Ll_transcript_18186

Id TrinityFTRINITY_DN54541_c0_g3_i5
Name TranscriptLl_transcript_18186
SequenceGGGTAATGTAATCTTTTCCATGAGTTATAATAAGGATTCGGTATAATATCAAATCCTTGAACTGTTGAATGAGTTGTGTCTTTCTATATATAAGTGGGCG AGAAAGGAGTATAGACGTGATCCCATCCCAAATCGTTTTTATATAATTTGAAGAAAAGCTTCATTTTATCTTTATATAAAGCATCTTCATGCAATAGCAA GAGAAATTCCACGGCCCATAAACAAAGCCAGAGGTGTGGTGATTACAGAGCAGAGCCATGGAAAGTGGTGCTTTCGTGAGTGTGAAACATGAATCAAAAA CAACTTCCACCATCACCATTAAGGGTATTCTCAGTCTTCTAATGGCAAGTGTTAATGAGAGTAATGATGCTAACAACAGAGTTATATCTCTGGGTATGGG TGACCCAACAATTTATACATGTTTCCGAACCACCACTGTTGCTGATGAAGCTGTTGCTGATAAAATTTACTCTCACAAGTTTAATGGTTATGCTCCCACT GCTGGTCTTCTTCAGGCAAGAAAGTAATGTTTCCTTCCTTCTCTGTTGCAAGTTTCAACTTTTCTTCTCGTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTGTTTCTATT TTTATTGTTTGTTTCTCGGGTTTCGATATGAGTTTTCTCTGGGTCGCTATATTTTTAACTGTAACAGATTCTGTCCAATATGATAGTGGCTGCATCTTTC TATCTTAATTTGGCATCATTTTACAATTTGTTAAGTGTTATAGTCCTGCATCCCTATGAGCTAACTTTTTTGTAGTAGATTTAGAATTAGTTATTCTAGT ATGTCACTAGAGTGTAGAGTCTATCTTTGCAATTGTCTACTTCATGCTCTATCATTCTGTTCTTAAAGTGTTTTACAACTTTTGGTTCTTCAATTTTGAA ATTTGTGCATCTTCACAAAATTGCTTATGTGACTAAGATTGTCATTTGGCATCAAGTACGTGTTGATTTTTAAAGCCTATTAATAATATGGCCTATACTT ATAATATGATGGAGGAAGGAATGACCAATACTTAAATTAGAGGAGTAAAACTCATACTAAAATAGAGGAGCTAAGGATGAGAACCAAGACTACAATCAAG CCAAAAGTTAAGTGGGTAGCTCATATACCTACGTACCCCATATTGAATTTACTATATCTTATATCATATATCGGATTTATCATAAATAATGTCTCATAAA ATTAATATAAAAAGTAACGAAACCAAATGAAACACTTATGTATAGCCATACTGCATAACTATGGTTAAGTGTTATAGTCCAACTTGTGTTGAGTATACTT TGGCAACATCTTCTGTTAATTTTTTGGTGGATTTACTGTCAGTCTAAGATGATTACTACCTTTTGCTCCTGCAGTTGAATGGATTTTACATGCTTGAATT CTGTTTCATTCTCCTGTAGTATCTTTTTCTAAATATAATGCAATCTAAGGTTACTTTCATGTTGGTGACAGTGCAATTGCTGAATATCTGTCATGTGACC TTCCTTACCAGTTATCATCTGATGATGTTTTCATTACTTGTGGATGCACACAAGCTATTGATGTGTCAATTGCAATGCTTGCTTACCCTGGTGCAAATAT CTTGCTTCCAAGACCAGGCTTCCCAATCTATGAACTTAGTGCTGCATTTAGACATGTTGAAGTGAGACATTATGATCTGCTTCCAGAGAAAGGATGGGAG GTTGATCTTGATGCTATTGAAGCTCTTGCAGATCAGAACACAGTTGCATTGGTTATTATAAACCCGGGGAATCCATGTGGAAATGTATACAGTTACAATC ATTTGGAGAAGGTTAGTTCTCTGCTATATGGCCTCAAACCAGATACATTTGAGAAAAAATGCTTATAGAATTGACAGCATTTGTATGGTTGGATTAGCTT ATTCTCAGTTGAACTACTTTAGTAAAACTTTAAATCGATCTTCCAAAGATATAATTGTCACTTGGCCCTTTATGGCCCGTTTACAAGCGGACCTTTGGAA GGGAAGGAAGGAAAGGAAAGGGGAAGGCTTCAGAATCATGTCTGTAATTCATGTCTCCCAAGCCTTCCCTTTCCCTCCCCCGTAAAATCCAACTCGGAAA CAGATCCTTAAAGAAAAGTGTCCAACTAAGTGTTTGAAGTTTAAAAACGTCATCATAGTCCTTCTAAGGACTTAATTGGTGAAATATTAAATCTTTCGTG ACTTAATTTTACACTATGTGATGACATTTTAAACTTTCATAACATATTTGGTGTCACTTTGCAAGAAAAAGTAGGCCACCCATGTACTTGTGGAGGGCCT TTCACTCAATAATTTTTATCAAAATCTTAGCGTGAGAGCTTTTGAAAGAAAGAAAAAAACTTTCCCCTGAAATTACTCGTCTCAGTTGTCTGTATTATGT TATTCTTCAGATTGCAGAAATTGCAGGGAGACTTGGAACAATTGTGATTGCTGATGAGGTTTATGGTCACCTTGCATTTGGGGACAAACCTTTTGTTCCA ATGGGAGTTTTTGGCTCTATTGTTCCTGTTCTCACTCTTGGGTCATTGTCTAAGAGATGGTTAGTTCCTGGATGGAGGCTTGGTTGGTTTGTCATAAATG ATCCTTGTGGCACTTATAAAAAACCCAAGGTTTCTCTCCCACTCTCTTTGTTCTGTTTAACCTGCATTATGATATATTTTTATACATTTTGAAGGCCTCA ATTGGTATGTAGTATAAGACATGATAGTATAATCTCATTATTATTATGTAGATGTTATAAAGTATAAACCATATGTTCCTTATGCAGGTAGTTGAGCGCA TTAAAAAGTATTTTGATCTTTTAGGAGGTCCAGCCACCTTCATCCAGGCCGCCGTACCTCGCATAATTTCGCAAACTGGAGAGGTTTTCTTCCAGAAAAC CATTGACAATTTGAAGCATACATTAGAAATATGTTGTAAAGAGATAGAAGATATTCCATGCATTTTCTGCCCTTACAAACCAGAAGGGTCGATGGCGATG ATGGTGAAACTAAATCTTTCACTTCTTGAAGATATTAGCGACGATATTGATTTTTGTTTCAAACTTGCAAAGGAGGAATCTGTTATCCTTCTTCCAGGAA CTGCAGTAGGACTAAAAGATTGGCTTCGGATTACTTTCGCGGCGGATTCATCTGCTGTTAGAGAGGGTATGGGAAGGATAAAATCTTTCTATCAAAGGCA TGCCAGAAAAAATTCAAAACAATAGTGAATCCACAAATAAAGACTAATAAAAATGTACTTGCCCTTAGTTCTGTTTCCTGCAAAAAAAGTCATTAGAATT ACAGATTCATTTGTACTTCAATAAGAGATATAGCTTCATGAGTAATCTACAGAACTCTGCAACATCATCACAGAGGAAAATTTCTTCAAAGTGAGGCATC ATATTTATTCATATATTAACTAGACCGTTTGCAGAAAGGAACACCATCTATATCAAAAGCATGTGGGACAATGGTTTTATACATATCTCAGAATTCACGC TTATTATGAAAAGCTAGCTATCGAATATATACTTTTTCTCTAATTAAAATGTAAAAGCATTTTAGGAAATTTAATTACATTCACACACTTTAATAATCCA GGGTTTTAAAAGAATTTTGGTCATAAATCAAGAGAAAAGTTATCATATGCATTGAAAAGCAATGTACAAAATTCAAAGAAAAAGGTAAAAACAGCCAAGA TTATGTATATAACTTTTCGAGACTTGGAAGCACAGAAAAACACATAACTTGACATTATATAATACATAAATGAAAATGATAATTTCTTTTATAATGTTTT TTACTCTCTCTAAATAATACCTATCACTCTATCTTTCAACATATATACTATGTGTCTATGTCTTCCTTTTTTCCCCAGGCACACAGCTACGGAGTTATTC TTGAGAATATTTGAATCTAGTCGAATGGTTCAACTTTTGATAGCAACACTTATTGAAATGGACAACTATATATTTTGAAAAGGATTAATTTCTTATCCAA AATAATAAAGACACTTTTAATAATACACAAGAAAACTTAATTATGATATTGAGTTGGAGTTTTTAATAATGAGAAAAACTAGTTATTTACATTTTCCCTA AGTATTGGTCTAGTAGATTATCATTATGAACGGTTTGGTTCATTGGTTTATAATATAACATGTTAAATTTTATCCTATATCTATATTTTTTGACATTGCC CTATCCTTTCTCCTCGGTAGACTTATCTTTACTCAAGTGTATACAATTTCTTTAATCATTTTTTGTTTGTATATATTAGTTTACAAAAGAGGAGGAATCA TATTGAACTATATCAAGTATCACTTAATTTTTATTTCTTCACAAGTTTCATGATTCAGTATCACTTATTTTTTAATTCTTCACTACTTTCACAATTCAGT TCTCATGTTCTCAAACATTAAGGTATTGTGGATCAAACCAGTTACAAATGATTATTTAAAAAGTCAACCAAATATCAATTTTTAATTTGGTTCAGTTCAA TTTCATCAAATTTTTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_43588; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_18186

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_18186

BlastpProbable aminotransferase TAT2 from Arabidopsis with 70.92% of identity
BlastxProbable aminotransferase TAT2 from Arabidopsis with 80% of identity
Eggnogaminotransferase(COG0436)
KeggLink to kegg annotations (AT5G53970)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0001617)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019451197.1)
PfamAminotransferase class I and II (PF00155.20)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;