Id Trinity | FTRINITY_DN54439_c3_g7_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_237209 |
Sequence | AAATGAAGATGAATCAATTGTTCATCACACTGCTAGTACTGGTGATATAGAGGTATGCCATATCACTTTTTGTGCAGATGCGTATGCTTTTAAAGCTTTC TTCCTTTTGAGGAATTTAAGTTATGGTTGAAGTTATTGACATGAAACAGAGGAAGTGGAAAATTATTATCTTTTCACAGGGAACTTGTTTAGTTAGAAGG TACAGATCTGAAACATGTGAATTAAGTTTAGTCATAGTGGATTTGATGAAATAAAACCAGGCTTAGTGTATTGGTTTGTCTAACAATTGAAATTGGAAAT CTTGGAGTCTGACTTAATTGTCTAAATAATCCAACAACAAAGGTTATGCCAAGTGGAGTTACAGCCAAGTAAACAATTTTTCCAACTAGCCTTTCTGTGT TTAGCTAGGTTGCTATTTATCAAACAATTCAGCTTCATCTTTCAGAAACTTCCCATTGGGATCCTTTGGAGTCTACTGGTGTAGCTTAAGCTTCTAGAGT ACGGTAAAATCCTTAATTTGATCAGGCCACTTTTTTACCCCAAAATTATCTGATATAGCAGGTCCTTGATAGAATTAGGAAATGTTGCTCGTGTTAAATT TTCAGAGGGCCATTGGGTAGGAGAATACTCGTTTAGAGATGCTTCCTTGTATCTCTGTTTTCCTTCTTCCATATAACTCTCCTGTCTGTTCAAGGTTCAA ATCTCTCTCAGAATTTCCGTTTCTTTGTTAATTTATATGATAGTGAATTCTCTGAACTGGAGTCTGTTTTGGGCCTTGTTAATTGTGTCCATTTAATTTC TATAATTAAGACCCCAACTAGTGAGATTAAGGCATGGTTGTTGTATTTGTTTTCTGTAATTCGGGAAAAAGCATTTGGCTCTTTCTTGTCATGTTTTTTT TTGTGGTACTTGTTTAAAATCTGAGGTGTTCTCATTATGACAGTAACCATAAAAAGTAGAGAAAGGCATCACAAAATCAGAAAATTCTTAAGTTTTTTAT TGAACATGAATCCTTGGATGATTTCATTTATGATTGAAGGTTACACTATAAAGGCGGTTGCAATCATATGAAACTAATGAAAGGCCACCCTCATAACTCA GCCATTGATGCTGAATGCTAACCTGCAACTTATGACACCACTTATTACATAGTTTTAATGATGGTAACTCCTAAAAATGACAATCCAAGTGATCAGCTGA TGAACTCACTTGGTCTTCAGGTTTTGGGACCTTAGACCATTATTATGTAGGTTTAGCAAATAGAATATGAATAGATTCTTGGATATTCCCATGCAAACTG GATGAAACATGGTCATGCCATGCCTCGGTCCACAATCGTGTTTCGTGGCCTGGATTCACGCCATGCTCGTGGTGCGTTCATAGCCATGGTTAGCCAAGTC CCTCCTTCTTCAACGCAATGCACCATCCTCGGTGGTTGCTCACTTGCTCCTCTTCCCTTTGGCTGGTTTTCATTAGGGCTTCTACAACCTATCGAAGGGC TTCCTTTTTCCGCTTGGTCCTTGCCCTGGGTAGTGGTCCCCCTAGGCCTTGAAGCTCTTGTTTCAGCTTGTCCTTTTCCATGCCCAAATCAACATGATTA TGTTTACTTAATTGATCTACAGATAAATTTAGTAGCTTTCCTCAAACTATGTTTTCTCTCTGTAATTTTATTTTCCCATTTTCGCTGAGATCCCTCATTC TTTAAACTCCTGCTTTTCTTCTTTCCTAGCTCCCTTTAATCCATTTATTCTGTATTGAAAAAGGAAATTAAGTTCTCATTTAAGATTTTGGAGTGGAAGA AGCTAAGTACAAGCATTGGAAAGCATTCATCGAACCTGAATGCTTAATACCTTTCGGTTAGTGACACAAATGAAGAATCACTTTTCGAACTATAGTGGTA TTTTATGCCCTGTACAAGGGGTTGTATACTTAATTTTTATTTTAATAATATTTTCAAGGAATAGAAAATTAAAATAGGGTGGACATTCATTCATTTCTGA ATTGTTGGTTTGATTGTTAACCTTCATGCATGTAGTTATGCTGTTGTTAAATTCAGCCATTGTCACTTTGTTTCTGGATATGATCTTAGAAAATATTTGA GGGCTAAGACTCCACATCTTTCAATTAGGGTTTGAAAAGTGCACTAGCTGCTGGTGCTGACAAGGATGAAGAAGATTCAGAGGGAAGAACAGCTTTGCAT TTTTCCTGTGGATA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_42681; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_237209
Blastp | - |
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Blastx | Ankyrin repeat domain-containing protein 2A from Arabidopsis with 82.14% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440909.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |