Id Trinity | FTRINITY_DN54365_c7_g2_i23 |
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Name Transcript | Ll_transcript_196537 |
Sequence | CTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTGGGGGTGATTCACCCAATTCCATCTCCTC CTATTAACCGCAACGTGGCTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGTCTTCAAGGAGAAGGAACAAAGTTAGCAG TGAAGACACCTTGCGTGGCGTGTGGCCACAGGTGCCAACGAGCTTCTCTTTGTTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATTGAGGACTGGATTATCGGGTTGCTTCAGCCTGTTATTGATGACTTGAAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTTGAGATTAAGCAGTTCTCATTGGGGGATGAACCATTGTCAGTTAGGAATGTCGAGCGCAGAACTTCTCGCCGTGTGAACGATCTGCA GTACCAGATAGGAGTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGCTTTCTCTAAAATTTGGCATTATTCCAATTGTGGTGCCTGTTGGTGTTCGA GATTTTGACATTGATGGCGAGCTTTGGGTAAAATTGCGATTAATACCAACACAACCCTGGGTGGGAGCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAAAA TCAAGTTTGAATTGTCTCCATTCCGTCTGTTCAATTTAATGGCAATTCCAGTACTCTCAATGTTTTTGACAAGACTTCTCACTGAAGATTTACCCAGACT ATTTGTACGCCCAAAGAAAATTGTTTTGGATTTCCAAAAGGGAAAAGCAGTTGGTCCTGTTGCAAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGAAAC AAAGATTCTGTCGGTGAACTATCTGTTACCCTTGTGGATGCTCGAAAGCTTTCTTATCTCTTCTATGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTCAGTCTTG GAAATCAAACTATACGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTCCTGGAATGCCAATTTGGAACCAAGATTTTCATATGCTTGTCGCCAA CCCTAAAAAGCAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCTCTGGGATTTGCAGATTTGACTATTGGTACAGGGGAGGTGTGTATTATATGCCATACCATA ATTTTTGTGACTTGTTATTTCACATTTGCTCCACTTAATAGTTTTGTACTTCTTTCATAGATTCTTTTAGCTATTGGATTTTCTTTGAGGTCTTGATACT TAGCTTCTAGTCTACCCTACAGTCGATACTGTTTCATGAATGCTTGTCTAACTAAGAAGTGCTTAGCAGATTCTCCCTCCTTTCCTTGTGGTCCACTTTG AGTTACCTTTCTTTTATTCTTTTTTTCTGATTATTATAAATTATGTTGGATACTAGCTCTTGATCAGCGGTGTTTTTCTTGTGTTGATGGTGAACTGAAT ATTTTGTTGAGGTGGGCTGGAATTGGTTGATGTTTGTGAGTTGATCTGTAATAAGCAAAATAAACCTCATATGATGTGGTGATTGTGGATTGGTGAGATT ACTTTTTAGAAGGGGTCGGTGATTATTTTCTTAGGTTAAATGCTTGAAAGGCTGTTTGTGGATGCACCATATTTTATGCCACTTATTTTGACATCTCCGA TGTATAGGTTCATTGAGTCTTTTGGAGTATTTCAGGAATGGGTGATTATCTTGGAGTGTTCTTGTAATTTTGCGATACCTCTCGCAAACAACTGAAATGT ATAAAAATAAATGAAAAACCCAATGTGTGGACATGGGAAAAAACTGGAATCAAAGGAGTGAAATTGACATCTCTATGTCATCTAACTACACTTTAGCAGA TAGTATATCCACCATTTTCACTGCACCACACCATGAGGCTATGATAAAGTTCCCGTAAAATAATGCTTTAATATGCCAGGGTGCCACGCCTTTCCAACAT TCAGAGAAAATGATATTTTTTCTTAATGCTGTGAAATTATTTCTTTTTATGTCATTAGAGTACTTTCTTGAAAAGTAAGCTATATCTTTTCTATCAGTTG CAACAGTAAAGTTCGGCATGTAGTATAATGTAATATAAAAGTTATTTTAAGAAATAACAATTTCTTTTGTTATTTAAGATTGTGTAGAATCTTCAGTTGC CATGTTTGATTCATATGTTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATATAATTTCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTT AATTGATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAACAGACAGGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGG GTTCTTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGATGAAGAAGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTC AGATGACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATGAAGGAGATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTA TTAGCAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAACTGGGTCTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAG TATCAAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAACTCTGAAGGTTTTGTAGGTACAGTGTTTTCTTTTACAATGGCTCTATT TTCCCTTTCCTTCTTCTTTTACGGGTATAATCCCTTAACGTAACCTAGAGGGGTCACACGCTCAAATCTTGAAAACAGTTGTTCCACATGCGGAATAAGA TTGCGACAGACCCCACTAGGGGTCCCTTGTGGGATGATATCTTATTTTTCCTTGTATAATATGGAGATGTATTATCTAAACTCCAAAGTTATATCTTATT TGTCTGTGTTGATGCTGACAAATAAAAGTTGTAACTGCAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTACTAGTATATCACTATTAATTGCAATCAACA TTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATCCTTGAGATGGTATTGTGCTGCTTGCATTCCAAATTTTGGTTCTGCTCAAGTAATTGATCAATGAAATGAAGTCTGT TTTTCTAGTTATAAACTCTGACATAATAATGATAAACCTTTTCCCATGAGAAAAATCATCTGTTTGCATTGTATGGTTATACAATTGGGTAGTCATTTTT GTATGATCATTTTATAAATATGCTAATGCCAATGTTTTTATTCTTTGGCAGAGTTGGCAGTAGATAATAATCAATTCTACATTGGGAGTTTATTAATATT CTGGTGATGGAGGAAAGCATATAGCGGCGCACATGATTTTTGGCTTTGTTTTATGTGAGCCACAAATTTGAAAAATTCAGCTTAAATACCTTGTTTATAT GTTAGAGTTTTGGACCCACCAAAAATAAAATAGAATCACAGATTTCTTGTTTCTCTCGCCCGAATCTGATTGATGTAAAACATGACAGAGAATTTCTTGC ATAATATGAAATATTAATTGCATTGCACCAATCACATCATTGTTGATAGTCTATGGTTGTTGTTAGTTAATAACCACTTCTTTTTCTTCTATGATTGTCC CATGTTAAGGATACTTCACAAAACAATTTTTTATGTGAAAAATTAATGTATCACCTCCCAGGATGTGAAATTTGATGATGATGTTTGGATGGTAAAAACT GACATAATTTâBLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_41964; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_196537
Blastp | Synaptotagmin-3 from Arabidopsis with 24.65% of identity |
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Blastx | Synaptotagmin-3 from Arabidopsis with 24.65% of identity |
Eggnog | Domain-Containing protein(COG5038) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G04220) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450948.1) |
Pfam | C2 domain (PF00168.29) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |