Ll_transcript_196529

• Id Trinity: FTRINITY_DN54365_c7_g2_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_196529
• Sequence: CTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTGGGGGTGATTCACCCAATTCCATCTCCTC CTATTAACCGCAACGTGGCTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGTCTTCAAGGAGAAGGAACAAAGTTAGCAG TGAAGACACCTTGCGTGGCGTGTGGCCACAGGTGCCAACGAGCTTCTCTTTGTTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATTGAGGACTGGATTATCGGGTTGCTTCAGCCTGTTATTGATGACTTGAAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTTGAGATTAAGCAGTTCTCATTGGGGGATGAACCATTGTCAGTTAGGAATGTCGAGCGCAGAACTTCTCGCCGTGTGAACGATCTGCA GTACCAGATAGGAGTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGCTTTCTCTAAAATTTGGCATTATTCCAATTGTGGTGCCTGTTGGTGTTCGA GATTTTGACATTGATGGCGAGCTTTGGGTAAAATTGCGATTAATACCAACACAACCCTGGGTGGGAGCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAAAA TCAAGTTTGAATTGTCTCCATTCCGTCTGTTCAATTTAATGGCAATTCCAGTACTCTCAATGTTTTTGACAAGACTTCTCACTGAAGATTTACCCAGACT ATTTGTACGCCCAAAGAAAATTGTTTTGGATTTCCAAAAGGGAAAAGCAGTTGGTCCTGTTGCAAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGAAAC AAAGATTCTGTCGGTGAACTATCTGTTACCCTTGTGGATGCTCGAAAGCTTTCTTATCTCTTCTATGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTCAGTCTTG GAAATCAAACTATACGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTCCTGGAATGCCAATTTGGAACCAAGTATTGTTTTTGGATTTCCTGAT TAATATTTGTTTTAAGCTCGTGCGATTTCTATATTTTTCATCTTTAACTTTTTTTTTGTTCTAAACTGTACAGGATTTTCATATGCTTGTCGCCAACCCT AAAAAGCAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCTCTGGGATTTGCAGATTTGACTATTGGTACAGGGGAGGTGTGTATTATATGCCATACCATAATTT TTGTGACTTGTTATTTCACATTTGCTCCACTTAATAGTTTTGTACTTCTTTCATAGATTCTTTTAGCTATTGGATTTTCTTTGAGGTCTTGATACTTAGC TTCTAGTCTACCCTACAGTCGATACTGTTTCATGAATGCTTGTCTAACTAAGAAGTGCTTAGCAGATTCTCCCTCCTTTCCTTGTGGTCCACTTTGAGTT ACCTTTCTTTTATTCTTTTTTTCTGATTATTATAAATTATGTTGGATACTAGCTCTTGATCAGCGGTGTTTTTCTTGTGTTGATGGTGAACTGAATATTT TGTTGAGGTGGGCTGGAATTGGTTGATGTTTGTGAGTTGATCTGTAATAAGCAAAATAAACCTCATATGATGTGGTGATTGTGGATTGGTGAGATTACTT TTTAGAAGGGGTCGGTGATTATTTTCTTAGGTTAAATGCTTGAAAGGCTGTTTGTGGATGCACCATATTTTATGCCACTTATTTTGACATCTCCGATGTA TAGGTTCATTGAGTCTTTTGGAGTATTTCAGGAATGGGTGATTATCTTGGAGTGTTCTTGTAATTTTGCGATACCTCTCGCAAACAACTGAAATGTATAA AAATAAATGAAAAACCCAATGTGTGGACATGGGAAAAAACTGGAATCAAAGGAGTGAAATTGACATCTCTATGTCATCTAACTACACTTTAGCAGATAGT ATATCCACCATTTTCACTGCACCACACCATGAGGCTATGATAAAGTTCCCGTAAAATAATGCTTTAATATGCCAGGGTGCCACGCCTTTCCAACATTCAG AGAAAATGATATTTTTTCTTAATGCTGTGAAATTATTTCTTTTTATGTCATTAGAGTACTTTCTTGAAAAGTAAGCTATATCTTTTCTATCAGTTGCAAC AGTAAAGTTCGGCATGTAGTATAATGTAATATAAAAGTTATTTTAAGAAATAACAATTTCTTTTGTTATTTAAGATTGTGTAGAATCTTCAGTTGCCATG TTTGATTCATATGTTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATATAATTTCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTTAATT GATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAACAGACAGGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGGGTTC TTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGATGAAGAAGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTCAGAT GACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATGAAGGAGATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTATTAG CAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAACTGGGTCTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAGTATC AAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAACTCTGAAGGTTTTGTAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTACTAGT ATATCACTATTAATTGCAATCAACATTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATCCTTGAGATGAGTTGGCAGTAGATAATAATCAATTCTACATTGGGAGTTTAT TAATATTCTGGTGATGGAGGAAAGCATATAGCGGCGCACATGATTTTTGGCTTTGTTTTATGTGAGCCACAAATTTGAAAAATTCAGCTTAAATACCTTG TTTATATGTTAGAGTTTTGGACCCACCAAAAATAAAATAGAATCACAGATTTCTTGTTTCTCTCGCCCGAATCTGATTGATGTAAAACATGACAGAGAAT TTCTTGCATAATATGAAATATTAATTGCATTGCACCAATCACATCATTGTTGATAGTCTATGGTTGTTGTTAGTTAATAACCACTTCTTTTTCTTCTATG ATTGTCCCATGTTAAGGATACTTCACAAAACAATTTTTTATGTGAAAAATTAATGTATCACCTCCCAGGATGTGAAATTTGATGATGATGTTTGGATGGT AAAAACTGACATAATTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_41964;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_196529

FPKM

• FPAB: 1
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0
• LF2: 0
• LF3: 0
• LF4: 0
• UF1: 0
• UF2: 0.3
• UF3: 0
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_196529

• Blastp: Uncharacterized protein PYUK71.03c from Schizosaccharomyces with 22.98% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein PYUK71.03c from Schizosaccharomyces with 22.01% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (SPAPYUK71.03c)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019450948.1)
• Pfam: C2 domain (PF00168.29)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;