| Id Trinity | FTRINITY_DN54505_c4_g2_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_18461 |
| Sequence | TCAGCATTTCCATCAGCTTGTTGTTTTCCTAGTGCGCAATTTCCAGATAGATAATTCTCTTTTGGAGAAGCGTGGTGCTTTGATAATCCGTCAGCTTTGT GTGCTTTTGAATGCTGAGAGGGTATACCGTGAACTTTCTATAATATTGGAAGGGGAATCTGATTTGGATTTTGCATCAATTATGGTCCAGGTATATCTGG GCTAAAGAGGCTGCAATGCACTTTGGTTTAGCTGTTTCATTATTTTATTTTGTTTCAGCCTTTGAGGTATGGAAGAGGTTAACCTGTTTGCATTTATGAG TAGGATTTGGTGTGCACTTTTATTTGACAGATGACTATCTTGTTTTGGTCATGTCCAACTAATCTTACTGTTGATGTGGATATACTTAAGATCTACTTGT TTTAAAATATTATATTATGCTTCAATGGAATCAGACGCTCAAGATTTCAAAGGTCTAGGCTTTTGTTAAATGATTTATGTTTTAGGGGAAGGGGTGTTGT TTTTATTTCTTACGCCATTGCTGAGCGGTTCTTTGGCAGTGTTAAGTGCAGTTGTTATTTGTGTGAATTTCTATTGTAGGCCTCTGTCTATTTTATGGAA GTGGAGAGAGGTTAATGACTGTTCTATAACAGGCCTAGATGTTCATAGACCAGACACTAGTACCAATGTTATATTTATTTGTTTGTTGCCTTTGTATTAT TGACGTAATTGTTTTTCAGGAGTTTAACACGTAGACAATCTATGCTGTAAAAAGAGTATTCAACTTCTTTTTTAACCCCTTTTGAAAACATTTCAGGCTT TGAATTTGATCTTACTTACATCATCAGAATTGTCTGAGATTCGATATCTTTTGAAGCAATCACTGGTAAATCCTGCTGGGAAGGACTTGTATATTGCTTT GTATGCTTCTTGGTGTCATTCTCCAATGGCAATTATAAGTCTTTGCTTTATAGCTCAGACTTACCAGCATGCAAGTGCTGTGATTCAATCTCTGGTAGAG GAGGATATTAATCCCAAATTTTTGGTCCAGCTGGATAAATTGATTCACTTGCTGGAAACTCCTATCTTTGCATATCTTAGATTGCAGCTTCTTGAACCTG GAAGATACATATGGTTATTCAAAGCATTGTATGGTCTGCTAATGTTGCTTCCTCAGGTATTTGCAACTTCAACAATTTCATTTCTTCAAAAGCTAGTGAG TCTTCAATTTTCTTTTATGAATAAGGTGTGTTCATACACCCTTCCTTTGTGGTATGTTATTTCATGGACTCCTGCATTGGTTGCATTATATGATTTTTTT CCTTTCCTTTTTAAGTATTTAGAAGTGACATTATGCAGCGTGTGACCTGTTTCCTGGTGTATATTACTTCATTCTTAATAAAGCTGTAATTTTATCATTT CTATGCCGTTAACCAAATCATGTTAATCATTCAAAAGCAGGAATGTGGTAGACTATTTATTTTTTGTTGCCTTCCCTTTTGCATCGCTTTATTTTAGAGA CATTTATTATTCGCCTAAAATAGGTCTTACAGATGGAAAGTTTTTAAATCTAGATGCTACCCTCCTGAATTTATTTGGGTAAAAACATGCAATGATATAT ACTTAAAGGCTGGTTAGTCAATTTTGTGCAATCACGCAAGGATAGCAGAGGAGTGGCTCACTCCTGCCCTTCTGCATGACAGGAAGACAAATTGGTGCTG AAACCCCTATTTTACCAAACTAAGAACACATGTCAAATCGTAATTTTTAATGTTGGGTAATTTCACGTTCCCCTTCTCTTTGTGATTTGGGCCAAGCCCA ATAAAATATTTAGAATCCTACCCCTCCTTCTAAAGCATTTCTGAAGCCATGAGAAATGCGAAAAACAAAATAAGCTCATCTGCTAAAGCTTTTAAGGCTA AGACGAACACAGCCACAAAATGACAATTATTTTCCGTTAGTCCCTGCCATTTTCGGTGACTCACATCAATTTCTGGACTTTTCATGCCATTTTGGCGACT CCCGCAATGGTTGTCAAACTCGTGAGTGCCTGCCATTTTCGTGACTCAATTCTTGAACTCGTATGAGTTTACTTGTTCAAGAAATATGTACATTAACATG ACATATATTACATCCCACATGATATTAGCCCCTGATTAATATTGCATATAGAAATTCCACAATAAAGTAAACAACCCTGAGCACCATGAGTAGGATATAA TTTAACAATAATGTTAACCAAGCCTTGTAGAAATTAGTCAACGATGGCTGAAGCTTCAGCCTGAGGTTGAGGATGATTGCGAAAGAAAAGGTTAAGGCAG AGAGCTTCAATATTTTTTGGGAGCCCTAATTTCACATTTGGCCGAAAAGTGTCCTTTTTACTATTGGTCATGAAACATTATCATTTCAGGTGTTTAGGTC ATGAAACAATGTCATATTAGGTGTTTAAAGAATATAAATGAAGTGGATCAGTGAATTTGTAAACTCGATGGTGAACTCACAAGTTTCCCAGAGTTTGCCC AAGTTTATATGAATTTACCCGAGTTCATCCAGCTCCGAATTTCCATGCAAGTTGGTTCGATTCTACCACATAAATGAGTTTACAAGTTAACACGAGTTAA ACAACCATGCTCCCGTCCATTTCCAGCCACCCACTTCACTTTGCTTCTTTCCCTCACTTTGCTTCTTTCACTCACTTTGCTTCTTTCCCTCACTTCTGTA CAACCACTCATTTCAACACCACAACCTTGATTCTATTTAAGGATTATACTCAAATAGTGGTTATGCCAGAGATAGTGATTCCGTAACTTTATTTAGGTTG CATGATTAGCTCAGTTGCTTGAAACCTGGGAAGTTTAAATTTTTTTTGGTTATTAAGTATGATGAACGTGTATCTACTTTGATTTGAATGTTTGATATTA ATTATGAATGTACATTTAATTTGGTGTGTTTTAGATCCAGTTAGAGAAAAAATGTAGGTTTTTAAGCTATTGTTCAGAATCTACTGGTAAAGCTTTGATC CCCTTGTGTTGTTATGTATATTGGATGATGCAGGTTCATCTTTATATGCTTTGTGTTTTAGTTTTATGTTTTTCTTACACATTGCGTTAGTAATTTAGCA ACTGTATGCATGTTTTTTAGATGTGTTAAGCCTTGTCAATAAATAATGATGACAAAAACTATTGTCTCGACTTATCTCATGGTCGTTCACATCATGCATT TTCTTGAAAAAGTAGGTGATATAATGGTTTAGTGTTTATTTTTTGACTTGATTTTGTATCCAATATACAGCAAAGTGCCGCCTTTAAAATATTAAAAACT CGTTTAAAAGCTGTTCCATCGTATTCTTTCAATGGCATGCAATCGAAGAGAATGCCTTCAGGGGATTCCTATCAATTTCTTCATCACATGTCTAATGGAT CCCAAATTATTGAGGATGATGACTTAACTAAAGATGGTGGAAGCTCACATAATGGAATAAATTTTGATGCTAGGCTACAACAGTTTCAGCAAATGCAGCA TCTGCATCGGATGCACTTTAAAGCACAGACGAAGTCTCTCAATAATTCTACCCCATTACCAAAGGAGGCGCAAAGAGAGGAAGAACCAAGTAGAACACAA TCTATTGACCTTAATGTTCTTCCTCATAGATCATCAAAGAGAGGTCCAGGGCAGCTAAAATTATAGTGCTAACGTTGCATCTGCCCCTATCTCAAGTCCA ATTGTGCATTGATCTCGAAGTGTATGTGAACTTTGAATGGCATCAGGTATAATGTGTAAAGTTGTAAATCATAGTAGCTCGTTTTATTCTAGTTGTTAGA GGTTGGGACTTGGGATGGTGAATATTGGGTTTTGGAATCAAGCTAAAGCTAGGGCTTTCCTGGTCTATTCTTTTGACCTCTATACAACTTGATAACCACA TGGTTCTGTTATTTTTTGTGTTGATAACCATGTGGGCTAGAGGGATATCTTATCTAGTAATTAACCAATTGGCATGGGGTACTGTAAAGGTTCACATTTA TTTTTGTATTTGGTTTGATTCAGTAGCATTAAGCCAGTATCATTGTCTACATGATTAATTCGGGTCAATGGTTATAGTTTTCTACTTTTGTCTATTTCTA TTTCAAGACTTGAATGGTGATATTGCATCAAAGCTCACTGGATATAAGAGGGATAGAATAATTTATTTTGTGCTGTACAAAAGGTATGGATATTTGTTTT TTTTCTTCACAAATCAGTAATTAACTTACAAAGCTTATCATGTCAACAG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_43268; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_18461
| Blastp | Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 33.33% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 69.63% of identity |
| Eggnog | vac14 homolog (S. cerevisiae)(ENOG410XP6E) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G01690) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019420378.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |