Id Trinity | FTRINITY_DN54541_c0_g3_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_18186 |
Sequence | GGGTAATGTAATCTTTTCCATGAGTTATAATAAGGATTCGGTATAATATCAAATCCTTGAACTGTTGAATGAGTTGTGTCTTTCTATATATAAGTGGGCG AGAAAGGAGTATAGACGTGATCCCATCCCAAATCGTTTTTATATAATTTGAAGAAAAGCTTCATTTTATCTTTATATAAAGCATCTTCATGCAATAGCAA GAGAAATTCCACGGCCCATAAACAAAGCCAGAGGTGTGGTGATTACAGAGCAGAGCCATGGAAAGTGGTGCTTTCGTGAGTGTGAAACATGAATCAAAAA CAACTTCCACCATCACCATTAAGGGTATTCTCAGTCTTCTAATGGCAAGTGTTAATGAGAGTAATGATGCTAACAACAGAGTTATATCTCTGGGTATGGG TGACCCAACAATTTATACATGTTTCCGAACCACCACTGTTGCTGATGAAGCTGTTGCTGATAAAATTTACTCTCACAAGTTTAATGGTTATGCTCCCACT GCTGGTCTTCTTCAGGCAAGAAAGTAATGTTTCCTTCCTTCTCTGTTGCAAGTTTCAACTTTTCTTCTCGTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTGTTTCTATT TTTATTGTTTGTTTCTCGGGTTTCGATATGAGTTTTCTCTGGGTCGCTATATTTTTAACTGTAACAGATTCTGTCCAATATGATAGTGGCTGCATCTTTC TATCTTAATTTGGCATCATTTTACAATTTGTTAAGTGTTATAGTCCTGCATCCCTATGAGCTAACTTTTTTGTAGTAGATTTAGAATTAGTTATTCTAGT ATGTCACTAGAGTGTAGAGTCTATCTTTGCAATTGTCTACTTCATGCTCTATCATTCTGTTCTTAAAGTGTTTTACAACTTTTGGTTCTTCAATTTTGAA ATTTGTGCATCTTCACAAAATTGCTTATGTGACTAAGATTGTCATTTGGCATCAAGTACGTGTTGATTTTTAAAGCCTATTAATAATATGGCCTATACTT ATAATATGATGGAGGAAGGAATGACCAATACTTAAATTAGAGGAGTAAAACTCATACTAAAATAGAGGAGCTAAGGATGAGAACCAAGACTACAATCAAG CCAAAAGTTAAGTGGGTAGCTCATATACCTACGTACCCCATATTGAATTTACTATATCTTATATCATATATCGGATTTATCATAAATAATGTCTCATAAA ATTAATATAAAAAGTAACGAAACCAAATGAAACACTTATGTATAGCCATACTGCATAACTATGGTTAAGTGTTATAGTCCAACTTGTGTTGAGTATACTT TGGCAACATCTTCTGTTAATTTTTTGGTGGATTTACTGTCAGTCTAAGATGATTACTACCTTTTGCTCCTGCAGTTGAATGGATTTTACATGCTTGAATT CTGTTTCATTCTCCTGTAGTATCTTTTTCTAAATATAATGCAATCTAAGGTTACTTTCATGTTGGTGACAGTGCAATTGCTGAATATCTGTCATGTGACC TTCCTTACCAGTTATCATCTGATGATGTTTTCATTACTTGTGGATGCACACAAGCTATTGATGTGTCAATTGCAATGCTTGCTTACCCTGGTGCAAATAT CTTGCTTCCAAGACCAGGCTTCCCAATCTATGAACTTAGTGCTGCATTTAGACATGTTGAAGTGAGACATTATGATCTGCTTCCAGAGAAAGGATGGGAG GTTGATCTTGATGCTATTGAAGCTCTTGCAGATCAGAACACAGTTGCATTGGTTATTATAAACCCGGGGAATCCATGTGGAAATGTATACAGTTACAATC ATTTGGAGAAGGTTAGTTCTCTGCTATATGGCCTCAAACCAGATACATTTGAGAAAAAATGCTTATAGAATTGACAGCATTTGTATGGTTGGATTAGCTT ATTCTCAGTTGAACTACTTTAGTAAAACTTTAAATCGATCTTCCAAAGATATAATTGTCACTTGGCCCTTTATGGCCCGTTTACAAGCGGACCTTTGGAA GGGAAGGAAGGAAAGGAAAGGGGAAGGCTTCAGAATCATGTCTGTAATTCATGTCTCCCAAGCCTTCCCTTTCCCTCCCCCGTAAAATCCAACTCGGAAA CAGATCCTTAAAGAAAAGTGTCCAACTAAGTGTTTGAAGTTTAAAAACGTCATCATAGTCCTTCTAAGGACTTAATTGGTGAAATATTAAATCTTTCGTG ACTTAATTTTACACTATGTGATGACATTTTAAACTTTCATAACATATTTGGTGTCACTTTGCAAGAAAAAGTAGGCCACCCATGTACTTGTGGAGGGCCT TTCACTCAATAATTTTTATCAAAATCTTAGCGTGAGAGCTTTTGAAAGAAAGAAAAAAACTTTCCCCTGAAATTACTCGTCTCAGTTGTCTGTATTATGT TATTCTTCAGATTGCAGAAATTGCAGGGAGACTTGGAACAATTGTGATTGCTGATGAGGTTTATGGTCACCTTGCATTTGGGGACAAACCTTTTGTTCCA ATGGGAGTTTTTGGCTCTATTGTTCCTGTTCTCACTCTTGGGTCATTGTCTAAGAGATGGTTAGTTCCTGGATGGAGGCTTGGTTGGTTTGTCATAAATG ATCCTTGTGGCACTTATAAAAAACCCAAGGTTTCTCTCCCACTCTCTTTGTTCTGTTTAACCTGCATTATGATATATTTTTATACATTTTGAAGGCCTCA ATTGGTATGTAGTATAAGACATGATAGTATAATCTCATTATTATTATGTAGATGTTATAAAGTATAAACCATATGTTCCTTATGCAGGTAGTTGAGCGCA TTAAAAAGTATTTTGATCTTTTAGGAGGTCCAGCCACCTTCATCCAGGCCGCCGTACCTCGCATAATTTCGCAAACTGGAGAGGTTTTCTTCCAGAAAAC CATTGACAATTTGAAGCATACATTAGAAATATGTTGTAAAGAGATAGAAGATATTCCATGCATTTTCTGCCCTTACAAACCAGAAGGGTCGATGGCGATG ATGGTGAAACTAAATCTTTCACTTCTTGAAGATATTAGCGACGATATTGATTTTTGTTTCAAACTTGCAAAGGAGGAATCTGTTATCCTTCTTCCAGGAA CTGCAGTAGGACTAAAAGATTGGCTTCGGATTACTTTCGCGGCGGATTCATCTGCTGTTAGAGAGGGTATGGGAAGGATAAAATCTTTCTATCAAAGGCA TGCCAGAAAAAATTCAAAACAATAGTGAATCCACAAATAAAGACTAATAAAAATGTACTTGCCCTTAGTTCTGTTTCCTGCAAAAAAAGTCATTAGAATT ACAGATTCATTTGTACTTCAATAAGAGATATAGCTTCATGAGTAATCTACAGAACTCTGCAACATCATCACAGAGGAAAATTTCTTCAAAGTGAGGCATC ATATTTATTCATATATTAACTAGACCGTTTGCAGAAAGGAACACCATCTATATCAAAAGCATGTGGGACAATGGTTTTATACATATCTCAGAATTCACGC TTATTATGAAAAGCTAGCTATCGAATATATACTTTTTCTCTAATTAAAATGTAAAAGCATTTTAGGAAATTTAATTACATTCACACACTTTAATAATCCA GGGTTTTAAAAGAATTTTGGTCATAAATCAAGAGAAAAGTTATCATATGCATTGAAAAGCAATGTACAAAATTCAAAGAAAAAGGTAAAAACAGCCAAGA TTATGTATATAACTTTTCGAGACTTGGAAGCACAGAAAAACACATAACTTGACATTATATAATACATAAATGAAAATGATAATTTCTTTTATAATGTTTT TTACTCTCTCTAAATAATACCTATCACTCTATCTTTCAACATATATACTATGTGTCTATGTCTTCCTTTTTTCCCCAGGCACACAGCTACGGAGTTATTC TTGAGAATATTTGAATCTAGTCGAATGGTTCAACTTTTGATAGCAACACTTATTGAAATGGACAACTATATATTTTGAAAAGGATTAATTTCTTATCCAA AATAATAAAGACACTTTTAATAATACACAAGAAAACTTAATTATGATATTGAGTTGGAGTTTTTAATAATGAGAAAAACTAGTTATTTACATTTTCCCTA AGTATTGGTCTAGTAGATTATCATTATGAACGGTTTGGTTCATTGGTTTATAATATAACATGTTAAATTTTATCCTATATCTATATTTTTTGACATTGCC CTATCCTTTCTCCTCGGTAGACTTATCTTTACTCAAGTGTATACAATTTCTTTAATCATTTTTTGTTTGTATATATTAGTTTACAAAAGAGGAGGAATCA TATTGAACTATATCAAGTATCACTTAATTTTTATTTCTTCACAAGTTTCATGATTCAGTATCACTTATTTTTTAATTCTTCACTACTTTCACAATTCAGT TCTCATGTTCTCAAACATTAAGGTATTGTGGATCAAACCAGTTACAAATGATTATTTAAAAAGTCAACCAAATATCAATTTTTAATTTGGTTCAGTTCAA TTTCATCAAATTTTTTâBLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_43588; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_18186
Blastp | Probable aminotransferase TAT2 from Arabidopsis with 70.92% of identity |
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Blastx | Probable aminotransferase TAT2 from Arabidopsis with 80% of identity |
Eggnog | aminotransferase(COG0436) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G53970) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001617) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019451197.1) |
Pfam | Aminotransferase class I and II (PF00155.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |