Ll_transcript_197679

• Id Trinity: FTRINITY_DN54389_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_197679
• Sequence: ACACTTTACACCAATGAGACCTACCAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAGAATTACCCAATGGAGGCTCCCCAGGTTGTTCTTTTGATCTTAACATTCATAA AAATAATCACTTGTTGTTGTTGTTGTTGCAAGTTCTGTTGTTCATTAATGACGATTCTACGATTAATGGTTTAACAGGTGATATTTTTGAATCCGGCTCC CATGCATCCCCATATCTACAGCAACGGCCATATTTGCTTAGGTATGTACGGGGTTTCACGATGTTAATCTTCCATGTGTTCATTTACTGTGTTTTATGGT CTGCTCCTGTAAATTAATGTTATGCCCCGTTTTTATGTTTGTTATTGCCCGACTTTTTATTGCATGGTTTTGGTATGTTTACATGTATGTTTGTTACAAT TACATTAACTTTTATGTTATCCATTCTAGTGATTTTAGTGATGAGCTCTTCATTTCCTCTAATTTGTGTTTGATTTTACTTTGAAGTCATGGGCTGATCG CATTCATAATTACAATTACTTGCTTATAATTCATGGGAAAGAGGATGGTTATGTGTTTGTCTACTTGTTTATGTGTCATTGGTGCCTGAGAAAATAAATT TACACCTTAAATTGGAAAGAAAAACTATATATCCTCCAAAAAAGTCATCCTAGTTATCAACTTAATTACTGAAAGAAAAATCATTATATGCATTTAAGGA ATTCTATCGTTCCCTGGTCAAAGATTTGGTTGGATGTGGGATCTACTCCATGAGGAGCGGTATGGGTATAGTTCTTATCATCATGAGTGATGACCACTCT TTTTGTACAACTAGGGATGCTTAAAGCCACTTCGCTAACTGGCGTTCCCTGCACTTATGTGATCTTGAACGCCATTACATTTTAGTCCAGTTCTTATTCT ATTAAGTAGATAGGACACAGTTGTTAAAAGTGCAATCCTGCCTATATAATAGTATGATTTTACAAGTTTGGAAGACTGGAGCAACCCCAATCCAGAACAA GCTCATTTCTGCTTTAGTTGTGCTGGGTGGAATTGACCCAGAGTTTGTACTCCAAAATGGTTTAGGCTTTCTAAATATTTTATATGAATGTTTGACTTAG ATATTTACATGGTTTGGTCAATCAAATGTTTTTTCCTTTTCCTCTGTAAATTTCTGTCTGGAATTTATTCTTCTTTTATGTTATAATGATATGCATTTGA AGTAAGGTAACCATGGAGAGTGAGAATAGTGGTAGTTAGAGATGCATTGCTATTTCCTTCATTCATGCCCGTGTAGAAATAGATGGTAATTTTCTCTCTA TCACTCCCTTGGGGGGTTAAGGAATTAAGAATAATCAACTTTTGTTTACAAACTGCTTGATATTGTCAGTATGTGAAGTGTATGAAAGTTTGATGTTTGA AGAGATTTACTTGACATGATAGATAAAATATTCTTATTCTCATCTGCACCCTTGATTTTAAAGTAGGAGCACCAGTTCTGAAGTCCAATCAGTTTTAGTG TATCGTACTTTATAGGTGGTCAATAATTTAAAAAGGAAAAAGAAAGTATGATTGACTTGGTGCTGGTTTTTGCTGGTGAACTGACATTAATATGCTTTGG ATGATGCAGACATATTGTATGATTCATGGTCCCCAGCCATGACTGTTAGTTCTATATGCATCAGTATCCTCTCAATGCTTTCAAGTTCAACTGTAAAGCA ACGCCCTGAGGATAATGATCGCTATGTGAGGAACTGCAGAAATGGCAGATCTCCGAAGGAGACAAGGTGGTGGTTCCATGACGATAAAGTATAACAACTA CTTTCTCGAACAAGTGAACAAAATTAGAGTAGAGAATTATGTTTTTGAAAGAAAATGGAAGGAGACGTGGGGAAAAGCTTTTTCGGAAACCTGAATCCCT TTAAATTTATGCATAAAACTCTCCTGTAAATTGGCATTACCTGGTATTTGTAAAGGAAGACAAAACTGTGTCTAGAAGGATCTCAAAAGAGTAATCAAAC TCAGAATACTGTGGTTATCTCAGGTATTTAGGTGTGGATATTATGGATACGTTTATCATCCCTCACATTTGATACCACGGTTTGGTTAATGCTTTTCTTT CTTGAGAATTATGTTCTAAATATCCTCGAATTTGCAATATCAACTTATCGAGTCTCAAGATTTTAACTGTTTCTGCC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_42128;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_197679

FPKM

• FPAB: 0.1
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0
• LF2: 0.3
• LF3: 0
• LF4: 0.2
• UF1: 0
• UF2: 0.1
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_197679

• Blastp: -
• Blastx: Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 16 from Arabidopsis with 92.86% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G75440)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019423644.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;