Ll_transcript_237500

Id TrinityFTRINITY_DN54425_c2_g4_i4
Name TranscriptLl_transcript_237500
SequenceGTGTGTAAGCAGAGCAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGGAAGTAAACTAGTAGTAACGTCTTCTTACACACAAACCCTAA TTCAATTCAATTGAAGAAAAGAGGAAGTTTATTCTTCATTCATTCATTCATTCTTCATCCATCTTCATCATGTGGACCAATGTTTTCAAAATTCCTGGTC TTCATCAGATATCATGGTTCCAATTCATGCCGCACGAACCTGACCTAAATCCTCCTCTACCTCTACCTGACAACAAAAGTGCAAAAGTGGATGCTGCAAT GTTACAAGTGCTTTCATCACATCTACAATTGCAGAAGGAAGGATTTCTCACTGCATGGACCAATTCCTTTGTCGGACCGTGGGACCCTTCTCAGGGTTTG CATAATCCTGATGAAAAGATCAAGCTCTGGCTTTTTATCCCTGGACGTCATTCATCGCTTCTTGACAATGCTCAACCTTTAGTATCCACACTAAGAGTCG TTGCCTCTGGCCTCTGGCTGGCTCCTGGGGATTCAGAAGAGGTTGCATCTGCTCTCTCTCAGGCTTTAAGGAATTGTATAGAAAGATCACTTATTGGGCT TTATTACATGAGATTTGGAGATGTATTTTCAAAGTTTCATCAACTTCAAAGTGAAGAACTGTTCAGGAGGGGGCATCCGGCACTTGAGTTTGCCTTTGCT GCAAATGAGGAGGCAATCTTTATACATGTCATACTGTCCTCAAAGCATATCCGGATGCTTACCACAGGTGATCTGGAAAAAGTATTAAAACATTCTACAG AGGCAACACATGGACTTCCAGTGATTGTTTCTCCTCATGGAATACGTGGCAGCCTCACTGGTTGTTCTCCAAGTGATCTCGTCAAGCAAAGCTATTTCAG CAGTTCTGCCAAGGTCAAGGCATCGAATGGAATTGTAGGTCTCCCATATCATGTTCCCCAAGGTGTTGGTTGCAAGCTGAGGGGGCAGAATTGTCATGTT GAAGTACGTCTTGGCTTCCCTAGACCTGGAACTGACAAGGCGTCACAGCAAAACAAAAATAATGTCAGGAATTTAACTAAGTTCAATGCTGCTGAATCTC TTGTTGTGGGACAAAGTGATCACAAGGGATCACCTAATCATTTGTCAGATTATGAGAAAACGTTTCTCTATCCAGCTGAGGCAGTGCTTGTGCCAGTTTT ACAAACATCATTAGCAAGATCTTCTTTGAGAAGATTTTGGCTGCAGAATTGGATGGGACCTTCCCTCCCTGGTTCCTTGTCCTTTATTCACTGTGCTGGT AATTTGGATAATTCTGAAGATCCATGGACTGAAATAAATGGAACCCGCACTCAAAATAGTTATGATAGTAGTAGCAATAGCAATAGTAGCAGCATCAGTA GCTTAAGCGCCAGCTCTAGTGATAGTGATTACAAGACTACAGGACCAAGTGAACTAGAGGCTGATGCTGATTCTTTAACATGTAGACAATCGGTGCTATC TTCCGGTGATCAGTTGCAAAGTGATGGCCTCAAATTGGTATATAATTAAAAAGTAATTTTGTTTTGTTTTGGACATAGGAAGAAAGTTAATGCGCTTTAC ACCAAACAGAAGGTAAATGCCTAGTCTTATCCCAACCCGTTTCCCTGTTGGTTACCCAATGAAACCTCCTTAAAAAGCATGAATACTACCTTTCAACCAA ATGCACCTAATAGTAGCATAGATTGCATATCGCTATAAAAACTTGGCCTCTTTACTTCTAAAAAAATCACTGAAGCAAATGAAAATTTCCCTTTTTAACA TGCTCATTGTTAGGCTCTAGGTAATGGTGGTAGTTTCCCGAATTTTAAAGATATGAAGGTATTTCTATTGACTGCGTTTTCTAAAATTGACCAAGAAAAG CTATAAACAAAACTATTAGAAGGGTTTCGAAGTAAATGGTTTGTTTATATACAATTTATTGTATGTGGTGTTGTTTGATCCATGTAGCCGAGCCACCTAA TGGGAGAAGTCTTGGTTATTGTTGCTACTTGCTACAATGTATTACTATTGGATGCAACTATGTTGCATTGATACTGGTGAGAGTAATAATTACAGTACTC TCAGGTATCAAATACAAGCATGCACAATCTTTTTAAACTAATATAAATGGGGTATTGTGCACATACTGGTAGTAATGCCCTTATCCTTTTGTTCTGGGTA AAGGTCTTTGGTCAATTTAATGGTGTACCCCTGCAATGTAGGGACAAAAATATGCATACTCCATTAGTTAGTCATTTATTTGGTTGTTTGCTCATGCATA TGGCTAAATTAATGTGCTTTTAAAGTAAAATGAAAAATATGCTTATTATGAAGTTTCTCTCTGATGAATATATGGAAGGTTCAGTGGGATTACTCAATGT CCTCTTATAATATTGTTGGTGTTTTTTGGAGGAAGAAGTCTTTTTTACTGTTCTGTTTTATGATCTTAGTTTTTTTGCAATTGAGCTGTATATCAACTCT AGTCTCTGTGCAGGGCTCTAAGCGGTCTCGAACAGGGGTGACAGAATCATTAAGCACAGCTACAAATGTTATCGTGCAAGATGCATACATGTCTGATGTG GGTTCCATGGAAGTTAACAATTCAGCCATTACTGTAGGAAATGAGCCTATTGGGTCGTACTGGAACTGGGATGATGATGATAGAGACCCAGTAATGGATA TTGGAGCTCTTCTGTCTGAGTTTGGTGATTTTGGTGATTTTTTTGTAAATGATGTTTTGCCTTTTGGAGAGCCCCCAGGAACTGCGGAATCTCAGGCACT TGTGTTTTCTGCACCGGATTGTGGAGATGTTAACAGCAGTCCAGTTGGAGTGATGGATGTTTCAGATCAAACGCTTTTGCCTGTTGGATTTACTTCTTTT GAGAGCTTTAATCCACCTCCTTCAATAGCCATGGAGGAATGTCTCAGCAAAAATCAAGATAACTTGAATAACTCCATGTCATCGGTTCCAGTCAATCAAA CTCAAATTTCATGTACACGGGAAGTTGAACATATAATGAAAGCTGAAGCAATGATGATATTTACTGCTGAATTTGGAGCCGTTGAGACCCCTACCAGTGA TTTGTCCACATTATTCACGAGCCCATATTTTCCAAAATCTCGAAAAGCAGAGAGTTCAAATTCAAGTTCAAACAATTACTTGTATGGTGCAGCACCACCC TCTACTCCCTACATTGATGGATCAGAGGGGAAGAATGGTATGGTGGCCACTACAAAAACAATTTGTGGAAAACATGATGCAAGTACGAGTCTCCACCCCA GAAATTACTATAATTATGTGGAGAGTAGGAAGGACATAAATGACAGAAAACCAGCTAATTTAAATGATAACGTCAACGGTAAATCTGAGGGGATGGTGCA ACCTCTGTTCTCAAATATTGGTTCCAATGCTGTCACCAAGTCTGTTCTAAGGAAGATGAGTGAAGGCACACATGAGACGGAGCATTTCCTTCTCTCTGCA AAAACTTTGTTAGCGACTGATGTCACATGTGTTATGTTGCAAGCTTCCATGTGCAGGCTACGACACATTCTCTTATCTTCTAGTAACCTCATGCCTGTTG GTTTGAGCAGGTCAACTGGGGCTACATTTTTTAATCAGCTTCCTGGTGACCCAAGTACAACAACAGACAACATATCCAATAAGTATGAGGTTAAGAAGAA AGAAAATATACCAGTTCGAATTGCAGGTGATATTGATGGAGGAATGCTTGATGGGCACCAGAACGCGCCTGTTGGTGTCTGGCGTACTGTAGGAGTTTCT AAAGTTGTAAAGTCTTCAAACTCGCCAAACATGGAAGTTGGTCCTTCCTTTTCTCATACTTCATTCAATGAAGATGGTATGCTTTCTTACAGTCAAAGAA AACCACTTCAGGAGCTTCTTGATGGGATTCCTTTGCTTGTCCAACAAGCTATTTCCTTTGTTGATCTGGCCTTGGATGCGGATTGGGGTGATGGTCCTTA TGGTTTGCTTGCATTGCAAGAACAGTGGAGGCGTGGATTTTGTTGTGGGCCTTCGATGGTCCATGCTGGTTGTGGGGGAACTCTTGCTTCATCTCATTCG TTGGACATTGCTGGTGTCGAGTTACTGGACCCACTTTCTGCTGATGTCCATGCATCTACTGTGATCAGTTTGCTGCAGTCTGATGTAAAAACAGCTTTAA AGTCTGCATTTTCCAATTTGGAAGGGCCATTATCTGTGACTGATTGGTGCAAAGGACGCAATCAGTTGGTTGATGCTGGCAGCATAGTTGATGGTGTTTC TGCTGAGTCCAGCATTAGTGAATGTAGGGATTCCTCAGAACCAATGAGTCCATCCCAGTCATCTGTCGCTGGATCATCCATTATTAAGGGATCTAGCATG ATGGATAGTGCTAAGGTGGATGAGATTTCCCAACGGAGAATTGGCCAAGATATATGCAGTTCAGAGTCAGAGCGGCAGCCATGTTCCCGGCTAAAACCTA CCCTCACTGCTCTTCCATTTCCTTCTATACTCATGGGGTATGCACATTTTTTATTTATCAGTTTTGTTTAAAGTCAAGTTTTGACTGTATAATTACCTAG AGCACAAGGTTCTTGATAGTATTTGGGTGCATTTGGTGCTGTACGCTTTTGATGATTAATGATGCTGCTTTGGGTTGTCCTTGTGGTTCGTCGAAGCTTA GACTTAGTTGGCTCAAACAATCAATGCATAAACCTGGCAGATTCAATCTTAAATATGGGCTGATATTTTAAAAAATGATATGTAGAATAGGTAGGTTTCA TGGGCAACTTCAGTTTCTAGCAGATTCTTTGTGCCATCTACCAAGTCCAAGGGTTATGTCTATTGGCTCCCTCTCCAGATGGTGAATCTCTTTTGGTGCT TATAGCATCCGCACTGTGATATCTAAAAATCAGCACATGCTTGGAGGGAACAAAATACAGTAGTGTCTTTTGAATAAAATTCCAACAGAGCAGAGTGTAT AATTTCAAAATCTAGGTTTCTGAGAAAGTGAGAGAAAGGAAGAATAGTCGAAGAGAATCAGATAGAGCGAGAACTGAGAGAATGATAATATAGAGCAAGT GAGTCTGAAGTTGATAATTGTAGTATTTATACATGTGATTGGAAAATATAGAATATTTTATTCTAATCTGAAGCTGTCATACCTATTCTAATTGAAATAC TCTGGTATTTTTCCCTCAAACTCAGCTAGATGCAACTTTTCCCCTTTGTCTAAGCCACCCCAAAACCACTTCAAGTTTTTGTTATCTCCTCTCCCCTACT AATCGTCCTTTTTATTCCATCTTCTAAGCCTTACTCCTTGCTTTCTCAAATGCCTTGCCATTTAGACCATGTTTGTTATAACCGAAATCCCTCTTTGTCT TACTCATAATTCTCAAGTGGTCTAGCATAAAATTGCCTAACATTGATTCAGATTCAAGTTATCTGTTCTTCCTCTAGGTTTTTATTTGTTAACTTGAGCT TTAACTGAGCCTTAGCTTCAAATAAGCCAGTTTCCCTTGCTAACTTGCTGGTGCATCACCATATTTTAAATATGATAAGTAAGCTAACATATTTGGCATG TGGTACTGTAAACTCGGCATTGATTTACCGCTCATTCAAATATAACATGTCAAGTAGGTATCAGGATGATTGGCTCAAGACATCAGCAAACTGTCTACAG TACTGGGAAAAGGCTCCTCTAGAACCCTATGCTCTACAGAAACCTATCACATATCATGTTGTATGTCCTGACATCGATCCTCTTACCTCTGCCGCTGCTG ATTTTTTTCAACAACTAGGAACTGTGTATGAGACATGCAAACTAGGTACTCATTCTCCACAAGTGTTGGGGAATCAGATGGAGATAGAGTCTGGGAAGTT GTCATCTAGTGGTTTTGTTTTACTTGATTGCCCCCAATCAATGAAGATTGAGAGCAGCCATGCGTCTCTTGTTGGTTCAATAAGTGATTATTTTTTATCT TTATCTAATGGTTGGGATCTGACTAGTTATCTGAAGTCTCTTTCAAAGGCGCTTAGAGCTTTAAAACTTAGTTCTTGCCTTTCCACAAACCCCACTGAAG GAAGCAACAGTTCATGCATGGTAATCTATGTGGTGTGCCCTTTTCCTGATCCTACTGCAATTTTGCAAACTGTAATTGAATCTTCCGTTGCCATTGGATC GGTTATCCAACAGTCAGATAGAGAGAAGAGATCTACCTTGCATAGTCAGGTTTTGAAGGCATTAAGTGGCTTGGCAACTGTTGATGAAGCTTCAGCATCT AATATCCTTGTCCTTTCTGGGTTTAGCATTCCAAAATTGGTCTTGCAGATAGTCACAGTTGATGCCATTTTCAGAGTCACAGGTCCATCAGTTAGTGAGC TTGCCATTTTGAAAGAGACTGCCTTCACTGTTTACAGCAAGGCTCGTCGAATTTCACGGGGAATCTCTAGTGACTTTCCTCTATCAGCATTTTCAGGTAG GTCTCATTCTGTTTTGACACAAATGCCTTCTCCCATATCGGGGATGTGGAAAGACAGCGTTGGTCCTCGAATAGTAGGTCATTCTCTTCCAAGAGAGGGT GACATTGATGCTAGCTTGAGGTCTGGTGGGTGGGATAATTCTTGGCAACCAACGAGGAGTGCGGGATTGAACTGTGATCCAAGTAGATCTGGGGATACTT TTTTTCACGATGAAATTAGGTACATGTTTGAACCCCTTTTTATTCTAGCAGAACCAGGTTCTCTAGATCATGGTACTTCTGTTATTGGTAGCCCCACTTC AGAATCTTCAAAAACATTGGGAGATGACAGTAGTGGTAGCTATATGCAGCAGAGTACAAGTACAGCTGGAAGCATGGATTCTGCTTCAAGCATTGATGGC TTAGGGTCTGATCAAAAGACTCCTCCGAGCCTACATTGTTGCTATGGATGGACCGAGGACTGGCGTTGGCTTGTATGCATCTGGACAGATTCAAGGGGAG AACTGCTTGACTGCAATATTTTCCCCTTTGGTGGAATAAGCAGTAGGCAGGATACCAAGGGTCTGCAATGCCTATTTGCTCAAGTTCTTCAGCAAGGTTG TCTAATACTTCAATCTTGTGATACCAGTCTTGCAAAACCTCGAGATTTTGTGATAGCACGCATTGGTGGTTTCTACGAGCTTGAATACCTTGAGTGGCAA AAAGCCATCTATTCATTTGGTGGATCTGAGATGAAGAGATGGCCCCTGCAACTCCGGAAATATATGTCGGATGGGGTGTCCATAACTAGTAATGGTTCTT CTTTACAACAACCAGAGATGAGTTTGATCCCAGAAAGAACTCTCCCTTCTTCACCTAGTCCTTTGTACAGCCCTCATACCAAAGCCACTGGTTTTATGAA AGGCGGCAGTTTAGGGCAATCTGCTGTGAGAAAGCAGCATATGGGTGGACATTCTATGGTTGACAACAATTCAAGGGGTTTACTTCATTGGGCACAAAGC