Ll_transcript_273674

Id TrinityFTRINITY_DN54256_c0_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_273674
SequenceGAGTTTAATATTTATATATCATTAATGTAAAGTTTTTTATATTATTGATATATTATTCACTAACATTTTATTTTTGAAATAAACGAATTTGTTAGACACC AAATTTGTTGAAGCGTGTTGCAGTGATATTGTTTGTTCATCCATTTTTTTTCATTTCTCTCTTAACATCACCATAGAGAAACATCGATCTCCATTTTTCA ACAATTCCATTTTCCTGCGAATTTTCGAAACCCTAGATCCTTCCATTCAATTTTCGCTTTCAACAGTTATCGCTTCCACAATCCAGATCTGAGAGGGTTG AACTTGAATTATGTTTTGAGCTGATTTCGTGAATCTGGGGTCTCTAAATTTGAAAACTTTTCTCCAATGACGAGTGATTCTGGTTCAATTGTTGAAATTT GAGGAATTGGGTCGATTCTATAGTGAAGAAATTTAGAGAATTTAGGTTTTGATTTGGTTAAAGAAGTTTTTGAAGGAGTCATGTTCTATGGTGCAGTGGT TTGGGACCCTTGGCTTATTGTTGGTCAAATTGTTTGTCTTCAATGCTTATACTATATCACTCTGGGAATGTTCTTGTCCTTACTTGTTGGAACTCGAGTT TCTCGAATGAGCCTTGTGTATTTCTTTGATTATGTTACCATCACTACCTCTACCATTACTGGTTGGTGTGTTATTGCTTCATTTCTGTTCAGCTCGCTTG CAGGAGTTGCAGTGTTTTGTAATATAGAGGAGGCACTCAATCCCTTAAATCTTCCTGCTTTTCTATGATTCTATGTAGACACCTAATGCTTTCTCAGTTT ACTTGAGGTAATTGGAAAGATTACGAAAGTCGGTGAGTGTGCATTTATGCAATGAGAAGTGCAAGTAAGATCATTACTGGTTAAAAATACTAGTACCGTG TTGGTAATTTGACATGTAGCTCCTTTCCTTAGCAAGATTATCATATCAAGAACAGAACTGTTTCTTTATTTTAGAAGCATTATGTCGACAAGCTTATAAA TAGCCTTAGTATGTGTTTACCATCTTTCCACTTATGCTATTTGTTGTTGCAGCATCATGTTGATAACCTTATAAATTGGTATTCAGTCTTTTCTGTTTGT TTTCATTGCATTGGTTCTGCTTTTTACGAGCATTCGTAAAGAAACAAAAGCTTAACCTTTGACCGTTTGAAGTTTGAATAGCTGTGCCTTTAATTAGGAG ACTCCATGGGTCTCTTTCTTTGTGTTCTGTGATTTTGTGTAGGAGGAAGGTACTGAGATGAAATTCTTAGCTGAATGACTTTTATGTATTATTGGCTTGT TAACTGAAATTATGATGCTCTAAATTGTACTGACGTCACCGTTGGTTTTATCAGGGCTGTATATATGCTTTATTTGATTGAAAGAGCAAAGAAGTGCTTG GATTTTTCTGCTACTCTCTACATCATTCATCTTTTTATATGCATTGTGTTTGGGGGTTGGCCCTCTTCTATAACATGGTGGATTGTGCAAGGTACTGGAA TTGCAGTGATGGCTTTGCTAGGTGAGTATCTGTGCATCAAGCGTGAACTCCGGGAGATACCGATAACACGATATCGTTCAAATGTTTGATTGGCACAAGT AACATGAGTTTTGAATTCGAGAAAGGAGTTTTGTTGCGGGATGATGATAACTTTTGTTTCTGTACATCGGATGATCTCCAAGATAAAACCGACCGTGTGC GTAATTCTATTATGCCATTGAAGGAATTTCTTTCCTATTCTTTAGTTGCAATATAGAGTTGAACCATAGATAATGAGAGGAGACTAGATATATAACTTTT CTGTAAACTCTGGAAATCTTAATGTATGTTATTCTTATTGTTTCTCTTTTCCCCTATTAGTTTTGGTTAAGGTAATGCCTTTAGTGGGTAGAGGTTCAAT TCTTTTACCTTATGTTTGTTTTGGATTTGTTTACATAAACAGTTTGTATAAATTATTAACATACACCTTACCCTTTACTAATAGTAAAACCATACTATTG TCTCCTTATTATGAAAATGGAGCATGTTTCTCACATAAGATAATGCTCTTCTA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_41115; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_273674

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_273674

Blastp-
BlastxProtein SYS1 homolog from Mus with 48.1% of identity
EggnogSYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae)(ENOG4111H59)
KeggLink to kegg annotations (66460)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019425094.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;