Ll_transcript_273668

• Id Trinity: FTRINITY_DN54225_c2_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_273668
• Sequence: AGCATGTCGACCATAATATCTATCCCCATCAAATTTCCTTGGCTCCGTCCAGCATATCATCATTCCCCGTGTCTCAAAAAGCTTTTCTTACACGCTCTCC AAAAACATAACGCGTTTTCTCACTCTTAACTTTGTAATTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTATTCCCCATGGAAACCCTTGCCTTCCTGATTTCAT TTTCAGAGTCATGATTTCATTTTCAAAGTAAACCCTTTTCACGCAGATTAACGCTCCTTATATTTTCTTCATTCATTTTCCTTATTAAAGGAAAAAGAAA TATTCTCATATTCATTCCATCGCGTTTCTGATTTTGTTCATTCCATCGCGTTTCTGATTTTGTTCATTCCATCAAAAGTTGTGGTTTATTTGTTTGGATA AGAATCTGGTTGGATTTTAAATTCTGGGTGTGGATCAAGTTTTGATTTTTCTGCAGTTTCGAAAAGGGTTATTGAGATCTCCATGTCTTCAGGAACATCA TCGTATTGGTGTTACAGGTGCAGTCGTTTCGTTAGGGTATCGAGGCAGGACACGGTGGTTTGTCCAGATTGTGACAGCGGTTTCATCGAGGGAATCGAGC AACCGGCGCGTGCTCTTCACGTCGGCGGACGCCGGCGGCGGTTTCCCGAAGCTGCGATGTATATGATTGGCCAGCGCCCAAGTTTTGATCAGAATTCTCG CCCCCTTATTCGTCGAACCCGCCGCAATGGTAGTAACCGGTCACCGTTCAATCCGGTCATCGTCCTGCTCGGAAGCGGTGGTGGTGGTTCCACGGAGGGG GCAGCTGAGCAGGACAGCGCGGAAGGTCGCGGGTTTGAGCTCTTTTATGATGATGGTGCAGGTTCTGGTCTTAGGCCTTTGCCTCCTAGCATGTCTGAGT TTCTTCTTGGATCAGGAATTGATAGGTTATTAGAACAGATTTCTCAGATTGAAATCAATGGTATTGGAAGGTATGAACACCCTCCTGCATCAAAATCTGC AATTGATTCATTACCAACAATTGAAATTTGTGATGGTCATTTAGAATTGGAAACACATTGTGCTGTTTGTATGGAGCCTTTTGAATTTGGCACTTCAGTT AGGGAAATGCCTTGTAAGCATATATACCATGAAGAATGCATTCTTCCATGGCTCGCACTTCATAATTCGTGCCCCGTTTGTCGCCATGAATTGCCTGCTG ATACTGTCCCAAATCAGAATACACCTTTAACACGGAATTCGCCGAACTCTCTTGCTTCGAACGAAATTGAAAATGATGGATTGACTATTTGGAGGTTTCC AGGGGGAGGGTTTGCTGTAGGGAGGTTTTCTGGTGGGAGAGGAGGTGCTGAGAGAGAGCTTCCAGTTGTTTATACCGAAATGGATGGTGGTTTTAACAAT GGTGGTGAACCCCGGAGGATTTCCTGGTCATCTAGAGGGAATAGTGGAAGGAGAGAGAGTAGTGGTTTCAACAGGTTTTTCCAGAACTTGTTTGGTTGCT TTAGAGGTGGTGAAGTTGGTCCCCGGCAACCTACTTCAAGTACAGCATCTCCATCCACCGGAAGGGCAAGTTCGCCACATTCCAATGTGGATCCCTCTCC ACGTTCGCGCAGAACTTGGTCTATGGATGTGAACAGTGGAATGAGTTCATGGTAAATGGTAGCTTAAACAAGCAGTGGAAGCTAAAAATATCAACTTTGT TTCGGTGTTCCCCAACTGAGACACGGAAAAAAGTTCTGTTTCAGGGTCATATTTGTCGGTTGGTCAATGTGCACTTAATGGGATGCACTTGAGCCTACAA TGCACTGTAATCAACAGGATTTCACAATTCTCACATTTTCAGCTGCAAATGATGTATGGTACGAGAGATCAATGTTGTTGTTTTGGATAGGGAATTGTTA CTGTAAAAGTCATCAGTCATTGTCTATATTAACAGTAGCCAATAGGGACAAGAAGCAGCAGCAATGGCATAAACCAACAGAGAAGAACCAAATAGGAAGA AAACCTGTGTGGTATTTATGTAACTTTTGGGCAGGGAACATTATGATCATTATCTTTATTCTAGTTTGTTAATGAACCGAAACGCCTTCATATTTTTTTT TATTTTATGTCTCTTCTTGTTCAACATTCGTAAAATTAGTTAGCTTCAGTTTATGGTGATTTTCAAATTTATGACATCATTTGTCATTGTTTTTCTCAAA GAAACCCATAATGTTCATATGCATGATAAGCTTATTGCCTCAAATTGTTTGTTAATGATGACTTATTTGCTGCTGGAGCTATAAGCTCACTTTTACCCCA ACACCATTATATCTGTACAATTTTCTCTAAGAAATCCAATGTGAATTGAATCCTTGGTACCTCTTTGTAGGCTGATATTGTGACTGTAATATTGTTCATC TTGTGTATTCTCTGGTTTAGTTTGTGTTATGATACAATCAATAACTAACTACTTTGATTGGATCATAAAAAATAACAATATTACTTATAGGGGCATGGTT GACTGGTTGAGATCTAAAGACATGGTTTCGAGTCCCCGCTTGAATATTGTTAGTTTTATTTGGTTAGCTTCTCCATTAGAATTCTATCTGTTTAACATGT TCACGGCGATTGTAATAAGACAGCCCCTTGAGTTAGATGCAGGTCGCGAGATGGGAGTAAAGTACTAGTGAAGTTTCTTGGTGTTTGGTCCAACAAGATC AGTATTGTAGTGCTATTTTTGCTCTGGTGGTACAAGGACACTCACTGTTAATGGCATTTCTGGACTGAACAGAAGGATCTATGTCGAATATGCCTATTCA TCGATGGTTCTATGGTAATTGGTGTGTGAAAGCTCAATTTTTCATCCTACTGAGATTCCATCTTTTGGGCAACCTAAAGGTTTCACATGTTTATTCATTC ATGTTCCATTGTCTCTATCCTTGTTTACTAAAACAAAACCATTTACATTGTGTTATTCTTTCATAAATAACAATATCCATCATTAAATATGTGAAGTATT TGTACAAATTCTAATGTTAATATTACATATTTGTATCTTTTATTATCAAATTCCTACCAAATAATCCTTAAGAATCTGTAGTCAGTAACAATGATTAGTG GGTCTAATGCCCATTGTTTTCCTCAACTTACCAAAAGCTTGAATTTTCTTTAGCAGCTCCTACAAGCCATTGTAACATGTATGCATACTTTTAAGTAAAA ACTAAAAATAAACAAATGTTCAATCTATGTCCAGATACATAGTACTTGTTTTGGCAACAACAACAAAAAGCCTACCTGTCTTGTACACTTTTGGTTGGAA CTATTATTGGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_40828;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_273668

FPKM

• FPAB: 31.1
• FPNAB: 23.8
• LF1: 8.5
• LF2: 8.5
• LF3: 7.1
• LF4: 7
• UF1: 7.4
• UF2: 8.3
• UF3: 6.5
• UF4: 5.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_273668

• Blastp: Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A from Arabidopsis with 48.48% of identity
• Blastx: Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A from Arabidopsis with 50.78% of identity
• Eggnog: zinc ion binding(ENOG41121N2)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G39720)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419778.1)
• Pfam: zinc-ribbon (PF14369.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;