| Id Trinity | FTRINITY_DN54293_c4_g2_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_273586 |
| Sequence | CTTGTACGTGAGGTTAAGAAGCTTGTGCATGAAGAGTGTAATGTGGTTTCTTCTTTGGTGCAAGGGGGTGTGGGCCAAGTGGATTTTTTAAATCCATCTA GTGTTGACGGGGTGCTACCTCCACGTCAAAATCATGCAGCTACCTTGGTTGGGGATAATTCTTTTGTGCTTTGTGATACTTTGGATTCTAATTCTATTGT CCCTTTCATTGGGTCCTCGGATATTCCTAAGAAAGGAAAAGTGCCTAAGCGTTCGAAGAAGGAGAAACAGAAACAAGTTTTGATTGAGTGGAATAATTTT TGTATTGACCTTGGGGATGTTCCGGAGATTTGTAATAATGATCCAGGTGGTTGTATTCCAGGTTCTGGTTCTCTTGCTGTTTAGGTAGGCAATGATGATT CGTTCAATCCTATTAATTGTGGATCTTCCGAGAGTCTATCGGGGTCCAGTAGCAAAGGAGTGAATGTCGATGTGTTTGAGGAAGCTAAGGAAATTTGGAA TATAGGTAAGAAGATTGGCTTACGCGGGAAAGGAAATGATGAAGAAATTATCTCTCGTCTGGTTGACATGGAAAATCGTGATAAAGCTCAATTTGTTGAA CAAAGAAGGAGATCATTAACGGTTGATGATAGTACTTTCCATTAATATTCGTGGTTTGGGAGGGCGGTTGAAGAAGAAGGAGATAAGGGATCTTGTTCGT GTGAATGATCCTGATTTTGTTTGCATCCAAGAGACTAAGGTTCAAGATGTGGGTCAGGCTCTCTGTGCGAACCTGTGGGGCAGTGATGATGTTGGTTGGG CGTTTGTCCTAGTGGAGGAGTTCTCATGGGGTATTCTGAGCCTTTGGAAAAAATCTTTGTTCTTATGTGAAGATATTACATTGGGTGTTAACTTCGTGGT GGTCAAAGGGATATGGTCATTGAATAATGTCTCTTGTAACATTATGAATGTGTACAGTCCTTGTGACTTAGCTCGGAAACAGTTGTTTTGGGAGGAAGCT AAGAGGGTGTGGGCAGTTCATTGTTATGATTTATGGTGTGTAGTGGGTGACTTCAACGCTGTCTTGCATTTGAATGAGAAAAAAGATTTGGTTTCTTCTA CTTGTAGTAGAGATATAGTGGAATTTACTCGATTTGTTGAGCAGTTGAATCTAGTGGATCTTCCTCTTGTAGGATCAAAATTCAGTTGGTTTCTTTCTAA CGGTTCGGCAATGAGTAGGCTTGATAGGTTCCTTGTTAACGACAAATGGCTAGCCATTTGGGGTCGGTTGGTCCAGAAGGCTCTGAAGAGATCTTTCTCT GATCATTGTCCCATCCTCCTTAAGTCTGATGCTTCTGATTGGGGCCCTTCTCCCTTTAGAACAAATAATTTCTGGTTTTCTGTTGCAGGTTTCTCTAATT TTGTTGAAGAAGAGTGGAAAAAGATGGATTTTGTTGGTAGGGGTTCTTATGTGCTCAAAGAGAAACTAAAAAGTCTTAAGAGCTCTCTTAAGATTTGGAA CTCTGGCCATTATGGGATTTTGGATAAGAAGATTGTAAACCAAGTGTCCATTATTAATGATATTGATGAAAAAGGTTGTGATGGTTTTCTCTCTGAAAGT GATATCGCTGCTAGGAGTGTTGCAACATCTGATTTGTGGAGGTTTTCTTCTCATAAAGATAATATGTTGCGTAAAAAATCGAGACAAAGATGGTTGCGGG ATGGTGACTCCAACACCAAGTTCTTTCATTCTTCTATTAATAGGAGGAGGAGATATAATGAAGTTCATGGCTTGAACATTGATGATGAGTGGGTGGAAGA TCCGGTCCGAGTAAAAACTCACATCAGGTCTTACTTCAAAGACAGGTTTTCTGAAGATCATTGGAATAGGCCTTCTCTCGATGGGATTGAGTTCAAACGC TTATATTATGTTGATAACTCTTTCCTTACAGCGAGGTTTGATGAATCTGAGGTTAAGGAGGCAGTTTGGAGTTGTGATGGCGATAAGAGTCCAGGTCCTG ATGGTTTCAACTTTACCTTTATCAAGAAATTCTGGGATTGCGTTAAAGTTGATATATTGGCTATGGTGTCAGATTTCTTTTGCTATGGTAATGTTGCTAG GGGTTGCAACGCTTCTTTCATTATTCTCATTCCGAAAAATGGTAGTCCCCAAAACCTCTCAGATTATAGGCCTATTTCGTTGGTGGGATGCATTCACAAG ATTATCTCGAAGCTTCTCGCTAGTCAGCTAAAGAAGGTTATCCACTTAGTGATCTCTGATTGCCAATCGACCTTCATTAAGGTAGGTTCATTTTGGATGG AGTCCTAATTGCTAATGAGGTTATCGATCAAGCTCAGAATAGTAAGGAGGGTGATTGCTTCATCTTTAAGGTGGATTTTGAAAAAGCGTACGACTCGGTT AATTGGTGCTTTTTGTTGTATATGATGGAAAGAATGGGATTTTGCTTCAAATGGAGAAACTAGATTAGAGTTGTCTTCAATCCAACTTGGTGCCTGTTCT AGTTAATGGAAGCCCTACTTTGGAGTTTGCCATGAATCGTGGTCTAAGACAGGGTGATCCGATGGCTCCCTTCTTGTTTCTTATTGTGGCCGAGGGTCTA GCAGGCATAATGGGTTCGGCGGTGGATAAGAATATCTTCAAAGGGTATCCGGTTGGTAGGGATAAGGTTAATGTTACTCATCTTCAATACGCAGATGATA CTCTGTTAATTGGGGAAAACTCAGTTGATAATGTCTTGGCCCTTAAGTGCATTCTGAAATGTTTTGAGTTATCGTCCGGGTTGAGGATTAATTTCCACAA GAGCAAGTTGATTGGTATTAAATCAAGTGAGGACTTTGTTCAGATGGCGGTGAATAAGCTTATTTGTGGAATTGGTTATGTTCCATTTTAGTTCCTTGGT ATCCCGATTGGCGCCAATCCTAGAAGGTCATAGACGTGGAATCCGGTTTTTGAATCTTTCAAGAAGAAACTCTCTTTTTGGCAACACAAACTTATTTCCT TTGGTGGCAGAATTACTCTTCTTAAGTTGGTGCTCTCTTCTCTTCCTATTTATTATTTCTCTTTCTTTAAAGCTCTGGCTTCTGTGATAAAGACTCTTGA GAGTATTCAGAGGAGATTTCTTTGGGGTAGAGGTGAGGAGAGTAAGGGTATCCATTGGGTTAAGTGGGAGTCTGTGTGAAG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_41384; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_273586
| Blastp | LINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 21.89% of identity |
|---|---|
| Blastx | LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein from Homo with 27.98% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019465331.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |