Id Trinity | FTRINITY_DN54365_c7_g2_i27 |
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Name Transcript | Ll_transcript_196542 |
Sequence | CTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTGGGGGTGATTCACCCAATTCCATCTCCTC CTATTAACCGCAACGTGGCTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGTCTTCAAGGAGAAGGAACAAAGTTAGCAG TGAAGACACCTTGCGTGGCGTGTGGCCACAGGTGCCAACGAGCTTCTCTTTGTTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATTGAGGACTGGATTATCGGGTTGCTTCAGCCTGTTATTGATGACTTGAAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTTGAGATTAAGCAGTTCTCATTGGGGGATGAACCATTGTCAGTTAGGAATGTCGAGCGCAGAACTTCTCGCCGTGTGAACGATCTGCA GTACCAGATAGGAGTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGCTTTCTCTAAAATTTGGCATTATTCCAATTGTGGTGCCTGTTGGTGTTCGA GATTTTGACATTGATGGCGAGCTTTGGGTAAAATTGCGATTAATACCAACACAACCCTGGGTGGGAGCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAAAA TCAAGTTTGAATTGTCTCCATTCCGTCTGTTCAATTTAATGGCAATTCCAGTACTCTCAATGTTTTTGACAAGACTTCTCACTGAAGATTTACCCAGACT ATTTGTACGCCCAAAGAAAATTGTTTTGGATTTCCAAAAGGGAAAAGCAGTTGGTCCTGTTGCAAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGAAAC AAAGATTCTGTCGGTGAACTATCTGTTACCCTTGTGGATGCTCGAAAGCTTTCTTATCTCTTCTATGGTAAAACTCTACTATGTTGTATTTGCTTTTAAT TAAATTGTTGCATTTTTCAATATCCAGCCTTGATTTGTCCATTCCTTCCCCTTAATTGGATTTTGATTTTCAAGCTGTCCAGTAATTATCTTCTTATATT TTTTGGCTATGCTCTGAGACTTTTTGTTTGATGTATAATAAACATTCTACAGTTTGAAATACTCTTATAACCCCCAGATGTTAGATGAGAATTGTATTTA TGTCCCCTGAATTGGAGTTTGATAAATACTATTACATGTTAAGTTAACTTATCTGGTATAAGGGGATAGACTCAGATTATGTATTGAACTATTCTGATTT GAGTATTTAGTGAAATATTACCATCTGCAGACACAAAAATGTGTCTACGTAACTACAAAAGTAGATTTCGACTATGTGTTCCATATTGTTCTATATGTTA TTTCTTTTCTCACTGGTTTTTGTTTCAACAAAAAAATGTTTTGAAATATAGTGCGAAATATATACTTGTTCTATTGTCTTCTAGAATAATTTTTTGTTTT GTTGTTTTGCTAGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTCAGTCTTGGAAATCAAACTATACGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTC CTGGAATGCCAATTTGGAACCAAGATTTTCATATGCTTGTCGCCAACCCTAAAAAGCAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCTCTGGGATTTGCAGA TTTGACTATTGGTACAGGGGAGGTGTGTATTATATGCCATACCATAATTTTTGTGACTTGTTATTTCACATTTGCTCCACTTAATAGTTTTGTACTTCTT TCATAGATTCTTTTAGCTATTGGATTTTCTTTGAGGTCTTGATACTTAGCTTCTAGTCTACCCTACAGTCGATACTGTTTCATGAATGCTTGTCTAACTA AGAAGTGCTTAGCAGATTCTCCCTCCTTTCCTTGTGGTCCACTTTGAGTTACCTTTCTTTTATTCTTTTTTTCTGATTATTATAAATTATGTTGGATACT AGCTCTTGATCAGCGGTGTTTTTCTTGTGTTGATGGTGAACTGAATATTTTGTTGAGGTGGGCTGGAATTGGTTGATGTTTGTGAGTTGATCTGTAATAA GCAAAATAAACCTCATATGATGTGGTGATTGTGGATTGGTGAGATTACTTTTTAGAAGGGGTCGGTGATTATTTTCTTAGGTTAAATGCTTGAAAGGCTG TTTGTGGATGCACCATATTTTATGCCACTTATTTTGACATCTCCGATGTATAGGTTCATTGAGTCTTTTGGAGTATTTCAGGAATGGGTGATTATCTTGG AGTGTTCTTGTAATTTTGCGATACCTCTCGCAAACAACTGAAATGTATAAAAATAAATGAAAAACCCAATGTGTGGACATGGGAAAAAACTGGAATCAAA GGAGTGAAATTGACATCTCTATGTCATCTAACTACACTTTAGCAGATAGTATATCCACCATTTTCACTGCACCACACCATGAGGCTATGATAAAGTTCCC GTAAAATAATGCTTTAATATGCCAGGGTGCCACGCCTTTCCAACATTCAGAGAAAATGATATTTTTTCTTAATGCTGTGAAATTATTTCTTTTTATGTCA TTAGAGTACTTTCTTGAAAAGTAAGCTATATCTTTTCTATCAGTTGCAACAGTAAAGTTCGGCATGTAGTATAATGTAATATAAAAGTTATTTTAAGAAA TAACAATTTCTTTTGTTATTTAAGATTGTGTAGAATCTTCAGTTGCCATGTTTGATTCATATGTTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATAT AATTTCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTTAATTGATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAACA GACAGGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGGGTTCTTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGATG AAGAAGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTCAGATGACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATGA AGGAGATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTATTAGCAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAACT GGGTCTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAGTATCAAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAACT CTGAAGGTTTTGTAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTACTAGTATATCACTATTAATTGCAATCAACATTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATCC TTGAGATGGGTTTGTTCTTTATATTCTGCTGATGGAGGATAGCATCTACCTGCTGCACCTGATTTTTTGGCATTTTTCATGTGAGCCACAAAATTTAAAA AGAGAACAAAAAAAAATAATAGATGAGTTTTATAAATTGTCATCCATTCACTGTTTATATGTAATTATTATTATAAAATAATGTATCTCCTCGTACCAGG ATATAATTTATCTCCTCTATTCAATAAAAGTATAACAAATGTACTATTTTCAAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_41964; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_196542
Blastp | Uncharacterized protein PYUK71.03c from Schizosaccharomyces with 23.17% of identity |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (SPAPYUK71.03c) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450948.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |