TTTTGATTTGTCTTGTAATAAATAAATTAAAAACTTTTCTAATACTTGCCTCTGGGCCCATGTTACAGGTGGCCCAACAGGAAGAAATAAGCCCAATCGA AAACCCTAAAATTGAAATCCAAAGAAAACAATAAGCTTCCTTCTCAACCTTCACCGTTGTGTTCAACAATGGAGGAGTCATTACTACTGTTAGGGTTCAA AGAAGAAAACGAAGACACAAATTCATCAACGTCTCTAAGATTGGTTCCTTGGCTTAACTGGAACGAATGGATTTTCGTTAAACATGCTCTCTTCTCCAAT TCCACTTCCTCTATTGCCTCTGCTCTCAACAGAATATCAGCATGGCGAAGTCGTGGTTCTTTGCCAATTACTGTTCAAATCACTGCTTCCATCATCGAAA TTCAGCTCAAGGATCCTTACTTTCAGTAACTACCTCGTTTTCCTATTCTCTCTGTTTTTTTATGAATCGTTCATTATTTATTGTTTTATCCAATTTTTGT TTAATGTAGAATGGTTGATCATGCTTCTGATTCTGATGAGATACTCTCTATGTTATATTGCATGGCAATCACGAGGCTTGTGAATGGTGTCATTGAGAAG ACACGTGTAAAAGAATTGGTGTCTATAGCTGTTGCTGCTGAAGCAATTGGTATTCCACGCACGCTGATCGATATTCGCCATGAGGCGTCGCATCGTGAAC TTCCATCACTGAAGGTTGTTCGTACTGCCTCCATTAAGGCACTTGATTGGTTAAAATTTTATTATTGGGAGCCTCAAAGCAAAGCAATTCCTTTTCAAGG TGAAAGAAATGATAAGGTCAAAAAGGAAGTCAAATCTAAAATTCGTGAATTAGCTATCTGCGTGAAAGTCAAAGGAAATCCCCAGCCTAGTACTTCATTA CTCAAGGGAAAACGTGTGTAAGCTTTGTTAATTTGTACCATATTACCCCTCTAACAAATGCTTTACTCTTCCTTCTTCTATGTCTCATACGTTCGACCTA TTCATTCTGTTCACCTTGTCTATTTCATTTTCGTAATTGCTGTTTCATTCATGCTCATCGAAAGCATGTGATTCATTTAATGTGGGAAGCCCAAAGTGAA ACTATGATGGTTGGAATTTGCCATGATCTTATATTGGGCATGATTTGGTTTTCACAAGGCATAATATTGCCTTTTGGCTTCAAATTTTTATTGGATAAAT TAATCTTGCACTTTCCACCCTAACCTCCGAAATGCTGATATTGCTCATGCTTCTTTTTCCTTTTCATAATGTGATGTAGTTTTGATAAAAAATATTAGAT TATACTTTTTGTTTGTTTATCACTTTACCCTCACGTTTTATCGCCCCATCCCAAATAAAATCCTGTGGCTTCATATACTTATGTTAGTGGTTTCTTGCAT CTTTTCGATTCACTACCCCTTGGAAGAAAAAATGCCATGCTTTTGTGCTTTGCTTTGTAGAGACGTGCTTCATGTAGTACGTATTAACACATCTGAAGGC ATTTTTTATATGATATTATCCATTAGTAAGCCACACTTCTTAGGTGAAGTATAAAATTTCATTAAAATTTATTGCAATTCAAGACAATATGGTGTTATTT GTTGATGACACAATTTTCAATTTAGCCTTGCTTTTAAGTTAATGAAGTAGTAATTTGCTTTTAATTTATTTGCTAGTGTTCTATTAATGTCTCAGCAGTA ATGAAGTATTGCTCCCACATGTGATGCAATACATTTCTAGCATCACATGCTTACATCCGAGTTAAAGTATTTGGTTTAGGTTTCTTTTAGTTGCCACTGT TTCTTATTTCTTCTGCTTTAGAGTCTTATGATGTTGAATATTGTATCTTTTAAAGGGTTGAAGCATGGTGAATTGCTCTTAGGGCGTAATAAGCTTTTGA GTCTTACGCTTGGCAAGAGCCAGTCCTCACAGTCTGGAGGTATCAGAATATTAATACATTAAATGTTTACAGTGTTTGTTCATTATACTTATATATGTGT GTGTCTTTCTCTAATCTAAGTGAGTCTAAGACCACATTAAAAAATCAAAAGGAAAACACAAGAAAATTTGCATGCAACACCATTTCGCGCAGGCATGAAC AATTACATAGAAATAAATGGTTCAATTTATAAAACCGATAATATTTGTAGGTCCACTAGCTTTAGTAGATATATCATTGGCTTGCATCGCATGCAATTGT TTGAGTGTTTGTTTAATCAAACTTAGCATGAACCAATTAAATTTCAGGAAACCCAATTCTTATTTTGGCAATTAAAATTGTATTAATCATGTACATGATC ATTAAAGTGATTGTGGATTTACATTACCATAGCATGCTGTGAAATATTCTCTACACCCTCTGGTTGTTTCTCCTTCAACTTGGAAAAGGCGAGAAATGAA AGTTTATATATTTACCAGTTTAGGGACTTGGAAGCTTGAAGTACAAAAGAAAGGAATGAAATTTAAATGATCATAGCAGTAACTTCGGCAAGGTGGTTTG TAATTCATTGTTAAGGGCAACTTCATTGTCACCTAAGGATTAGGTTTGGCTTAATGGGTTTGAGGGAAGGACTTTGGTGAGCAGCTTTGTCAATGTTAAG