Ll_transcript_196539

Id TrinityFTRINITY_DN54365_c7_g2_i25
Name TranscriptLl_transcript_196539
SequenceCTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTGGGGGTGATTCACCCAATTCCATCTCCTC CTATTAACCGCAACGTGGCTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGTCTTCAAGGAGAAGGAACAAAGTTAGCAG TGAAGACACCTTGCGTGGCGTGTGGCCACAGGTGCCAACGAGCTTCTCTTTGTTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATTGAGGACTGGATTATCGGGTTGCTTCAGCCTGTTATTGATGACTTGAAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTTGAGATTAAGCAGTTCTCATTGGGGGATGAACCATTGTCAGTTAGGAATGTCGAGCGCAGAACTTCTCGCCGTGTGAACGATCTGCA GTACCAGATAGGAGTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGCTTTCTCTAAAATTTGGCATTATTCCAATTGTGGTGCCTGTTGGTGTTCGA GATTTTGACATTGATGGCGAGCTTTGGGTAAAATTGCGATTAATACCAACACAACCCTGGGTGGGAGCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAAAA TCAAGTTTGAATTGTCTCCATTCCGTCTGTTCAATTTAATGGCAATTCCAGTACTCTCAATGTTTTTGACAAGACTTCTCACTGAAGATTTACCCAGACT ATTTGTACGCCCAAAGAAAATTGTTTTGGATTTCCAAAAGGGAAAAGCAGTTGGTCCTGTTGCAAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGAAAC AAAGATTCTGTCGGTGAACTATCTGTTACCCTTGTGGATGCTCGAAAGCTTTCTTATCTCTTCTATGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTCAGTCTTG GAAATCAAACTATACGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTCCTGGAATGCCAATTTGGAACCAAGATTTTCATATGCTTGTCGCCAA CCCTAAAAAGCAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCTCTGGGATTTGCAGATTTGACTATTGGTACAGGGGAGGTGTGTATTATATGCCATACCATA ATTTTTGTGACTTGTTATTTCACATTTGCTCCACTTAATAGTTTTGTACTTCTTTCATAGATTCTTTTAGCTATTGGATTTTCTTTGAGGTCTTGATACT TAGCTTCTAGTCTACCCTACAGTCGATACTGTTTCATGAATGCTTGTCTAACTAAGAAGTGCTTAGCAGATTCTCCCTCCTTTCCTTGTGGTCCACTTTG AGTTACCTTTCTTTTATTCTTTTTTTCTGATTATTATAAATTATGTTGGATACTAGCTCTTGATCAGCGGTGTTTTTCTTGTGTTGATGGTGAACTGAAT ATTTTGTTGAGGTGGGCTGGAATTGGTTGATGTTTGTGAGTTGATCTGTAATAAGCAAAATAAACCTCATATGATGTGGTGATTGTGGATTGGTGAGATT ACTTTTTAGAAGGGGTCGGTGATTATTTTCTTAGGTTAAATGCTTGAAAGGCTGTTTGTGGATGCACCATATTTTATGCCACTTATTTTGACATCTCCGA TGTATAGGTTCATTGAGTCTTTTGGAGTATTTCAGGAATGGGTGATTATCTTGGAGTGTTCTTGTAATTTTGCGATACCTCTCGCAAACAACTGAAATGT ATAAAAATAAATGAAAAACCCAATGTGTGGACATGGGAAAAAACTGGAATCAAAGGAGTGAAATTGACATCTCTATGTCATCTAACTACACTTTAGCAGA TAGTATATCCACCATTTTCACTGCACCACACCATGAGGCTATGATAAAGTTCCCGTAAAATAATGCTTTAATATGCCAGGGTGCCACGCCTTTCCAACAT TCAGAGAAAATGATATTTTTTCTTAATGCTGTGAAATTATTTCTTTTTATGTCATTAGAGTACTTTCTTGAAAAGTAAGCTATATCTTTTCTATCAGTTG CAACAGTAAAGTTCGGCATGTAGTATAATGTAATATAAAAGTTATTTTAAGAAATAACAATTTCTTTTGTTATTTAAGATTGTGTAGAATCTTCAGTTGC CATGTTTGATTCATATGTTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATATAATTTCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTT AATTGATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAACAGACAGGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGG GTTCTTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGATGAAGAAGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTC AGATGACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATGAAGGAGATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTA TTAGCAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAACTGGGTCTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAG TATCAAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAACTCTGAAGGTTTTGTAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTAC TAGTATATCACTATTAATTGCAATCAACATTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATCCTTGAGATGAGTTGGCAGTAGATAATAATCAATTCTACATTGGGAGT TTATTAATATTCTGGTGATGGAGGAAAGCATATAGCGGCGCACATGATTTTTGGCTTTGTTTTATGTGAGCCACAAATTTGAAAAATTCAGCTTAAATAC CTTGTTTATATGTTAGAGTTTTGGACCCACCAAAAATAAAATAGAATCACAGATTTCTTGTTTCTCTCGCCCGAATCTGATTGATGTAAAACATGACAGA GAATTTCTTGCATAATATGAAATATTAATTGCATTGCACCAATCACATCATTGTTGATAGTCTATGGTTGTTGTTAGTTAATAACCACTTCTTTTTCTTC TATGATTGTCCCATGTTAAGGATACTTCACAAAACAATTTTTTATGTGAAAAATTAATGTATCACCTCCCAGGATGTGAAATTTGATGATGATGTTTGGA TGGTAAAAACTGACATAATTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_41964; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_196539

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_196539

BlastpSynaptotagmin-3 from Arabidopsis with 24.65% of identity
BlastxSynaptotagmin-3 from Arabidopsis with 24.65% of identity
EggnogDomain-Containing protein(COG5038)
KeggLink to kegg annotations (AT5G04220)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019450948.1)
PfamC2 domain (PF00168.29)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;