ATTAGTTTTGTTGCAGTTTCTATGGATCATACATTACAGCTTGTTCTCCCAGCTTCTGATTCATCTGGTTACACAGAAGGTTTTACTCCAGTGAAGTCTC TTGGTTCTACGTCTTGCGCGTATGTTGTAATTCCTTCTCCTAGTATGAGGTTCCTTCCTCCAACAGCTCTTCAACTCCCGACATGCCTCACTGCAGAATC TCCACCTCTAGCTCATCTGCTTCACAGCAAGGGTTCTGCTCTTCCACTGTCCACAGGATTTGTGGTTTCAAAAGCAGTACCTTCCATGAGGAAGGACCAC AGAAGCAACCTGAAAGAAGAATGGCCTTCAGTACTTTCAGTGAGCCTCATTGATTACTATGGAGTTGCTAATATCCGAGGAATTAACAATAAGCAGCAAG GTGGTGGTAGAAGTTTAAGCTGGGAAACTAAAGATTTTGAAACAGAGACCCACTTGGTTCTGGAGACCCTTGCTGCAGAGCTTCATGCTTTGTCATGGAT GACTGTGAGCCCCACATACATAGAGCGGCGAACGTCACTTCCTTTCCACTGTGACATGGTTCTAAGACTAAGAAGACTTCTTCACTTTGCTGATAAAGAG CTATCTAAGAAGTCAGAGAAATCTTGACTACACCATATGCTATGATTAATACACTGCAATACTGCATCCTATCCTATCCATACATATTAATTATATTGAT CCTTTGTAAAATATTTGTAAAGCCTCTTCCTTGTGTGTTCCAGGAAGAAAGATTTAGCAGTTGTAGGGTATGACTGGAAATAGTTGAGAATGCATGTACA TGAGTTGAGTTTTCTAGAGCAGCTGATTGTTAGCATTATTGATTTATTGATGAAAGCTGTTGATGGCACATAGGACTTTGACTATGGTTTTCTTGTAGAA AAGTGCATGAGAAAACCTTCAAGCAAGTCCATCTAGTAAGTAGAATGCAGCTAGGTGTGAGGGGATAATAAAATCTAATTATACTTGATTAACACTTTGT TGACACCTTATCTTTATTATAATAAAAATTTATGCTACTCGCACTTTTGTCGGGTGATGAGGAAATGATAAAACTTTTGAATCCTAAACCATGTTTCTTC ACCTCAAATCTTAAGCAAAATGTTTTTAGCATTCTTCTAACACTAACACTCTGTTTGGTTTAAAGAGGACAATAGAAAGAAAGAAAACGGAAGGAAAGAA AAAAGAAGGAATGAAAATAAGTAGAAAATAAGGTGAAAAGACTATTATAGCAACAATAATATAAAATGTATCTAATAAAATAGAAATATTAAACACAATT GACATAATATCAATGAACATAAAATATATGACATTCAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_42506; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_237500

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_237500

BlastpMediator of RNA polymerase II transcription subunit 13 from Arabidopsis with 60.48% of identity
BlastxMediator of RNA polymerase II transcription subunit 13 from Arabidopsis with 60.72% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (AT1G55325)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019438261.1)
PfamMediator complex subunit 13 C-terminal (PF06333.11)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;