AGGTTGTAGCTGTTTAAGGGGGAGGCTTGTTTTTTTGTTTCACCTCTTTTATAGGATAGACCTGTACTTTAGTTTTTTGTGTGGGTATAGCTAATAGGTT ATTTTAGGATTTGCCTAGTCTGTTATGCCAACAGGTTATTTTAGAAGGATTCCTGATTCTATCCAATTTTTGTTTTTTAATTAAATAAAAAGCTCAAGTA TTGCAGTTTGTCTAAAACTGGTCAAACAAATAAGTAATGTTGAATGAGATTCCTAATCTACAATGTATTAGGTTTTTATTTTTTTGTTATATTCTGAAAA GGACGTGTATTCAAGCACTAATGCATCCTGATACTTTCAGGCTCTAAGAAACCAATTGCGAAGATTTTGAAATCTGTTCTTCGGTTGTATTCCTCCTTCT CCTCAGAGATTGTATCTGTGTTGTTGGAGTATTTGCTGAAGGCTATGAGTTCTGCAGAGTTCAAAGAGAAAGCAGATGCTGCTTCTGTCGGTCTAACCAT TCAGAGTGTTTTGGCTGATTGGAAGCCTGTCATACTCAAATTGTGGGACAAGGAACCAGAATTACTTGTAAACCTTCTTAAGGAAGTTCTTGATATGATT GAGACTCGGGAAGATATGAAGTGTGATGGAGATAACCCGTGCACTGGGATTTCACACGCAAAGGCAGAGTTTTGCCGAAGTGATTATCTTTCTTCTTTGT TTGCTTGGCTTGTTGGGATTCTCAGCAAAGTTCCTTCTGCCACAGCAAATGTGCCAAAAAAAGTTTTGCTCGAGCTTCTTCATAAATGTCTTTTAATATC ACAACTTTGCAACAAGCAGCTCATGGATTCAGCCCTTTATCTCGCTGAACTGGTGGGTGACAGGTTTTTGTTGGAGAGAGCTAAAAGGCTCTATCTCATT GGTTTGTCAAACTTAGACTATGCAGATGATAAAGCTTCCTCTGTGTTGACTACAAAGAATATTTTCCAATTTGAGGAATCCATACATGAAGCAGCTAAGA AGCTAGAGTTATTTAAACAACAGATATTGAAAAATAAAACACCAAGGGCTGTGGATTGTGAGAATAAAAAATTACAGACTTGGTCTTTGGCAAAATCATG GAACCCATGTCCTATTGGCATGTTGCCCCGTGCAGTTGGTTCATCTGGTTTTCTCCCTGTTCTTGACCATGTTGATAACCAAAAACAGAATGTAGTATCA GAAAGGAGAGAGGATCAGAAATTGACCCAACATGGTACCAAGCGAGATGCCACTGAAGACCTTCAACTACTCGATAATTCATCTGTTAAGAAGATGAGGG ATACCAAAGAATCTTGTGATTTAAATGATGTATTGCCGAGAGATGGAGTGAAGGGATGCCTCATGGTAGCCGGAGTTTGGAAGAGAGTCGGGGAAGAAGA GCTACAAGCCATTCAGTCTTCTTTGAGGATTTTAGTTTAATTTGATAATTATTGCTTAGCTTGTCAAGATTCAATATGAGGTATGCTAGTCATTTATACG CATCTTATTTGATCTGATTTATAGAGCATTCACTGAAATTTTGTTTTAGAAGGGGTGTAGTTTGTATCTCCCCCACCCATATCTGATTTATAAAAGAAAA AGAGGAAATTAAATGAAAAACAATCCTATAGTTTAATTACCTGAATTAAATTCATGTAATCAGAATAGTCTTTTATCTTTGTCAGTACCATTTTCATTGT GCTGAGTGCTTGTTCAATCAGTTATGCTAGGATGCCAATGCTGTATTGTGGTAAAGGAAAGTCCAGCAGGGGCGACCTGAGAACACGTGAGCTGGGAGGT ATTCTGAAACCTCTCGGCAATCTTCATGTGTTCTCAGTACGACCCTGTAGAACCCCTCTACCTCTACATTTTCTGGAAAGTATTTTTTGCCTAAATTGGA ACATTGACCTTTCTGTCATGTTTTAGCAAAGTAATGAGTTTCTCATTTTGATTCAATGGATATATAGCCTGAAACTATGTACTACTACTTCTAGAGGCTA ATTTGTACTGCAACAACTACTTTTAGCAGTTTAATGAGTTTTCCTAATTTGTTTCAATATCTGAAACTTAGTATTTCTAGTCGAAAGATGTAGTACACTC AAGTACTTCCTCAAATAAATGACGCATTATGCATGTTTGG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_40545; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_44484
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Ribosomal biogenesis protein LAS1L from Homo with 30.34% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | gma-MIR398c (MI0017847) |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460434.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | MIR398 (RF00695) |
| GO | - |