Id Trinity | FTRINITY_DN54542_c1_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_17355 |
Sequence | CTCCTCCTCACCTCAGGTTTTCTCTTTTTCTTTTTCTAATCTGCACTTCATTGCATTTGCACTTTTACCAGTTTGTGCTGCCTTCCGCCACCCATTGCCC TGTTTCGGCCGCCATACCGCCATGGCGGTTGCGGATCATGGGATAAATGATGGAAATGCTCAAATTTCACTCTCTAATTTGGCTCTTTCATGTCACGAGA ACCCAGATCCGGCAACACCTAATGTCATTAGCTCATTGTGAGTAGCAGTGGCAGCAAGTGACAGTGGGCAATGGCATCGAGCCTGCAGAAGATCGAAGGG GACGAGTCTGTCCTCTTACGGGTCACTCATTCTAATCTAAAGACTTTCACCGCTGACATTCGCTTCTCGCTTCAGCTGACGGTGGAAGCCGTGAAAGATA AGCTTTGGAAAAAATGTGGTACTTCTGTGAACTCGATGCACCTTGAGCTATATGATGATGCTCGCAACAAACTTGCTGATCTTAGTGATAATTCCAAACT CCTTGCATTATATTCACCTCTAGATGGGTTTCGTTTGCATGTTTTAGATCTGGATCCGTCATCTGTCACTTCTGGTGGTTGGCTGGAAGATACTTCATTG GTGGAAAAATACAAAATTTCTGATGAAGCCTATAATAAGCTAGAAGGCATGTTCCCCACCCCTTCTGTTTTGTTTAAACTTTCCCTCTTTTAAAACCTGT GCACATATGAACAAATATCTGTTTAATGTACTTTTGGCATTGAATAATTAACTAAACCAGTATTTATCTTAATAGACAAAATCAACTTTTGTAAATATCA ATGTAAATATACTTAAGCAGACAGAACTTACCGTGATACAATTCTCCTGAGAGGGTGTTTAACTTTGACCATTCTAAAGAAGACAACACCAGAATAATAA 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_43591; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_17355
Blastp | Tubulin-folding cofactor B from Arabidopsis with 69.92% of identity |
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Blastx | Tubulin-folding cofactor B from Arabidopsis with 69.92% of identity |
Eggnog | tubulin folding cofactor B(ENOG410YKGB) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G10220) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428994.1) |
Pfam | Ubiquitin-like domain (PF14560.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |