Id Trinity | FTRINITY_DN54196_c3_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_44796 |
Sequence | AAAAAAACAATTTAGTCACTCACTTTTCTTTTCTCTCTTAATTTCTCCAAATTTTCAAACGTTAAACATATTGTCTCTTTCATCCACCATCTTCATCATT TCACTGCCACCGTCTCCTTCAATCGCAACCATAATCAAATCCCATTTCTCAAACACTCTTAACACTTTCAGATTCTAAGGGTTTTGTTAAAATGTCTCAA CAGAGTAAGAAATTAACACCGAATCTCGATGAACAAAGCACAAAAGTGCTGAATCTTACTGTTCTTCAACGAATGGATTCATTCATCGACCAGATTCTCT TCACTGCTGCTCATGTTTCTTTCTATGACTTCAATCTTCAAACTAATCAGTGGAGTCGTAAGGATGTTGAAGGATCTCTTTTTGTTGTTAAAAGGAATTC ACAACCTCGCTTTCAGTTTATCGTAATGAATCGAAGAAATACAGATAACCTAGTGGAGAATCTTTTGGATTTTGAGTATGAACTTAAGAAGCCATACTTA TTGTATCGGAATGCTGCCCAAGATGTTAATGGTATATGGTTTTACGATCCAGATGAATGTGAACAAGTTGCAAATCTCTTTAATAGAATACTTGGTGCAT ACCCAAAGGTACCTCCAACTACAACAATACCTTCTAACAACAGGTAAGGATTTTTAGATTGAAGAATCGTGTGAGTTGATTCTATAAATATCTCTTTCAA GTATAATACCTTTCAGCATAATTTATAGTTGTAAATATATTCATATTGCTATTGGATGCTTATATATGTTAATAATTCCAAATAACATTGTCTTTGGTAT TGTATTCCTAGAGAAACTTTGTGATTTAAAATTTGGTACTAAATTTCTTTAATATATTGTATATGTTATTAATTGCACACCATTGAGTCCTCCAACCCAA CCATTCCAAAAATCAACTAAATTGTGGTCTATTACATCCACTACACTAATAAGAGGAGAAATCATCTATCAAATATTTGTTATTTCAATTCATGTTTATA CACTATCTCTCATATTAATAATAATGAAACAAAAAGACAATAATAATAAAATTTAATTAATGTATCATATTTTTATTAATATGAGCAGCGTATATAATAA AATCTAAAACAAAAAATATTTGTTCAAAATATGTCATAGCTATTGCAGCTTCTAGCCTTCATGGGTATCTAGAGTCTATGACGCATGCAACCTAGAATGA AAATATCATATATAATGTCTCTTATCCTATAAATTTTTTATTAAGAAAAGATGCTATCATGTCTCTTATCTTATATATAGAAATAGTATGAATTATTTTT ATTGTTTCCATAATTTTTATTCGCTATATCATCACAAAGTTATTTAAGTTGGTCGCTCTATATACTATACTATATGAGATCGACTATATAGATTTGTATA ATGAGAAACTCAATATAAGTACTACCTTCACATGCTATTTCTTGTGCATTGATTGTTCTTGCTCAAAATTTCAACTTCTTTATTTATTCAGTCCCACTTA ATTATTTCTCCTAGTTAAGTTTATAAGTGATTATAGTTGCACGCTTATCCCTGATGTTATATATATATATATATATATATAAATATAAAATGTAGTGTGT TTGAGGAACTTGAGCCAGTGTCAATTATAACCAAAAGTCCTCTACACCTATCTTCATCTTCAAATGATGCTCATGAAGATCCTATATTTACCAACTTTTT CAGTGTAAGTAATCTACTTGCATACCAATTTTCTCAGCTTTTTTATGAACACTTCCACTATGCAAATTTTAGCTTTTTGTTCTATTCTATCATGCATGTG CTTCAGATTTTCTTGGTTCAACTGTTGCAGACTTCTATTGAAACAATTAACAGTGGCAAAGAAGTGAATAATCTTCTTAAGCCTTCTACATATTTTTCAT CAACCTCTTCATCTTCATATCCAATGCTTCAACCTTTTCCACCACCTAATCCATCTCTTTCTCTTGCTCCTATTTCTAACTCAAATCCAAGTAAACCAGT TATCACTAGAGATAAAGTTCGTGATGCACTTGTATCACTATTTCAGGATGATCAATTCATTGACATGATGTTCCAAGCATTATTGAAGGTCAATCATTCA TGAATGTTCAAAAGTATATCCAAAATTATGTTCTAAATTAATGAAAAAACAATTAATGTTTTTTTTATGGATATGTTATGTTTTCATTAATTTCGGAAGC AAATCATTATCCGAACTTCTAAGGAATGGAGTTAAAAACGCCGTCTGTGGGGATCGAACCCACGACCACGTGGTTAAAAGCCACGCGCTCTACCACTGAG CTAAGACGGCATTGTTGTTAAGTTTTGTATATCATATTTTCTACTTTACATATTACACGCTCTACTATAAACTAAATCGTAGCTCACATGATAGTAAATC AATGCTTTGTATATCATATTTTCATATCAATTCAAACTTCAGATATTGTTTAAGAAAAATCAAATATTTATCACTTG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_40563; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_44796
Blastp | - |
---|---|
Blastx | mRNA-decapping enzyme-like protein from Arabidopsis with 74.64% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425238.1) |
Pfam | - |
Rfam | tRNA (RF00005) |
GO | - |