Ll_transcript_273676

Id TrinityFTRINITY_DN54256_c0_g1_i5
Name TranscriptLl_transcript_273676
SequenceTATTAGGTGAAGGACTAAGCATAACCAAAACCAAAACGACGTAGTTCACTGAACTTCATTCACGCTTGTTGCACCTCTCTGATACAATTTGTTCATCTCT CTCTTTTCACGTTCATCTCCATTTTCAACAGTTCGATTTTAAGTCAATTTTCGCTTTCAACAGTTATCGCTTTCAACAATTCAGATCTGAGTGGGTTGAA CTTGATTCGTGTTTTAAGCTGATTTTGAGAAACTGGGGTCTCTAAATTTGAAAACTTTTGTCCAATGACGAGTGATTCGGATTCAATTGTTGAGATTTGA GTTTTTGAAGAAAGTTTTGAAGAATTTGGTTTTGAATTGATTAACGAAATTTGTTAAGGAGTCATGTTCTATGGTGCGGTTGTATGGGACCCTTGGCTTA TTGTTGGTCAAATTGTTTGTCTCCAATGCTTGTACTATATCACTCTGGGAATGTTCTTGTCCTTACTTGTTGGAACTCGAGTTTCTCGAATGAGCCTTGT GTATTTCTTTGACTATGTAACCATCACTGCCTCCACTGTTACTGGTTGGTGTGTTATTGCTTCATTTCTGCTCAGCTCAATTGCAGGATATGGAGATACC TAATGCTTTCTCAATTTACATGAGTGAATGCGAAGGATTGTGAAATTGGATGAGTATGTAATGAGAAGTGCAAGTAAGACCATTAGTGGTAACTAATGCT ATTACTGTGTCAGTAATGTAAGCTGTAGCTCCTTTCCCTAACAAGACTGTCATACCAAGAACAGAGTTGTGTTTGTTTTAGCAGCATTATGTTCACAAGC TTATAAATAGCCTGACTATGTATTTACCACCTTTCCAATTTTGTTCTTTGCTTCTTTTAGGCTTTTAGCAGCATTACGTTTAAAACCTTATAAATTGTTG TTCATTCTTAAATCTGTTTGTTTTCTTTGCGTTGGATTAATTGTGCTTTTTTCGAGCATTTGTAAAGAAATAAAAAGTTAACCTTTGACCCTTTGATTTA GATGTGCCTTTATTTAGGAGATTCCATGTGTGTCTTCCTTTGTGTTCTGTGATTTTGTGCGAGAGCAAGATACTGAGAGAGGCATTCTTAGCTGTACATC TTTTTGTACCTTGGGTTGTTAACTGAAATTATGTAGTAACTCTACCTTGTACTGAGTTACTGACACTACTATTGGTTTAATTCAGGGCTGTATATATGTT TTATTTGATTGAAAGAGCGAATAAGTGCTTGGATTTTTCAGCCACTCTCTACATCATCCATATTTTTATATGCATTGTGTATGGGGGTTGGCCCTCTTCT ATAACATGGTGGGTTGTGAATGGTACTGGAATTGCAGTGATGGCTTTGCTAGCTGAGTATCTATGCATCAAGCGTGAAAGCCGGGAGATACCAATAACAC GATATCGTTCAAGTAAGAACTTATGGTTGTTTGGCTGGCTCCTTTGACACGTGTTTTAAATCTCTGTATCTGTGTTATATTATAAATTGTATTTTCTTTT TTCCTTGTAAGTTTTACTTATTCCAGTAGCCTGAATATATATTTATCTCGTCAAACTAAAGTTTTTTAGGATTTTTTTAATCTCTATATGTTGTGTTGCT ATGCTGACTGTATTTATGCGAAGATCTGGAATATTCTTGCTCAGTGGGTCACGATGCTATTTATGCATTATGTTTTATATGATGTGTCAAATGGCACTAT CGCAGTCGGTTTGTATGTCGCCAAATATCGGTTTGCTATTTTTATGATTTAATATGCTTGAGTTCCTTGCAGATGTTTGATTGGCAGAAGTAACTCGAGT TTTGAATTCAAGAAAGAAGTTGTGTTGCGGGATGATGATAACTTTTGTTTGTATACCTTGGATGATCTCCAAGATAAAATCAATGATGTGCATAGTTCTG TTATGCCATTGAAGGAATTTCCTTTCTATTCTTTAGTTGCAATAGAGAGGTTAAGCATAGATAACAAGGAGACTAGGTACTTGATTTTTCAGGAAATTCT TAATGTCTTAATGTATGTTATTCTCATTATTTCTCTTTTTCCCCTTTTAGTTTTGGTTAAGGTAATGCATTTAGTTGATAGAGCTTCTAATTTGTTTAAC CATTTTGTTTGTTTCGGATGTTTAATATCATGGAAATATATCTTAGTTCTGTGTTATTGCTGATTTACTGTTAATAGGGTTGTTACATCATATAGCAGAA TGAATCTCTAAGGCAGATTTGTGTTTTAACTAATTTATTTTGACACCATAGTTCCTAACCAATTACAAAACTCGTGAAGGTTGCAATATGTATAAAGAAT GTGCATCATATGGTTCACTTTA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_41115; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_273676

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_273676

Blastp-
BlastxProtein SYS1 homolog from Nematostella with 38.46% of identity
EggnogSYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae)(ENOG4111H59)
KeggLink to kegg annotations (NEMVE_v1g229542)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019425098.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;