| Id Trinity | FTRINITY_DN54438_c0_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_236777 |
| Sequence | ATGAAATTAAGTTGATTGGATCACGCGCATGGCAAAAAACGCACGAAAGAGTATATAAAAGAAAGTACCTCACACAAACATGTCTCAGATAAACAAAAAC AACTTTCAAACCCTAGCGATTGCGAGGTTAACCCAAAATTCCCACTCTCCTTTTCAATTCTCCAGATTTTCATCTTTTTTTAGTATCTATTCGATTTAAC TATTCGTTTTTTTATCTGTTTTGATCGAGAGGAATTCGATTTTGGGATTTTTAGGGTTTGATTTCAATTTTCTTTTTTACCCTTCTGATCGGTTTTGTTG TTTAATAAAATCGTTTGTTGTGTTTTTAGTTTTTCATTTAGAGTTTCTGATATTTGCAATTGAAAAAAAAATAGTTTATTTTGGTAAAGAGAATCTTCTG ATTATCATGCTATTTTGTTTTTAATTAATTTTGTGTTAAGAGCACATATTTACCTCTCTACTAATTTTAATTATTATCAGTAGTATGCAACAAGTTTGGT TTTGGTTTAAAATTGACTTCACATGCTTTTGTTGCAAAACATTTGATATATATGCTATAATTAGACTTTGTAATAAAATTGTGACAACGCAATTGTTTTT GAACAATGGGGTTTGAATCCTCAGACCCCCCGCGTTTCAATGGTGGTTCATGTTTAAGTTTTTAATGGTTGCTTTATCTATATAGGATCAGTTTATTTGT TACTTGTGAGTTGGATAAGCAGGTTTATATGTGAATTTTGTGTTCATGTCATGATATATTTTATAATTGTACATGTAATATAGTACCAACTACCAAAATA TCTCTGATTCAAACTTTTTTTCTTTTTTGTATTACTTGCACATTTCTTGAAGCAAGTTGAATGTTTATTTCTTGGAGTGAGTGTGAGGAGTCGGGCTCTT TATTTGTCTTTGGAATTGAGTGTCGTAGTTTGTTTCATAATCGTCATCATTACAATAACTCTTTTCCTTCATTCTGTTTTGGAAACTGGGGCTGTCATGC TTGTTGCCTTTATACTCACTTTTATGTAGTTTTAAGTACCGGTACGACTAAATTTGTGTGTTAATCTTTGTACAGTTGAGATGGCTTCAAAACGTATTAC TAAGGAGTTGAAGGACCTACAGAAAGATCCTCCTGTTTCCTGCAGTGCTGGCCCTGTTGGTGAAGACATCTTTCATTGGCAAGCTACAATCATGGGTCCA GCAGACAGCCCTTATGCTGGTGGTGTATTCCTAGTGACAATTCACTTCCCACCAGATTATCCATTTAAACCACCAAAGGTAAGTAGGCCTAAACTACTTG CTGTTTATGTTATTATATAAAAGCATATCAGAGATTCAACACCTATTAGTAATTTAGTATGTAGTTGGACTGAAATTTGAAACTTGGACACCTTTGTTGT TTAAATTGATTTTTTTATAGTTTTTATTTGTCTTCTGAGTTTTGCCAAGCATTCTCTTTTAGTTGGCTTCTTGTGAATGACACTCTGTTCAACCTTTTTC TGTTGTCATGATAATATCTAGATATGATGTGTCACCAAACTAATATTGAAGCTAGAACCTACATTCATTGACATGGATTCAACTAGATATTTGAATATGT GGGGTGAGGATTAATTCCTATGCATCATTTTTAGTTTTTTTCCCCGACTTGGTGAAGAGTTAATGGTCCTCTATTTGATATTGCCTTTTCGTAATGTGTA GATTATTAATTGAATTCTGTTATATGGATTCACACGGCTTGTTTTTAGTTTTTATGCTCATTGATTTTATTGAATTGACCATTCACTTTTTCTTGAGGCC TTAGCATATATCATGCACATTCATTTTATCTTGGGTCAAAAGATGTTGATAGTTTACATTTGGAAAAGGACCTTACAGCTTGGTTTTTGTAGGTTGCCTT CAAAACAAAGGTATTCCACCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATCTGTCTTGACATCCTGAAAGAGCAATGGAGCCCTGCCCTTACAGTTTCCAAGGTT CTGCTGTCAATTTGCTCCCTGCTGACAGACCCAAACCCTGATGACCCTCTAGTTCCAGATATTGCTCACATGTACAAGACTGACCGAGCCAAGTACGAGA GCACGGCCCGTTCTTGGACTCAGAAATATGCCATGAACTAGTTGACCTATGCTTATGGTTCTGGTGGGCAGTTTATGTGCAAAGAAAGTTGTCGAGAAAT ATCAGCTAGTATATATTCATATGAATGGTTCTTCCGCTTTGATTTAATAATAATTCCAACTCAGAAATGTTTAGCTTTCATGGTTAATATGGCAAAGTCT TCAGAATGGGTTGCATTTTTATTTGCTTTGAGATTTCAGTTTTTGCCCTCTTTTCTTAATTTTGTAGTTTAATGAGAAGCAAAATATCAAGGCCAAATTT CAATATTAAGCTTCAGTTTTGCAACATCAAGTAACATAACATGTTATTTTTCAAGCATATAGGTTAATATTTATGCACATGTACTAAATGTTT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_42667; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_236777
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Ubiquitin-conjugating enzyme E2-17 kDa from Lycopersicon with 78.3% of identity |
| Eggnog | ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078) |
| Kegg | Link to kegg annotations (100301932) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002933) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462151.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |