| Id Trinity | FTRINITY_DN54348_c3_g1_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_197506 |
| Sequence | CTGGCACATTATTTAACAATTGCATCAGAGAATTACACTTCACTTGATTCTTTTCTTCAAGAAAAGTATGACATCATAAATCCTTGACTTTAATCCTTAT TGCCCTCTCCACATTAAGGGGTATATGATTGCTGATATTACAAAAAAATTACCAAAGAAATTTTGCAGAATTTGGATGGGATGCAAGGGTAGCACTTAAC ATCTATGGTGCTTTCAGTAGCAAGGAGTACATAAAAGCTCAGAAGATTAGGTACGTAGTACGTGGTATGTTAACCTGTCAAATACTGATATACTAGAGGT ATATTAAGTAGGGCTCCTGTAACTCTCTCCACGGTCGTCTCTAGTGCTACTTCTTGAAGGTTTCAATCAACATTAGTTTCACCATAAAAGAAAGAACCAA GGATAACAAAAATTTTGGTTTGTTGTAACTCATTCATGTAGGTGAAAATATATTATCAAATATTCTTCTTTTCTAAGTAAAAATCTGGTTCGTTCCTTGA AGGGAATCAGTTCATAAAAGAACCATGAATCAATACAATGATAGGGTCTATTTGCCTTGGGAATTACTTTTCATGTAATAGGATCACAGTTATTGCCTTT TTCCATTCTTTTTCTGTTTTTGGCAAGTGACAGTTAAAACCGTTAGCTATAAATAGCAAGTTTTAATTGTTTTAGTTTTAATCCAATTTTTCAAGAATCA ACACTTCAATATTGTACTCTCTTCTTCCCCATTGAATAATATACACTCGGGATCCTCCATTATCAAAGGAATCCCCTGAATTTCATCTTGCAATTCTTCG AATTTCACCTAATTCCTGGAATTCTTATCCTTCTCTTTCTACTTCAATTTCTCTTCTTCTCAATTCTACTTCTTTCATATCAATTGGTATCAGATTGGGT 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TCCATTCTTTTTCTGTTTTTGGCAAGTGACAGTTAAAACCGTTAGCTATAAATAGCAAGTTTTAATTGTTTTAGTTTTAATCCAATTTTTCAAGAATCAA CACTTCAATATTGTACTCTCTTCTTCCCC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_41850; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_197506
| Blastp | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 from Sophophora with 40% of identity |
|---|---|
| Blastx | Transposon Tf2-6 polyprotein from Schizosaccharomyces with 33.33% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014490494.1) |
| Pfam | Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF00078.26) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |