| Id Trinity | FTRINITY_DN54293_c4_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_273592 |
| Sequence | AAAGAACCCAAAATCTTACCCCGACCTCACGCCAATCTCAAATTTTCTTCCTTTTCTTCCTATGGTAATCGTGGGACGGTTAGGGAGAAGGTTAAAGGAG CCCCTGTTTCTTTTCATGGTGATTTTAGTTCGTTTTACATAGCCAACTTTCCATATGATGTTAGTTCAAAGGACCTTTGGAACCTCTTTCAAAAATGGGG TAGGGTTCGGGATGTCTACATTCCGCGAAAAAAAAATAAGATCAACCAGAGGTTCGCCTTTATTAGATTCGATAGAGTGAAGGATGAAAGAAGTCTTGCT TTGGAATTGGATAAGGTGTGGATTGGGAATTGCAAAATCTTTGCAAAATTCCTTTGTTCAATAGAAATCAGTCTGAAACCTCGGTTAAAAGGGGGTCTCT TCATCTAGGCCGAAGTTGGATAGATTTAAATTTAGAGACTCAAGAAGTTTTGTAGATGCGGTGAAAGGAAAGGATGGTATTGTTGGAGGCTCAGGTTTAA ATTATGTTCACCCATCTTCGGTTAAGGTTTCGGGCTCTTTTTCCTATTCGGCGGAGTAGGCGGATTTGGATTGGCTTCAGAAATGTATGGTCGGGAAAAT GGTGGAGACAGTGGATGTTCGGATGGTGTTTGGGCTTCTAAAAAACGAGGGTTTCCTTACGATTTCTGCACACCCTATCGGAGGGGACCTTGTCCTCTTA TCCCCTTCGGAATGAGAGGATATTAATGTAGTGTTGAAAGATGCTAAAGACTGGATCTCTGCCATTTTCGTTTCGTTTCAACCTTGGAGGAAGGAGACGA GGGTTGGCTTCAGGGATGTTTGGTTGCTCTGTAGGGGGATCCCCCTTCACGCTTGGAACGAAAATTTCTTCGTCCAACTTGCTACAGGTTTCGGTTCCCT 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CTTCTGGTTTGCGGATTAACTTTCACAAGAGCAGTTTCATGGGCATTAACTCTGGTGATAATCTTGTTGAGAGGGCGGTTGGCAAACTTTTCTGCAAAAT TGGTTCCGTGCCGTTTAAATTTTTAGGTATTCCGGTGGGGGCTAACCCGAGGAGAATTTCTACCTGGTCTCCGGTTATTGATGTCTTCAAAAGGAGATTA TCTTCCTGGAATCAGAAGCTCATTTCTTTTTCTGGTAGAGTCACTCTTATTAAGTCTGTTCTTTCGGCCCTTCCTATTTATTACTTCTCTTTCTTTAAAG CTCCGGTCTCTGTTATTGCTGAGTTGAATCGTATTCAGAGGAGGTTTCTTTGGGGTAGAGGAGAGGAGAGTAAAGGTATTCATTGGGTTAGTTGGGATAA AGTGTGTCGTTCAAAGGGAGAGGGTGGTTTGGGGATTAAAAATCTGAGTCTGTTTAACTTGTCTTTGTTAGGTAAATGGAGGTGACGTCTTTTGATTGAG AAGAATAATCTTTGGGTGAGAGTTTTACTTTCTAGATATGGGTCTAGACTAGGTCGGGGTGTGGATGTTTTTCTATCTTCTGAGTGCTTTCTGAGAGGGT CTATTTGGTGGAGAGACATGGGGAGTTTGTGCAGTGTAGTTAATGGGGTTTCTAAGGGCTGGTTCTGTGAGAATGTTCGTAGAAAGGTTGGTGTTGGCAA TTCTGTTAGGTTCTGGAGTGAGTTGTGGGTGGGTGAGGTTTGCCTTAAATACAGGTTTCCGAGATTGTTTCAGGTGGCTTCTGACAAAGATGCTTTCGTG TGTTCCATGGGTTTATGGAGGTCTGGTGCTTGGTGCTGGTCTTGCTCTTGGAGGAGATTGCTTTTTGACTGGGAGAAACAAGAAGAATTAGATCTTCTCT TGTGCTTGCAGAATGCTATACTGGATCCTCATCGCGAGGATGGTTGGCTTTGGTGTCTTGCTAAGGATGGTATTTATTCGGTAAAAAATGCTTACACTTT CTTACTTTCAGAGGTATCCAACACTGATAGTGTCTTCTTCAATCGTTTGTGGAGCTGTAATGTCCTGTCGAAGTTCAAATGTTTAGCTTGGAGAATTGCT TTGGATGGCTTG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_41383; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_273592
| Blastp | LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein from Homo with 27.27% of identity |
|---|---|
| Blastx | LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein from Homo with 25.85% of identity |
| Eggnog | NA(ENOG410Y9TZ) |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418409.1) |
| Pfam | Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF00078.26) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |