| Id Trinity | FTRINITY_DN54365_c7_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_196514 |
| Sequence | CTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTGGGGGTGATTCACCCAATTCCATCTCCTC CTATTAACCGCAACGTGGCTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGTCTTCAAGGAGAAGGAACAAAGTTAGCAG TGAAGACACCTTGCGTGGCGTGTGGCCACAGGTGCCAACGAGCTTCTCTTTGTTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATTGAGGACTGGATTATCGGGTTGCTTCAGCCTGTTATTGATGACTTGAAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTTGAGATTAAGCAGTTCTCATTGGGGGATGAACCATTGTCAGTTAGGAATGTCGAGCGCAGAACTTCTCGCCGTGTGAACGATCTGCA GTACCAGATAGGAGTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGCTTTCTCTAAAATTTGGCATTATTCCAATTGTGGTGCCTGTTGGTGTTCGA GATTTTGACATTGATGGCGAGCTTTGGGTAAAATTGCGATTAATACCAACACAACCCTGGGTGGGAGCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAAAA TCAAGTTTGAATTGTCTCCATTCCGTCTGTTCAATTTAATGGCAATTCCAGTACTCTCAATGTTTTTGACAAGACTTCTCACTGAAGATTTACCCAGACT ATTTGTACGCCCAAAGAAAATTGTTTTGGATTTCCAAAAGGGAAAAGCAGTTGGTCCTGTTGCAAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGAAAC AAAGATTCTGTCGGTGAACTATCTGTTACCCTTGTGGATGCTCGAAAGCTTTCTTATCTCTTCTATGGTAAAACTCTACTATGTTGTATTTGCTTTTAAT TAAATTGTTGCATTTTTCAATATCCAGCCTTGATTTGTCCATTCCTTCCCCTTAATTGGATTTTGATTTTCAAGCTGTCCAGTAATTATCTTCTTATATT TTTTGGCTATGCTCTGAGACTTTTTGTTTGATGTATAATAAACATTCTACAGTTTGAAATACTCTTATAACCCCCAGATGTTAGATGAGAATTGTATTTA TGTCCCCTGAATTGGAGTTTGATAAATACTATTACATGTTAAGTTAACTTATCTGGTATAAGGGGATAGACTCAGATTATGTATTGAACTATTCTGATTT GAGTATTTAGTGAAATATTACCATCTGCAGACACAAAAATGTGTCTACGTAACTACAAAAGTAGATTTCGACTATGTGTTCCATATTGTTCTATATGTTA TTTCTTTTCTCACTGGTTTTTGTTTCAACAAAAAAATGTTTTGAAATATAGTGCGAAATATATACTTGTTCTATTGTCTTCTAGAATAATTTTTTGTTTT GTTGTTTTGCTAGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTCAGTCTTGGAAATCAAACTATACGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTC CTGGAATGCCAATTTGGAACCAAGTATTGTTTTTGGATTTCCTGATTAATATTTGTTTTAAGCTCGTGCGATTTCTATATTTTTCATCTTTAACTTTTTT TTTGTTCTAAACTGTACAGGATTTTCATATGCTTGTCGCCAACCCTAAAAAGCAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCTCTGGGATTTGCAGATTTG ACTATTGGTACAGGGGAGGTGTGTATTATATGCCATACCATAATTTTTGTGACTTGTTATTTCACATTTGCTCCACTTAATAGTTTTGTACTTCTTTCAT AGATTCTTTTAGCTATTGGATTTTCTTTGAGGTCTTGATACTTAGCTTCTAGTCTACCCTACAGTCGATACTGTTTCATGAATGCTTGTCTAACTAAGAA GTGCTTAGCAGATTCTCCCTCCTTTCCTTGTGGTCCACTTTGAGTTACCTTTCTTTTATTCTTTTTTTCTGATTATTATAAATTATGTTGGATACTAGCT CTTGATCAGCGGTGTTTTTCTTGTGTTGATGGTGAACTGAATATTTTGTTGAGGTGGGCTGGAATTGGTTGATGTTTGTGAGTTGATCTGTAATAAGCAA AATAAACCTCATATGATGTGGTGATTGTGGATTGGTGAGATTACTTTTTAGAAGGGGTCGGTGATTATTTTCTTAGGTTAAATGCTTGAAAGGCTGTTTG TGGATGCACCATATTTTATGCCACTTATTTTGACATCTCCGATGTATAGGTTCATTGAGTCTTTTGGAGTATTTCAGGAATGGGTGATTATCTTGGAGTG TTCTTGTAATTTTGCGATACCTCTCGCAAACAACTGAAATGTATAAAAATAAATGAAAAACCCAATGTGTGGACATGGGAAAAAACTGGAATCAAAGGAG TGAAATTGACATCTCTATGTCATCTAACTACACTTTAGCAGATAGTATATCCACCATTTTCACTGCACCACACCATGAGGCTATGATAAAGTTCCCGTAA AATAATGCTTTAATATGCCAGGGTGCCACGCCTTTCCAACATTCAGAGAAAATGATATTTTTTCTTAATGCTGTGAAATTATTTCTTTTTATGTCATTAG AGTACTTTCTTGAAAAGTAAGCTATATCTTTTCTATCAGTTGCAACAGTAAAGTTCGGCATGTAGTATAATGTAATATAAAAGTTATTTTAAGAAATAAC AATTTCTTTTGTTATTTAAGATTGTGTAGAATCTTCAGTTGCCATGTTTGATTCATATGTTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATATAATT TCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTTAATTGATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAACAGACA GGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGGGTTCTTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGATGAAGA AGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTCAGATGACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATGAAGGA GATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTATTAGCAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAACTGGGT CTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAGTATCAAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAACTCTGA AGGTTTTGTAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTACTAGTATATCACTATTAATTGCAATCAACATTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATCCTTGA GATGAGTTGGCAGTAGATAATAATCAATTCTACATTGGGAGTTTATTAATATTCTGGTGATGGAGGAAAGCATATAGCGGCGCACATGATTTTTGGCTTT GTTTTATGTGAGCCACAAATTTGAAAAATTCAGCTTAAATACCTTGTTTATATGTTAGAGTTTTGGACCCACCAAAAATAAAATAGAATCACAGATTTCT TGTTTCTCTCGCCCGAATCTGATTGATGTAAAACATGACAGAGAATTTCTTGCATAATATGAAATATTAATTGCATTGCACCAATCACATCATTGTTGAT AGTCTATGGTTGTTGTTAGTTAATAACCACTTCTTTTTCTTCTATGATTGTCCCATGTTAAGGATACTTCACAAAACAATTTTTTATGTGAAAAATTAAT GTATCACCTCCCAGGATGTGAAATTTGATGATGATGTTTGGATGGTAAAAACTGACATAATTT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_41964; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_196514
| Blastp | Uncharacterized protein PYUK71.03c from Schizosaccharomyces with 23.17% of identity |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (SPAPYUK71.03c) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450948.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |