| Id Trinity | FTRINITY_DN54390_c3_g10_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_196948 |
| Sequence | GGTTCTTCACAGGGAACAACAGGTTCTTCAGTAATTTCAGAATCTGAGTCTCAACAAGGTCTAGGTAATTTACTAATTGTCTTATTTTTTTTGGTTTTTA TCTTCCGACATATTTATCATTTTAATTACAATGAAATAACACTTTGCCCTGAACACAATCTCCGGTACAGGAGAGGATCCCTATTCCAATTTCATGGTGT TTAGATGTTAAAAGCATCTGACTAATTTTTTGTTTTCTTGGATTGTTTTTGCTGTTTAAGTTTTATTTTTATTTTTATTTCCTGTTTTGTGTCCACATTT TAGTGTATTATTCATCAATCAGCCAAAAAAAAAGAGCATCTTTTAGCTCGTACCCTTAATTACTAATCAATACACTAAGATTTGAAGATGCAAAAATCAA AGAGTAGAAGCAGAACACAACATAAGAGGAGGCCTAAAGAAATAAAACCCTAATGTTTCTTTTATTAATAGAAGCATTTTTAAGTCAGGTATAGCTTGGT CATATAAAATGGATCTATTTTGAGCATAAAATCTATATACGAACAATATTAAGATTTACAATATTAATATTAATATTAAGATTTATAACAGTCAATACTT CATTCATCATTCATTTGTATCACTTTTAAGAGTCGATAATGATAAAATACAAATGGTGGATGGTGCACTCATAGTGTAACAATCTCTTACACTGTCATTG CATACATTTTTCTCATCTGTTTTATTAGAGATAGTATTTAGTTTAGCCCATCTTATTATTCATAAAAAAATAAGTTTTAAAAAATCAAAGCACTTGGGAA TTAAAAAATTGTACCAAGTATACCAGAAATTATCATATATTTGATAGGATAGTGTATCGCATACCTGGTACCAAGTTACAGGTTCATATTGGTTAATTTA ATTTTGTTAATTAGATTCTAATTTGTAGCAAAAGCAGATCAAGATTTGTTCTCTGTTTCTATTATTATATATGTGTCACATGGTATTCATTGTTTGGTTT GATCTTGCCTTGTCATATGTCAGATCATGTTTATCCATGCCTTTTGGCAAATATTAACCAAAGTTTTCTCTAGATCAATTTGACAACTATTGTATATGAT TTTTGTCACAACCCAACTAATTAGATTATTTGATTTAAAATTTCCATTTATGTGATTGGAATTATATAGTTCTTGGACTGATAGATATTTACATTCTCAG TCAAAAGGGACCATTGCAAACTTTTAGAGTACCTGTACTTCCTTTTTCTTATATCTCCATTTTTATATGTGTAAGAGTCTTTTCAAAATTTCCTTGTTAA TTTCCTTATATAGTTAAATTTGCATTCTCTATAATGTCCATTGTCTAAGATGGCCTCAGTGATGATTATGGAAGGAAGACTTTTTAATATCATGATCTTT ATGATTACTCTTCGAAGTTATTTATTATTACAGCTTGACGTTGGGATGAAATGTTAAATGGAACCTTTAGCTATGAAGCTGAAGGGATGTTGGAGTAAAC AATTTAATTAAGCACTTATCCGATGAGATTTTTTGAATAAGCTAAAAAGTATGAATAAGCTAAAAAGTATTTATTTTCTGTCGTAAGTTGGTTGAAATAA GATTAGAAGAGCTTATAGGCAAGTTATAATCTATTTTTCGTGAGATATTCCGGTAGGCTTTTCCAAATACCTTGTTTATGATTATAGCTCTCGGTGCTCG AAGATAAAAGTATGAGATATTAGCTCCGAGAGTTGGCCATATTAATGTAATTCGTGTTATGATGATGGCATTTTGACATAATAAAATTTCTAAAATTGAA GCCTCATCATCCACACATACTATTGTCTTGTGTGCATAAGTTAGGAATATTTTTATAAATCATGTTGAGTTCATTAGATTTCTGACTATTTAGGAAGGTG AGTATGTGAGCAATCATGTCATTTTCCGACTATTTTCCATGAAGGCATAGCAGCCTTTTTACTGTCCCAACTTGTCGTATCATGTTTTGGAGGAGTGGTG AATTGTGGCCAAATCATGTCCTTCATGTGTCTTGTTTTGTGGAGTGGCGAATTGCAGCCGACTCGTACTTTATGGACACAACCTGTGTTGTGTTTTGGTG GAGTAGCGAATCAGCATCACCATGTCCTTTATGGACAGAATCTGTTATGTTTTGGTAGAGTGGCGAATGGTGGCCGCTTCACGTCCTTTATGCACACTCT CTGTGTCTGTGGCAAAATTCCCGTTCTGCCCTTTTTAGTTGTTTCCCATTTTATTTGAAGTCGTTTGTTTAAGCCAATACTCATTTACGGCTACAAACCT GTCTTCTTCAACCAATTTAACTGTAGAAACGGTGTACTAGTTATAATTCGGCAACTCTGATGTGCTGAGTCCTCTTCATAGTCTTCTGTTGGCAGCAATA AATGCTGCTCCATTTTTTAACTTCAGCCCATAGTATAGTTTAGTTACCCAAAAATACAGTGATGGTGATTATGTGTTTATATTCTCAATACTGAACTGTA TTATTTATGATGAGTAGGTCCTTATCTTTGGTAACTTTTTATTTTTTAGTATTCATGTGTGTAGTATAACTTATTTATATTGTTTTCCTAATCTTTATTA TAGCAGCTATCCCGCTATCTCTGTACGTTAGTTGCATTGCTTGCTCTGGCCGTATCGTGATGCCATCCAAGATTGATAACTATGGTCTTAAGTGTGCTTC TTCGGCTTTTAAGATCGTTTTCTGCATCCCACTGTGTCACAACAATTAGTGGGATCACTGCTTTTGCTTATCTGTTTGAGTTGCAATTTTGGATTAATTT ATGGTCATTAACTACTTAGGTCATTCATGCTAGATTACTTATGATTGTAAAATCCATAGATAGTATATGAGTTGAAAGTTATTATCTCGCTGCATGTCCT AATTACGTATAGTTAGTTCCTCTAGGTATCCCTAGAAACGAAAAAGGTTTGTTTCAATTTTGTAGTTTCATCTGATAAAGATGAAAACGATTTATGATAT CGTTCAATCCATGTAGCCGATCCCACTTGGTGGGAGTAAGCTTGGTGGTTGTTGTTTGTATTCCTCTGAAAATTTTACCTTATCTATTATGTGAATGCAC TAGTCAAATATTCCACTTTTATTTGATTCTAAACACAACCTTCAGGTTTTCTGTTCAAGAATTGGATTCTAATTTCTATATAAAGAAAAGAAGAAAATCT ATTGGAATACTATAAAGCTTCTTTTCAACTTTTTTGGACTTTAAACAGTGTGTTTGAGAATTCCTATCATAGTTTTACAACTTAAAAGATCTGAGTAGCC AAAGTATATTTTCATATAGTGTCTATTCTTATGACTAAGAAAGTTGCAACCTGGTTTCGGAGGTACTTTGTTCTTGCTGTCTTACAAAAGTTGTTCTTTT AACTGTATGTTCGGCTGCCGCTCTCATTTCCGATCTTGTCACATGAAAGTCCAGAACTAAAGCTGCGATTTCATTATGTTTTAATTTCAACCATGGTCTT TATTAGGTTTGTCCATGTTTTGAATTGCACTCGGTAACCGCATTGTGTTCGCAATTTTGCGGTTTCTGGAGTATATGCAACGAGATCGCCACTGTAATTA TAAAAGTAATTTTCCGGAATTATGGTAAACACAGTGCAACTGCAACCGTGGCCAAGGATAGTGTAAGGTGTTTCTCAGGTCTTTAACTTACAATTATTTT TTAACCGATTTCTCTTATGCTTCAGGAACAAAAGCAGCAGATGCTAGGAGCCCTATCGGTGGCGACTCATCGCCAGACTGCGAGCAGAAATCACCTCCAG TAACATTGAGAAATCAGCTGAACAATCAGTCATCACCGGAAAACAGAACCGAAGACACGGTGAGGAACTTGTTGGAAGATATGCCTTGTGTGTCTACCAA AGGTGACGGCCCCAATGGAAAAAAGATCGACGGTTTTCTTTATCGATATGGGAAAGGCGAAGAAGTGAGGATAGTGTGTGTATGCCATGGCAGTTTTCTC ACCCCAGCCGAGTTCATCAAGCATGCCGGTGGTGGTGAGGTTGCGAACCCGCTGAAGCATATTGTTGTTAGTCCGAGCATGTTGTAACTCTTTTGAGAGA CCTAAGAGAAGGTACCAAATGATGAGCATGTTATAGTTATAGTTAACTGCATGCATGTAATGTGTAAGTTCTTTTTTGTGTCCTTTGAGATCATAGAGAT ACTATGCAGGATTTGATTTCTTTCTGATTAAGTATCCATCACCATTGTTCTAATGTGTTTGAACACTTTGAGGGGATAATGGTACAAGTTAGAGTTTGAT TTGGTACATTTTTGTTAGCTTGAATGATTTACATTAGTAGCTTTTTGATTAATTTTTATAATGATTTGGTAAATTAATGTTCTTCTATC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_42133; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_196948
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Ninja-family protein AFP3 from Arabidopsis with 77.38% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429618.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |