Id Trinity | FTRINITY_DN54381_c1_g4_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_196042 |
Sequence | ATTATATATAGAGCTCTTGTATTTATGAGGTAGCAATATATAATAACCTGCTTTGAAATTGTGATCATCAGTGACCAAAGATGAGAAAAAGGGAGTGCCA TCCATTGTTGAAGGGAGGGAGAGGGGATAACGAATACAAACATGGGTTTTATGATGCTGAGATGAAATCACTAGCAAGTATATGTGAAATTGTGTTGCCA CCTTTGTCAATGAATTCTCTAAAAATAGAAAAGGAATATGAAGCTGATCATGAAAATAACAAGATGTGGAGTCTTTCTGGAACACTTCTGGTTCTTGTTA TCCAATCCCTCATGAGGTATATATGCATATTATGATATAACTTGTGTTGATTTTACACTCCTTATATTAATTTTATAATATTTTTACTTATAAAAAATAG TTTATTTAGACTTAAAGTTTTCTTATATCTGATCTGCATCAAATTCCTGTATGCAAGGAAGGAAGTACAAGTGGGACCCATGGTAGTTCCTTGTACGATA CAAATCCTGGTTGTTGTTTTTCTCGTGGGCTATTGTTTAATGATCCCTTTTGTGTTTTTTTATTCCATGCACCTTTCATTTTGTCATAAATTGTGAAAAA TTCTAAAGTATGTTTTTAAATGAGTTTTTTAGAGATGCACAAAGTAAAAAATAATTAAGAAATGAATGAAGATAGAGATAATTGGATTTGTTGTCACGGA AGTGGTCAAATTTGAGTGGTTAAACTAATACTACTATCTTGCTTTTTTTTCATTTATTTATTAATATAAAAAGTTAATAGCTAAGGTTGAATGATGAAAA TTTTGTGATCCCAATCCTCCACCCACATCCACCACTTAGAACCACCAACTCTGGTATCCAACCGGCCACCACCACCATCATCTACCATTGCTATCACTCT 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_42073; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_196042
Blastp | Long-chain-alcohol oxidase FAO1 from Lotus with 79.91% of identity |
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Blastx | Long-chain-alcohol oxidase FAO1 from Lotus with 80% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (CAP15762) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019414161.1) |
Pfam | GMC oxidoreductase (PF00732.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |